More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_0989 on replicon NC_013501
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013501  Rmar_0989  heat shock protein Hsp20  100 
 
 
148 aa  302  1.0000000000000001e-81  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.543303  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1824  heat shock protein Hsp20  49.66 
 
 
146 aa  143  7.0000000000000006e-34  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0843989  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1296  heat shock protein Hsp20  51.52 
 
 
143 aa  139  9.999999999999999e-33  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2957  HSP20 family protein  45.52 
 
 
143 aa  132  1.9999999999999998e-30  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1348  heat shock protein Hsp20  41.5 
 
 
146 aa  122  2e-27  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.403253 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2024  heat shock protein Hsp20  41.5 
 
 
146 aa  122  2e-27  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.106375 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0197  heat shock protein Hsp20  43.24 
 
 
147 aa  120  6e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0542117 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0543  heat shock protein Hsp20  45.59 
 
 
147 aa  120  7e-27  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0340696  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0557  heat shock protein Hsp20  45.59 
 
 
147 aa  120  8e-27  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0117197  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4342  heat shock protein Hsp20  43.24 
 
 
147 aa  119  1.9999999999999998e-26  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.232434  normal  0.204531 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2986  heat shock protein Hsp20  37.93 
 
 
147 aa  117  3.9999999999999996e-26  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00130326  normal  0.964264 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2522  heat shock protein Hsp20  49.06 
 
 
150 aa  117  4.9999999999999996e-26  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0052  heat shock protein Hsp20  37.16 
 
 
151 aa  117  7e-26  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.319643  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2477  heat shock protein Hsp20  38.78 
 
 
143 aa  115  9.999999999999999e-26  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2790  heat shock protein Hsp20  37.93 
 
 
149 aa  116  9.999999999999999e-26  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000163808  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2532  HSP20 family protein  39.73 
 
 
144 aa  115  1.9999999999999998e-25  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3905  heat shock protein Hsp20  37.93 
 
 
147 aa  115  1.9999999999999998e-25  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000984381  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0538  HSP20 family protein  37.24 
 
 
147 aa  114  3.9999999999999997e-25  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4819  heat shock protein Hsp20  38.62 
 
 
146 aa  114  3.9999999999999997e-25  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.414421 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2188  heat shock protein Hsp20  38.41 
 
 
156 aa  114  5e-25  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.345525  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0102  heat shock protein Hsp20  46.67 
 
 
142 aa  114  6e-25  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4061  heat shock protein Hsp20  38.67 
 
 
147 aa  114  6e-25  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3076  heat shock protein Hsp20  37.24 
 
 
148 aa  114  6e-25  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4023  heat shock protein Hsp20  38.67 
 
 
147 aa  114  6e-25  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1262  small heat shock protein  36.73 
 
 
151 aa  112  2.0000000000000002e-24  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.753574  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1320  Hsp20/alpha crystallin family protein  36.73 
 
 
151 aa  112  2.0000000000000002e-24  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0623  heat shock protein Hsp20  39.33 
 
 
152 aa  111  3e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.844177  normal  0.400233 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4507  heat shock protein Hsp20  40.82 
 
 
145 aa  110  6e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02640  low molecular weight heat shock protein  38.78 
 
 
158 aa  110  8.000000000000001e-24  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4488  heat shock protein Hsp20  40.82 
 
 
145 aa  109  1.0000000000000001e-23  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3765  heat shock protein Hsp20  41.89 
 
 
143 aa  109  1.0000000000000001e-23  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2730  heat shock protein Hsp20  39.26 
 
 
148 aa  109  2.0000000000000002e-23  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1434  low molecular weight heat shock protein  35.81 
 
 
160 aa  108  2.0000000000000002e-23  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1365  heat shock protein Hsp20  35.81 
 
 
160 aa  108  2.0000000000000002e-23  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.117276  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4352  heat shock protein Hsp20  40.14 
 
 
145 aa  108  3e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.735936  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3078  heat shock protein Hsp20  39.46 
 
 
145 aa  108  3e-23  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000700712  normal  0.0754711 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3788  heat shock protein Hsp20  37.24 
 
 
144 aa  107  5e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.964317 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0320  heat shock protein Hsp20  39.19 
 
 
150 aa  107  5e-23  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0125  heat shock protein Hsp20  37.93 
 
 
139 aa  107  6e-23  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.369397  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1366  heat shock protein Hsp20  40.71 
 
 
176 aa  107  7.000000000000001e-23  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.74874  normal  0.190619 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4499  heat shock protein Hsp20  36.05 
 
 
145 aa  105  3e-22  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.100268 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3468  heat shock protein Hsp20  35.95 
 
 
148 aa  105  3e-22  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.282569  normal  0.556723 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2635  heat shock protein Hsp20  35.95 
 
 
148 aa  104  4e-22  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1762  heat shock protein Hsp20  34.93 
 
 
144 aa  104  5e-22  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1214  molecular chaperone (small heat shock protein)  36.36 
 
 
260 aa  103  6e-22  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.318766  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0143  heat shock protein Hsp20  35.81 
 
 
156 aa  103  1e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0343  heat shock protein Hsp20  39.55 
 
 
144 aa  103  1e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.90555e-28 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2899  heat shock protein Hsp20  38.41 
 
 
145 aa  102  1e-21  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0174584 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0362  heat shock protein Hsp20  39.55 
 
