More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tgr7_1921 on replicon NC_011901
Organism: Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011901  Tgr7_1921  heat shock protein Hsp20  100 
 
 
167 aa  338  2e-92  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.985705  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2731  heat shock protein Hsp20  52.12 
 
 
166 aa  179  1e-44  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1732  HSP20 family protein  42.07 
 
 
167 aa  138  3.9999999999999997e-32  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.371108  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0833  heat shock protein Hsp20  39.64 
 
 
169 aa  124  4.0000000000000003e-28  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1170  heat shock protein Hsp20  40.94 
 
 
170 aa  118  4.9999999999999996e-26  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1445  putative heat shock protein  39.29 
 
 
167 aa  116  9.999999999999999e-26  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.000891901  normal  0.866362 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4461  heat shock protein Hsp20  44.04 
 
 
163 aa  95.5  3e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3312  heat shock protein, putative  41.82 
 
 
129 aa  95.1  4e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.267805  normal  0.275059 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4819  heat shock protein Hsp20  34.67 
 
 
218 aa  92.8  2e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0557  heat shock protein Hsp20  45.1 
 
 
147 aa  90.9  7e-18  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0117197  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2212  heat shock protein Hsp20  49.04 
 
 
171 aa  90.9  8e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0543  heat shock protein Hsp20  44.12 
 
 
147 aa  90.1  1e-17  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0340696  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2287  heat shock protein Hsp20  42.06 
 
 
189 aa  87.8  6e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2355  heat shock protein Hsp20  48.08 
 
 
165 aa  87.8  7e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.20966  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0200  heat shock protein Hsp20  41.41 
 
 
176 aa  87  1e-16  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.377048  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4819  heat shock protein Hsp20  42.31 
 
 
146 aa  86.3  2e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.414421 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3394  heat shock protein Hsp20  40.95 
 
 
189 aa  85.5  3e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0219016  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1171  heat shock protein Hsp20  39.34 
 
 
189 aa  85.1  4e-16  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.726376  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0389  heat shock protein Hsp20  38.68 
 
 
166 aa  85.1  4e-16  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.706384 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0629  heat shock protein Hsp20  41.12 
 
 
189 aa  85.1  5e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.185609 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0989  heat shock protein Hsp20  39.32 
 
 
148 aa  84.3  7e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.543303  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1917  heat shock protein Hsp20  39.29 
 
 
156 aa  84.3  7e-16  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.86534  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4118  heat shock protein Hsp20  46.67 
 
 
172 aa  84.3  7e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.513744 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1348  heat shock protein Hsp20  40.37 
 
 
146 aa  84  8e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.403253 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2024  heat shock protein Hsp20  40.37 
 
 
146 aa  84  8e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.106375 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3412  small HspC2 heat shock protein  41.12 
 
 
189 aa  84  9e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.260583  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5491  heat shock protein Hsp20  43.69 
 
 
211 aa  83.6  0.000000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.710483  normal  0.352797 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2860  heat shock protein Hsp20  37.36 
 
 
184 aa  82.4  0.000000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.793853  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1543  heat shock protein Hsp20  39.81 
 
 
146 aa  82.8  0.000000000000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.000494204  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6892  heat shock protein Hsp20  47.19 
 
 
157 aa  82.8  0.000000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.862152  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3788  heat shock protein Hsp20  38.68 
 
 
144 aa  83.2  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.964317 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1115  heat shock protein Hsp20  44.04 
 
 
162 aa  82  0.000000000000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0741755  normal  0.307075 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0838  heat shock protein Hsp20  37.14 
 
 
162 aa  82.4  0.000000000000003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3903  heat shock protein Hsp20  40.2 
 
 
194 aa  82  0.000000000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.534424 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4859  heat shock protein Hsp20  41.18 
 
 
204 aa  81.3  0.000000000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3386  heat shock protein Hsp20  38.98 
 
 
147 aa  80.9  0.000000000000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20170  heat shock protein Hsp20  35.48 
 
 
177 aa  79.3  0.00000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.638214  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4128  heat shock protein Hsp20  39.13 
 
 
154 aa  79.3  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.226976  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2460  heat shock protein Hsp20  33.55 
 
 
186 aa  79.7  0.00000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.0031555  normal  0.623789 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3234  HSP20 family protein  33.55 
 
 
231 aa  78.6  0.00000000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0580  heat shock protein Hsp20  34.95 
 
 
145 aa  79  0.00000000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000199173  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0481  heat shock protein Hsp20  35.64 
 
 
150 aa  78.6  0.00000000000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.411475 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3582  heat shock protein Hsp20  36.19 
 
 
166 aa  77.8  0.00000000000007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0538  HSP20 family protein  35.64 
 
 
147 aa  77.4  0.00000000000008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2049  heat shock protein Hsp20  38.71 
 
 
164 aa  77.4  0.00000000000008  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  hitchhiker  0.0000140473  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3076  heat shock protein Hsp20  37.63 
 
 
173 aa  77.4  0.00000000000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4395  heat shock protein Hsp20  34.55 
 
 
181 aa  76.6  0.0000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.481666  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2802  heat shock protein Hsp20  43.69 
 
 
167 aa  77  0.0000000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.20157 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3498  heat shock protein Hsp20  46.07 
 
 
158 aa  77  0.0000000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.938667  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6104  heat shock protein Hsp20  42.7 
 
 
158 aa  76.6  0.0000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0249434 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4528  heat shock protein Hsp20  34.55 
 
