More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Htur_1808 on replicon NC_013743
Organism: Haloterrigena turkmenica DSM 5511



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013743  Htur_1808  integrase family protein  100 
 
 		 345 aa  709    Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3592  integrase family protein  61.42 
 
 		 353 aa  429  1e-119  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1216  integrase family protein  61.95 
 
 		 344 aa  428  1e-119  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00000753673 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2505  integrase family protein  59.88 
 
 		 345 aa  410  1e-113  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.600696  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0154  integrase domain protein SAM domain protein  57.47 
 
 		 353 aa  406  1.0000000000000001e-112  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.32279  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2247  site-specific recombinase  26.45 
 
 		 315 aa  99.4  8e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.0011212  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1750  tyrosine recombinase XerD  29.05 
 
 		 294 aa  86.3  7e-16  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1142  hypothetical protein  24.49 
 
 		 369 aa  85.5  0.000000000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.313473  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0492  phage integrase family site specific recombinase  25.8 
 
 		 294 aa  74.7  0.000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0248661  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0840  integrase family protein  23.49 
 
 		 294 aa  73.2  0.000000000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.774041 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3042  tyrosine recombinase XerD subunit  25.55 
 
 		 294 aa  73.2  0.000000000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000138339  normal  0.959316 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1104  site-specific tyrosine recombinase XerC  25 
 
 		 300 aa  72  0.00000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000317379  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1320  tyrosine recombinase XerD  26.65 
 
 		 302 aa  72.4  0.00000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0607  recombinase  23.48 
 
 		 296 aa  71.6  0.00000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_998  integrase/recombinase  22.87 
 
 		 302 aa  70.5  0.00000000004  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0758  phage integrase family protein  25.66 
 
 		 304 aa  68.2  0.0000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  decreased coverage  0.000222973  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2346  tyrosine recombinase XerC  24.13 
 
 		 302 aa  68.2  0.0000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.126195  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4012  tyrosine recombinase XerC  25.16 
 
 		 294 aa  67.8  0.0000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00152232  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1185  tyrosine recombinase XerD  22.94 
 
 		 310 aa  67  0.0000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.497096  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1028  tyrosine recombinase XerD subunit  27.79 
 
 		 313 aa  67  0.0000000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00856798  unclonable  0.00000000634873 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0285  tyrosine recombinase XerC  23 
 
 		 302 aa  67  0.0000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0487  tyrosine recombinase XerC  26.01 
 
 		 293 aa  66.6  0.0000000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000269064 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1025  tyrosine recombinase XerD subunit  22.26 
 
 		 302 aa  66.6  0.0000000006  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2257  site-specific tyrosine recombinase XerD  24.36 
 
 		 299 aa  66.2  0.0000000007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.977256  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2105  tyrosine recombinase XerD  25.84 
 
 		 297 aa  65.9  0.0000000009  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.179497  hitchhiker  0.00877552 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0367  site-specific tyrosine recombinase XerD  25.28 
 
 		 298 aa  65.9  0.0000000009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0470  tyrosine recombinase XerC  25.71 
 
 		 293 aa  65.9  0.0000000009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1215  tyrosine recombinase XerD  22.26 
 
 		 302 aa  65.5  0.000000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.157843  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1996  site-specific tyrosine recombinase XerC  25.16 
 
 		 300 aa  65.5  0.000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2104  tyrosine recombinase XerD  24.62 
 
 		 301 aa  65.9  0.000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.443082 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1266  tyrosine recombinase XerD  25.96 
 
 		 310 aa  65.1  0.000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0676  tyrosine recombinase XerD subunit  23.19 
 
 		 296 aa  64.7  0.000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1473  tyrosine recombinase XerD  26.42 
 
 		 296 aa  64.3  0.000000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.202075  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1698  integrase family protein  23.98 
 
 		 314 aa  64.3  0.000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.23599  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3124  integrase family protein  32.35 
 
 		 323 aa  63.9  0.000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3062  site-specific tyrosine recombinase XerD  23.34 
 
 		 308 aa  64.3  0.000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0842  hypothetical protein  24.07 
 
 		 290 aa  64.3  0.000000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1300  tyrosine recombinase XerD subunit  22.66 
 
 		 297 aa  64.3  0.000000003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1344  integrase family protein  22.69 
 
 		 292 aa  63.5  0.000000005  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00000678444  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0722  phage integrase family protein  21.68 
 
 		 306 aa  63.5  0.000000005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.0599364 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3133  site-specific tyrosine recombinase XerC  24.55 
 
 		 306 aa  63.2  0.000000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.40751  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0341  tyrosine recombinase XerC  24.82 
 
 		 317 aa  62.8  0.000000008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000100724  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2996  site-specific tyrosine recombinase XerC  24.55 
 
 		 306 aa  62.8  0.000000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0374572 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1786  tyrosine recombinase XerD  24.04 
 
 		 291 aa  62  0.00000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0596225  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0074  site-specific tyrosine recombinase XerC  25 
 
 		 307 aa  62  0.00000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2695  tyrosine recombinase XerC  26.28 
 
 		 342 aa  62.4  0.00000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.400065  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08760  tyrosine recombinase XerD  24.64 
 
 		 309 aa  62.4  0.00000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.940341  unclonable  0.00000000128305 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0098  integrase family protein  23.51 
 
 		 298 aa  62.4  0.00000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47730  site-specific tyrosine recombinase XerC  26.24 
 
 		 299 aa  61.2  0.00000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0435757  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0602  phage integrase family protein  29.76 
 
