More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mboo_2294 on replicon NC_009712
Organism: Candidatus Methanoregula boonei 6A8



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009051  Memar_0461  translation initiation factor IF-2  67.97 
 
 		 593 aa  850    Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0535363  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3384  translation initiation factor IF-2  52.53 
 
 		 591 aa  642    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.0000114381  normal  0.0283403 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2294  translation initiation factor IF-2  100 
 
 		 591 aa  1201    Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2489  translation initiation factor IF-2  68.93 
 
 		 604 aa  842    Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0339  translation initiation factor IF-2  73.08 
 
 		 593 aa  911    Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.618473 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0223  translation initiation factor IF-2  53.64 
 
 		 591 aa  650    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0201203  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1520  translation initiation factor IF-2  64.68 
 
 		 589 aa  792    Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.537265  normal  0.628449 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1302  translation initiation factor IF-2  52.63 
 
 		 602 aa  632  1e-180  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0942  translation initiation factor aIF-2  51.96 
 
 		 578 aa  624  1e-177  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0755  translation initiation factor aIF-2  48.07 
 
 		 599 aa  588  1e-166  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2060  translation initiation factor IF-2  47.04 
 
 		 597 aa  575  1.0000000000000001e-163  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.280189  normal  0.136093 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2715  translation initiation factor aIF-2  47.9 
 
 		 607 aa  577  1.0000000000000001e-163  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1312  translation initiation factor IF-2  49.24 
 
 		 604 aa  576  1.0000000000000001e-163  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.662538  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2679  translation initiation factor IF-2  48.15 
 
 		 602 aa  552  1e-156  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0901  translation initiation factor IF-2  45.74 
 
 		 598 aa  526  1e-148  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1389  translation initiation factor IF-2  45.08 
 
 		 598 aa  519  1e-146  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0669  translation initiation factor IF-2  44.74 
 
 		 598 aa  515  1.0000000000000001e-145  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1287  translation initiation factor IF-2  45.08 
 
 		 598 aa  513  1e-144  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.492003 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1296  translation initiation factor IF-2  44.91 
 
 		 598 aa  500  1e-140  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1206  translation initiation factor aIF-2  42.31 
 
 		 600 aa  475  1e-132  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.142011  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0030  translation initiation factor IF-2  40.34 
 
 		 597 aa  467  9.999999999999999e-131  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.0331491 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0229  translation initiation factor IF-2  41.64 
 
 		 593 aa  462  1e-129  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1600  translation initiation factor IF-2  41.86 
 
 		 588 aa  462  1e-129  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0628  translation initiation factor IF-2  42.13 
 
 		 592 aa  456  1e-127  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0631  translation initiation factor IF-2  42.03 
 
 		 589 aa  458  1e-127  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.39875  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0638  translation initiation factor IF-2  42.23 
 
 		 592 aa  456  1e-127  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0499  translation initiation factor IF-2  42.16 
 
 		 601 aa  445  1e-123  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.116589  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0457  translation initiation factor IF-2  41.2 
 
 		 594 aa  432  1e-120  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.202965 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_48964  predicted protein  36.56 
 
 		 623 aa  377  1e-103  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.241447  normal  0.306586 
 
 
-
 
NC_006684  CNB01090  GTPase, putative  35.36 
 
 		 1228 aa  364  3e-99  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.560658  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04038  mitochondrial translation initiation factor IF-2, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G03970)  35.85 
 
 		 1072 aa  333  5e-90  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_82202  predicted protein  36.75 
 
 		 997 aa  329  1.0000000000000001e-88  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.236958  normal  1 
 
 
-
 
NC_011695  PHATRDRAFT_16603  predicted protein  34.46 
 
 		 599 aa  314  3.9999999999999997e-84  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.212191  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1645  translation initiation factor IF-2  31.97 
 
 		 692 aa  192  2e-47  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0509218  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1940  translation initiation factor IF-2  30.96 
 
 		 679 aa  183  6e-45  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.995818  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1658  translation initiation factor IF-2  30.96 
 
 		 679 aa  183  7e-45  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2710  translation initiation factor IF-2  30.94 
 
 		 992 aa  177  6e-43  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3393  translation initiation factor IF-2  30.58 
 
 		 992 aa  177  7e-43  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.718402 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0355  translation initiation factor IF-2  30.6 
 
 		 903 aa  175  1.9999999999999998e-42  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  unclonable  0.000123126  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1309  translation initiation factor IF-2  29.02 
 
 		 924 aa  174  5e-42  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0121044  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1025  translation initiation factor IF-2  30.18 
 
 		 1183 aa  174  5e-42  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1662  translation initiation factor IF-2  29.93 
 
 		 822 aa  174  5.999999999999999e-42  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.775404  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0599  translation initiation factor IF-2  30.63 
 
 		 1042 aa  173  7.999999999999999e-42  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18951  translation initiation factor IF-2  30.18 
 
 		 1183 aa  172  1e-41  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2774  translation initiation factor IF-2  29.87 
 
 		 1131 aa  172  2e-41  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0650084  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2081  translation initiation factor IF-2  29.7 
 
 		 1104 aa  171  4e-41  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1050  translation initiation factor 2  29.93 
 
 		 903 aa  171  4e-41  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.000000107022  unclonable  0.0000000303018 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2020  translation initiation factor IF-2  29.95 
 
 		 1030 aa  170  6e-41  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.340482 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3976  translation initiation factor 2  29.91 
 
 		 1059 aa  169  2e-40  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0900  translation initiation factor IF-2  28.73 
 
 		 882 aa  168  2e-40  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.437883  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0592  translation initiation factor IF-2  29.66 
 
