87 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmar_0010 on replicon NC_010085
Organism: Nitrosopumilus maritimus SCM1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010085  Nmar_0010  heat shock protein HSP20  100 
 
 
163 aa  326  7e-89  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0640  heat shock protein Hsp20  48.91 
 
 
170 aa  115  1.9999999999999998e-25  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.402449  normal  0.271447 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1620  heat shock protein Hsp20  36.69 
 
 
175 aa  102  3e-21  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.192454  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0537  heat shock protein Hsp20  35.88 
 
 
173 aa  101  4e-21  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.0220395 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1810  heat shock protein Hsp20  34.68 
 
 
176 aa  100  7e-21  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1657  heat shock protein Hsp20  36.26 
 
 
174 aa  100  8e-21  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.760781 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0231  heat shock protein Hsp20  40.91 
 
 
176 aa  98.6  3e-20  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1856  heat shock protein Hsp20  39.39 
 
 
176 aa  94.4  6e-19  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0907  putative heat shock protein  32.73 
 
 
175 aa  93.6  1e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.606312  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1492  heat shock protein Hsp20  42.31 
 
 
182 aa  91.3  5e-18  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0447  heat shock protein Hsp20  35.66 
 
 
171 aa  86.3  2e-16  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0805  heat shock protein Hsp20  34.46 
 
 
195 aa  83.6  0.000000000000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0906  hypothetical protein  30.72 
 
 
165 aa  78.2  0.00000000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0942345  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2833  heat shock protein Hsp20  43.64 
 
 
183 aa  72.8  0.000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0285  heat shock protein Hsp20  36.59 
 
 
133 aa  62.8  0.000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1246  heat shock protein, HSP20 family protein  31.36 
 
 
177 aa  59.3  0.00000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.143675  normal  0.0444206 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1812  hypothetical protein  33.83 
 
 
170 aa  58.5  0.00000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2140  heat shock protein Hsp20  31.71 
 
 
133 aa  57.4  0.00000008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2444  putative heat shock protein  30.71 
 
 
175 aa  57  0.0000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2547  putative heat shock protein  34.78 
 
 
132 aa  56.2  0.0000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.837495  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0658  heat shock protein Hsp20  32 
 
 
130 aa  55.1  0.0000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0695  hypothetical protein  29.32 
 
 
183 aa  55.1  0.0000005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.756333  normal  0.812325 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3021  heat shock protein HSP20  29.46 
 
 
176 aa  52.8  0.000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1083  hypothetical protein  32.88 
 
 
183 aa  52.4  0.000003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2370  HSP20 type chaperone  30.21 
 
 
125 aa  51.2  0.000006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.40451 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2132  heat shock protein Hsp20  25.44 
 
 
164 aa  48.5  0.00003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.585874 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2802  heat shock protein Hsp20  24.29 
 
 
167 aa  48.9  0.00003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.20157 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3241  heat shock protein Hsp20  23.56 
 
 
166 aa  48.5  0.00004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.406826  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1170  heat shock protein Hsp20  25.48 
 
 
170 aa  48.5  0.00004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2355  heat shock protein Hsp20  31.03 
 
 
165 aa  47.8  0.00006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.20966  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2462  heat shock protein Hsp20  23.98 
 
 
168 aa  47.8  0.00007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0466294  normal  0.178308 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4816  Molecular chaperone (small heat shock protein)- like protein  33.9 
 
 
143 aa  47.8  0.00007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.59096  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3323  heat shock protein Hsp20  28.97 
 
 
228 aa  47.4  0.00009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0052  heat shock protein Hsp20  34.58 
 
 
151 aa  47.4  0.00009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.319643  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1562  small heat shock protein (HSP20-1)  27.52 
 
 
150 aa  47.4  0.00009  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0580  heat shock protein Hsp20  29.63 
 
 
145 aa  47  0.0001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000199173  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1648  heat shock protein Hsp20  33.8 
 
 
115 aa  46.6  0.0001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1840  heat shock protein Hsp20  35.82 
 
 
127 aa  46.6  0.0001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.388818 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0472  heat shock protein Hsp20  33.33 
 
 
115 aa  46.2  0.0002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  hitchhiker  0.00129647  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2323  putative small heat shock protein  32.43 
 
 
100 aa  46.2  0.0002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.814003  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0053  hypothetical protein  33.02 
 
 
204 aa  45.8  0.0002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0647937  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3336  heat shock protein Hsp20  28.07 
 
 
191 aa  45.4  0.0003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3146  heat shock protein Hsp20  21.93 
 
