More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_A2600 on replicon NC_007951
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007951  Bxe_A2600  putative heat shock protein Hsp20  100 
 
 
187 aa  383  1e-106  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.207676  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6093  heat shock protein Hsp20  81.82 
 
 
187 aa  321  4e-87  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6390  heat shock protein Hsp20  80.75 
 
 
187 aa  317  6e-86  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.065602 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2578  putative heat shock protein  61.7 
 
 
185 aa  236  1e-61  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5491  heat shock protein Hsp20  39.81 
 
 
211 aa  148  6e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.710483  normal  0.352797 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6892  heat shock protein Hsp20  48.67 
 
 
157 aa  144  8.000000000000001e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.862152  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0481  heat shock protein Hsp20  36.31 
 
 
150 aa  100  2e-20  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.411475 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0037  heat shock protein Hsp20  41.74 
 
 
142 aa  94  1e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20170  heat shock protein Hsp20  34.93 
 
 
177 aa  92.8  3e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.638214  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2287  heat shock protein Hsp20  38.53 
 
 
189 aa  92  4e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25770  heat shock Hsp20 protein  41.9 
 
 
198 aa  91.7  6e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3394  heat shock protein Hsp20  35.16 
 
 
189 aa  91.7  6e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0219016  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3412  small HspC2 heat shock protein  29.05 
 
 
189 aa  89.4  3e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.260583  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4461  heat shock protein Hsp20  41.18 
 
 
163 aa  88.2  6e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0538  HSP20 family protein  35.85 
 
 
147 aa  87  1e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0629  heat shock protein Hsp20  33.59 
 
 
189 aa  87.4  1e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.185609 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1171  heat shock protein Hsp20  33.59 
 
 
189 aa  86.7  2e-16  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.726376  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0383  heat shock protein Hsp20  43.81 
 
 
166 aa  87  2e-16  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.170778  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0686  heat shock protein HSP20  32.67 
 
 
153 aa  85.9  3e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1917  heat shock protein Hsp20  41.35 
 
 
156 aa  85.9  3e-16  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.86534  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0389  heat shock protein Hsp20  39.81 
 
 
166 aa  86.3  3e-16  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.706384 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2986  heat shock protein Hsp20  34.58 
 
 
147 aa  85.5  4e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00130326  normal  0.964264 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1366  heat shock protein Hsp20  30.05 
 
 
176 aa  85.5  4e-16  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.74874  normal  0.190619 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1762  heat shock protein Hsp20  36.79 
 
 
144 aa  84.7  6e-16  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2024  heat shock protein Hsp20  35.58 
 
 
146 aa  84.7  8e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.106375 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2678  HSP20 family protein  40 
 
 
151 aa  84.7  8e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1738  small HspC2 heat shock protein  41.07 
 
 
189 aa  84.7  8e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.267785  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2798  small HspC2 heat shock protein  41.07 
 
 
189 aa  84.7  8e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.159343  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1348  heat shock protein Hsp20  35.58 
 
 
146 aa  84.7  8e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.403253 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6104  heat shock protein Hsp20  42.86 
 
 
158 aa  84  0.000000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0249434 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0052  heat shock protein Hsp20  38.61 
 
 
151 aa  84  0.000000000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.319643  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3582  heat shock protein Hsp20  32.26 
 
 
166 aa  83.6  0.000000000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3076  heat shock protein Hsp20  32.74 
 
 
148 aa  83.6  0.000000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3498  heat shock protein Hsp20  37.9 
 
 
158 aa  82.4  0.000000000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.938667  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0838  heat shock protein Hsp20  37.11 
 
 
162 aa  82.8  0.000000000000003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5194  heat shock protein Hsp20  38.97 
 
 
169 aa  82.4  0.000000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0987038  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3805  heat shock protein Hsp20  37.9 
 
 
158 aa  82.4  0.000000000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.232205  normal  0.564168 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0580  heat shock protein Hsp20  34.78 
 
 
145 aa  81.6  0.000000000000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000199173  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0445  heat shock protein Hsp20  34.85 
 
 
150 aa  81.3  0.000000000000007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2414  hypothetical protein  34.81 
 
 
164 aa  81.3  0.000000000000008  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0125  heat shock protein Hsp20  31.45 
 
 
139 aa  81.3  0.000000000000008  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.369397  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2532  HSP20 family protein  33.98 
 
 
144 aa  80.5  0.00000000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2559  hypothetical protein  35.77 
 
 
164 aa  80.5  0.00000000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2355  heat shock protein Hsp20  40.95 
 
 
165 aa  80.5  0.00000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.20966  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2860  heat shock protein Hsp20  28.7 
 
 
184 aa  80.5  0.00000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.793853  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2316  heat shock protein Hsp20  27.59 
 
 
139 aa  80.9  0.00000000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0611291  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1127  heat shock protein Hsp20  34.33 
 
 
142 aa  80.1  0.00000000000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1115  heat shock protein Hsp20  41.9 
 
 
162 aa  80.1  0.00000000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0741755  normal  0.307075 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3323  heat shock protein Hsp20  45.83 
 
 
228 aa  79.7  0.00000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2635  heat shock protein Hsp20  36.7 
 
 
195 aa  79.7  0.00000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000662159  normal  0.965311 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0296  heat shock protein Hsp20  31.54 
 
 
156 aa  79.7  0.00000000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0102  heat shock protein Hsp20  34.81 
 