 		 1176 aa  167  4e-40  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0910  translation initiation factor IF-2  29.93 
 
 		 656 aa  167  4e-40  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0157  translation initiation factor IF-2  29.24 
 
 		 905 aa  167  5.9999999999999996e-40  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1957  translation initiation factor IF-2  31.25 
 
 		 985 aa  167  6.9999999999999995e-40  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0836  translation initiation factor IF-2  29.2 
 
 		 720 aa  166  8e-40  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_16741  translation initiation factor IF-2  28.62 
 
 		 1161 aa  166  1.0000000000000001e-39  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_04131  translation initiation factor IF-2  30 
 
 		 1124 aa  166  1.0000000000000001e-39  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1934  translation initiation factor IF-2  28.93 
 
 		 571 aa  166  2.0000000000000002e-39  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.0000776037  hitchhiker  0.0000000112049 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0074  translation initiation factor IF-2  30.1 
 
 		 908 aa  165  2.0000000000000002e-39  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0422922  normal  0.247669 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3221  translation initiation factor IF-2  29.43 
 
 		 815 aa  166  2.0000000000000002e-39  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.109257 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1493  translation initiation factor IF-2  31.13 
 
 		 838 aa  165  2.0000000000000002e-39  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  decreased coverage  0.00496659  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0570  translation initiation factor IF-2  30.71 
 
 		 928 aa  164  3e-39  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16161  translation initiation factor IF-2  29.29 
 
 		 1113 aa  164  3e-39  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.446889  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1012  translation initiation factor IF-2  31.32 
 
 		 854 aa  164  4.0000000000000004e-39  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  decreased coverage  0.000000897592  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1329  translation initiation factor IF-2  28.14 
 
 		 705 aa  164  5.0000000000000005e-39  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1355  translation initiation factor IF-2  28.14 
 
 		 705 aa  164  5.0000000000000005e-39  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.657841  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3554  translation initiation factor IF-2  28.88 
 
 		 686 aa  162  1e-38  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3572  translation initiation factor IF-2  28.88 
 
 		 686 aa  162  1e-38  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0069  translation initiation factor IF-2  29.93 
 
 		 908 aa  163  1e-38  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.00377162  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1495  translation initiation factor IF-2  29.87 
 
 		 885 aa  163  1e-38  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0130747  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1411  translation initiation factor 2  29.16 
 
 		 689 aa  162  1e-38  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3851  translation initiation factor IF-2  28.7 
 
 		 686 aa  162  2e-38  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.970916  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2120  translation initiation factor IF-2  29.86 
 
 		 845 aa  162  2e-38  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0599462  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1587  translation initiation factor IF-2  28.21 
 
 		 1128 aa  162  2e-38  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.73073  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2357  translation initiation factor IF-2  30.65 
 
 		 1101 aa  162  2e-38  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3860  translation initiation factor IF-2  28.7 
 
 		 686 aa  162  2e-38  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000141928  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3911  translation initiation factor IF-2  28.88 
 
 		 686 aa  162  2e-38  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.188142  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1051  translation initiation factor IF-2  29.95 
 
 		 845 aa  162  2e-38  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000251511  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1333  translation initiation factor IF-2  28.98 
 
 		 688 aa  162  2e-38  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0112644  hitchhiker  0.000569775 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2465  translation initiation factor IF-2  29 
 
 		 689 aa  161  2e-38  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000966946  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3664  translation initiation factor IF-2  28.7 
 
 		 686 aa  161  3e-38  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3950  translation initiation factor IF-2  28.7 
 
 		 686 aa  161  3e-38  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.373868  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0057  translation initiation factor IF-2  28.57 
 
 		 921 aa  160  5e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0153  translation initiation factor IF-2  28.19 
 
 		 693 aa  160  6e-38  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000770227  n/a   
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_33386  mitochondrial translation initiation factor 2  32.21 
 
 		 683 aa  160  6e-38  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.330812  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0151  translation initiation factor IF-2  28.55 
 
 		 690 aa  160  7e-38  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.000351563  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1236  translation initiation factor IF-2  28.75 
 
 		 601 aa  160  8e-38  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0135157  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_16851  translation initiation factor IF-2  28.21 
 
 		 1114 aa  160  8e-38  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1155  translation initiation factor IF-2  26.81 
 
 		 732 aa  159  1e-37  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000874472  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_16981  translation initiation factor IF-2  28.39 
 
 		 1126 aa  159  1e-37  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1473  translation initiation factor IF-2  29.32 
 
 		 579 aa  159  1e-37  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.147864  unclonable  0.00000476955 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3635  translation initiation factor IF-2  28.34 
 
 		 688 aa  159  1e-37  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0196676  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07840  translation initiation factor IF-2  28.01 
 
 		 686 aa  159  2e-37  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1208  translation initiation factor IF-2  32.01 
 
 		 658 aa  158  2e-37  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000392009  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1864  translation initiation factor IF-2  29.81 
 
 		 876 aa  158  2e-37  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0480  translation initiation factor IF-2  29.03 
 
 		 880 aa  158  2e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.471358  normal  0.3853 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0222  translation initiation factor IF-2  28.42 
 
 		 877 aa  158  3e-37  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.0273572  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1679  translation initiation factor IF-2  29.27 
 
 		 914 aa  158  3e-37  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.010886  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3348  translation initiation factor IF-2  29.29 
 
 		 848 aa  158  3e-37  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0346308  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0024  translation initiation factor IF-2  31.81 
 
 		 871 aa  157  4e-37  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0480379 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>