 
167 aa  44.7  0.0005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.754957 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2351  heat shock protein Hsp20  24.75 
 
 
158 aa  44.7  0.0005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1115  heat shock protein Hsp20  25 
 
 
162 aa  44.3  0.0006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0741755  normal  0.307075 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1445  putative heat shock protein  34.15 
 
 
167 aa  44.3  0.0006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.000891901  normal  0.866362 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2316  heat shock protein Hsp20  33.66 
 
 
139 aa  44.3  0.0008  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0611291  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0037  heat shock protein Hsp20  34.58 
 
 
142 aa  43.9  0.001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1594  heat shock protein Hsp20  36.11 
 
 
113 aa  43.5  0.001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.386135 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1977  heat shock protein Hsp20  32.69 
 
 
139 aa  43.5  0.001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.334288  normal  0.643075 
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4550  heat shock protein Hsp20  29.67 
 
 
166 aa  43.5  0.001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1396  molecular chaperone-like protein  29.17 
 
 
152 aa  43.1  0.001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.610569 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4669  heat shock protein Hsp20  28.26 
 
 
147 aa  43.9  0.001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4310  heat shock protein Hsp20  29.67 
 
 
166 aa  43.5  0.001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2564  heat shock protein Hsp20  27.71 
 
 
123 aa  43.1  0.001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2210  heat shock protein Hsp20  30.77 
 
 
139 aa  43.5  0.001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0417447  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0383  heat shock protein Hsp20  21.88 
 
 
166 aa  43.5  0.001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.170778  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0833  heat shock protein Hsp20  31.71 
 
 
169 aa  43.1  0.002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1149  heat shock protein Hsp20  30.85 
 
 
140 aa  42.7  0.002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1219  heat shock protein Hsp20  30.85 
 
 
140 aa  42.7  0.002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2074  heat shock protein Hsp20  21.93 
 
 
173 aa  42.7  0.002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.145284  normal  0.308358 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0774  heat shock protein Hsp20  30.69 
 
 
139 aa  42.4  0.002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1165  heat shock protein Hsp20  30 
 
 
145 aa  42  0.003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.245253  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5194  heat shock protein Hsp20  22.62 
 
 
169 aa  42.4  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0987038  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3725  heat shock protein Hsp20  32.35 
 
 
143 aa  42  0.003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.843054  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2940  heat shock protein Hsp20  22.44 
 
 
168 aa  42.4  0.003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0154  heat shock protein Hsp20  22.99 
 
 
156 aa  42  0.003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.184978  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0289  heat shock protein Hsp20  29.75 
 
 
148 aa  42.4  0.003  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0247001  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2024  heat shock protein Hsp20  30.48 
 
 
146 aa  41.6  0.004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.106375 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1348  heat shock protein Hsp20  30.48 
 
 
146 aa  41.6  0.004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.403253 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3255  heat shock protein Hsp20  27.84 
 
 
132 aa  42  0.004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1869  putative small heat shock protein  29.47 
 
 
142 aa  42  0.004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.309197  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3577  heat shock protein Hsp20  27.36 
 
 
157 aa  41.6  0.005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.202692  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3788  heat shock protein Hsp20  30.77 
 
 
144 aa  41.2  0.006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.964317 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2159  heat shock protein Hsp20  29.7 
 
 
139 aa  41.2  0.006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0146906  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1543  heat shock protein Hsp20  29.67 
 
 
146 aa  41.2  0.006  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.000494204  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12068  heat shock protein hspX  32.76 
 
 
144 aa  41.2  0.006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1076  heat shock protein Hsp20  28.57 
 
 
148 aa  41.2  0.006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.713568  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3078  heat shock protein Hsp20  30.56 
 
 
145 aa  41.2  0.006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000700712  normal  0.0754711 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0630  heat shock protein Hsp20  26.72 
 
 
138 aa  41.2  0.006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.140987  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3724  heat shock protein Hsp20  23.23 
 
 
185 aa  41.2  0.007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3680  heat shock protein Hsp20  23.23 
 
 
185 aa  41.2  0.007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.626967 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1374  heat shock protein Hsp20  34.02 
 
 
143 aa  40.8  0.007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.2364  normal  0.511095 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2118  heat shock protein Hsp20  31.25 
 
 
166 aa  41.2  0.007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3074  heat shock protein Hsp20  23.58 
 
 
144 aa  40.8  0.008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0982  HSP20 family protein  31.31 
 
 
176 aa  40.8  0.008  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4118  heat shock protein Hsp20  21.21 
 
 
172 aa  40.4  0.009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.513744 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>