More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene AFE_2086 on replicon NC_011761
Organism: Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011761  AFE_2086  heat shock protein, Hsp20 family  100 
 
 
145 aa  297  3e-80  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1743  heat shock protein Hsp20  100 
 
 
145 aa  297  3e-80  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.49982  normal  0.0110244 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2683  heat shock protein Hsp20  61.38 
 
 
145 aa  174  4e-43  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.338339  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0623  heat shock protein Hsp20  51.01 
 
 
152 aa  157  4e-38  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.844177  normal  0.400233 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0052  heat shock protein Hsp20  51.7 
 
 
151 aa  154  3e-37  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.319643  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2790  heat shock protein Hsp20  43.92 
 
 
149 aa  120  5e-27  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000163808  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2986  heat shock protein Hsp20  39.46 
 
 
147 aa  119  9.999999999999999e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00130326  normal  0.964264 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0538  HSP20 family protein  37.67 
 
 
147 aa  119  1.9999999999999998e-26  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3076  heat shock protein Hsp20  40.82 
 
 
148 aa  118  1.9999999999999998e-26  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3905  heat shock protein Hsp20  36.3 
 
 
147 aa  114  3.9999999999999997e-25  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000984381  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2024  heat shock protein Hsp20  40 
 
 
146 aa  112  2.0000000000000002e-24  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.106375 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1348  heat shock protein Hsp20  40 
 
 
146 aa  112  2.0000000000000002e-24  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.403253 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0989  heat shock protein Hsp20  37.84 
 
 
148 aa  111  3e-24  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.543303  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1127  heat shock protein Hsp20  42.86 
 
 
142 aa  110  7.000000000000001e-24  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4352  heat shock protein Hsp20  41.38 
 
 
145 aa  110  9e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.735936  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2287  heat shock protein Hsp20  42.86 
 
 
189 aa  108  2.0000000000000002e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4507  heat shock protein Hsp20  40.69 
 
 
145 aa  108  2.0000000000000002e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0543  heat shock protein Hsp20  40.44 
 
 
147 aa  107  4.0000000000000004e-23  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0340696  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1365  heat shock protein Hsp20  40.15 
 
 
160 aa  107  5e-23  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.117276  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0383  heat shock protein Hsp20  42.47 
 
 
158 aa  107  5e-23  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1434  low molecular weight heat shock protein  40.15 
 
 
160 aa  107  5e-23  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4488  heat shock protein Hsp20  40 
 
 
145 aa  107  6e-23  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0481  heat shock protein Hsp20  47.71 
 
 
150 aa  107  6e-23  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.411475 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0557  heat shock protein Hsp20  40.44 
 
 
147 aa  107  6e-23  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0117197  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2860  heat shock protein Hsp20  39.69 
 
 
184 aa  107  7.000000000000001e-23  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.793853  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0102  heat shock protein Hsp20  40.71 
 
 
142 aa  106  9.000000000000001e-23  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3580  molecular chaperone (small heat shock protein)  37.41 
 
 
141 aa  106  1e-22  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3394  heat shock protein Hsp20  41.6 
 
 
189 aa  105  2e-22  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0219016  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1076  heat shock protein Hsp20  39.04 
 
 
148 aa  105  2e-22  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.713568  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2522  heat shock protein Hsp20  44.44 
 
 
150 aa  105  2e-22  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0197  heat shock protein Hsp20  39.57 
 
 
147 aa  104  3e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0542117 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2477  heat shock protein Hsp20  36.62 
 
 
143 aa  104  4e-22  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0343  heat shock protein Hsp20  34.81 
 
 
144 aa  103  6e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.90555e-28 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2022  heat shock protein Hsp20  39.86 
 
 
141 aa  103  7e-22  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0362  heat shock protein Hsp20  34.81 
 
 
144 aa  103  9e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.025472  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4499  heat shock protein Hsp20  39.19 
 
 
145 aa  103  1e-21  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.100268 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0838  heat shock protein Hsp20  39.72 
 
 
162 aa  103  1e-21  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2320  heat shock protein Hsp20  46.22 
 
 
149 aa  103  1e-21  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4342  heat shock protein Hsp20  38.85 
 
 
147 aa  102  1e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.232434  normal  0.204531 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0762  heat shock protein Hsp20  42.31 
 
 
134 aa  102  2e-21  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1917  heat shock protein Hsp20  40 
 
 
156 aa  102  2e-21  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.86534  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1010  heat shock protein Hsp20  44.44 
 
 
153 aa  102  2e-21  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00224234  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0320  heat shock protein Hsp20  40 
 
 
150 aa  102  2e-21  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2188  heat shock protein Hsp20  36.13 
 
 
156 aa  101  4e-21  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.345525  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0037  heat shock protein Hsp20  40.58 
 
 
142 aa  101  4e-21  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0629  heat shock protein Hsp20  38.89 
 
 
189 aa  100  5e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.185609 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02640  low molecular weight heat shock protein  39.39 
 
 
158 aa  100  6e-21  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1171  heat shock protein Hsp20  40 
 
 
189 aa  100  6e-21  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.726376  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0774  heat shock protein Hsp20  38.51 
 
 
139 aa  100  7e-21  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2957  HSP20 family protein  37.41 
 
 
143 aa  100  7e-21  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1166  heat shock protein Hsp20  58.75 
 
