More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_4118 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_4118  heat shock protein Hsp20  100 
 
 		 172 aa  343  5e-94  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.513744 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3724  heat shock protein Hsp20  68.6 
 
 		 185 aa  231  4.0000000000000004e-60  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3680  heat shock protein Hsp20  68.6 
 
 		 185 aa  231  4.0000000000000004e-60  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.626967 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2212  heat shock protein Hsp20  61.9 
 
 		 171 aa  214  5.9999999999999996e-55  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2355  heat shock protein Hsp20  60.74 
 
 		 165 aa  203  8e-52  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.20966  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3146  heat shock protein Hsp20  58.24 
 
 		 167 aa  196  1.0000000000000001e-49  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.754957 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2074  heat shock protein Hsp20  60.92 
 
 		 173 aa  195  3e-49  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.145284  normal  0.308358 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4635  heat shock protein Hsp20  58.08 
 
 		 169 aa  193  1e-48  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2940  heat shock protein Hsp20  54.82 
 
 		 168 aa  189  1e-47  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5194  heat shock protein Hsp20  56.29 
 
 		 169 aa  189  2e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0987038  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0383  heat shock protein Hsp20  53.94 
 
 		 166 aa  182  2.0000000000000003e-45  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.170778  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2118  heat shock protein Hsp20  56.55 
 
 		 166 aa  181  4.0000000000000006e-45  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4310  heat shock protein Hsp20  55.95 
 
 		 166 aa  177  5.999999999999999e-44  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4550  heat shock protein Hsp20  55.95 
 
 		 166 aa  177  5.999999999999999e-44  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2802  heat shock protein Hsp20  51.5 
 
 		 167 aa  176  2e-43  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.20157 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2462  heat shock protein Hsp20  51.81 
 
 		 168 aa  174  4e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0466294  normal  0.178308 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3241  heat shock protein Hsp20  50.3 
 
 		 166 aa  170  7.999999999999999e-42  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.406826  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1115  heat shock protein Hsp20  53.33 
 
 		 162 aa  169  2e-41  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0741755  normal  0.307075 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2132  heat shock protein Hsp20  49.37 
 
 		 164 aa  155  2e-37  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.585874 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2384  heat shock protein Hsp20  47.02 
 
 		 164 aa  143  1e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4859  heat shock protein Hsp20  44.3 
 
 		 204 aa  131  3.9999999999999996e-30  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4461  heat shock protein Hsp20  41.76 
 
 		 163 aa  127  6e-29  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3903  heat shock protein Hsp20  45.64 
 
 		 194 aa  127  7.000000000000001e-29  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.534424 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3412  small HspC2 heat shock protein  42.26 
 
 		 189 aa  125  4.0000000000000003e-28  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.260583  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1171  heat shock protein Hsp20  38.3 
 
 		 189 aa  124  6e-28  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.726376  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0629  heat shock protein Hsp20  41.07 
 
 		 189 aa  123  1e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.185609 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3394  heat shock protein Hsp20  41.32 
 
 		 189 aa  122  3e-27  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0219016  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2287  heat shock protein Hsp20  37.23 
 
 		 189 aa  119  1.9999999999999998e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2860  heat shock protein Hsp20  36.61 
 
 		 184 aa  118  3.9999999999999996e-26  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.793853  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0200  heat shock protein Hsp20  45.27 
 
 		 176 aa  115  3.9999999999999997e-25  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.377048  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3527  putative HspC2 heat shock protein  42.94 
 
 		 173 aa  109  2.0000000000000002e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0868338  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2857  heat shock protein Hsp20  41.1 
 
 		 158 aa  107  1e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.274432  normal  0.0879388 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0389  heat shock protein Hsp20  34.3 
 
 		 166 aa  107  1e-22  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.706384 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1917  heat shock protein Hsp20  38.32 
 
 		 156 aa  103  8e-22  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.86534  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1366  heat shock protein Hsp20  39.26 
 
 		 176 aa  103  1e-21  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.74874  normal  0.190619 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3582  heat shock protein Hsp20  45.95 
 
 		 166 aa  103  2e-21  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1127  heat shock protein Hsp20  39.1 
 
 		 142 aa  100  1e-20  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0543  heat shock protein Hsp20  38.24 
 
 		 147 aa  99  3e-20  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0340696  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2276  heat shock protein Hsp20  40.46 
 
 		 175 aa  99  3e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0557  heat shock protein Hsp20  39.06 
 
 		 147 aa  97.4  9e-20  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0117197  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2559  hypothetical protein  33.56 
 
 		 164 aa  95.9  2e-19  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2414  hypothetical protein  33.56 
 
 		 164 aa  96.3  2e-19  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0989  heat shock protein Hsp20  39.1 
 
 		 148 aa  95.9  2e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.543303  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4819  heat shock protein Hsp20  37.5 
 
 		 146 aa  96.3  2e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.414421 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2122  heat shock protein Hsp20  32.37 
 
 		 180 aa  95.1  4e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.451471 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20170  heat shock protein Hsp20  37.75 
 
 		 177 aa  94.4  6e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.638214  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0481  heat shock protein Hsp20  40.29 
 
 		 150 aa  94.4  7e-19  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.411475 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3498  heat shock protein Hsp20  36.36 
 
 		 158 aa  94.4  7e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.938667  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0538  HSP20 family protein  37.14 
 
