More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_1491 on replicon NC_008254
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004310  BR1387  hypothetical protein  85.6 
 
 		 373 aa  677    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.102316  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2514  exodeoxyribonuclease V protein, alpha subunit  82.13 
 
 		 375 aa  654    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.237198  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2770  exodeoxyribonuclease V protein, alpha subunit  82.4 
 
 		 375 aa  654    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.527428  normal  0.584188 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2796  exodeoxyribonuclease V  79.52 
 
 		 376 aa  641    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.517009  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1808  exodeoxyribonuclease V  85.6 
 
 		 373 aa  678    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.205321  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1491  exonuclease V subunit alpha  100 
 
 		 375 aa  771    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1343  hypothetical protein  85.07 
 
 		 373 aa  674    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.000254854  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1994  exodeoxyribonuclease V  82.4 
 
 		 375 aa  649    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0919  hypothetical protein  77.84 
 
 		 369 aa  595  1e-169  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.551853  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3505  putative deoxyribonuclease  60.7 
 
 		 363 aa  450  1e-125  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.618009  normal  0.621388 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2140  conserved hypothetical protein; putative deoxyribonuclease  61.23 
 
 		 363 aa  450  1e-125  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1859  hypothetical protein  59.21 
 
 		 369 aa  440  9.999999999999999e-123  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0594  exodeoxyribonuclease V  57.52 
 
 		 369 aa  436  1e-121  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0955  exodeoxyribonuclease V  59.15 
 
 		 369 aa  431  1e-120  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.219189 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0686  exodeoxyribonuclease V  57.52 
 
 		 369 aa  434  1e-120  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.150776  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1281  deoxyribonuclease  58.36 
 
 		 369 aa  428  1e-119  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0255  putative deoxyribonuclease  57.6 
 
 		 367 aa  425  1e-118  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.836307  normal  0.0109793 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4672  putative deoxyribonuclease  56.95 
 
 		 372 aa  425  1e-118  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.186884 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5462  putative deoxyribonuclease  57.75 
 
 		 368 aa  426  1e-118  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3837  putative deoxyribonuclease  57.82 
 
 		 397 aa  426  1e-118  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.738872  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0674  putative deoxyribonuclease  57.33 
 
 		 373 aa  427  1e-118  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.663725 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0685  putative deoxyribonuclease  57.33 
 
 		 373 aa  427  1e-118  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0151419 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1466  exodeoxyribonuclease V  57.94 
 
 		 369 aa  427  1e-118  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0648  conserved hypothetical protein; putative deoxyribonuclease  56.91 
 
 		 372 aa  424  1e-117  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.58481 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5077  putative deoxyribonuclease  54.57 
 
 		 365 aa  396  1e-109  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4249  putative deoxyribonuclease  55.38 
 
 		 365 aa  397  1e-109  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3841  putative deoxyribonuclease  55.11 
 
 		 365 aa  395  1e-109  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2487  putative deoxyribonuclease  55.38 
 
 		 365 aa  397  1e-109  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.280682  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4089  putative deoxyribonuclease  52 
 
 		 372 aa  359  5e-98  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2622  putative deoxyribonuclease  52.93 
 
 		 373 aa  359  5e-98  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013502  Rmar_2849  AAA ATPase  30.56 
 
 		 678 aa  134  1.9999999999999998e-30  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0353435  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3509  exonuclease V subunit alpha  25.65 
 
 		 924 aa  102  1e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.996983  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1226  exonuclease V subunit alpha  25.65 
 
 		 924 aa  102  1e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.688264 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1619  hypothetical protein  27.8 
 
 		 761 aa  102  2e-20  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  decreased coverage  0.00216862  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10593  ATP-dependent exoDNAse (exonuclease V), alpha subunit - helicase superfamily I member  25.6 
 
 		 476 aa  99  1e-19  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2772  Exodeoxyribonuclease V  28.96 
 
 		 653 aa  97.4  4e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00547941  hitchhiker  0.000384136 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1469  exonuclease V subunit alpha  25.41 
 
 		 480 aa  97.1  5e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.232256 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0826  helicase RecD/TraA  28.27 
 
 		 726 aa  96.7  7e-19  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.306624  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1852  ATPase  24.78 
 
 		 745 aa  94.7  2e-18  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0232  ATP-dependent exoDNAse (exonuclease V)  26.5 
 
 		 475 aa  95.1  2e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.14834  normal  0.233843 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4515  exonuclease V subunit alpha  24.73 
 
 		 469 aa  94.4  3e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1303  helicase, putative  26.61 
 
 		 471 aa  93.6  5e-18  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2850  putative ATPase  27.9 
 
 		 511 aa  92.8  8e-18  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.935903  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3625  AAA ATPase  27.89 
 
 		 511 aa  92.8  9e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.107724  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1461  exonuclease V subunit alpha  27.14 
 
 		 496 aa  92  1e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.00677876  normal  0.63958 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2665  ATP-dependent exoDNAse (exonuclease V)  26.29 
 
 		 474 aa  92.4  1e-17  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3101  ATPase  26.61 
 
 		 517 aa  90.1  6e-17  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.422259  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2619  AAA ATPase  28.12 
 
 		 566 aa  89  1e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1186  exonuclease V subunit alpha  28.86 
 
 		 792 aa  89.4  1e-16  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000641615  normal  0.675634 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0246  RecD/TraA family helicase  27.3 
 
 		 742 aa  88.2  2e-16  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3010  AAA ATPase  27.86 
 
