59 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mhun_1173 on replicon NC_007796
Organism: Methanospirillum hungatei JF-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011832  Mpal_2686  type II secretion system protein  51.65 
 
 
644 aa  662    Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.473115 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2354  type II secretion system protein  51.42 
 
 
652 aa  644    Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.149954  normal  0.434022 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1173  type II secretion system protein  100 
 
 
641 aa  1291    Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0525708  normal  0.392057 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2401  type II secretion system protein  33.64 
 
 
647 aa  375  1e-102  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0449  type II secretion system protein  34.35 
 
 
716 aa  359  9e-98  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1031  type II secretion system protein  32.31 
 
 
715 aa  317  5e-85  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.549235 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1458  hypothetical protein  31.24 
 
 
625 aa  300  5e-80  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.441143 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2722  type II secretion system protein  31.31 
 
 
807 aa  295  2e-78  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.722587 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2815  type II secretion system protein  33.87 
 
 
802 aa  294  3e-78  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0732  transporter  28.42 
 
 
660 aa  287  2.9999999999999996e-76  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1065  Type II secretion system F domain protein  32.82 
 
 
536 aa  273  9e-72  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0977  type II secretion system protein  27.4 
 
 
680 aa  223  7e-57  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2385  type II secretion system protein  29.94 
 
 
610 aa  221  3e-56  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0700595  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3138  Type II secretion system F domain protein  26.78 
 
 
684 aa  221  3.9999999999999997e-56  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.160866  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2860  type II secretion system protein  27.61 
 
 
678 aa  218  2e-55  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0313  type II secretion system protein  29.72 
 
 
625 aa  219  2e-55  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.549227  normal  0.205186 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0947  Type II secretion system F domain protein  27.27 
 
 
697 aa  216  9.999999999999999e-55  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1538  hypothetical protein  26.28 
 
 
601 aa  207  5e-52  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.0000607294  hitchhiker  0.000766837 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2147  type II secretion system protein  27.19 
 
 
679 aa  201  3.9999999999999996e-50  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.0236165 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1903  type II secretion system protein  35.49 
 
 
349 aa  179  2e-43  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.697256 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2001  type II secretion system protein  32.59 
 
 
349 aa  167  8e-40  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0252  type II secretion system protein  34.24 
 
 
328 aa  154  4e-36  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.163074  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3168  type II secretion system protein  31.74 
 
 
329 aa  152  1e-35  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.577481  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3169  type II secretion system protein  34.81 
 
 
296 aa  148  2.0000000000000003e-34  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2002  type II secretion system protein  35.44 
 
 
307 aa  140  6e-32  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0253  type II secretion system protein  36.65 
 
 
306 aa  134  5e-30  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0793731  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1904  type II secretion system protein  35.98 
 
 
224 aa  129  1.0000000000000001e-28  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.374216 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0007  Type II secretion system F domain protein  31.71 
 
 
332 aa  114  6e-24  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0008  Type II secretion system F domain protein  31.65 
 
 
290 aa  110  6e-23  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2405  type II secretion system protein  22.67 
 
 
450 aa  84.3  0.000000000000006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0777  type II secretion system protein  29.03 
 
 
284 aa  66.6  0.000000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2404  type II secretion system protein  25.16 
 
 
300 aa  66.2  0.000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.633415 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1648  type II secretion system protein  21.03 
 
 
590 aa  57  0.000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.505042  hitchhiker  0.00186987 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2365  hypothetical protein  25.3 
 
 
324 aa  54.7  0.000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.195084  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2314  type II secretion system protein  25 
 
 
317 aa  54.7  0.000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2696  type II secretion system protein  28.14 
 
 
301 aa  53.9  0.000009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0581937  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2276  putative integral membrane protein  26.89 
 
 
273 aa  52.4  0.00002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.846433  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0445  type II secretion system protein  20.41 
 
 
604 aa  52.8  0.00002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.179017  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2923  putative type II secretion system protein F  26.35 
 
 
293 aa  52.4  0.00003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0651  type II secretion system protein  21.78 
 
 
615 aa  52.4  0.00003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.219631 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6878  type II secretion system protein  28.36 
 
 
293 aa  52  0.00004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.465681  normal  0.240753 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0425  type II secretion system protein  28.03 
 
 
271 aa  51.2  0.00006  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1850  type II secretion system protein  23.84 
 
 
307 aa  49.3  0.0002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0102974  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2114  type II secretion system protein  26.06 
 
 
288 aa  48.9  0.0003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2869  Type II secretion system F domain protein  20.92 
 
 
574 aa  48.5  0.0003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.43773  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0805  type II secretion system protein  22.27 
 
 
295 aa  48.5  0.0003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3212  type II secretion system protein  22.67 
 
 
311 aa  48.5  0.0004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.514288 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3420  Type II secretion system F domain protein  22.78 
 
 
295 aa  48.1  0.0005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.490118  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4348  type II secretion system protein  28.93 
 
 
292 aa  47.8  0.0006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0494  Type II secretion system F domain protein  24.39 
 
 
658 aa  47  0.001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0249  type II secretion system protein  24.05 
 
 
313 aa  46.6  0.001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.876214 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2736  type II secretion system protein  25.79 
 
 
326 aa  45.8  0.002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0552  type II secretion system protein  27.34 
 
 
326 aa  45.4  0.003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1018  type II secretion system protein  26.45 
 
 
336 aa  44.7  0.005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1343  type II secretion system protein  24.29 
 
 
256 aa  44.3  0.006  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.753846 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1903  putative Flp pilus assembly protein TadC  27.34 
 
 
326 aa  44.3  0.006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0926452  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4157  type II secretion system protein  28.33 
 
 
309 aa  44.7  0.006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.530435 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1530  type II secretion system protein  21.74 
 
 
301 aa  44.3  0.007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1317  Type II secretion system F domain protein  22.86 
 
 
554 aa  44.3  0.007  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.89339  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>