 
144 aa  102  2e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.025472  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2049  heat shock protein Hsp20  35.86 
 
 
164 aa  101  3e-21  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  hitchhiker  0.0000140473  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0481  heat shock protein Hsp20  41.75 
 
 
150 aa  100  6e-21  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.411475 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4812  heat shock protein Hsp20  35.66 
 
 
155 aa  100  6e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00238667  normal  0.807841 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2857  heat shock protein Hsp20  39.86 
 
 
158 aa  100  8e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.274432  normal  0.0879388 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0505  heat shock protein Hsp20  35.42 
 
 
158 aa  99  2e-20  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2320  heat shock protein Hsp20  37.32 
 
 
149 aa  98.6  2e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0289  heat shock protein Hsp20  38.46 
 
 
148 aa  99  2e-20  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0247001  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4413  heat shock protein Hsp20  40.6 
 
 
150 aa  98.2  3e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2022  heat shock protein Hsp20  36.49 
 
 
141 aa  98.6  3e-20  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2132  heat shock protein Hsp20  38.97 
 
 
164 aa  98.6  3e-20  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.585874 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4461  heat shock protein Hsp20  38.24 
 
 
163 aa  97.1  7e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1127  heat shock protein Hsp20  38.03 
 
 
142 aa  97.1  7e-20  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2086  heat shock protein, Hsp20 family  37.84 
 
 
145 aa  96.7  9e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1743  heat shock protein Hsp20  37.84 
 
 
145 aa  96.7  9e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.49982  normal  0.0110244 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3680  heat shock protein Hsp20  37.16 
 
 
185 aa  96.3  1e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.626967 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0540  heat shock protein Hsp20  34.46 
 
 
147 aa  96.3  1e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3076  heat shock protein Hsp20  32.43 
 
 
173 aa  96.3  1e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3386  heat shock protein Hsp20  37.67 
 
 
147 aa  96.3  1e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2683  heat shock protein Hsp20  36.91 
 
 
145 aa  96.3  1e-19  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.338339  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3724  heat shock protein Hsp20  37.16 
 
 
185 aa  96.3  1e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2122  heat shock protein Hsp20  32.19 
 
 
180 aa  95.5  2e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.451471 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2287  heat shock protein Hsp20  37.01 
 
 
189 aa  95.5  2e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2078  heat shock protein Hsp20  35.81 
 
 
147 aa  95.9  2e-19  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0762  heat shock protein Hsp20  38.58 
 
 
134 aa  95.9  2e-19  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1917  heat shock protein Hsp20  39.26 
 
 
156 aa  95.9  2e-19  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.86534  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4118  heat shock protein Hsp20  39.1 
 
 
172 aa  95.9  2e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.513744 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6892  heat shock protein Hsp20  46.67 
 
 
157 aa  95.1  3e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.862152  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3074  heat shock protein Hsp20  40.28 
 
 
144 aa  95.1  3e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0865  heat shock protein Hsp20  37.5 
 
 
134 aa  94.7  4e-19  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.303654  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1076  heat shock protein Hsp20  35.37 
 
 
148 aa  94.7  4e-19  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.713568  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_825  HSP20/alpha crystallin  38.68 
 
 
162 aa  94.7  4e-19  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2938  heat shock protein Hsp20  37.69 
 
 
145 aa  94.7  4e-19  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000000491843  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5151  heat shock protein Hsp20  35.37 
 
 
148 aa  94.4  5e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0184623  normal  0.32984 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3394  heat shock protein Hsp20  36.6 
 
 
189 aa  94.4  5e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0219016  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0954  Hsp20/alpha crystallin family protein  38.68 
 
 
162 aa  94  6e-19  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.154946  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1010  heat shock protein Hsp20  36.18 
 
 
153 aa  94  6e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00224234  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0838  heat shock protein Hsp20  37.14 
 
 
162 aa  94  6e-19  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0391  heat shock protein Hsp20  36.69 
 
 
143 aa  94  7e-19  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000478859  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0774  heat shock protein Hsp20  39.84 
 
 
139 aa  93.6  7e-19  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2860  heat shock protein Hsp20  35.25 
 
 
184 aa  93.6  8e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.793853  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2635  heat shock protein Hsp20  36.36 
 
 
195 aa  93.6  9e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000662159  normal  0.965311 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3080  heat shock protein Hsp20  34.23 
 
 
230 aa  93.2  1e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1445  putative heat shock protein  41.09 
 
 
167 aa  93.2  1e-18  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.000891901  normal  0.866362 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1892  HSP20 family protein  37.41 
 
 
132 aa  92.8  1e-18  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.684879  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3412  small HspC2 heat shock protein  37.25 
 
 
189 aa  92.8  1e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.260583  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1159  heat shock protein Hsp20  37.76 
 
 
148 aa  93.2  1e-18  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000413054  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0836  heat shock protein Hsp20  40.6 
 
 
149 aa  92.8  1e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.414458 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4766  heat shock protein Hsp20  39.47 
 
 
163 aa  93.2  1e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  decreased coverage  0.0000408851  hitchhiker  0.00874264 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1171  heat shock protein Hsp20  37.25 
 
 
189 aa  92.4  2e-18  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.726376  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1474  heat shock protein Hsp20  35.42 
 
 
151 aa  92.8  2e-18  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.242626  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0629  heat shock protein Hsp20  37.25 
 
 
189 aa  92  2e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.185609 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>