224 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A0907 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007355  Mbar_A0907  putative heat shock protein  100 
 
 
175 aa  355  9.999999999999999e-98  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.606312  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0906  hypothetical protein  50.59 
 
 
165 aa  150  8.999999999999999e-36  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0942345  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2444  putative heat shock protein  38.15 
 
 
175 aa  124  7e-28  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0231  heat shock protein Hsp20  37.93 
 
 
176 aa  101  5e-21  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0640  heat shock protein Hsp20  38.46 
 
 
170 aa  100  1e-20  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.402449  normal  0.271447 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1492  heat shock protein Hsp20  39.73 
 
 
182 aa  97.1  1e-19  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0537  heat shock protein Hsp20  34.32 
 
 
173 aa  95.1  4e-19  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.0220395 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1657  heat shock protein Hsp20  35.23 
 
 
174 aa  95.1  5e-19  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.760781 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0010  heat shock protein HSP20  32.73 
 
 
163 aa  93.6  1e-18  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1620  heat shock protein Hsp20  34.48 
 
 
175 aa  93.2  2e-18  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.192454  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1810  heat shock protein Hsp20  33.33 
 
 
176 aa  92  3e-18  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0805  heat shock protein Hsp20  39.66 
 
 
195 aa  85.5  4e-16  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0658  heat shock protein Hsp20  45.24 
 
 
130 aa  83.6  0.000000000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1856  heat shock protein Hsp20  36.36 
 
 
176 aa  82  0.000000000000004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1246  heat shock protein, HSP20 family protein  34.17 
 
 
177 aa  77.8  0.00000000000007  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.143675  normal  0.0444206 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0447  heat shock protein Hsp20  36.69 
 
 
171 aa  77  0.0000000000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0285  heat shock protein Hsp20  44.58 
 
 
133 aa  75.5  0.0000000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2140  heat shock protein Hsp20  43.37 
 
 
133 aa  73.9  0.000000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2833  heat shock protein Hsp20  30.33 
 
 
183 aa  72  0.000000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3021  heat shock protein HSP20  35.29 
 
 
176 aa  68.2  0.00000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0695  hypothetical protein  32.2 
 
 
183 aa  66.2  0.0000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.756333  normal  0.812325 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2547  putative heat shock protein  36.14 
 
 
132 aa  65.1  0.0000000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.837495  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2370  HSP20 type chaperone  39.53 
 
 
125 aa  65.1  0.0000000005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.40451 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1812  hypothetical protein  36.13 
 
 
170 aa  64.3  0.0000000007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0735  heat shock protein Hsp20  40 
 
 
145 aa  64.7  0.0000000007  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  unclonable  0.0000000000000037192  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1562  small heat shock protein (HSP20-1)  34.69 
 
 
150 aa  63.9  0.000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0580  heat shock protein Hsp20  33.33 
 
 
145 aa  61.6  0.000000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000199173  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1429  heat shock protein Hsp20  31.01 
 
 
169 aa  59.7  0.00000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0445  heat shock protein Hsp20  33.64 
 
 
150 aa  58.2  0.00000006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0406  heat shock protein Hsp20  35.85 
 
 
137 aa  57.8  0.00000008  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0194442  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0472  heat shock protein Hsp20  37.33 
 
 
115 aa  57.4  0.00000009  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  hitchhiker  0.00129647  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1840  heat shock protein Hsp20  38.16 
 
 
127 aa  57  0.0000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.388818 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1494  hypothetical protein  25.79 
 
 
184 aa  56.6  0.0000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.911601  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0369  HSP20 family protein  34.58 
 
 
153 aa  56.2  0.0000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  4.93231e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1573  heat shock protein Hsp20  32.71 
 
 
173 aa  55.8  0.0000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  decreased coverage  0.00130938  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0037  heat shock protein Hsp20  35.85 
 
 
142 aa  54.7  0.0000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0982  HSP20 family protein  28.97 
 
 
176 aa  54.3  0.0000008  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2505  heat shock protein Hsp20  34.26 
 
 
138 aa  54.3  0.0000008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.239492  normal  0.0462479 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1594  heat shock protein Hsp20  42.25 
 
 
113 aa  54.3  0.0000008  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.386135 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1076  heat shock protein Hsp20  33.63 
 
 
148 aa  53.9  0.000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.713568  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0543  heat shock protein Hsp20  34.62 
 
 
147 aa  53.1  0.000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0340696  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4118  heat shock protein Hsp20  34.44 
 
 
172 aa  52.8  0.000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.513744 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0557  heat shock protein Hsp20  34.62 
 
 
147 aa  52.4  0.000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0117197  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0203  heat shock protein Hsp20  27.53 
 
 
154 aa  52.8  0.000003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3582  heat shock protein Hsp20  27.59 
 
 
166 aa  52.4  0.000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1127  heat shock protein Hsp20  32.69 
 
 
142 aa  52  0.000004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1986  heat shock protein Hsp20  37.14 
 
 
156 aa  52  0.000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3666  heat shock protein Hsp20  29.93 
 
 
132 aa  51.6  0.000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0021013  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2355  heat shock protein Hsp20  33.06 
 
 
165 aa  51.6  0.000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.20966  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3774  heat shock protein Hsp20  29.93 
 