 
181 aa  76.6  0.0000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.550609  normal  0.0462291 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2401  heat shock protein Hsp20  41.75 
 
 
163 aa  76.3  0.0000000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.0000662378  hitchhiker  0.00157329 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2600  putative heat shock protein Hsp20  42.55 
 
 
187 aa  75.9  0.0000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.207676  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2122  heat shock protein Hsp20  37.36 
 
 
180 aa  76.3  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.451471 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2074  heat shock protein Hsp20  44.23 
 
 
173 aa  76.3  0.0000000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.145284  normal  0.308358 
 
 
-
 
NC_002936  DET0954  Hsp20/alpha crystallin family protein  34.29 
 
 
162 aa  75.5  0.0000000000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.154946  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2132  heat shock protein Hsp20  42.16 
 
 
164 aa  75.5  0.0000000000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.585874 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3805  heat shock protein Hsp20  44.94 
 
 
158 aa  75.5  0.0000000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.232205  normal  0.564168 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3080  heat shock protein Hsp20  30.12 
 
 
230 aa  75.9  0.0000000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3078  heat shock protein Hsp20  35.58 
 
 
145 aa  75.5  0.0000000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000700712  normal  0.0754711 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0383  heat shock protein Hsp20  41.82 
 
 
166 aa  75.5  0.0000000000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.170778  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0037  heat shock protein Hsp20  35.92 
 
 
142 aa  75.5  0.0000000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0154  heat shock protein Hsp20  37.38 
 
 
156 aa  75.1  0.0000000000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.184978  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3680  heat shock protein Hsp20  41.9 
 
 
185 aa  74.7  0.0000000000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.626967 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3724  heat shock protein Hsp20  41.9 
 
 
185 aa  74.7  0.0000000000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1159  heat shock protein Hsp20  37.62 
 
 
148 aa  75.1  0.0000000000005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000413054  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5194  heat shock protein Hsp20  44.09 
 
 
169 aa  74.7  0.0000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0987038  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1742  heat shock protein Hsp20  39 
 
 
152 aa  75.1  0.0000000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.314982  hitchhiker  0.000988198 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_825  HSP20/alpha crystallin  34.31 
 
 
162 aa  74.7  0.0000000000006  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2505  heat shock protein Hsp20  39.6 
 
 
138 aa  74.3  0.0000000000007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.239492  normal  0.0462479 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0102  heat shock protein Hsp20  39.08 
 
 
142 aa  73.9  0.0000000000009  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0369  HSP20 family protein  34.95 
 
 
153 aa  73.6  0.000000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  4.93231e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2790  heat shock protein Hsp20  31.45 
 
 
149 aa  73.6  0.000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000163808  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0445  heat shock protein Hsp20  40.57 
 
 
150 aa  73.9  0.000000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1076  heat shock protein Hsp20  37 
 
 
148 aa  73.9  0.000000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.713568  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4635  heat shock protein Hsp20  43.01 
 
 
169 aa  73.9  0.000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4061  heat shock protein Hsp20  38.71 
 
 
147 aa  73.2  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6093  heat shock protein Hsp20  41.46 
 
 
187 aa  72.8  0.000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3468  heat shock protein Hsp20  36.56 
 
 
148 aa  72.8  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.282569  normal  0.556723 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4023  heat shock protein Hsp20  38.71 
 
 
147 aa  73.2  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2462  heat shock protein Hsp20  41.67 
 
 
168 aa  73.2  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0466294  normal  0.178308 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6390  heat shock protein Hsp20  41.46 
 
 
187 aa  72.8  0.000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.065602 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4507  heat shock protein Hsp20  37.86 
 
 
145 aa  72.4  0.000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2957  HSP20 family protein  34.33 
 
 
143 aa  72  0.000000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2635  heat shock protein Hsp20  36.56 
 
 
148 aa  72.4  0.000000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4352  heat shock protein Hsp20  37.86 
 
 
145 aa  72.4  0.000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.735936  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4812  heat shock protein Hsp20  34.41 
 
 
155 aa  71.6  0.000000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00238667  normal  0.807841 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3241  heat shock protein Hsp20  41.9 
 
 
166 aa  71.6  0.000000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.406826  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0184  heat shock protein Hsp20  32.12 
 
 
160 aa  72  0.000000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.29101  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1429  heat shock protein Hsp20  34.31 
 
 
169 aa  72  0.000000000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0296  heat shock protein Hsp20  36.73 
 
 
156 aa  72  0.000000000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0690  heat shock protein Hsp20  37.86 
 
 
147 aa  72  0.000000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000202005  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0391  heat shock protein Hsp20  31.34 
 
 
143 aa  71.6  0.000000000005  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000478859  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0859  heat shock protein Hsp20  37.5 
 
 
153 aa  71.6  0.000000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0735  heat shock protein Hsp20  39.22 
 
 
145 aa  71.6  0.000000000005  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  unclonable  0.0000000000000037192  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4488  heat shock protein Hsp20  36.89 
 
 
145 aa  71.6  0.000000000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3612  hypothetical protein  32.79 
 
 
177 aa  71.6  0.000000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011771  BCAH820_C0008  Hsp  34.26 
 
 
146 aa  71.2  0.000000000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3765  heat shock protein Hsp20  38.32 
 
 
143 aa  71.2  0.000000000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1920  heat shock protein Hsp20  40.19 
 
 
162 aa  71.2  0.000000000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.143113  normal  0.422548 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>