More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A2247 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007355  Mbar_A2247  site-specific recombinase  100 
 
 		 315 aa  657    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.0011212  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3592  integrase family protein  26.25 
 
 		 353 aa  104  2e-21  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1808  integrase family protein  26.45 
 
 		 345 aa  99.4  7e-20  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2505  integrase family protein  25.97 
 
 		 345 aa  98.6  1e-19  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.600696  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0676  tyrosine recombinase XerD subunit  28.47 
 
 		 296 aa  98.6  1e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1215  tyrosine recombinase XerD  28.52 
 
 		 302 aa  97.8  2e-19  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.157843  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0154  integrase domain protein SAM domain protein  26.04 
 
 		 353 aa  98.2  2e-19  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.32279  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1216  integrase family protein  25.44 
 
 		 344 aa  97.4  3e-19  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00000753673 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_998  integrase/recombinase  27.45 
 
 		 302 aa  96.7  5e-19  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1025  tyrosine recombinase XerD subunit  27.87 
 
 		 302 aa  93.6  4e-18  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1473  tyrosine recombinase XerD  28.33 
 
 		 296 aa  93.2  5e-18  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.202075  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1668  tyrosine recombinase XerD subunit  27.3 
 
 		 295 aa  91.3  2e-17  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.179488  normal  0.0195248 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0435  integrase family protein  26.44 
 
 		 299 aa  90.5  3e-17  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2052  tyrosine recombinase XerD  25.57 
 
 		 296 aa  90.5  3e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2257  site-specific tyrosine recombinase XerD  28.15 
 
 		 299 aa  89.7  6e-17  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.977256  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1982  tyrosine recombinase XerC  27.36 
 
 		 298 aa  89.4  7e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0026523  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0519  phage integrase family protein  26.94 
 
 		 300 aa  87.8  2e-16  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.24612  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1524  integrase family protein  26.55 
 
 		 300 aa  87.4  2e-16  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.681425  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0047  integrase family protein  26.98 
 
 		 314 aa  87.8  2e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.456307  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0602  phage integrase family protein  26.56 
 
 		 317 aa  86.7  5e-16  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00243284  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1225  integrase family protein  25.71 
 
 		 301 aa  85.1  0.000000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.103765  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1099  tyrosine recombinase XerD  26.42 
 
 		 296 aa  85.5  0.000000000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0863  phage integrase family protein  27.72 
 
 		 313 aa  84.7  0.000000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1450  integrase family protein  27.24 
 
 		 299 aa  84  0.000000000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00858396  normal  0.734684 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0367  site-specific tyrosine recombinase XerD  25 
 
 		 298 aa  83.2  0.000000000000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0106  phage integrase family protein  26.41 
 
 		 295 aa  82.8  0.000000000000007  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08760  tyrosine recombinase XerD  25.08 
 
 		 309 aa  82.8  0.000000000000007  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.940341  unclonable  0.00000000128305 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1028  tyrosine recombinase XerD subunit  25.96 
 
 		 313 aa  80.9  0.00000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00856798  unclonable  0.00000000634873 
 
 
-
 
NC_009469  Acry_3505  phage integrase family protein  25.48 
 
 		 330 aa  81.3  0.00000000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.431904  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2788  site-specific tyrosine recombinase XerD  24.58 
 
 		 296 aa  80.9  0.00000000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000777667  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0078  phage integrase family protein  25.27 
 
 		 319 aa  80.1  0.00000000000004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0159  integrase family protein  25.56 
 
 		 295 aa  80.1  0.00000000000005  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2105  tyrosine recombinase XerD  24.32 
 
 		 297 aa  79.7  0.00000000000005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.179497  hitchhiker  0.00877552 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1320  tyrosine recombinase XerD  24.66 
 
 		 302 aa  79.3  0.00000000000007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1266  tyrosine recombinase XerD  25.66 
 
 		 310 aa  79.3  0.00000000000007  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3920  site-specific tyrosine recombinase XerD  23.92 
 
 		 296 aa  79.3  0.00000000000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00000317777  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1821  integrase family protein  23.72 
 
 		 307 aa  79.3  0.00000000000008  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0364742  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4222  site-specific tyrosine recombinase XerD  24.25 
 
 		 296 aa  79  0.0000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00160259  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4158  site-specific tyrosine recombinase XerD  24.25 
 
 		 296 aa  79  0.0000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.44443  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3999  site-specific tyrosine recombinase XerD  24.25 
 
 		 296 aa  78.6  0.0000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.189801  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3830  site-specific tyrosine recombinase XerD  24.25 
 
 		 296 aa  78.6  0.0000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1751  tyrosine recombinase XerD  23.41 
 
 		 294 aa  79  0.0000000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4311  site-specific tyrosine recombinase XerD  24.25 
 
 		 296 aa  78.6  0.0000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.789664  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4113  site-specific tyrosine recombinase XerD  24.25 
 
 		 296 aa  78.6  0.0000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.00015e-24 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3846  site-specific tyrosine recombinase XerD  24.25 
 
 		 296 aa  78.2  0.0000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0256715  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0235  Integrase  23.84 
 
 		 308 aa  78.2  0.0000000000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.386202  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0722  phage integrase family protein  23.32 
 
 		 306 aa  77.8  0.0000000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.0599364 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3654  site-specific tyrosine recombinase XerC  25.32 
 
 		 301 aa  78.2  0.0000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000489449  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3590  site-specific tyrosine recombinase XerC  25.81 
 