 
81 aa  100  8e-21  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.380039  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2316  heat shock protein Hsp20  40.54 
 
 
139 aa  100  9e-21  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0611291  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0540  heat shock protein Hsp20  32.89 
 
 
147 aa  100  9e-21  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0954  Hsp20/alpha crystallin family protein  38.3 
 
 
162 aa  99.4  1e-20  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.154946  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2210  heat shock protein Hsp20  40 
 
 
139 aa  99.8  1e-20  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0417447  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3412  small HspC2 heat shock protein  39.68 
 
 
189 aa  100  1e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.260583  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1296  heat shock protein Hsp20  36.96 
 
 
143 aa  98.6  2e-20  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4859  heat shock protein Hsp20  39.84 
 
 
204 aa  99  2e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_825  HSP20/alpha crystallin  39.01 
 
 
162 aa  99  2e-20  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3078  heat shock protein Hsp20  35.37 
 
 
145 aa  98.6  3e-20  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000700712  normal  0.0754711 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3080  heat shock protein Hsp20  35.1 
 
 
230 aa  98.6  3e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1824  heat shock protein Hsp20  38.35 
 
 
146 aa  98.2  3e-20  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0843989  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1320  Hsp20/alpha crystallin family protein  38.24 
 
 
151 aa  98.2  4e-20  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1262  small heat shock protein  38.24 
 
 
151 aa  98.2  4e-20  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.753574  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1977  heat shock protein Hsp20  51.61 
 
 
139 aa  97.8  5e-20  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.334288  normal  0.643075 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2730  heat shock protein Hsp20  35.29 
 
 
148 aa  97.1  8e-20  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2078  heat shock protein Hsp20  33.55 
 
 
147 aa  96.7  1e-19  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3386  heat shock protein Hsp20  39.29 
 
 
147 aa  95.1  3e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3234  HSP20 family protein  40.14 
 
 
231 aa  94.4  4e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0125  heat shock protein Hsp20  35.21 
 
 
139 aa  94.4  4e-19  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.369397  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4819  heat shock protein Hsp20  34.19 
 
 
218 aa  94.4  5e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3903  heat shock protein Hsp20  39.84 
 
 
194 aa  94.4  5e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.534424 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2532  HSP20 family protein  38.18 
 
 
144 aa  93.6  7e-19  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0735  heat shock protein Hsp20  41.78 
 
 
145 aa  93.6  7e-19  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  unclonable  0.0000000000000037192  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1165  heat shock protein Hsp20  43.97 
 
 
145 aa  93.2  9e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.245253  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0505  heat shock protein Hsp20  31.21 
 
 
158 aa  93.6  9e-19  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0865  heat shock protein Hsp20  44.66 
 
 
134 aa  92.8  1e-18  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.303654  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2460  heat shock protein Hsp20  39.46 
 
 
186 aa  92.8  1e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.0031555  normal  0.623789 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4766  heat shock protein Hsp20  39.31 
 
 
163 aa  93.2  1e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  decreased coverage  0.0000408851  hitchhiker  0.00874264 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20170  heat shock protein Hsp20  38.51 
 
 
177 aa  92.8  1e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.638214  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2299  heat shock protein Hsp20  59.72 
 
 
73 aa  92.8  1e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.123462  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1573  heat shock protein Hsp20  38.89 
 
 
173 aa  91.7  3e-18  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  decreased coverage  0.00130938  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0369  HSP20 family protein  41.12 
 
 
153 aa  91.7  3e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  4.93231e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0250  HSP20 family protein  43.06 
 
 
139 aa  92  3e-18  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.962825  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1892  HSP20 family protein  45.16 
 
 
132 aa  91.7  3e-18  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.684879  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2301  heat shock protein Hsp20  44.76 
 
 
142 aa  91.7  3e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.46681  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2796  heat shock protein  36.96 
 
 
152 aa  91.7  3e-18  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.300285  normal  0.746249 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1537  heat shock protein Hsp20  44.64 
 
 
142 aa  91.7  3e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3074  heat shock protein Hsp20  40.3 
 
 
144 aa  91.7  3e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2132  heat shock protein Hsp20  38.76 
 
 
164 aa  91.7  3e-18  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.585874 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2355  heat shock protein Hsp20  38.52 
 
 
165 aa  90.9  5e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.20966  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1762  heat shock protein Hsp20  33.11 
 
 
144 aa  90.9  6e-18  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2857  heat shock protein Hsp20  39.1 
 
 
158 aa  90.5  8e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.274432  normal  0.0879388 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2212  heat shock protein Hsp20  40 
 
 
171 aa  90.5  8e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6439  heat shock protein Hsp20  40.57 
 
 
153 aa  90.5  8e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.024706  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1366  heat shock protein Hsp20  38.21 
 
 
176 aa  90.5  8e-18  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.74874  normal  0.190619 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2678  HSP20 family protein  34.09 
 
 
151 aa  89.4  1e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1199  heat shock protein Hsp20  41.9 
 
 
143 aa  89.7  1e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.76992  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2074  heat shock protein Hsp20  34.31 
 
 
173 aa  89.7  1e-17  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.145284  normal  0.308358 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3582  heat shock protein Hsp20  42.86 
 
 
166 aa  89.7  1e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>