More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hlac_1216 on replicon NC_012029
Organism: Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012029  Hlac_1216  integrase family protein  100 
 
 		 344 aa  702    Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00000753673 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2505  integrase family protein  65.22 
 
 		 345 aa  461  1e-129  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.600696  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0154  integrase domain protein SAM domain protein  61.81 
 
 		 353 aa  440  9.999999999999999e-123  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.32279  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3592  integrase family protein  63.13 
 
 		 353 aa  439  9.999999999999999e-123  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1808  integrase family protein  61.95 
 
 		 345 aa  428  1e-119  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1142  hypothetical protein  30.38 
 
 		 369 aa  100  5e-20  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.313473  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2247  site-specific recombinase  25.44 
 
 		 315 aa  97.4  3e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.0011212  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1473  tyrosine recombinase XerD  24.92 
 
 		 296 aa  77  0.0000000000005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.202075  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1025  tyrosine recombinase XerD subunit  23.5 
 
 		 302 aa  74.3  0.000000000003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0047  tyrosine recombinase XerC  26.38 
 
 		 298 aa  73.9  0.000000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_998  integrase/recombinase  23.5 
 
 		 302 aa  72.8  0.000000000007  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0722  phage integrase family protein  21.19 
 
 		 306 aa  72.8  0.000000000008  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.0599364 
 
 
-
 
NC_002936  DET1215  tyrosine recombinase XerD  23.21 
 
 		 302 aa  72.4  0.00000000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.157843  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0607  recombinase  24.22 
 
 		 296 aa  71.6  0.00000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4012  tyrosine recombinase XerC  23.72 
 
 		 294 aa  70.5  0.00000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00152232  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2257  site-specific tyrosine recombinase XerD  24.27 
 
 		 299 aa  70.5  0.00000000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.977256  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0285  tyrosine recombinase XerC  22.42 
 
 		 302 aa  70.1  0.00000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1786  tyrosine recombinase XerD  23.44 
 
 		 291 aa  69.3  0.00000000009  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0596225  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2052  tyrosine recombinase XerD  23.12 
 
 		 296 aa  67  0.0000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1750  tyrosine recombinase XerD  25.67 
 
 		 294 aa  67.4  0.0000000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1082  integrase family protein  22.29 
 
 		 290 aa  67.4  0.0000000004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1266  tyrosine recombinase XerD  26.25 
 
 		 310 aa  67  0.0000000005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0748  tyrosine recombinase XerD  24.37 
 
 		 303 aa  66.6  0.0000000005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.50433  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1524  integrase family protein  23.01 
 
 		 300 aa  66.6  0.0000000006  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.681425  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0537  tyrosine recombinase XerD subunit  25.99 
 
 		 302 aa  66.2  0.0000000008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0787  formylmethanofuran dehydrogenase subunit E-like protein  20.47 
 
 		 320 aa  65.9  0.000000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  decreased coverage  0.00453269  unclonable  0.000000000000100471 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3042  tyrosine recombinase XerD subunit  23.44 
 
 		 294 aa  65.5  0.000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000138339  normal  0.959316 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0492  phage integrase family site specific recombinase  24.68 
 
 		 294 aa  65.1  0.000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0248661  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1185  tyrosine recombinase XerD  24.63 
 
 		 310 aa  65.1  0.000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.497096  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0676  tyrosine recombinase XerD subunit  20.44 
 
 		 296 aa  65.1  0.000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1185  tyrosine recombinase XerD  24.44 
 
 		 315 aa  65.1  0.000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0531401  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3247  integrase/recombinase XerC  23.64 
 
 		 296 aa  64.7  0.000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1427  tyrosine recombinase XerD subunit  24.32 
 
 		 295 aa  64.3  0.000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2255  tyrosine recombinase XerD  24.52 
 
 		 305 aa  63.5  0.000000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000204462  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0487  tyrosine recombinase XerC  23.88 
 
 		 293 aa  63.5  0.000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000269064 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3133  site-specific tyrosine recombinase XerC  27.25 
 
 		 306 aa  63.2  0.000000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.40751  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2996  site-specific tyrosine recombinase XerC  27.25 
 
 		 306 aa  63.2  0.000000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0374572 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0350  phage integrase family protein  22.25 
 
 		 341 aa  62.8  0.000000009  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000105216  hitchhiker  0.0000498769 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2528  tyrosine recombinase XerC  22.7 
 
 		 294 aa  62.4  0.00000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.237042 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2788  site-specific tyrosine recombinase XerD  24.48 
 
 		 296 aa  62.4  0.00000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000777667  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0047  integrase family protein  25.44 
 
 		 314 aa  62.4  0.00000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.456307  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0476  tyrosine recombinase XerD  23.2 
 
 		 302 aa  62.4  0.00000001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2260  integrase family protein  25.07 
 
 		 395 aa  62  0.00000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.46728  normal  0.0539974 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0142  integrase family protein  21.89 
 
 		 292 aa  62  0.00000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1300  tyrosine recombinase XerD subunit  21.82 
 
 		 297 aa  62.4  0.00000001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0452  tyrosine recombinase XerC subunit  22.46 
 
 		 335 aa  62.4  0.00000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.577676  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1320  tyrosine recombinase XerD  27.38 
 
 		 302 aa  62.8  0.00000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6437  site-specific tyrosine recombinase XerC  25.83 
 
 		 306 aa  61.2  0.00000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.798094 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2473  site-specific tyrosine recombinase XerC  25.99 
 
 		 306 aa  61.6  0.00000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3104  site-specific tyrosine recombinase XerC  26.75 
 