 		 299 aa  77.4  0.0000000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0796955  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4199  site-specific tyrosine recombinase XerD  23.92 
 
 		 296 aa  77.4  0.0000000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00345142  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1038  site-specific tyrosine recombinase XerD  23.92 
 
 		 296 aa  77.4  0.0000000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00331502  normal  0.0102802 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3873  site-specific tyrosine recombinase XerC  25.81 
 
 		 299 aa  77  0.0000000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00557083  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3682  site-specific tyrosine recombinase XerC  25.81 
 
 		 299 aa  77  0.0000000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.245295  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3572  site-specific tyrosine recombinase XerC  25.81 
 
 		 299 aa  77  0.0000000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000685052  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1314  site-specific tyrosine recombinase XerC  25.48 
 
 		 299 aa  77  0.0000000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000019497  unclonable  8.39468e-26 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5348  integrase family protein  23.57 
 
 		 330 aa  77  0.0000000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.464558 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3969  site-specific tyrosine recombinase XerC  25.81 
 
 		 299 aa  77  0.0000000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000391393  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2228  integrase family protein  23.57 
 
 		 330 aa  77  0.0000000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.763924 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3843  site-specific tyrosine recombinase XerC  25.81 
 
 		 299 aa  77  0.0000000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  4.27577e-62 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2008  integrase family protein  23.57 
 
 		 330 aa  77  0.0000000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.461761  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3878  site-specific tyrosine recombinase XerC  25.81 
 
 		 299 aa  76.6  0.0000000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000107327  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0279  phage integrase family protein  24.45 
 
 		 282 aa  76.6  0.0000000000006  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.033075  hitchhiker  0.000013626 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3929  site-specific tyrosine recombinase XerC  25.48 
 
 		 299 aa  76.3  0.0000000000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000313294  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0124  phage integrase family protein  25.25 
 
 		 298 aa  75.1  0.000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.776243  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_63  site-specific recombinase, phage integrase family  27.24 
 
 		 332 aa  75.1  0.000000000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1082  integrase family protein  25.22 
 
 		 290 aa  74.7  0.000000000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0660  integrase family protein  24.82 
 
 		 284 aa  74.7  0.000000000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0285  tyrosine recombinase XerC  25.5 
 
 		 302 aa  74.7  0.000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1383  integrase family protein  25.25 
 
 		 307 aa  73.9  0.000000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4696  integrase family protein  27.39 
 
 		 306 aa  74.3  0.000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2699  integrase family protein  23.56 
 
 		 327 aa  73.9  0.000000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0421  integrase family protein  23.51 
 
 		 329 aa  73.9  0.000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0358  integrase family protein  25.96 
 
 		 287 aa  73.9  0.000000000003  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0487  tyrosine recombinase XerC  23.15 
 
 		 293 aa  73.9  0.000000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000269064 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0678  tyrosine recombinase XerD  23.81 
 
 		 294 aa  73.6  0.000000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0265142 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0470  tyrosine recombinase XerC  24.08 
 
 		 293 aa  73.6  0.000000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3715  integrase family protein  25.57 
 
 		 298 aa  73.9  0.000000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0772  phage integrase  26.4 
 
 		 304 aa  73.2  0.000000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.672054 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4151  site-specific tyrosine recombinase XerD  24.83 
 
 		 298 aa  72.8  0.000000000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.596099 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0651  tyrosine recombinase XerC subunit  24.24 
 
 		 307 aa  72.8  0.000000000007  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0716  tyrosine recombinase XerC  24.66 
 
 		 307 aa  72.8  0.000000000008  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.841608  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0607  recombinase  24.56 
 
 		 296 aa  72.8  0.000000000008  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1932  tyrosine recombinase XerD  21.77 
 
 		 310 aa  72.4  0.000000000009  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1468  site-specific tyrosine recombinase XerD  24.59 
 
 		 298 aa  72  0.00000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.208903 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0817  tyrosine recombinase XerD  24.84 
 
 		 305 aa  71.6  0.00000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.763193  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4253  site-specific tyrosine recombinase XerD  24.59 
 
 		 298 aa  72  0.00000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5408  phage integrase family protein  23.44 
 
 		 330 aa  72.4  0.00000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.123433 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1786  tyrosine recombinase XerD  24.74 
 
 		 291 aa  72  0.00000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0596225  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1513  site-specific recombinase  23.75 
 
 		 295 aa  71.6  0.00000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.110584  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0590  tyrosine recombinase XerD  23.47 
 
 		 306 aa  71.2  0.00000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2844  integrase family protein  21.82 
 
 		 329 aa  71.2  0.00000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4524  Phage integrase  27.1 
 
 		 310 aa  71.6  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0872  phage integrase family protein  24.41 
 
 		 324 aa  70.9  0.00000000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0884  integrase  23.96 
 
 		 302 aa  71.2  0.00000000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.161871  hitchhiker  0.000000000000894527 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1185  tyrosine recombinase XerD  26.01 
 
 		 310 aa  71.6  0.00000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.497096  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1478  integrase/recombinase XerD  24.5 
 
 		 298 aa  70.5  0.00000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0755097  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_623  site-specific recombinase  25.51 
 
 		 307 aa  70.9  0.00000000003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39510  site-specific tyrosine recombinase XerD  23.41 
 
 		 298 aa  70.5  0.00000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0758  phage integrase family protein  23.57 
 
 		 304 aa  70.9  0.00000000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  decreased coverage  0.000222973  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09270  tyrosine recombinase XerC subunit  24.16 
 
 		 346 aa  70.9  0.00000000003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.111586  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>