57 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbur_0314 on replicon NC_007955
Organism: Methanococcoides burtonii DSM 6242



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007955  Mbur_0314  cadherin  100 
 
 		 1021 aa  2053    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3540  putative adhesin or RTX toxin  32.91 
 
 		 2060 aa  136  1.9999999999999998e-30  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3182  putative outer membrane adhesin like proteiin  32.49 
 
 		 2678 aa  134  9e-30  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1797  hypothetical protein  33.33 
 
 		 405 aa  113  2.0000000000000002e-23  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  unclonable  0.000000000782574  normal  1 
 
 
 
NC_007955  Mbur_1549  Pyrrolo-quinoline quinone  34.36 
 
 		 656 aa  109  3e-22  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.259742  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3182  putative outer membrane adhesin-like protein  28.88 
 
 		 3132 aa  106  2e-21  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2931  cell surface protein  29.91 
 
 		 940 aa  105  3e-21  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0750354  hitchhiker  0.00446431 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3145  hypothetical protein  32.39 
 
 		 1096 aa  104  8e-21  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.404826  normal  0.106206 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1928  hypothetical protein  33.94 
 
 		 525 aa  103  1e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.361746  normal  0.675694 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3706  hypothetical protein  33.64 
 
 		 771 aa  99.4  3e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1644  hypothetical protein  34.67 
 
 		 416 aa  96.3  3e-18  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0698  cell surface protein  33.55 
 
 		 586 aa  92.8  3e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.497702 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2198  hypothetical protein  37.91 
 
 		 747 aa  90.5  1e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0450097  normal  0.656514 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2108  hypothetical protein  31.28 
 
 		 373 aa  90.1  2e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1197  hypothetical protein  27.68 
 
 		 631 aa  88.2  8e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2670  hypothetical protein  32.68 
 
 		 635 aa  87.4  0.000000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.734137  normal  0.611525 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3494  hypothetical protein  33.73 
 
 		 861 aa  84  0.00000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00785016  normal  0.357624 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1864  hypothetical protein  30.46 
 
 		 656 aa  83.2  0.00000000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.935351  normal  0.282908 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1743  hypothetical protein  31.68 
 
 		 926 aa  82.8  0.00000000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.274233  normal  0.78184 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0125  hypothetical protein  31.61 
 
 		 418 aa  74.7  0.000000000008  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3974  alpha-L-rhamnosidase  42.05 
 
 		 733 aa  72.4  0.00000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.559372  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2006  hypothetical protein  29.03 
 
 		 435 aa  71.6  0.00000000007  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6131  alpha-L-rhamnosidase  30.77 
 
 		 755 aa  70.9  0.0000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1069  PKD domain-containing protein  29.38 
 
 		 1783 aa  71.2  0.0000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.62393 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0172  alpha-L-rhamnosidase  45.21 
 
 		 894 aa  67.4  0.000000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.192026 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3887  alpha-L-rhamnosidase  40.54 
 
 		 904 aa  67  0.000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0156  alpha-L-rhamnosidase  34.09 
 
 		 1084 aa  67  0.000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3899  alpha-L-rhamnosidase domain protein  36.84 
 
 		 910 aa  65.5  0.000000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.019543  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1249  alpha-L-rhamnosidase  38.36 
 
 		 951 aa  65.1  0.000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0242132 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3741  alpha-L-rhamnosidase  36.49 
 
 		 1107 aa  63.5  0.00000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00158847  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6430  alpha-L-rhamnosidase  36.17 
 
 		 757 aa  63.2  0.00000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4085  alpha-L-rhamnosidase  31.82 
 
 		 926 aa  62.8  0.00000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.394304  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2759  alpha-L-rhamnosidase  38.89 
 
 		 916 aa  61.6  0.00000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.534251  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2783  alpha-L-rhamnosidase  35.62 
 
 		 941 aa  60.5  0.0000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.666994  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4080  alpha-L-rhamnosidase  45.07 
 
 		 916 aa  60.1  0.0000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2735  alpha-L-rhamnosidase  31.94 
 
 		 899 aa  59.7  0.0000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.133276  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4188  alpha-L-rhamnosidase  36.11 
 
 		 909 aa  59.3  0.0000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0297646  normal  0.0625599 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0689  alpha-L-rhamnosidase  33.78 
 
 		 935 aa  58.5  0.0000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1807  alpha-L-rhamnosidase  33.8 
 
 		 1251 aa  58.9  0.0000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0999515  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6551  alpha-L-rhamnosidase  29.52 
 
 		 1061 aa  57.4  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.585079  hitchhiker  0.000045666 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2781  alpha-L-rhamnosidase  35.37 
 
 		 910 aa  57.4  0.000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1682  alpha-L-rhamnosidase  30.28 
 
 		 876 aa  56.6  0.000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000411087  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1874  alpha-L-rhamnosidase  28.38 
 
 		 895 aa  55.5  0.000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.881972 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0284  LVIVD repeat-containing protein  28.71 
 
 		 882 aa  55.5  0.000006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.635237  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3580  alpha-L-rhamnosidase  32.88 
 
 		 918 aa  55.1  0.000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0618383  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0884  KP-43 peptidase  26.83 
 
 		 2552 aa  55.1  0.000007  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.92948  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1212  Ig domain-containing protein  29.63 
 
 		 1279 aa  53.9  0.00002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1213  Ig domain-containing protein  30 
 
 		 1361 aa  53.1  0.00003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.406135  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3063  alpha-L-rhamnosidase  36.99 
 
 		 941 aa  51.2  0.0001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.813349  hitchhiker  0.00138683 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0937  KP-43 peptidase  30.94 
 
 		 1351 aa  51.2  0.0001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.215277  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3064  hypothetical protein  35.14 
 
 		 168 aa  50.4  0.0002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.187552  normal  0.503908 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1672  beta strand repeat-containing protein  33.93 
 
 		 3391 aa  49.7  0.0003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0848841 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0714  Cadherin  33.02 
 
 		 1134 aa  49.3  0.0004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.48369  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1907  PKD domain-containing protein  36.51 
 
 		 910 aa  47  0.002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08465  alpha-rhamnosidase (Eurofung)  34.25 
 
 		 914 aa  47.4  0.002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.638531  normal  0.620989 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0435  alpha-L-rhamnosidase  33.33 
 
 		 910 aa  46.6  0.003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0279  cadherin domain/calx-beta domain-containing protein  29.06 
 
 		 5899 aa  46.2  0.003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>