228 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mext_2451 on replicon NC_010172
Organism: Methylobacterium extorquens PA1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010172  Mext_2451  resolvase domain-containing protein  100 
 
 		 268 aa  536  1e-151  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4152  resolvase domain-containing protein  70.09 
 
 		 231 aa  288  5.0000000000000004e-77  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6747  putative resolvase (site-specific recombinase)  60.91 
 
 		 223 aa  227  2e-58  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.232296  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4942  putative DNA-invertase (site-specific recombinase)  56.82 
 
 		 214 aa  225  5.0000000000000005e-58  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.406148  normal  1 
 
 
-
 
NC_011888  Mnod_7746  Resolvase domain protein  47.27 
 
 		 217 aa  172  5.999999999999999e-42  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3483  Resolvase domain  44.2 
 
 		 219 aa  170  2e-41  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1741  Resolvase domain  44.05 
 
 		 228 aa  165  6.9999999999999995e-40  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0275  resolvase domain-containing protein  41.74 
 
 		 224 aa  157  1e-37  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2725  Resolvase domain protein  43.24 
 
 		 228 aa  151  1e-35  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4956  resolvase domain-containing protein  44.93 
 
 		 236 aa  150  2e-35  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.90554  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2281  resolvase-like protein  42.86 
 
 		 216 aa  149  4e-35  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00855121  normal  0.056664 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0893  Resolvase domain protein  41.15 
 
 		 227 aa  145  5e-34  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.174131  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4233  Resolvase domain  44.14 
 
 		 216 aa  145  5e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2472  resolvase domain-containing protein  44.04 
 
 		 237 aa  145  8.000000000000001e-34  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1223  resolvase domain-containing protein  51.58 
 
 		 225 aa  143  3e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7497  Resolvase domain protein  43.23 
 
 		 231 aa  142  4e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3656  resolvase-like protein  44.44 
 
 		 248 aa  141  9.999999999999999e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1482  resolvase domain-containing protein  43.3 
 
 		 233 aa  139  3.9999999999999997e-32  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.569487  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2499  resolvase, N-terminal  40.62 
 
 		 229 aa  139  7e-32  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.994531 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2996  Resolvase domain  41.7 
 
 		 221 aa  138  7e-32  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.000012222  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0923  resolvase-like protein  43.72 
 
 		 234 aa  136  4e-31  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.916878 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22080  resolvase  40.43 
 
 		 231 aa  136  4e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000105368  unclonable  3.95615e-22 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0802  resolvase, N-terminal  39.73 
 
 		 229 aa  135  5e-31  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000162467  unclonable  0.000000072068 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1116  resolvase family site-specific recombinase  40.87 
 
 		 236 aa  135  6.0000000000000005e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00106717 
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4298  hypothetical protein  49.55 
 
 		 226 aa  134  1.9999999999999998e-30  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3500  resolvase-like protein  37.96 
 
 		 248 aa  128  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.318802  normal  0.137861 
 
 
-
 
NC_011893  Mnod_8811  Resolvase domain protein  46.4 
 
 		 227 aa  122  6e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3788  resolvase domain-containing protein  37.19 
 
 		 269 aa  114  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.692278  normal  1 
 
 
-
 
NC_009433  Rsph17025_4394  resolvase domain-containing protein  45.63 
 
 		 198 aa  115  1.0000000000000001e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3000  Resolvase domain  40.82 
 
 		 197 aa  113  3e-24  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2389  Resolvase domain  42.01 
 
 		 224 aa  110  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013733  Slin_7010  Resolvase domain protein  40.28 
 
 		 216 aa  108  7.000000000000001e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.998314  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6912  resolvase domain-containing protein  47.26 
 
 		 243 aa  101  1e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6343  resolvase domain protein  34.16 
 
 		 211 aa  92.8  5e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3908  resolvase domain-containing protein  39.62 
 
 		 229 aa  89.7  4e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.582833 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8420  Resolvase domain protein  45.25 
 
 		 227 aa  86.3  5e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.875604  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3595  resolvase domain-containing protein  34.48 
 
 		 237 aa  85.5  9e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1421  Resolvase domain protein  37.93 
 
 		 231 aa  84  0.000000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.510042  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4374  Resolvase domain  37.83 
 
 		 216 aa  82.8  0.000000000000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1088  resolvase domain-containing protein  41.56 
 
 		 227 aa  80.5  0.00000000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0592  Resolvase domain protein  29.73 
 
 		 462 aa  74.3  0.000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3649  resolvase domain-containing protein  34.6 
 
 		 380 aa  72.8  0.000000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.340945 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7341  Resolvase domain protein  31.76 
 
 		 295 aa  68.2  0.0000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3976  resolvase domain-containing protein  25.1 
 
 		 415 aa  66.6  0.0000000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5598  DNA recombinase, putative  26.03 
 
 		 522 aa  65.9  0.0000000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.318471  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5214  hypothetical protein  47.37 
 
 		 117 aa  62.4  0.000000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.333892  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1424  Resolvase domain protein  35.06 
 
 		 215 aa  62  0.000000009  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  decreased coverage  0.00141617  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3862  resolvase domain-containing protein  36.13 
 
 		 194 aa  60.8  0.00000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0506724  unclonable  0.00000235811 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3478  resolvase domain-containing protein  31.38 
 
 		 242 aa  60.8  0.00000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6608  resolvase domain-containing protein  33.16 
 
