197 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_2969 on replicon NC_008254
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008254  Meso_2969  coenzyme A transferase  100 
 
 		 300 aa  615  1e-175  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.177711  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1040  putative coenzyme A transferase, subunit A  64.58 
 
 		 302 aa  390  1e-107  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000012559  normal  1 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5072  coenzyme A transferase  35.29 
 
 		 329 aa  138  1e-31  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  decreased coverage  0.000990125  normal  0.375198 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2205  coenzyme A transferase  31.06 
 
 		 599 aa  130  2.0000000000000002e-29  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.401277  normal  0.0481798 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4842  coenzyme A transferase  32.62 
 
 		 305 aa  122  9.999999999999999e-27  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.130717  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1888  putative coenzyme A transferase  30.31 
 
 		 276 aa  120  3e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.817278  normal  0.651618 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4813  coenzyme A transferase  33.73 
 
 		 305 aa  117  3e-25  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.168158  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0403  glutaconate CoA-transferase  28.29 
 
 		 326 aa  113  4.0000000000000004e-24  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.255219  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2064  coenzyme A transferase  30.42 
 
 		 286 aa  112  9e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.852286  normal  0.684027 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1558  coenzyme A transferase  33.22 
 
 		 296 aa  110  2.0000000000000002e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2126  coenzyme A transferase  29.15 
 
 		 313 aa  108  1e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3751  coenzyme A transferase  30 
 
 		 298 aa  107  2e-22  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1432  coenzyme A transferase  33 
 
 		 297 aa  105  1e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.768493  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0811  coenzyme A transferase  33.06 
 
 		 332 aa  105  1e-21  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.255875 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3923  3-oxoadipate CoA-transferase  32.39 
 
 		 304 aa  105  1e-21  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.99885  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2696  Glutaconate CoA-transferase  27.76 
 
 		 322 aa  103  4e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2804  coenzyme A transferase  30.22 
 
 		 280 aa  103  4e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000211937 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2354  coenzyme A transferase  28.37 
 
 		 289 aa  103  4e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.20907  normal  0.0705771 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2605  coenzyme A transferase  29.34 
 
 		 280 aa  103  4e-21  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.315961  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4619  coenzyme A transferase  30.04 
 
 		 281 aa  102  7e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1644  glutaconate CoA-transferase  30.77 
 
 		 317 aa  101  2e-20  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0810  glutaconate CoA-transferase  28.71 
 
 		 325 aa  99.4  6e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.417423 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5132  coenzyme A transferase  32.48 
 
 		 268 aa  98.2  1e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.914807  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3827  coenzyme A transferase  27.68 
 
 		 290 aa  98.6  1e-19  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2072  coenzyme A transferase  26.6 
 
 		 294 aa  98.6  1e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2058  coenzyme A transferase  28.74 
 
 		 268 aa  97.8  2e-19  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.599622  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1076  coenzyme A transferase  32.03 
 
 		 272 aa  98.2  2e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.616034 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1472  coenzyme A transferase  29.6 
 
 		 251 aa  97.1  3e-19  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1380  coenzyme A transferase  30.51 
 
 		 261 aa  96.3  6e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.161573  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1221  coenzyme A transferase  32.17 
 
 		 272 aa  95.1  1e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1906  coenzyme A transferase  25.59 
 
 		 325 aa  92.4  8e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.0723821 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2744  coenzyme A transferase  29.43 
 
 		 293 aa  92.4  9e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.933072  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4600  putative glutaconate CoA-transferase, subunit A  31.09 
 
 		 269 aa  91.7  1e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3297  coenzyme A transferase  29.37 
 
 		 293 aa  92  1e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0965913 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2328  3-oxoadipate CoA-transferase  28.83 
 
 		 295 aa  90.9  2e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.504192 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2751  putative acyl CoA-transferase subunit A  30.63 
 
 		 276 aa  91.3  2e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000616772  normal  0.229124 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1489  coenzyme A transferase  27.43 
 
 		 296 aa  90.9  3e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2154  coenzyme A transferase  28.22 
 
 		 291 aa  90.1  4e-17  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4684  coenzyme A transferase  26.74 
 
 		 295 aa  88.6  1e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.537215  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4770  coenzyme A transferase  26.74 
 
 		 295 aa  88.6  1e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0352343  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5069  coenzyme A transferase  26.74 
 
 		 295 aa  87.8  2e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.539559 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2825  coenzyme A transferase  26.45 
 
 		 320 aa  87.4  3e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1387  coenzyme A transferase  26.13 
 
 		 320 aa  86.3  5e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2837  3-oxoadipate CoA-transferase  27.82 
 
 		 271 aa  86.3  5e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.351609  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5267  coenzyme A transferase  26.04 
 
 		 295 aa  86.3  7e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.174288 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3035  glutaconate CoA-transferase  25.81 
 
 		 321 aa  85.9  7e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1203  putative CoA transferase, subunit A  31.08 
 
 		 272 aa  85.9  9e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.917021 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3617  putative glutaconate CoA-transferase, subunit A  30.87 
 
 		 272 aa  85.1  0.000000000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.32721  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3982  coenzyme A transferase  26.78 
 
 		 297 aa  84  0.000000000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1134  coenzyme A transferase  26.46 
 
 		 299 aa  84  0.000000000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.012829  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1709  coenzyme A transferase  24.84 
 
 		 321 aa  83.2  0.000000000000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2285  coenzyme A transferase  28.1 
 