 		 147 aa  94  9e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3882  heat shock protein Hsp20  38.78 
 
 		 158 aa  94  9e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.545217  normal  0.180827 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6892  heat shock protein Hsp20  41.22 
 
 		 157 aa  93.6  1e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.862152  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3805  heat shock protein Hsp20  36.36 
 
 		 158 aa  94  1e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.232205  normal  0.564168 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25770  heat shock Hsp20 protein  38.73 
 
 		 198 aa  94  1e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0197  heat shock protein Hsp20  40.58 
 
 		 147 aa  92.4  2e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0542117 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2790  heat shock protein Hsp20  36.76 
 
 		 149 aa  92.4  2e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000163808  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5491  heat shock protein Hsp20  40.46 
 
 		 211 aa  93.2  2e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.710483  normal  0.352797 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2320  heat shock protein Hsp20  40.71 
 
 		 149 aa  92.8  2e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0762  heat shock protein Hsp20  40.48 
 
 		 134 aa  92.4  3e-18  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4342  heat shock protein Hsp20  39.86 
 
 		 147 aa  91.7  4e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.232434  normal  0.204531 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3234  HSP20 family protein  39.22 
 
 		 231 aa  91.7  5e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2049  heat shock protein Hsp20  37.5 
 
 		 164 aa  91.3  7e-18  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  hitchhiker  0.0000140473  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2460  heat shock protein Hsp20  36.42 
 
 		 186 aa  90.9  8e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.0031555  normal  0.623789 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2836  heat shock protein Hsp20  32.16 
 
 		 197 aa  90.9  9e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00556978  normal  0.209218 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3765  heat shock protein Hsp20  40.44 
 
 		 143 aa  90.1  1e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2635  heat shock protein Hsp20  37.68 
 
 		 148 aa  89.4  2e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4230  heat shock protein Hsp20  44.95 
 
 		 105 aa  89.7  2e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1892  HSP20 family protein  35 
 
 		 132 aa  89.7  2e-17  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.684879  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3612  hypothetical protein  34.94 
 
 		 177 aa  89.4  2e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0924  heat shock protein  36.36 
 
 		 180 aa  89.4  2e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3468  heat shock protein Hsp20  37.68 
 
 		 148 aa  89.7  2e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.282569  normal  0.556723 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4023  heat shock protein Hsp20  34.31 
 
 		 147 aa  89  3e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0369  HSP20 family protein  37.98 
 
 		 153 aa  89  3e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  4.93231e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1429  heat shock protein Hsp20  34.39 
 
 		 169 aa  89  3e-17  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4061  heat shock protein Hsp20  34.31 
 
 		 147 aa  89  3e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0580  heat shock protein Hsp20  36.23 
 
 		 145 aa  89  3e-17  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000199173  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4819  heat shock protein Hsp20  31.72 
 
 		 218 aa  88.6  4e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0838  heat shock protein Hsp20  36.04 
 
 		 162 aa  88.2  5e-17  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4499  heat shock protein Hsp20  41.55 
 
 		 145 aa  88.2  5e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.100268 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2522  heat shock protein Hsp20  34.65 
 
 		 150 aa  87.4  8e-17  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4395  heat shock protein Hsp20  39.41 
 
 		 181 aa  87.4  9e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.481666  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4528  heat shock protein Hsp20  39.41 
 
 		 181 aa  87.4  9e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.550609  normal  0.0462291 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0865  heat shock protein Hsp20  37.6 
 
 		 134 aa  86.7  1e-16  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.303654  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0445  heat shock protein Hsp20  39.69 
 
 		 150 aa  87  1e-16  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0954  Hsp20/alpha crystallin family protein  35.78 
 
 		 162 aa  85.9  2e-16  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.154946  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3788  heat shock protein Hsp20  32.09 
 
 		 144 aa  86.7  2e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.964317 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4488  heat shock protein Hsp20  41.48 
 
 		 145 aa  85.9  2e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2578  putative heat shock protein  36.94 
 
 		 185 aa  85.9  2e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4507  heat shock protein Hsp20  41.48 
 
 		 145 aa  85.5  3e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1170  heat shock protein Hsp20  45.63 
 
 		 170 aa  85.9  3e-16  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2505  heat shock protein Hsp20  34.01 
 
 		 138 aa  85.9  3e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.239492  normal  0.0462479 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1018  heat shock protein Hsp20  39.24 
 
 		 177 aa  85.9  3e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.683731  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2024  heat shock protein Hsp20  35.29 
 
 		 146 aa  85.1  4e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.106375 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4128  heat shock protein Hsp20  33.57 
 
 		 154 aa  85.5  4e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.226976  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0675  heat shock protein Hsp20  40.79 
 
 		 163 aa  85.1  4e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.000000558694  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1348  heat shock protein Hsp20  35.29 
 
 		 146 aa  85.1  4e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.403253 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_825  HSP20/alpha crystallin  38 
 
 		 162 aa  85.1  5e-16  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3076  heat shock protein Hsp20  33.57 
 
 		 173 aa  84.7  6e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1921  heat shock protein Hsp20  46.67 
 
 		 167 aa  84.3  7e-16  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.985705  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4812  heat shock protein Hsp20  33.81 
 
 		 155 aa  84.3  7e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00238667  normal  0.807841 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1738  small HspC2 heat shock protein  32.62 
 
 		 189 aa  84.3  7e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.267785  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>