More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_3903 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010511  M446_3903  heat shock protein Hsp20  100 
 
 
194 aa  387  1e-107  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.534424 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4859  heat shock protein Hsp20  88.27 
 
 
204 aa  292  2e-78  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4118  heat shock protein Hsp20  46.45 
 
 
172 aa  138  3.9999999999999997e-32  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.513744 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2212  heat shock protein Hsp20  47.44 
 
 
171 aa  136  2e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2355  heat shock protein Hsp20  48.98 
 
 
165 aa  135  5e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.20966  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0383  heat shock protein Hsp20  48.3 
 
 
166 aa  134  8e-31  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.170778  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3146  heat shock protein Hsp20  49.66 
 
 
167 aa  134  9.999999999999999e-31  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.754957 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2462  heat shock protein Hsp20  46.62 
 
 
168 aa  133  1.9999999999999998e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0466294  normal  0.178308 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3680  heat shock protein Hsp20  47.47 
 
 
185 aa  131  6e-30  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.626967 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3724  heat shock protein Hsp20  47.47 
 
 
185 aa  131  6e-30  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3241  heat shock protein Hsp20  47.02 
 
 
166 aa  130  9e-30  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.406826  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5194  heat shock protein Hsp20  48.32 
 
 
169 aa  130  9e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0987038  normal 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4635  heat shock protein Hsp20  48.99 
 
 
169 aa  130  1.0000000000000001e-29  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2940  heat shock protein Hsp20  47.65 
 
 
168 aa  130  1.0000000000000001e-29  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3394  heat shock protein Hsp20  45.75 
 
 
189 aa  128  5.0000000000000004e-29  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0219016  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3412  small HspC2 heat shock protein  45.75 
 
 
189 aa  127  9.000000000000001e-29  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.260583  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0629  heat shock protein Hsp20  44.51 
 
 
189 aa  127  1.0000000000000001e-28  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.185609 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0543  heat shock protein Hsp20  43.97 
 
 
147 aa  127  1.0000000000000001e-28  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0340696  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2802  heat shock protein Hsp20  47.26 
 
 
167 aa  127  1.0000000000000001e-28  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.20157 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2287  heat shock protein Hsp20  44.59 
 
 
189 aa  127  1.0000000000000001e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1171  heat shock protein Hsp20  44.37 
 
 
189 aa  126  2.0000000000000002e-28  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.726376  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2074  heat shock protein Hsp20  45.06 
 
 
173 aa  126  2.0000000000000002e-28  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.145284  normal  0.308358 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0557  heat shock protein Hsp20  43.26 
 
 
147 aa  125  4.0000000000000003e-28  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0117197  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1115  heat shock protein Hsp20  46.79 
 
 
162 aa  124  6e-28  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0741755  normal  0.307075 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2384  heat shock protein Hsp20  51.03 
 
 
164 aa  124  7e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2118  heat shock protein Hsp20  47.3 
 
 
166 aa  124  1e-27  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4310  heat shock protein Hsp20  42.76 
 
 
166 aa  120  9.999999999999999e-27  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4550  heat shock protein Hsp20  42.76 
 
 
166 aa  120  9.999999999999999e-27  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2276  heat shock protein Hsp20  40.13 
 
 
175 aa  109  3e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4461  heat shock protein Hsp20  40.82 
 
 
163 aa  107  8.000000000000001e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0538  HSP20 family protein  42.31 
 
 
147 aa  107  1e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1366  heat shock protein Hsp20  35.81 
 
 
176 aa  105  4e-22  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.74874  normal  0.190619 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2790  heat shock protein Hsp20  41.84 
 
 
149 aa  105  4e-22  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000163808  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2860  heat shock protein Hsp20  36.69 
 
 
184 aa  104  6e-22  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.793853  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1917  heat shock protein Hsp20  40 
 
 
156 aa  103  1e-21  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.86534  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2132  heat shock protein Hsp20  39.46 
 
 
164 aa  102  4e-21  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.585874 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0200  heat shock protein Hsp20  39.22 
 
 
176 aa  102  4e-21  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.377048  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3582  heat shock protein Hsp20  39.83 
 
 
166 aa  102  4e-21  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1010  heat shock protein Hsp20  36.02 
 
 
153 aa  99.8  2e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00224234  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2320  heat shock protein Hsp20  37.27 
 
 
149 aa  100  2e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1127  heat shock protein Hsp20  35.25 
 
 
142 aa  99  4e-20  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2986  heat shock protein Hsp20  37.65 
 
 
147 aa  98.6  5e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00130326  normal  0.964264 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1892  HSP20 family protein  35.21 
 
 
132 aa  98.2  6e-20  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.684879  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0838  heat shock protein Hsp20  34.27 
 
 
162 aa  98.2  7e-20  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0865  heat shock protein Hsp20  32.87 
 
 
134 aa  97.1  1e-19  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.303654  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0369  HSP20 family protein  42.73 
 
 
153 aa  97.1  1e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  4.93231e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0762  heat shock protein Hsp20  34.97 
 
 
134 aa  97.4  1e-19  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0296  heat shock protein Hsp20  35.06 
 
 
156 aa  95.9  3e-19  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0481  heat shock protein Hsp20  42.11 
 
 
150 aa  95.5  4e-19  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.411475 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4342  heat shock protein Hsp20  36.42 
 
