More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmc1_1348 on replicon NC_008576
Organism: Magnetococcus sp. MC-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008576  Mmc1_1348  heat shock protein Hsp20  100 
 
 
146 aa  304  2.0000000000000002e-82  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.403253 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2024  heat shock protein Hsp20  100 
 
 
146 aa  304  2.0000000000000002e-82  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.106375 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3078  heat shock protein Hsp20  72.92 
 
 
145 aa  221  3e-57  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000700712  normal  0.0754711 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2986  heat shock protein Hsp20  47.59 
 
 
147 aa  144  5e-34  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00130326  normal  0.964264 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0538  HSP20 family protein  46.9 
 
 
147 aa  143  8.000000000000001e-34  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4352  heat shock protein Hsp20  45.83 
 
 
145 aa  141  3e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.735936  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4507  heat shock protein Hsp20  45.14 
 
 
145 aa  138  1.9999999999999998e-32  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3905  heat shock protein Hsp20  45.52 
 
 
147 aa  137  6e-32  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000984381  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4488  heat shock protein Hsp20  44.44 
 
 
145 aa  137  6e-32  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2790  heat shock protein Hsp20  44.9 
 
 
149 aa  132  9.999999999999999e-31  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000163808  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4499  heat shock protein Hsp20  46.53 
 
 
145 aa  132  9.999999999999999e-31  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.100268 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3076  heat shock protein Hsp20  44.52 
 
 
148 aa  127  4.0000000000000003e-29  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0623  heat shock protein Hsp20  41.72 
 
 
152 aa  125  2.0000000000000002e-28  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.844177  normal  0.400233 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2957  HSP20 family protein  42.55 
 
 
143 aa  122  2e-27  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0383  heat shock protein Hsp20  43.75 
 
 
158 aa  122  2e-27  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0989  heat shock protein Hsp20  41.5 
 
 
148 aa  122  2e-27  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.543303  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2730  heat shock protein Hsp20  41.78 
 
 
148 aa  121  3e-27  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2477  heat shock protein Hsp20  40.29 
 
 
143 aa  119  1.9999999999999998e-26  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2188  heat shock protein Hsp20  39.87 
 
 
156 aa  114  3e-25  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.345525  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1365  heat shock protein Hsp20  41.78 
 
 
160 aa  115  3e-25  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.117276  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1434  low molecular weight heat shock protein  41.78 
 
 
160 aa  115  3e-25  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2532  HSP20 family protein  40.74 
 
 
144 aa  114  3.9999999999999997e-25  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1762  heat shock protein Hsp20  36.62 
 
 
144 aa  113  1.0000000000000001e-24  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1127  heat shock protein Hsp20  40.58 
 
 
142 aa  111  3e-24  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0197  heat shock protein Hsp20  36.62 
 
 
147 aa  110  5e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0542117 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0391  heat shock protein Hsp20  40 
 
 
143 aa  110  7.000000000000001e-24  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000478859  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02640  low molecular weight heat shock protein  42.07 
 
 
158 aa  110  8.000000000000001e-24  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0125  heat shock protein Hsp20  39.29 
 
 
139 aa  110  9e-24  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.369397  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0362  heat shock protein Hsp20  37.88 
 
 
144 aa  109  2.0000000000000002e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.025472  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4342  heat shock protein Hsp20  36.62 
 
 
147 aa  108  2.0000000000000002e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.232434  normal  0.204531 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0343  heat shock protein Hsp20  37.12 
 
 
144 aa  108  3e-23  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.90555e-28 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2022  heat shock protein Hsp20  39.44 
 
 
141 aa  107  4.0000000000000004e-23  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0891  heat shock protein Hsp20  39.72 
 
 
137 aa  108  4.0000000000000004e-23  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.805469  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0320  heat shock protein Hsp20  39.86 
 
 
150 aa  107  4.0000000000000004e-23  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1892  HSP20 family protein  46.85 
 
 
132 aa  106  8.000000000000001e-23  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.684879  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0838  heat shock protein Hsp20  45.71 
 
 
162 aa  105  2e-22  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0557  heat shock protein Hsp20  37.86 
 
 
147 aa  105  2e-22  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0117197  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1296  heat shock protein Hsp20  39.42 
 
 
143 aa  105  2e-22  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1824  heat shock protein Hsp20  39.04 
 
 
146 aa  105  2e-22  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0843989  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2320  heat shock protein Hsp20  37.32 
 
 
149 aa  105  2e-22  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0052  heat shock protein Hsp20  34.87 
 
 
151 aa  104  3e-22  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.319643  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0762  heat shock protein Hsp20  46.85 
 
 
134 aa  105  3e-22  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0543  heat shock protein Hsp20  37.86 
 
 
147 aa  104  5e-22  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0340696  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0505  heat shock protein Hsp20  34.53 
 
 
158 aa  104  5e-22  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1320  Hsp20/alpha crystallin family protein  35.81 
 
 
151 aa  103  6e-22  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1262  small heat shock protein  35.81 
 
 
151 aa  103  6e-22  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.753574  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0540  heat shock protein Hsp20  36.11 
 
 
147 aa  103  6e-22  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0610  heat shock protein Hsp20  37.96 
 
 
136 aa  103  6e-22  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.335952  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1076  heat shock protein Hsp20  34.48 
 