 		 563 aa  88.6  2e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.71626 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0521  ATP-dependent exodeoxyribonuclease  25.49 
 
 		 473 aa  87.4  3e-16  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0608  ATP-dependent RecD/TraA family DNA helicase  28.12 
 
 		 825 aa  87.4  3e-16  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0847  ATPase  29.5 
 
 		 515 aa  87.8  3e-16  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.102768 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0959  ATPase  27.9 
 
 		 566 aa  87  5e-16  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.975549  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3584  Exodeoxyribonuclease V  27.5 
 
 		 720 aa  86.3  8e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0250312  normal  0.68504 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2305  AAA ATPase  27.57 
 
 		 747 aa  86.3  9e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.476827  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl322  exodeoxyribonuclease V  26.63 
 
 		 743 aa  85.9  0.000000000000001  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000862926  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0847  helicase RecD/TraA  26.08 
 
 		 738 aa  85.9  0.000000000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1047  helicase, RecD/TraA family  26.41 
 
 		 711 aa  83.6  0.000000000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.604739  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4487  Exodeoxyribonuclease V  25.85 
 
 		 738 aa  83.6  0.000000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00100877  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0838  RecD/TraA family helicase  26.89 
 
 		 731 aa  83.2  0.000000000000007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4895  exodeoxyribonuclease V  29.03 
 
 		 776 aa  82.4  0.00000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.382382  normal  0.0563011 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0455  RecD/TraA family helicase  26.18 
 
 		 731 aa  82.4  0.00000000000001  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.232252  n/a   
 
 
-
 
NC_014214  Mesil_3656  AAA ATPase  27.54 
 
 		 641 aa  81.6  0.00000000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.29435  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2658  Exodeoxyribonuclease V  28.64 
 
 		 659 aa  80.9  0.00000000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0285632  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8706  helicase, RecD/TraA family  28.86 
 
 		 740 aa  79.3  0.0000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.671857  normal  0.279794 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0956  helicase, RecD/TraA family  26.81 
 
 		 786 aa  78.6  0.0000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3380  RecD/TraA family helicase  25.12 
 
 		 742 aa  77  0.0000000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.586227 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2311  helicase, RecD/TraA family  26.3 
 
 		 726 aa  77  0.0000000000006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2085  exodeoxyribonuclease V  25 
 
 		 732 aa  76.6  0.0000000000006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5748  helicase, RecD/TraA family  27.94 
 
 		 768 aa  76.6  0.0000000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0306  AAA ATPase  24.48 
 
 		 710 aa  76.6  0.0000000000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.933314  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2403  helicase, RecD/TraA family  24.06 
 
 		 747 aa  76.6  0.0000000000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.934653 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0818  RecD/TraA family helicase  24.63 
 
 		 688 aa  76.3  0.0000000000008  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.662153  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0993  helicase, RecD/TraA family  25.9 
 
 		 728 aa  76.3  0.0000000000008  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2495  helicase, RecD/TraA family  25.97 
 
 		 784 aa  76.3  0.0000000000009  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1710  RecD/TraA family helicase  25.34 
 
 		 825 aa  75.9  0.000000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1757  helicase, RecD/TraA family  25.84 
 
 		 746 aa  75.9  0.000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0947  helicase, RecD/TraA family  25.25 
 
 		 740 aa  75.5  0.000000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2733  helicase, RecD/TraA family  26.8 
 
 		 762 aa  75.9  0.000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0135188  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4241  RecD/TraA family helicase  25 
 
 		 778 aa  75.9  0.000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1676  RecD/TraA family helicase  25.34 
 
 		 825 aa  75.9  0.000000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0183  hypothetical protein  25.18 
 
 		 879 aa  75.1  0.000000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1183  RecD/TraA family helicase  26.92 
 
 		 810 aa  74.3  0.000000000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf852  exodeoxyribonuclease V, alpha subunit  26.08 
 
 		 732 aa  74.3  0.000000000003  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2433  RecD/TraA family helicase  24.27 
 
 		 744 aa  74.3  0.000000000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2143  RecD/TraA family helicase  24.27 
 
 		 744 aa  74.3  0.000000000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3839  helicase, RecD/TraA family  25.37 
 
 		 750 aa  74.7  0.000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0839164  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0696  ATP-dependent RecD/TraA family DNA helicase  26.56 
 
 		 795 aa  74.7  0.000000000003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1742  exonuclease V subunit alpha  26.01 
 
 		 834 aa  74.3  0.000000000003  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0302  exodeoxyribonuclease V, alpha subunit  25.18 
 
 		 744 aa  73.9  0.000000000004  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1753  helicase RecD/TraA  24.35 
 
 		 736 aa  73.9  0.000000000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.473009  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2726  helicase, RecD/TraA family  24.52 
 
 		 741 aa  74.3  0.000000000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000501325  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6026  helicase, RecD/TraA family  24.15 
 
 		 742 aa  73.9  0.000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.143293  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5319  helicase, RecD/TraA family  25.55 
 
 		 750 aa  73.9  0.000000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.481799  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0169  hypothetical protein  25.37 
 
 		 881 aa  73.9  0.000000000005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0244  helicase, RecD/TraA family  26.3 
 
 		 728 aa  73.6  0.000000000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0667  helicase, RecD/TraA family  26.47 
 
 		 728 aa  73.6  0.000000000005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0540027  normal  0.0105669 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0989  helicase, RecD/TraA family  25.81 
 
 		 738 aa  73.6  0.000000000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>