 
147 aa  95.5  4e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.232434  normal  0.204531 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2122  heat shock protein Hsp20  39.47 
 
 
180 aa  95.1  5e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.451471 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3905  heat shock protein Hsp20  36.84 
 
 
147 aa  95.5  5e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000984381  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4499  heat shock protein Hsp20  38.26 
 
 
145 aa  94  1e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.100268 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1742  heat shock protein Hsp20  39.6 
 
 
152 aa  94.4  1e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.314982  hitchhiker  0.000988198 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2024  heat shock protein Hsp20  35.14 
 
 
146 aa  93.2  2e-18  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.106375 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1348  heat shock protein Hsp20  35.14 
 
 
146 aa  93.2  2e-18  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.403253 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1018  heat shock protein Hsp20  37.5 
 
 
177 aa  93.2  2e-18  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.683731  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1706  heat shock protein Hsp20  32.17 
 
 
132 aa  92.8  3e-18  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00808314  hitchhiker  0.000432661 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1296  heat shock protein Hsp20  38.46 
 
 
143 aa  92.4  4e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2522  heat shock protein Hsp20  40.15 
 
 
150 aa  92.4  4e-18  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0445  heat shock protein Hsp20  36 
 
 
150 aa  92.4  4e-18  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0197  heat shock protein Hsp20  35.76 
 
 
147 aa  92.4  4e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0542117 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0580  heat shock protein Hsp20  38.6 
 
 
145 aa  92  4e-18  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000199173  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1170  heat shock protein Hsp20  39.5 
 
 
170 aa  91.3  7e-18  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3765  heat shock protein Hsp20  35.53 
 
 
143 aa  90.9  9e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2505  heat shock protein Hsp20  35.57 
 
 
138 aa  90.9  9e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.239492  normal  0.0462479 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3076  heat shock protein Hsp20  38.3 
 
 
148 aa  90.9  9e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0954  Hsp20/alpha crystallin family protein  42.27 
 
 
162 aa  90.9  1e-17  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.154946  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2857  heat shock protein Hsp20  36.73 
 
 
158 aa  90.9  1e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.274432  normal  0.0879388 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0989  heat shock protein Hsp20  38.85 
 
 
148 aa  89.7  2e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.543303  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3080  heat shock protein Hsp20  33.53 
 
 
230 aa  90.1  2e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4507  heat shock protein Hsp20  36.54 
 
 
145 aa  89.4  3e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20170  heat shock protein Hsp20  35.8 
 
 
177 aa  89.7  3e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.638214  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_825  HSP20/alpha crystallin  37.01 
 
 
162 aa  89.4  3e-17  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4352  heat shock protein Hsp20  36.54 
 
 
145 aa  89.4  3e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.735936  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3612  hypothetical protein  35.67 
 
 
177 aa  89.7  3e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3234  HSP20 family protein  38.03 
 
 
231 aa  89  4e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4488  heat shock protein Hsp20  36.54 
 
 
145 aa  89  4e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3527  putative HspC2 heat shock protein  35.03 
 
 
173 aa  88.6  5e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0868338  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0924  heat shock protein  34.42 
 
 
180 aa  88.6  5e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3078  heat shock protein Hsp20  35.33 
 
 
145 aa  88.6  6e-17  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000700712  normal  0.0754711 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0675  heat shock protein Hsp20  35.19 
 
 
163 aa  88.2  7e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.000000558694  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2796  heat shock protein  38.46 
 
 
152 aa  87.8  9e-17  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.300285  normal  0.746249 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0463  heat shock protein Hsp20  32.93 
 
 
166 aa  87.4  1e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6892  heat shock protein Hsp20  39.52 
 
 
157 aa  87.8  1e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.862152  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0936  heat shock protein Hsp20  36.62 
 
 
155 aa  87  2e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.172536  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6104  heat shock protein Hsp20  40.14 
 
 
158 aa  85.9  3e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0249434 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2366  heat shock protein Hsp20  36.77 
 
 
151 aa  85.9  3e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.550987  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1320  Hsp20/alpha crystallin family protein  35.46 
 
 
151 aa  85.9  4e-16  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2460  heat shock protein Hsp20  37.32 
 
 
186 aa  85.5  4e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.0031555  normal  0.623789 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1262  small heat shock protein  35.46 
 
 
151 aa  85.9  4e-16  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.753574  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2578  putative heat shock protein  34.36 
 
 
185 aa  85.5  4e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1921  heat shock protein Hsp20  37.3 
 
 
167 aa  85.5  4e-16  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.985705  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4395  heat shock protein Hsp20  37.5 
 
 
181 aa  85.1  5e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.481666  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4528  heat shock protein Hsp20  37.5 
 
 
181 aa  85.1  5e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.550609  normal  0.0462291 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1543  heat shock protein Hsp20  40.32 
 
 
146 aa  85.5  5e-16  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.000494204  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0383  heat shock protein Hsp20  35.03 
 
 
158 aa  85.5  5e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1762  heat shock protein Hsp20  37.01 
 
 
144 aa  85.1  6e-16  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0102  heat shock protein Hsp20  31.03 
 
 
142 aa  85.1  6e-16  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2938  heat shock protein Hsp20  35.03 
 
 
145 aa  85.1  6e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000000491843  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>