More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcal_1810 on replicon NC_009073
Organism: Pyrobaculum calidifontis JCM 11548



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009073  Pcal_1810  heat shock protein Hsp20  100 
 
 
176 aa  348  2e-95  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1657  heat shock protein Hsp20  89.2 
 
 
174 aa  312  1.9999999999999998e-84  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.760781 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0537  heat shock protein Hsp20  88.64 
 
 
173 aa  310  4.999999999999999e-84  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.0220395 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1620  heat shock protein Hsp20  86.36 
 
 
175 aa  308  2e-83  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.192454  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1856  heat shock protein Hsp20  51.11 
 
 
176 aa  169  1e-41  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0231  heat shock protein Hsp20  51.15 
 
 
176 aa  123  1e-27  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0640  heat shock protein Hsp20  49.23 
 
 
170 aa  122  3e-27  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.402449  normal  0.271447 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0447  heat shock protein Hsp20  39.88 
 
 
171 aa  115  3.9999999999999997e-25  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1492  heat shock protein Hsp20  44.06 
 
 
182 aa  103  9e-22  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2833  heat shock protein Hsp20  46.62 
 
 
183 aa  102  3e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0010  heat shock protein HSP20  34.68 
 
 
163 aa  100  8e-21  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0805  heat shock protein Hsp20  39.11 
 
 
195 aa  99.4  2e-20  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0907  putative heat shock protein  33.33 
 
 
175 aa  92  3e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.606312  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0906  hypothetical protein  36.13 
 
 
165 aa  90.9  9e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0942345  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0695  hypothetical protein  41.88 
 
 
183 aa  90.1  1e-17  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.756333  normal  0.812325 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2547  putative heat shock protein  51.32 
 
 
132 aa  80.9  0.000000000000008  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.837495  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2444  putative heat shock protein  37.67 
 
 
175 aa  79.7  0.00000000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0658  heat shock protein Hsp20  41.44 
 
 
130 aa  80.1  0.00000000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0285  heat shock protein Hsp20  45.88 
 
 
133 aa  77.4  0.0000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3021  heat shock protein HSP20  37.61 
 
 
176 aa  75.5  0.0000000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2140  heat shock protein Hsp20  47.06 
 
 
133 aa  75.5  0.0000000000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0472  heat shock protein Hsp20  46.51 
 
 
115 aa  75.1  0.0000000000004  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  hitchhiker  0.00129647  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1494  hypothetical protein  38.32 
 
 
184 aa  73.9  0.000000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.911601  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1648  heat shock protein Hsp20  44.19 
 
 
115 aa  72.4  0.000000000003  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1246  heat shock protein, HSP20 family protein  35.29 
 
 
177 aa  72.4  0.000000000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.143675  normal  0.0444206 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1840  heat shock protein Hsp20  45.35 
 
 
127 aa  71.2  0.000000000007  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.388818 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1594  heat shock protein Hsp20  41.86 
 
 
113 aa  68.2  0.00000000005  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.386135 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1812  hypothetical protein  33.04 
 
 
170 aa  65.5  0.0000000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0557  heat shock protein Hsp20  37.76 
 
 
147 aa  60.8  0.00000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0117197  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2559  hypothetical protein  34.43 
 
 
164 aa  59.7  0.00000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2414  hypothetical protein  34.43 
 
 
164 aa  59.7  0.00000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1806  small heat shock protein  37.14 
 
 
152 aa  59.3  0.00000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2370  HSP20 type chaperone  36.84 
 
 
125 aa  58.9  0.00000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.40451 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1562  small heat shock protein (HSP20-1)  31.51 
 
 
150 aa  59.3  0.00000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0543  heat shock protein Hsp20  35.71 
 
 
147 aa  59.3  0.00000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0340696  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0982  HSP20 family protein  30.48 
 
 
176 aa  58.5  0.00000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0369  HSP20 family protein  32.04 
 
 
153 aa  58.9  0.00000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  4.93231e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1354  heat shock protein Hsp20  34 
 
 
134 aa  58.5  0.00000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0222398  normal  0.226114 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0445  heat shock protein Hsp20  35.51 
 
 
150 aa  58.2  0.00000006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2074  heat shock protein Hsp20  32.29 
 
 
173 aa  57.8  0.00000008  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.145284  normal  0.308358 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0047  heat shock protein Hsp20  38.68 
 
 
148 aa  57  0.0000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.333015  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1076  heat shock protein Hsp20  35.48 
 
 
148 aa  57  0.0000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.713568  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4461  heat shock protein Hsp20  35.16 
 
 
163 aa  56.6  0.0000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0859  heat shock protein Hsp20  35.51 
 
 
153 aa  56.2  0.0000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1508  heat shock protein Hsp20  37.37 
 
 
154 aa  56.6  0.0000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0438643  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1083  hypothetical protein  30.67 
 
 
183 aa  55.5  0.0000004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1543  heat shock protein Hsp20  35.92 
 
 
146 aa  54.7  0.0000006  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.000494204  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0580  heat shock protein Hsp20  33.64 
 
 
145 aa  54.3  0.0000008  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000199173  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3386  heat shock protein Hsp20  30 
 
 
147 aa  54.7  0.0000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0926  heat shock protein Hsp20  35.23 
 