 		 317 aa  61.6  0.00000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00243284  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3104  site-specific tyrosine recombinase XerC  24.38 
 
 		 306 aa  61.6  0.00000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.494742 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6437  site-specific tyrosine recombinase XerC  24.39 
 
 		 306 aa  61.6  0.00000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.798094 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2127  tyrosine recombinase XerD  24.34 
 
 		 308 aa  61.6  0.00000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.518947  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2473  site-specific tyrosine recombinase XerC  24.38 
 
 		 306 aa  62  0.00000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1777  tyrosine recombinase XerD  22.84 
 
 		 290 aa  61.2  0.00000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3087  site-specific tyrosine recombinase XerC  24.38 
 
 		 306 aa  62  0.00000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0748  tyrosine recombinase XerD  23.55 
 
 		 303 aa  60.8  0.00000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.50433  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2260  integrase family protein  26.13 
 
 		 395 aa  60.8  0.00000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.46728  normal  0.0539974 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2992  tyrosine recombinase XerD  25.84 
 
 		 308 aa  61.2  0.00000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2052  tyrosine recombinase XerD  22.39 
 
 		 296 aa  60.8  0.00000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1133  integrase family protein  25.53 
 
 		 299 aa  61.2  0.00000003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1241  tyrosine recombinase XerD  25.21 
 
 		 311 aa  60.8  0.00000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.657845  normal  0.578091 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3928  integrase family protein  21.43 
 
 		 290 aa  60.5  0.00000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2063  tyrosine recombinase XerD  23.15 
 
 		 290 aa  60.5  0.00000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0678  tyrosine recombinase XerD  22.42 
 
 		 294 aa  60.5  0.00000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0265142 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0452  tyrosine recombinase XerC subunit  22.99 
 
 		 335 aa  60.5  0.00000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.577676  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1531  phage integrase family protein  23.55 
 
 		 311 aa  60.1  0.00000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.504949 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0863  phage integrase family protein  23.94 
 
 		 313 aa  60.5  0.00000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2788  tyrosine recombinase XerC  25.88 
 
 		 343 aa  60.1  0.00000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0114244  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3082  site-specific tyrosine recombinase XerC  25.16 
 
 		 306 aa  59.7  0.00000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.633641  normal  0.120316 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3102  integrase family protein  21 
 
 		 301 aa  59.7  0.00000007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000184896  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2689  tyrosine recombinase XerC  24.78 
 
 		 311 aa  59.7  0.00000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.147909 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09590  tyrosine recombinase XerD  26.39 
 
 		 302 aa  59.7  0.00000007  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.0503565 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23640  tyrosine recombinase XerC subunit  21.99 
 
 		 310 aa  59.7  0.00000007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.154193  normal  0.0993098 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0247  integrase family protein  24.84 
 
 		 322 aa  59.7  0.00000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.121071  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1501  tyrosine recombinase XerD subunit  21.75 
 
 		 295 aa  59.3  0.00000008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1970  site-specific tyrosine recombinase XerC  26.28 
 
 		 300 aa  58.9  0.0000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.397741 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2528  tyrosine recombinase XerC  25.45 
 
 		 294 aa  58.9  0.0000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.237042 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0476  tyrosine recombinase XerD  23.53 
 
 		 302 aa  58.5  0.0000001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1990  site-specific tyrosine recombinase XerC  26.28 
 
 		 300 aa  58.9  0.0000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1003  tyrosine recombinase XerD subunit  22.56 
 
 		 302 aa  58.9  0.0000001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.497558  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1524  integrase family protein  23.1 
 
 		 300 aa  58.9  0.0000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.681425  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4805  tyrosine recombinase XerC  27.38 
 
 		 367 aa  58.9  0.0000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.104736  normal  0.146847 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2036  site-specific tyrosine recombinase XerC  26.28 
 
 		 300 aa  58.9  0.0000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0541579  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1023  integrase family protein  26.97 
 
 		 297 aa  58.2  0.0000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0854512  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2881  tyrosine recombinase XerC  25.56 
 
 		 343 aa  58.5  0.0000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.312354  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0047  tyrosine recombinase XerC  25.9 
 
 		 298 aa  58.5  0.0000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2497  integrase family protein  24.62 
 
 		 308 aa  58.5  0.0000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0177  site-specific tyrosine recombinase XerC  25.83 
 
 		 323 aa  58.2  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1513  site-specific recombinase  23.35 
 
 		 295 aa  58.2  0.0000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.110584  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2194  integrase family protein  25.66 
 
 		 317 aa  58.2  0.0000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.103281  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0519  site-specific tyrosine recombinase XerD  23.79 
 
 		 302 aa  58.2  0.0000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0998774  normal  0.238721 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0347  site-specific tyrosine recombinase XerC  32.61 
 
 		 307 aa  58.5  0.0000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.693124 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0724  integrase family protein  25.8 
 
 		 308 aa  58.2  0.0000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.971464 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2815  integrase/recombinase XerD  25.29 
 
 		 311 aa  57.8  0.0000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0047  integrase family protein  24.09 
 
 		 314 aa  57.4  0.0000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.456307  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3442  phage integrase  25.09 
 
 		 337 aa  57.8  0.0000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0787  formylmethanofuran dehydrogenase subunit E-like protein  21.61 
 
 		 320 aa  57.8  0.0000003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  decreased coverage  0.00453269  unclonable  0.000000000000100471 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0536  site-specific tyrosine recombinase XerC  25.21 
 
 		 300 aa  57.8  0.0000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.538013  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39510  site-specific tyrosine recombinase XerD  24.63 
 
 		 298 aa  57.8  0.0000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>