 
148 aa  103  7e-22  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.713568  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4766  heat shock protein Hsp20  40.54 
 
 
163 aa  103  8e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  decreased coverage  0.0000408851  hitchhiker  0.00874264 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3788  heat shock protein Hsp20  36.55 
 
 
144 aa  102  1e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.964317 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0369  HSP20 family protein  44.66 
 
 
153 aa  103  1e-21  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  4.93231e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0445  heat shock protein Hsp20  37.33 
 
 
150 aa  102  1e-21  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0539  heat shock protein Hsp20  36.81 
 
 
161 aa  102  1e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0954  Hsp20/alpha crystallin family protein  42.86 
 
 
162 aa  101  3e-21  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.154946  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2078  heat shock protein Hsp20  35.86 
 
 
147 aa  101  3e-21  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0481  heat shock protein Hsp20  35.77 
 
 
150 aa  101  4e-21  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.411475 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2316  heat shock protein Hsp20  50 
 
 
139 aa  101  4e-21  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0611291  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1010  heat shock protein Hsp20  36.99 
 
 
153 aa  100  5e-21  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00224234  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2132  heat shock protein Hsp20  41.13 
 
 
164 aa  100  7e-21  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.585874 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1977  heat shock protein Hsp20  38.39 
 
 
139 aa  100  8e-21  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.334288  normal  0.643075 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_825  HSP20/alpha crystallin  42.86 
 
 
162 aa  100  8e-21  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1743  heat shock protein Hsp20  40 
 
 
145 aa  99.4  1e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.49982  normal  0.0110244 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2086  heat shock protein, Hsp20 family  40 
 
 
145 aa  99.4  1e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0865  heat shock protein Hsp20  44.14 
 
 
134 aa  99.4  1e-20  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.303654  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4023  heat shock protein Hsp20  34.25 
 
 
147 aa  99.4  2e-20  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0622  HSP20 family protein  45.05 
 
 
132 aa  99  2e-20  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4061  heat shock protein Hsp20  34.25 
 
 
147 aa  99.4  2e-20  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0102  heat shock protein Hsp20  36.64 
 
 
142 aa  99.4  2e-20  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0774  heat shock protein Hsp20  41.12 
 
 
139 aa  97.8  5e-20  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0836  heat shock protein Hsp20  40.31 
 
 
143 aa  97.4  6e-20  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.534587  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2522  heat shock protein Hsp20  37.27 
 
 
150 aa  97.4  6e-20  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0936  heat shock protein Hsp20  32.41 
 
 
155 aa  97.4  6e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.172536  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2287  heat shock protein Hsp20  34.75 
 
 
189 aa  97.1  7e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0403  heat shock protein Hsp20  36.88 
 
 
138 aa  96.7  1e-19  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0788  heat shock protein Hsp20  38.46 
 
 
143 aa  95.9  2e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.351008  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2210  heat shock protein Hsp20  38.74 
 
 
139 aa  95.5  2e-19  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0417447  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0513  heat shock protein Hsp20  39.34 
 
 
147 aa  95.1  3e-19  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2857  heat shock protein Hsp20  36.92 
 
 
158 aa  94.7  3e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.274432  normal  0.0879388 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0037  heat shock protein Hsp20  31.47 
 
 
142 aa  94.7  4e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3394  heat shock protein Hsp20  33.33 
 
 
189 aa  94  6e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0219016  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2683  heat shock protein Hsp20  36.3 
 
 
145 aa  94  6e-19  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.338339  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2938  heat shock protein Hsp20  35.97 
 
 
145 aa  94  6e-19  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000000491843  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2635  heat shock protein Hsp20  32.88 
 
 
148 aa  93.6  7e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3468  heat shock protein Hsp20  32.88 
 
 
148 aa  94  7e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.282569  normal  0.556723 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2578  putative heat shock protein  34 
 
 
185 aa  93.6  7e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0580  heat shock protein Hsp20  35.34 
 
 
145 aa  93.2  1e-18  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000199173  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1171  heat shock protein Hsp20  33.33 
 
 
189 aa  92.8  1e-18  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.726376  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4859  heat shock protein Hsp20  38.26 
 
 
204 aa  92.4  2e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0756  heat shock protein Hsp20  43.44 
 
 
132 aa  92.4  2e-18  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.16256 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1917  heat shock protein Hsp20  37.98 
 
 
156 aa  92  2e-18  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.86534  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0629  heat shock protein Hsp20  33.78 
 
 
189 aa  92.4  2e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.185609 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0675  heat shock protein Hsp20  37.84 
 
 
163 aa  92.4  2e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.000000558694  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3074  heat shock protein Hsp20  40 
 
 
144 aa  92.4  2e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2366  heat shock protein Hsp20  36.96 
 
 
151 aa  92.4  2e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.550987  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0200  heat shock protein Hsp20  35.97 
 
 
176 aa  91.7  3e-18  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.377048  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1706  heat shock protein Hsp20  41.13 
 
 
132 aa  91.7  3e-18  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00808314  hitchhiker  0.000432661 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2159  heat shock protein Hsp20  44.76 
 
 
139 aa  92  3e-18  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0146906  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1983  heat shock protein Hsp20  34.29 
 
 
153 aa  91.7  3e-18  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00684856  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4819  heat shock protein Hsp20  33.33 
 
 
146 aa  91.3  4e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.414421 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>