 
142 aa  80.1  0.00000000000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3468  heat shock protein Hsp20  30.99 
 
 
148 aa  80.1  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.282569  normal  0.556723 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2635  heat shock protein Hsp20  30.99 
 
 
148 aa  79.7  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3905  heat shock protein Hsp20  30.09 
 
 
147 aa  79.7  0.00000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000984381  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2122  heat shock protein Hsp20  34.82 
 
 
180 aa  79.3  0.00000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.451471 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3903  heat shock protein Hsp20  40.57 
 
 
194 aa  79.3  0.00000000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.534424 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3080  heat shock protein Hsp20  35.4 
 
 
230 aa  79.7  0.00000000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1262  small heat shock protein  31.03 
 
 
151 aa  79  0.00000000000004  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.753574  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1320  Hsp20/alpha crystallin family protein  31.03 
 
 
151 aa  79  0.00000000000004  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2505  heat shock protein Hsp20  33.58 
 
 
138 aa  78.2  0.00000000000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.239492  normal  0.0462479 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2074  heat shock protein Hsp20  36.89 
 
 
173 aa  78.2  0.00000000000006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.145284  normal  0.308358 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3113  heat shock protein Hsp20  35.92 
 
 
142 aa  77.8  0.00000000000007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.800815  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0989  heat shock protein Hsp20  36.79 
 
 
148 aa  77.8  0.00000000000008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.543303  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3788  heat shock protein Hsp20  28.47 
 
 
144 aa  77.8  0.00000000000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.964317 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2401  heat shock protein Hsp20  33.04 
 
 
163 aa  77.8  0.00000000000008  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.0000662378  hitchhiker  0.00157329 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0200  heat shock protein Hsp20  37.14 
 
 
176 aa  77.8  0.00000000000009  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.377048  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3882  heat shock protein Hsp20  33.6 
 
 
158 aa  77.8  0.00000000000009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.545217  normal  0.180827 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2790  heat shock protein Hsp20  28.32 
 
 
149 aa  77.8  0.00000000000009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000163808  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3680  heat shock protein Hsp20  34.96 
 
 
185 aa  77.4  0.0000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.626967 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3527  putative HspC2 heat shock protein  38.1 
 
 
173 aa  77.4  0.0000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0868338  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1170  heat shock protein Hsp20  45.57 
 
 
170 aa  77.4  0.0000000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2802  heat shock protein Hsp20  38.1 
 
 
167 aa  77.4  0.0000000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.20157 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2462  heat shock protein Hsp20  39.05 
 
 
168 aa  77.8  0.0000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0466294  normal  0.178308 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3724  heat shock protein Hsp20  34.96 
 
 
185 aa  77.4  0.0000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3580  molecular chaperone (small heat shock protein)  33.33 
 
 
141 aa  76.3  0.0000000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0369  HSP20 family protein  35.24 
 
 
153 aa  76.6  0.0000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  4.93231e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2857  heat shock protein Hsp20  37.72 
 
 
158 aa  76.6  0.0000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.274432  normal  0.0879388 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1977  heat shock protein Hsp20  26.71 
 
 
139 aa  76.6  0.0000000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.334288  normal  0.643075 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2477  heat shock protein Hsp20  31.16 
 
 
143 aa  76.6  0.0000000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2522  heat shock protein Hsp20  37.76 
 
 
150 aa  76.3  0.0000000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1921  heat shock protein Hsp20  42.55 
 
 
167 aa  75.9  0.0000000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.985705  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2836  heat shock protein Hsp20  32.29 
 
 
197 aa  75.9  0.0000000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00556978  normal  0.209218 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1806  small heat shock protein  34.06 
 
 
152 aa  75.5  0.0000000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1445  putative heat shock protein  40.21 
 
 
167 aa  75.5  0.0000000000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.000891901  normal  0.866362 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4819  heat shock protein Hsp20  29.41 
 
 
146 aa  75.5  0.0000000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.414421 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3234  HSP20 family protein  31.21 
 
 
231 aa  75.5  0.0000000000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0543  heat shock protein Hsp20  33.62 
 
 
147 aa  75.1  0.0000000000005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0340696  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2940  heat shock protein Hsp20  37.07 
 
 
168 aa  75.1  0.0000000000005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0735  heat shock protein Hsp20  38.89 
 
 
145 aa  75.1  0.0000000000005  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  unclonable  0.0000000000000037192  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0557  heat shock protein Hsp20  30.95 
 
 
147 aa  75.1  0.0000000000005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0117197  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0622  HSP20 family protein  32.41 
 
 
132 aa  74.7  0.0000000000006  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3336  heat shock protein Hsp20  30.9 
 
 
191 aa  75.1  0.0000000000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0423  heat shock protein Hsp20  31.01 
 
 
152 aa  74.7  0.0000000000007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.943695  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0924  heat shock protein  36.79 
 
 
180 aa  74.7  0.0000000000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1076  heat shock protein Hsp20  34.04 
 
 
148 aa  74.7  0.0000000000008  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.713568  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0954  Hsp20/alpha crystallin family protein  26.8 
 
 
162 aa  73.9  0.000000000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.154946  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4395  heat shock protein Hsp20  38.1 
 
 
181 aa  74.3  0.000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.481666  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2460  heat shock protein Hsp20  30.46 
 
 
186 aa  73.9  0.000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.0031555  normal  0.623789 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2212  heat shock protein Hsp20  40 
 
 
171 aa  74.3  0.000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>