 		 189 aa  60.5  0.00000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.525053  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3142  resolvase-like protein  32.48 
 
 		 203 aa  59.3  0.00000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3384  resolvase domain-containing protein  30.49 
 
 		 590 aa  59.3  0.00000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0980736 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2851  resolvase domain-containing protein  27.08 
 
 		 565 aa  58.9  0.00000009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.437901 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0536  resolvase domain-containing protein  35.58 
 
 		 203 aa  58.9  0.00000009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.201567  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0209  Resolvase domain  33.15 
 
 		 264 aa  57.8  0.0000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0049  resolvase domain-containing protein  26.92 
 
 		 542 aa  57.4  0.0000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1684  resolvase-like protein  31.14 
 
 		 665 aa  57.8  0.0000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.560816 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0048  resolvase domain-containing protein  26.92 
 
 		 542 aa  57.4  0.0000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3410  Resolvase domain protein  35.71 
 
 		 206 aa  57.8  0.0000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.260918 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5704  resolvase domain-containing protein  34.27 
 
 		 283 aa  58.2  0.0000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0430  Resolvase domain protein  27.54 
 
 		 535 aa  58.2  0.0000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3786  Resolvase domain  30.45 
 
 		 242 aa  57.8  0.0000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.366578 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3998  resolvase domain-containing protein  28.21 
 
 		 521 aa  57  0.0000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2499  cassette chromosome recombinase B  26.92 
 
 		 542 aa  56.6  0.0000004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0277  resolvase domain-containing protein  28.28 
 
 		 551 aa  56.6  0.0000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.738521  normal  0.0325045 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0051  site-specific recombinase  26.25 
 
 		 513 aa  56.2  0.0000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.169299  hitchhiker  0.000782563 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2383  resolvase domain-containing protein  58.7 
 
 		 83 aa  56.2  0.0000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1594  resolvase domain-containing protein  30.92 
 
 		 189 aa  55.8  0.0000007  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.94865  normal  0.455677 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0974  Resolvase domain protein  30.58 
 
 		 513 aa  55.5  0.000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3989  recombinase  30.04 
 
 		 613 aa  55.1  0.000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5360  resolvase domain protein  24.69 
 
 		 546 aa  55.1  0.000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000247289  hitchhiker  0.00000000017806 
 
 
-
 
NC_008762  Pnap_4991  resolvase domain-containing protein  35.26 
 
 		 189 aa  55.1  0.000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0430  putative resolvase  27.73 
 
 		 540 aa  54.3  0.000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0212047  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2362  DNA-invertase  29.75 
 
 		 188 aa  54.7  0.000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009958  Dshi_4081  resolvase domain-containing protein  35.85 
 
 		 199 aa  53.5  0.000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.0381075 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3876  resolvase domain-containing protein  35.85 
 
 		 199 aa  53.5  0.000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.3792 
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4154  resolvase domain-containing protein  31.95 
 
 		 199 aa  53.5  0.000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3680  resolvase domain-containing protein  35.85 
 
 		 199 aa  53.5  0.000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0737  resolvase  30.07 
 
 		 542 aa  53.5  0.000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0547783  normal  1 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4796  resolvase domain-containing protein  35.33 
 
 		 310 aa  53.1  0.000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.271999  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2966  Resolvase domain protein  27.5 
 
 		 524 aa  53.1  0.000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1021  resolvase domain-containing protein  31.46 
 
 		 230 aa  53.1  0.000005  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.0963583 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0338  Recombinase  25.94 
 
 		 498 aa  52.8  0.000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0235  resolvase domain-containing protein  31.36 
 
 		 187 aa  52.8  0.000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0409  resolvase domain-containing protein  32.54 
 
 		 186 aa  52.8  0.000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00000318958  n/a   
 
 
-
 
NC_008790  CJJ81176_pTet0024  cpp27  27.95 
 
 		 204 aa  52.8  0.000006  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.586795  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2132  resolvase domain-containing protein  34.64 
 
 		 198 aa  52.4  0.000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0356691 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1503  resolvase  29.33 
 
 		 182 aa  52.4  0.000007  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.236013  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3045  Resolvase domain protein  34.19 
 
 		 189 aa  52.8  0.000007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.436524  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01209  bacteriocin production protein  31.65 
 
 		 198 aa  52.4  0.000008  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.000000702686  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2432  resolvase domain-containing protein  30.08 
 
 		 281 aa  52.4  0.000008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0183379  normal  1 
 
 
-
 
NC_010509  Mrad2831_6307  resolvase domain-containing protein  34.62 
 
 		 209 aa  52  0.000009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1069  phage integrase family site specific recombinase  27.06 
 
 		 519 aa  52  0.00001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.278434  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4182  resolvase domain-containing protein  25.2 
 
 		 579 aa  51.6  0.00001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.86871  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1486  resolvase domain-containing protein  24.78 
 
 		 485 aa  52  0.00001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3474  resolvase domain-containing protein  30.12 
 
 		 188 aa  52  0.00001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3694  resolvase domain-containing protein  32.89 
 
 		 206 aa  51.6  0.00001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0095  resolvase domain-containing protein  32.99 
 
 		 189 aa  52  0.00001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.386301 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1942  Resolvase domain protein  27.13 
 
 		 561 aa  52  0.00001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2967  DNA-invertase hin  35.26 
 
 		 188 aa  50.8  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000835062 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>