 		 306 aa  61.6  0.00000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.494742 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3087  site-specific tyrosine recombinase XerC  25.99 
 
 		 306 aa  61.6  0.00000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2346  tyrosine recombinase XerC  23.36 
 
 		 302 aa  61.6  0.00000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.126195  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1344  integrase family protein  24.02 
 
 		 292 aa  61.6  0.00000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00000678444  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1282  tyrosine recombinase XerD  23.96 
 
 		 295 aa  60.8  0.00000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.63418  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3920  site-specific tyrosine recombinase XerD  23.67 
 
 		 296 aa  61.2  0.00000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00000317777  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3665  integrase family protein  23.46 
 
 		 313 aa  60.8  0.00000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.211751 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3796  phage integrase family protein  26.8 
 
 		 304 aa  60.8  0.00000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0470  tyrosine recombinase XerC  23.42 
 
 		 293 aa  60.5  0.00000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2063  tyrosine recombinase XerD  21.97 
 
 		 290 aa  60.1  0.00000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3715  integrase family protein  21.68 
 
 		 298 aa  60.5  0.00000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23640  tyrosine recombinase XerC subunit  25.14 
 
 		 310 aa  59.7  0.00000006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.154193  normal  0.0993098 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0912  integrase/recombinase  26.46 
 
 		 304 aa  60.1  0.00000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0261382  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0863  phage integrase family protein  26.98 
 
 		 313 aa  60.1  0.00000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1038  site-specific tyrosine recombinase XerD  23.37 
 
 		 296 aa  59.7  0.00000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00331502  normal  0.0102802 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1777  tyrosine recombinase XerD  21.66 
 
 		 290 aa  59.7  0.00000007  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0010  tyrosine recombinase XerC  20.93 
 
 		 299 aa  59.7  0.00000007  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4199  site-specific tyrosine recombinase XerD  23.37 
 
 		 296 aa  59.7  0.00000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00345142  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11170  site-specific recombinase XerD  27.72 
 
 		 336 aa  59.3  0.00000008  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0225756  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0967  integrase family protein  26.96 
 
 		 373 aa  59.3  0.00000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3090  tyrosine recombinase XerD  22.29 
 
 		 320 aa  58.9  0.0000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0396  tyrosine recombinase XerD  25.15 
 
 		 309 aa  58.9  0.0000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3643  tyrosine recombinase XerD  21.83 
 
 		 309 aa  58.9  0.0000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4158  site-specific tyrosine recombinase XerD  23.01 
 
 		 296 aa  58.9  0.0000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.44443  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1982  tyrosine recombinase XerC  22.76 
 
 		 298 aa  58.9  0.0000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0026523  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0234  site-specific tyrosine recombinase XerC  23.99 
 
 		 302 aa  59.3  0.0000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4222  site-specific tyrosine recombinase XerD  23.01 
 
 		 296 aa  58.9  0.0000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00160259  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39510  site-specific tyrosine recombinase XerD  25.69 
 
 		 298 aa  58.9  0.0000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0139  tyrosine recombinase XerD  25.15 
 
 		 312 aa  58.5  0.0000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3124  integrase family protein  28.28 
 
 		 323 aa  58.9  0.0000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1241  tyrosine recombinase XerD  25.63 
 
 		 311 aa  58.5  0.0000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.657845  normal  0.578091 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1381  site-specific tyrosine recombinase XerD  25.08 
 
 		 298 aa  58.2  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  hitchhiker  0.00360913  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3449  tyrosine recombinase XerD  21.78 
 
 		 300 aa  58.5  0.0000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3999  site-specific tyrosine recombinase XerD  22.78 
 
 		 296 aa  58.5  0.0000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.189801  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3830  site-specific tyrosine recombinase XerD  22.78 
 
 		 296 aa  58.5  0.0000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0825  site-specific tyrosine recombinase XerC  23.26 
 
 		 277 aa  58.5  0.0000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0104756  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3846  site-specific tyrosine recombinase XerD  23.08 
 
 		 296 aa  58.5  0.0000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0256715  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0577  site-specific tyrosine recombinase XerD  30.72 
 
 		 305 aa  58.2  0.0000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0855221  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4311  site-specific tyrosine recombinase XerD  22.78 
 
 		 296 aa  58.5  0.0000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.789664  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1028  tyrosine recombinase XerD subunit  23.77 
 
 		 313 aa  58.2  0.0000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00856798  unclonable  0.00000000634873 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2329  tyrosine recombinase XerD  22.12 
 
 		 277 aa  58.5  0.0000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00235896  normal  0.0350779 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4113  site-specific tyrosine recombinase XerD  22.78 
 
 		 296 aa  58.5  0.0000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.00015e-24 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3450  tyrosine recombinase XerD  23.64 
 
 		 322 aa  58.2  0.0000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0758  phage integrase family protein  20.89 
 
 		 304 aa  58.2  0.0000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  decreased coverage  0.000222973  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1839  integrase family protein  23.76 
 
 		 310 aa  58.2  0.0000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3102  integrase family protein  22.36 
 
 		 301 aa  57.8  0.0000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000184896  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0082  site-specific tyrosine recombinase XerC  24.2 
 
 		 339 aa  57.4  0.0000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.472951  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1619  phage integrase family protein  22.82 
 
 		 286 aa  57.8  0.0000003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0074  site-specific tyrosine recombinase XerC  34.19 
 
 		 307 aa  57.8  0.0000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0098  integrase family protein  22.16 
 
 		 298 aa  57.8  0.0000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3524  tyrosine recombinase XerD  21.53 
 
 		 309 aa  57.4  0.0000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>