 		 276 aa  83.2  0.000000000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.275927  normal  0.260145 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3046  coenzyme A transferase  27.9 
 
 		 271 aa  82  0.00000000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.94721  normal  0.612276 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4180  3-oxoadipate CoA-transferase  25.82 
 
 		 297 aa  79.3  0.00000000000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13584  CoA-transferase subunit alpha  26.99 
 
 		 292 aa  77.8  0.0000000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.972  normal  0.101355 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0312  putative CoA transferase, subunit A  26.87 
 
 		 283 aa  77  0.0000000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7928  3-oxoadipate CoA-transferase  28.87 
 
 		 273 aa  76.6  0.0000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.386225  normal  0.327959 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38220  3-oxoadipate:succinyl-CoA transferase subunit A  28.81 
 
 		 289 aa  76.6  0.0000000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.722574  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02760  putative CoA transferase, subunit A  26.72 
 
 		 283 aa  75.1  0.000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0433466 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0299  coenzyme A transferase  27.76 
 
 		 273 aa  74.7  0.000000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12980  acyl CoA:acetate/3-ketoacid CoA transferase, alpha subunit  26.79 
 
 		 273 aa  73.9  0.000000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2561  coenzyme A transferase  25.26 
 
 		 331 aa  73.6  0.000000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1584  glutaconate CoA-transferase  29.18 
 
 		 286 aa  73.2  0.000000000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.803865  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4309  3-oxoadipate:succinyl-CoA transferase, subunit A  24.44 
 
 		 285 aa  73.2  0.000000000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4013  glutaconate CoA-transferase  24.81 
 
 		 285 aa  72.4  0.000000000009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0148032 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1267  coenzyme A transferase  24.11 
 
 		 285 aa  68.9  0.00000000009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5087  coenzyme A transferase  25.3 
 
 		 265 aa  64.3  0.000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.903463  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1136  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  26.92 
 
 		 217 aa  63.2  0.000000005  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3127  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  28.5 
 
 		 270 aa  61.2  0.00000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.400116  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0212  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  27.6 
 
 		 217 aa  61.2  0.00000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2658  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  28.04 
 
 		 272 aa  60.5  0.00000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1984  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  27.65 
 
 		 233 aa  58.9  0.0000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00015466 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0518  3-oxoacid CoA-transferase  23.04 
 
 		 253 aa  57.4  0.0000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.368438 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2608  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  28.11 
 
 		 235 aa  57  0.0000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.357891 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2003  3-oxoacid CoA-transferase, subunit A  28.02 
 
 		 220 aa  55.5  0.000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.881736  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1014  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  25.23 
 
 		 233 aa  55.5  0.000001  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.233795  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1846  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  26.05 
 
 		 228 aa  55.5  0.000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.257726  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0825  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  25.23 
 
 		 233 aa  55.1  0.000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3262  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  27.49 
 
 		 267 aa  53.9  0.000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.569935  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2497  coenzyme A transferase  30.54 
 
 		 590 aa  53.5  0.000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.501333  normal  0.32873 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02148  acetyl-CoA:acetoacetyl-CoA transferase, alpha subunit  24.79 
 
 		 220 aa  51.6  0.00002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.35571  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1437  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  24.79 
 
 		 220 aa  51.6  0.00002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.364395  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1108  3-oxoadipate CoA-succinyl transferase alpha subunit  26.51 
 
 		 234 aa  51.2  0.00002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.356707  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02107  hypothetical protein  24.79 
 
 		 220 aa  51.6  0.00002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.408134  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2343  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  26.89 
 
 		 252 aa  51.6  0.00002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000394864  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2362  acetyl-CoA:acetoacetyl-CoA transferase subunit alpha  24.79 
 
 		 220 aa  51.2  0.00002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0491  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  23.53 
 
 		 246 aa  51.6  0.00002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1550  3-oxoacid CoA-transferase subunit A  26.51 
 
 		 234 aa  51.2  0.00002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0213  3-oxoacid CoA-transferase subunit A  26.51 
 
 		 234 aa  51.2  0.00002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0677248  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1699  3-oxoacid CoA-transferase subunit A  26.51 
 
 		 234 aa  51.2  0.00002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.288367  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1725  3-oxoacid CoA-transferase subunit A  26.51 
 
 		 234 aa  51.2  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.796955  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0951  3-oxoacid CoA-transferase subunit A  26.51 
 
 		 234 aa  51.2  0.00002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0890692  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1429  acetyl-CoA:acetoacetyl-CoA transferase subunit alpha  24.79 
 
 		 220 aa  51.6  0.00002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00124064 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2370  acetyl-CoA:acetoacetyl-CoA transferase subunit alpha  24.79 
 
 		 220 aa  50.8  0.00002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0895417  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1877  3-oxoadipate CoA-succinyl transferase alpha subunit  26.51 
 
 		 234 aa  50.4  0.00003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0683608  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2969  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  24.77 
 
 		 235 aa  50.4  0.00003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.534819 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1855  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  27.93 
 
 		 217 aa  50.8  0.00003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.945952 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2823  coenzyme A transferase  24.77 
 
 		 285 aa  50.4  0.00003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3037  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  24.22 
 
 		 228 aa  50.4  0.00003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.625654  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1472  butyryl-CoA:acetoacetate CoA-transferase alpha subunit  26.52 
 
 		 220 aa  50.4  0.00004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.146026  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>