 
152 aa  54.3  0.0000009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0406  heat shock protein Hsp20  34.65 
 
 
137 aa  53.9  0.000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0194442  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0446  heat shock protein Hsp20  40.22 
 
 
151 aa  53.5  0.000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.281567  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0593  heat shock protein Hsp20  31.78 
 
 
191 aa  53.9  0.000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.95349  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1758  heat shock protein Hsp20  31.25 
 
 
223 aa  53.5  0.000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1122  heat shock protein Hsp20  33.33 
 
 
170 aa  52.4  0.000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.421321  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0537  heat shock protein Hsp20  29.59 
 
 
140 aa  52.8  0.000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1170  heat shock protein Hsp20  36.36 
 
 
170 aa  52.4  0.000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2505  heat shock protein Hsp20  28.43 
 
 
138 aa  52.8  0.000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.239492  normal  0.0462479 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1018  heat shock protein Hsp20  29.63 
 
 
177 aa  52.4  0.000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.683731  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1214  molecular chaperone (small heat shock protein)  32.65 
 
 
260 aa  52  0.000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.318766  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5150  heat shock protein Hsp20  33.33 
 
 
146 aa  52.4  0.000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4118  heat shock protein Hsp20  32 
 
 
172 aa  52  0.000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.513744 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2384  heat shock protein Hsp20  30.68 
 
 
164 aa  52  0.000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3903  heat shock protein Hsp20  29.52 
 
 
194 aa  52.4  0.000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.534424 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1824  heat shock protein Hsp20  31.63 
 
 
146 aa  51.6  0.000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0843989  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1537  heat shock protein Hsp20  36.36 
 
 
142 aa  52  0.000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1488  hypothetical protein  29.11 
 
 
340 aa  52  0.000005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.560243  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3323  heat shock protein Hsp20  29.25 
 
 
228 aa  51.2  0.000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4395  heat shock protein Hsp20  27.27 
 
 
181 aa  51.2  0.000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.481666  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4528  heat shock protein Hsp20  27.27 
 
 
181 aa  51.2  0.000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.550609  normal  0.0462291 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0504  heat shock protein Hsp20  34.86 
 
 
152 aa  51.2  0.000007  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.5396  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4859  heat shock protein Hsp20  27.27 
 
 
204 aa  51.2  0.000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0203  heat shock protein Hsp20  34.65 
 
 
154 aa  50.4  0.00001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2212  heat shock protein Hsp20  31.58 
 
 
171 aa  50.8  0.00001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3680  heat shock protein Hsp20  33.68 
 
 
185 aa  50.1  0.00002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.626967 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1731  HSP20 family protein  37.5 
 
 
126 aa  50.1  0.00002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.13098  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1732  HSP20 family protein  31.73 
 
 
167 aa  49.7  0.00002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.371108  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0892  heat shock protein Hsp20  34.65 
 
 
154 aa  49.7  0.00002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1171  heat shock protein Hsp20  30.91 
 
 
189 aa  50.1  0.00002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.726376  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1983  heat shock protein Hsp20  36.45 
 
 
153 aa  49.7  0.00002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00684856  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1708  heat shock protein HSP20  34.65 
 
 
154 aa  50.1  0.00002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.563674  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3724  heat shock protein Hsp20  33.68 
 
 
185 aa  50.1  0.00002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5491  heat shock protein Hsp20  27.55 
 
 
211 aa  49.7  0.00002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.710483  normal  0.352797 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0052  heat shock protein Hsp20  28.68 
 
 
151 aa  49.7  0.00002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.319643  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1631  heat shock protein Hsp20  35.05 
 
 
145 aa  50.1  0.00002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0188  heat shock protein Hsp20  34.29 
 
 
150 aa  49.7  0.00002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0481  heat shock protein Hsp20  35.51 
 
 
150 aa  50.1  0.00002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.411475 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0720  heat shock protein Hsp20  32.38 
 
 
120 aa  50.1  0.00002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00436062  normal  0.512737 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0117  heat shock protein Hsp20  33.68 
 
 
111 aa  49.7  0.00002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000104123  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3774  heat shock protein Hsp20  30.21 
 
 
132 aa  49.3  0.00003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3666  heat shock protein Hsp20  30.21 
 
 
132 aa  49.3  0.00003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0021013  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14610  heat shock protein Hsp20  32.65 
 
 
143 aa  49.3  0.00003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000610495  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0037  heat shock protein Hsp20  32.71 
 
 
142 aa  49.3  0.00003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2462  heat shock protein Hsp20  33.33 
 
 
168 aa  48.5  0.00004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0466294  normal  0.178308 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0383  heat shock protein Hsp20  29.29 
 
 
166 aa  48.9  0.00004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.170778  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2049  heat shock protein Hsp20  25.71 
 
 
164 aa  48.5  0.00005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  hitchhiker  0.0000140473  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2564  heat shock protein Hsp20  34.18 
 
 
123 aa  48.1  0.00005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0629  heat shock protein Hsp20  29.59 
 
 
189 aa  48.5  0.00005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.185609 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1396  molecular chaperone-like protein  32.85 
 
 
152 aa  48.5  0.00005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.610569 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3255  heat shock protein Hsp20  29 
 
 
132 aa  48.5  0.00005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>