 
132 aa  51.2  0.000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0471  heat shock protein Hsp20  31.48 
 
 
155 aa  51.2  0.000007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1708  heat shock protein HSP20  28.65 
 
 
154 aa  51.2  0.000008  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.563674  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1806  small heat shock protein  32.69 
 
 
152 aa  51.2  0.000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0481  heat shock protein Hsp20  36.54 
 
 
150 aa  51.2  0.000008  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.411475 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3724  heat shock protein Hsp20  35.56 
 
 
185 aa  50.8  0.000009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3680  heat shock protein Hsp20  35.56 
 
 
185 aa  50.8  0.000009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.626967 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2074  heat shock protein Hsp20  31 
 
 
173 aa  50.8  0.000009  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.145284  normal  0.308358 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2384  heat shock protein Hsp20  35.35 
 
 
164 aa  50.4  0.00001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1967  heat shock protein Hsp20  35.51 
 
 
178 aa  50.4  0.00001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3323  heat shock protein Hsp20  34.41 
 
 
228 aa  50.8  0.00001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1348  heat shock protein Hsp20  26.61 
 
 
146 aa  50.4  0.00001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.403253 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2024  heat shock protein Hsp20  26.61 
 
 
146 aa  50.4  0.00001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.106375 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0052  heat shock protein Hsp20  30.84 
 
 
151 aa  50.1  0.00001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.319643  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0892  heat shock protein Hsp20  27.53 
 
 
154 aa  50.8  0.00001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2635  heat shock protein Hsp20  35.58 
 
 
195 aa  49.3  0.00002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000662159  normal  0.965311 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0629  heat shock protein Hsp20  30.61 
 
 
189 aa  50.1  0.00002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.185609 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3725  heat shock protein Hsp20  30.53 
 
 
143 aa  49.7  0.00002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.843054  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0423  heat shock protein Hsp20  31.63 
 
 
152 aa  49.7  0.00002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.943695  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1396  molecular chaperone-like protein  28.04 
 
 
152 aa  49.3  0.00002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.610569 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1648  heat shock protein Hsp20  32.89 
 
 
115 aa  49.7  0.00002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6104  heat shock protein Hsp20  26.53 
 
 
158 aa  49.3  0.00003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0249434 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2250  heat shock protein Hsp20  34.58 
 
 
178 aa  49.3  0.00003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2683  heat shock protein Hsp20  27.36 
 
 
145 aa  49.3  0.00003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.338339  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2802  heat shock protein Hsp20  34.65 
 
 
167 aa  49.3  0.00003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.20157 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2323  putative small heat shock protein  30.26 
 
 
100 aa  49.3  0.00003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.814003  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1083  hypothetical protein  30.49 
 
 
183 aa  49.3  0.00003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2078  heat shock protein Hsp20  31.43 
 
 
147 aa  48.1  0.00005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0183  heat shock protein Hsp20  29.93 
 
 
132 aa  48.5  0.00005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0939501  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1917  heat shock protein Hsp20  29.91 
 
 
156 aa  48.1  0.00007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.86534  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2287  heat shock protein Hsp20  29 
 
 
189 aa  48.1  0.00007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0182  heat shock protein Hsp20  26.85 
 
 
149 aa  47.8  0.00008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0138231  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0336  hypothetical protein  38.16 
 
 
229 aa  47.8  0.00008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.705551 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1651  heat shock protein Hsp20  31.91 
 
 
155 aa  47.8  0.00008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000431905  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2643  heat shock protein Hsp20  25.95 
 
 
151 aa  47.8  0.00008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.840862  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1294  heat shock protein Hsp20  29.52 
 
 
159 aa  47.8  0.00008  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.770288 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0298  heat shock protein Hsp20  35.24 
 
 
166 aa  47.4  0.00009  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.295208 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3215  heat shock protein Hsp20  29.35 
 
 
150 aa  47.4  0.00009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0580949  hitchhiker  0.000000163698 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3241  heat shock protein Hsp20  30.84 
 
 
166 aa  47.8  0.00009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.406826  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0690  heat shock protein Hsp20  32.26 
 
 
147 aa  47  0.0001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000202005  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0047  heat shock protein Hsp20  34.95 
 
 
148 aa  47.4  0.0001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.333015  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2986  heat shock protein Hsp20  29.63 
 
 
147 aa  47.4  0.0001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00130326  normal  0.964264 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2132  heat shock protein Hsp20  31.43 
 
 
164 aa  47.4  0.0001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.585874 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1171  heat shock protein Hsp20  28.57 
 
 
189 aa  47.4  0.0001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.726376  normal 
 
 
-
 
NC_011771  BCAH820_C0008  Hsp  33.98 
 
 
146 aa  47.4  0.0001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0383  heat shock protein Hsp20  31.25 
 
 
166 aa  47  0.0001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.170778  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3394  heat shock protein Hsp20  29.59 
 
 
189 aa  47  0.0001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0219016  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0446  heat shock protein Hsp20  31.43 
 
 
151 aa  47  0.0001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.281567  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0926  heat shock protein Hsp20  29.59 
 
 
152 aa  47  0.0001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1758  heat shock protein Hsp20  28.97 
 
 
223 aa  47  0.0001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2022  heat shock protein Hsp20  32.29 
 
 
144 aa  47.4  0.0001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.12456  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>