More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Huta_0154 on replicon NC_013158
Organism: Halorhabdus utahensis DSM 12940



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013158  Huta_0154  integrase domain protein SAM domain protein  100 
 
 		 353 aa  725    Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.32279  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2505  integrase family protein  65.8 
 
 		 345 aa  471  1e-132  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.600696  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1216  integrase family protein  61.81 
 
 		 344 aa  440  9.999999999999999e-123  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00000753673 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3592  integrase family protein  62.39 
 
 		 353 aa  431  1e-119  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1808  integrase family protein  57.47 
 
 		 345 aa  406  1.0000000000000001e-112  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2247  site-specific recombinase  26.04 
 
 		 315 aa  98.2  2e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.0011212  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1142  hypothetical protein  30.89 
 
 		 369 aa  82  0.00000000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.313473  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0840  integrase family protein  23.17 
 
 		 294 aa  80.9  0.00000000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.774041 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0842  hypothetical protein  24.62 
 
 		 290 aa  78.6  0.0000000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1028  tyrosine recombinase XerD subunit  26.36 
 
 		 313 aa  76.6  0.0000000000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00856798  unclonable  0.00000000634873 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2695  tyrosine recombinase XerC  25.36 
 
 		 342 aa  75.5  0.000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.400065  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0487  tyrosine recombinase XerC  25.07 
 
 		 293 aa  74.7  0.000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000269064 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2788  tyrosine recombinase XerC  25.42 
 
 		 343 aa  74.7  0.000000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0114244  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1750  tyrosine recombinase XerD  25.45 
 
 		 294 aa  75.1  0.000000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0396  tyrosine recombinase XerD  25.79 
 
 		 309 aa  74.7  0.000000000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2881  tyrosine recombinase XerC  25.14 
 
 		 343 aa  73.6  0.000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.312354  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0607  recombinase  24 
 
 		 296 aa  73.9  0.000000000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3715  integrase family protein  23.17 
 
 		 298 aa  72.4  0.00000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2257  site-specific tyrosine recombinase XerD  23.19 
 
 		 299 aa  72.4  0.00000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.977256  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3524  tyrosine recombinase XerD  23.84 
 
 		 309 aa  71.6  0.00000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1524  integrase family protein  24.26 
 
 		 300 aa  71.2  0.00000000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.681425  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0063  tyrosine recombinase XerC  27.41 
 
 		 304 aa  70.9  0.00000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0285  tyrosine recombinase XerC  23.91 
 
 		 302 aa  71.2  0.00000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1025  tyrosine recombinase XerD subunit  22.9 
 
 		 302 aa  71.2  0.00000000003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0492  phage integrase family site specific recombinase  24.56 
 
 		 294 aa  70.5  0.00000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0248661  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2260  integrase family protein  25.54 
 
 		 395 aa  70.9  0.00000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.46728  normal  0.0539974 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0470  tyrosine recombinase XerC  25.37 
 
 		 293 aa  70.5  0.00000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0843  tyrosine recombinase XerD  23.84 
 
 		 309 aa  70.5  0.00000000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3643  tyrosine recombinase XerD  23.55 
 
 		 309 aa  70.5  0.00000000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0367  site-specific tyrosine recombinase XerD  24.73 
 
 		 298 aa  70.1  0.00000000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002113  tyrosine recombinase XerC  24.1 
 
 		 310 aa  70.1  0.00000000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3449  tyrosine recombinase XerD  25.15 
 
 		 300 aa  69.7  0.00000000007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3450  tyrosine recombinase XerD  24.11 
 
 		 322 aa  69.7  0.00000000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0676  tyrosine recombinase XerD subunit  21.38 
 
 		 296 aa  69.3  0.00000000009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0234  site-specific tyrosine recombinase XerC  24.85 
 
 		 302 aa  68.9  0.0000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_998  integrase/recombinase  24.21 
 
 		 302 aa  68.2  0.0000000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1215  tyrosine recombinase XerD  23.92 
 
 		 302 aa  67.8  0.0000000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.157843  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0170  site-specific tyrosine recombinase XerC  26.35 
 
 		 306 aa  68.6  0.0000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1473  tyrosine recombinase XerD  23.89 
 
 		 296 aa  68.6  0.0000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.202075  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1300  tyrosine recombinase XerD subunit  23.48 
 
 		 297 aa  68.2  0.0000000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00307  site-specific tyrosine recombinase XerC  24.1 
 
 		 313 aa  67.4  0.0000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2052  tyrosine recombinase XerD  20.32 
 
 		 296 aa  67.8  0.0000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3042  tyrosine recombinase XerD subunit  25.3 
 
 		 294 aa  67.4  0.0000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000138339  normal  0.959316 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2739  integrase/recombinase XerD  24.92 
 
 		 321 aa  67.8  0.0000000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0651  tyrosine recombinase XerD  23.67 
 
 		 297 aa  67.4  0.0000000004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0950079  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0574  integrase family protein  25.95 
 
 		 304 aa  67.4  0.0000000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.0000000663621  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1982  tyrosine recombinase XerC  25.61 
 
 		 298 aa  67  0.0000000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0026523  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1003  tyrosine recombinase XerD subunit  22.43 
 
 		 302 aa  67.4  0.0000000004  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.497558  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2473  site-specific tyrosine recombinase XerC  26.58 
 
 		 306 aa  66.6  0.0000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3087  site-specific tyrosine recombinase XerC  26.58 
 
 		 306 aa  66.6  0.0000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3104  site-specific tyrosine recombinase XerC  26.58 
 
 		 306 aa  66.6  0.0000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.494742 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23640  tyrosine recombinase XerC subunit  26.35 
 
