91 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_2069 on replicon NC_008254
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008254  Meso_2069  OmpA/MotB  100 
 
 
703 aa  1314    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0149284  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2055  OmpA/MotB domain protein  41.69 
 
 
742 aa  351  2e-95  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.124789  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2288  OmpA/MotB domain protein  39.46 
 
 
739 aa  340  5.9999999999999996e-92  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.540261 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3509  OmpA/MotB domain-containing protein  41.13 
 
 
742 aa  328  2.0000000000000001e-88  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2068  OmpA family protein  47.25 
 
 
880 aa  324  3e-87  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1587  OmpA/MotB domain-containing protein  53.85 
 
 
720 aa  297  4e-79  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.068035  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2802  OmpA/MotB  43.27 
 
 
663 aa  221  3.9999999999999997e-56  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.687378  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3622  OmpA/MotB  44.33 
 
 
673 aa  212  2e-53  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0476  OmpA/MotB  40.74 
 
 
697 aa  203  9.999999999999999e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.66276  normal  0.424488 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1486  OmpA/MotB domain protein  44.18 
 
 
666 aa  202  1.9999999999999998e-50  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.231029  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0065  OmpA/MotB  51.06 
 
 
617 aa  200  7e-50  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.656472  normal  0.842902 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0321  OmpA/MotB  43.29 
 
 
651 aa  199  1.0000000000000001e-49  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.210637  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4749  OmpA/MotB domain-containing protein  42.39 
 
 
717 aa  199  2.0000000000000003e-49  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0350948  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5216  OmpA/MotB domain protein  42.03 
 
 
723 aa  198  3e-49  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.152488 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0695  OmpA/MotB domain-containing protein  46.38 
 
 
624 aa  197  8.000000000000001e-49  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.430633 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0237  OmpA family protein  40.94 
 
 
727 aa  191  4e-47  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.95127 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0211  OmpA/MotB domain protein  48.56 
 
 
306 aa  188  3e-46  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.542857  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5566  OmpA/MotB domain-containing protein  45.75 
 
 
348 aa  181  4.999999999999999e-44  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1933  OmpA/MotB family outer membrane protein  39.44 
 
 
701 aa  180  7e-44  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0585  OmpA/MotB domain-containing protein  39.44 
 
 
701 aa  180  7e-44  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.610361  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0330  OmpA/MotB domain-containing protein  38.81 
 
 
730 aa  178  3e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.312966  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4324  OmpA/MotB domain-containing protein  34.55 
 
 
711 aa  136  9.999999999999999e-31  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1663  hypothetical protein  29.48 
 
 
2449 aa  76.3  0.000000000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0896  OmpA/MotB  36.73 
 
 
212 aa  75.9  0.000000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0555  hypothetical protein  38.39 
 
 
212 aa  73.9  0.000000000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.279361 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0909  OmpA/MotB domain-containing protein  41.12 
 
 
227 aa  72.8  0.00000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0900  OmpA/MotB  41.28 
 
 
208 aa  73.2  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0835  OmpA/MotB domain-containing protein  41.28 
 
 
213 aa  72  0.00000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.374195  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5159  OmpA/MotB domain protein  36.36 
 
 
216 aa  72.4  0.00000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.314153  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3121  OmpA/MotB domain protein  35.34 
 
 
192 aa  70.9  0.00000000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1008  OmpA/MotB  37.07 
 
 
212 aa  70.5  0.00000000009  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.223165  normal  0.0458619 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5487  cell wall anchor domain-containing protein  35.34 
 
 
3242 aa  68.9  0.0000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1403  OmpA/MotB domain protein  41.24 
 
 
213 aa  68.9  0.0000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0715247  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3028  OmpA/MotB  39.81 
 
 
213 aa  68.9  0.0000000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.251626  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2179  putative outer membrane adhesin like proteiin  55.93 
 
 
14916 aa  68.6  0.0000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_16331  hypothetical protein  43.7 
 
 
190 aa  67.4  0.0000000008  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.377957 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1901  OmpA/MotB domain protein  40.38 
 
 
335 aa  67.4  0.0000000008  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000028398  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4592  OmpA/MotB domain-containing protein  38.04 
 
 
296 aa  67  0.000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4115  OmpA/MotB domain-containing protein  36.7 
 
 
262 aa  66.2  0.000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3590  OmpA/MotB  44.23 
 
 
451 aa  66.2  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.663745 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4220  OmpA/MotB domain-containing protein  38.24 
 
 
263 aa  66.2  0.000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.956448  normal  0.667838 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2207  putative outer membrane protein of unknown function  35.66 
 
 
216 aa  66.6  0.000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.533668 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1422  OmpA/MotB domain-containing protein  36.26 
 
 
210 aa  66.6  0.000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0642505  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0870  OmpA/MotB  43.14 
 
 
220 aa  65.9  0.000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1012  OmpA/MotB  37.61 
 
 
217 aa  65.5  0.000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.0857514 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2923  cell wall surface anchor family protein  41.58 
 