 		 310 aa  66.6  0.0000000006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.154193  normal  0.0993098 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2104  tyrosine recombinase XerD  23.49 
 
 		 301 aa  66.2  0.0000000007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.443082 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6437  site-specific tyrosine recombinase XerC  26.25 
 
 		 306 aa  66.2  0.0000000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.798094 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0247  integrase family protein  25.72 
 
 		 322 aa  65.5  0.000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.121071  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3133  site-specific tyrosine recombinase XerC  26.88 
 
 		 306 aa  65.5  0.000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.40751  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0890  tyrosine recombinase XerD  23.44 
 
 		 300 aa  65.9  0.000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.267893  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0347  site-specific tyrosine recombinase XerC  25.08 
 
 		 307 aa  64.7  0.000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.693124 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0047  tyrosine recombinase XerC  23.57 
 
 		 298 aa  65.1  0.000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0537  tyrosine recombinase XerD subunit  23.01 
 
 		 302 aa  65.1  0.000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2996  site-specific tyrosine recombinase XerC  26.88 
 
 		 306 aa  65.1  0.000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0374572 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0519  site-specific tyrosine recombinase XerD  21.98 
 
 		 302 aa  65.1  0.000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0998774  normal  0.238721 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1720  tyrosine recombinase XerD  25.65 
 
 		 319 aa  64.7  0.000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.514315 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0795  tyrosine recombinase XerD  23.74 
 
 		 300 aa  65.1  0.000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0452  tyrosine recombinase XerC subunit  24.38 
 
 		 335 aa  64.7  0.000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.577676  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0207  site-specific tyrosine recombinase XerC  26.93 
 
 		 310 aa  64.3  0.000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0359  tyrosine recombinase XerD  25.54 
 
 		 290 aa  64.3  0.000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00723526 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0392  site-specific tyrosine recombinase XerC  26.93 
 
 		 310 aa  64.3  0.000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0602  phage integrase family protein  23.67 
 
 		 317 aa  64.3  0.000000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00243284  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3228  tyrosine recombinase XerD  23.53 
 
 		 300 aa  64.3  0.000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.302685  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0010  tyrosine recombinase XerC  22.55 
 
 		 299 aa  64.3  0.000000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0805  tyrosine recombinase XerD  22.46 
 
 		 300 aa  63.9  0.000000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0989  integrase family protein  27.81 
 
 		 292 aa  63.5  0.000000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0618431 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3082  site-specific tyrosine recombinase XerC  26.32 
 
 		 306 aa  63.5  0.000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.633641  normal  0.120316 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3258  site-specific tyrosine recombinase XerC  26.93 
 
 		 310 aa  63.5  0.000000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.706598  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2169  site-specific tyrosine recombinase XerC  26.93 
 
 		 310 aa  63.5  0.000000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.126979  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0195  site-specific tyrosine recombinase XerC  26.93 
 
 		 310 aa  63.5  0.000000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3428  site-specific tyrosine recombinase XerC  26.93 
 
 		 310 aa  63.5  0.000000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1202  tyrosine recombinase XerC  24.76 
 
 		 304 aa  63.5  0.000000005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.910177  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2920  site-specific tyrosine recombinase XerC  26.93 
 
 		 310 aa  63.5  0.000000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.510567  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3331  tyrosine recombinase XerD  23.44 
 
 		 300 aa  63.5  0.000000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3247  integrase/recombinase XerC  23.51 
 
 		 296 aa  63.5  0.000000006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2497  integrase family protein  26.2 
 
 		 308 aa  63.2  0.000000007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1821  integrase family protein  22.69 
 
 		 307 aa  63.2  0.000000008  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0364742  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0577  site-specific tyrosine recombinase XerD  20.31 
 
 		 305 aa  63.2  0.000000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0855221  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1185  tyrosine recombinase XerD  23.26 
 
 		 315 aa  63.2  0.000000008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0531401  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0787  formylmethanofuran dehydrogenase subunit E-like protein  21.33 
 
 		 320 aa  62.8  0.000000009  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  decreased coverage  0.00453269  unclonable  0.000000000000100471 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4805  tyrosine recombinase XerC  23.84 
 
 		 367 aa  62  0.00000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.104736  normal  0.146847 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0184  site-specific tyrosine recombinase XerC  24.04 
 
 		 303 aa  62.4  0.00000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.72736  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1312  tyrosine recombinase XerC  24.37 
 
 		 298 aa  62.4  0.00000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.199373  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1337  tyrosine recombinase XerC  24.37 
 
 		 298 aa  62.4  0.00000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0149085  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1556  integrase family protein  23.35 
 
 		 307 aa  62  0.00000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.36987  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1282  tyrosine recombinase XerD  25 
 
 		 295 aa  62.4  0.00000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.63418  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0663  tyrosine recombinase XerD  24.21 
 
 		 305 aa  62.8  0.00000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2809  phage integrase family protein  25.67 
 
 		 311 aa  62.4  0.00000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1996  site-specific tyrosine recombinase XerC  24.62 
 
 		 300 aa  62.8  0.00000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1668  tyrosine recombinase XerD subunit  20.91 
 
 		 295 aa  62.4  0.00000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.179488  normal  0.0195248 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1432  tyrosine recombinase XerD  24.1 
 
 		 321 aa  62.8  0.00000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0895087  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2821  tyrosine recombinase XerD  23.15 
 
 		 313 aa  61.6  0.00000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.346068  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3981  site-specific tyrosine recombinase XerC  24.25 
 
 		 300 aa  61.6  0.00000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.105897  normal  0.285215 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>