 
746 aa  65.5  0.000000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3363  OmpA/MotB domain-containing protein  35.14 
 
 
261 aa  65.1  0.000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1502  OmpA/MotB domain protein  37.25 
 
 
263 aa  64.7  0.000000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0641332  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1338  OmpA family protein  36.13 
 
 
229 aa  64.7  0.000000006  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1336  OmpA/MotB domain protein  38.32 
 
 
222 aa  64.3  0.000000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.761552  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0277  OmpA/MotB domain protein  42.45 
 
 
204 aa  64.3  0.000000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2338  hypothetical protein  37.62 
 
 
1977 aa  64.3  0.000000008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3137  OmpA/MotB domain-containing protein  39.22 
 
 
254 aa  63.5  0.00000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.0526297 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0366  OmpA/MotB domain-containing protein  36.45 
 
 
359 aa  63.9  0.00000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.193162  normal  0.220878 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04793  OmpA family protein  40.65 
 
 
241 aa  62.8  0.00000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.188001  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3494  OmpA/MotB domain-containing protein  39.22 
 
 
254 aa  63.2  0.00000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.471457  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1107  OmpA/MotB domain-containing protein  34.86 
 
 
263 aa  62.8  0.00000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0122  OmpA/MotB domain protein  39.29 
 
 
310 aa  62.4  0.00000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1877  OmpA/MotB  43.27 
 
 
434 aa  62.4  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.0777893 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0843  OmpA/MotB  44.55 
 
 
1619 aa  62  0.00000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.516542  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23330  major outer membrane porin OprF  36.61 
 
 
351 aa  62  0.00000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0169824  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2208  ribonuclease, Rne/Rng family protein  31.62 
 
 
1065 aa  61.6  0.00000005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.162702 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0924  OmpA/MotB domain-containing protein  39.05 
 
 
356 aa  60.8  0.00000007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3529  outer membrane protein OprF precursor  35.48 
 
 
350 aa  60.8  0.00000009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0341835  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41570  major porin and structural outer membrane porin OprF precursor  35.48 
 
 
350 aa  60.8  0.00000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000484221  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2097  thrombospondin type 3 repeat-containing OmpA/MotB protein  36.61 
 
 
344 aa  60.5  0.0000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  unclonable  0.000000182424  decreased coverage  0.00163672 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3078  cellulosome anchoring protein, cohesin region  33.83 
 
 
2313 aa  59.3  0.0000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1777  OmpF  35.48 
 
 
344 aa  59.7  0.0000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.000465517  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1090  OmpA/MotB domain-containing protein  33.91 
 
 
367 aa  58.5  0.0000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000322286  normal  0.0373781 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1607  OmpF family protein  35.71 
 
 
345 aa  57.8  0.0000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  decreased coverage  0.00000281488  decreased coverage  0.0000000000176342 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1599  outer membrane fibronectin-binding protein  39.29 
 
 
333 aa  57.8  0.0000008  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  unclonable  0.00000000197596  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0783  hypothetical protein  40.4 
 
 
166 aa  57.8  0.0000008  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.024345  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0032  rhodanese-like protein  50.67 
 
 
248 aa  57.4  0.0000009  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3651  OmpF family protein  34.41 
 
 
344 aa  57.4  0.000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  decreased coverage  0.0000349757  normal  0.525566 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1600  OmpF family protein  34.41 
 
 
344 aa  57.4  0.000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000517848  decreased coverage  0.00289016 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2089  OmpF family protein  34.41 
 
 
344 aa  57.4  0.000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.437855  normal  0.0407434 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0451  hypothetical protein  36.61 
 
 
682 aa  56.2  0.000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.935118  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3545  OmpA family protein  35.19 
 
 
370 aa  55.5  0.000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0607  internalin, putative  37.5 
 
 
1088 aa  55.1  0.000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3048  OmpA/MotB domain-containing protein  35.19 
 
 
372 aa  54.7  0.000006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.00212901  normal  0.16507 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3909  OmpA/MotB domain protein  41.41 
 
 
202 aa  53.9  0.00001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3986  OmpA/MotB domain-containing protein  41.41 
 
 
202 aa  53.9  0.00001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1045  OmpA/MotB domain-containing protein  37.5 
 
 
363 aa  52  0.00003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000183072  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1146  OmpA/MotB domain-containing protein  37.5 
 
 
369 aa  51.6  0.00004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00262556  normal  0.603197 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2705  hypothetical protein  45.74 
 
 
524 aa  50.1  0.0001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2964  enterotoxin  42.25 
 
 
488 aa  48.5  0.0004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000376462 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3005  hypothetical protein  37.02 
 
 
570 aa  47.8  0.0007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0520915  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4807  ftsk/spoiiie family protein  44.92 
 
 
1284 aa  47.8  0.0008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2759  3D domain-containing protein  42.75 
 
 
575 aa  46.6  0.002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00579221  n/a   
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0060  surface layer protein  32 
 
 
484 aa  44.3  0.008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000340805  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2684  hypothetical protein  41.73 
 
 
524 aa  43.9  0.01  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0188967  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>