More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_2860 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008554  Sfum_2860  heat shock protein Hsp20  100 
 
 
184 aa  382  1e-105  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.793853  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3394  heat shock protein Hsp20  54.26 
 
 
189 aa  202  3e-51  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0219016  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2287  heat shock protein Hsp20  54.1 
 
 
189 aa  199  1.9999999999999998e-50  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1171  heat shock protein Hsp20  54.3 
 
 
189 aa  199  1.9999999999999998e-50  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.726376  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0629  heat shock protein Hsp20  54.1 
 
 
189 aa  198  3.9999999999999996e-50  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.185609 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3412  small HspC2 heat shock protein  54.64 
 
 
189 aa  197  7e-50  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.260583  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1366  heat shock protein Hsp20  49.11 
 
 
176 aa  170  1e-41  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.74874  normal  0.190619 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1738  small HspC2 heat shock protein  46.2 
 
 
189 aa  162  3e-39  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.267785  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2798  small HspC2 heat shock protein  46.2 
 
 
189 aa  162  3e-39  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.159343  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2836  heat shock protein Hsp20  34.01 
 
 
197 aa  134  8e-31  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00556978  normal  0.209218 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2462  heat shock protein Hsp20  36.96 
 
 
168 aa  126  2.0000000000000002e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0466294  normal  0.178308 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0383  heat shock protein Hsp20  37.36 
 
 
166 aa  126  2.0000000000000002e-28  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.170778  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1917  heat shock protein Hsp20  42.76 
 
 
156 aa  123  2e-27  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.86534  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3146  heat shock protein Hsp20  35.36 
 
 
167 aa  122  2e-27  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.754957 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4118  heat shock protein Hsp20  36.61 
 
 
172 aa  118  4.9999999999999996e-26  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.513744 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2074  heat shock protein Hsp20  36.22 
 
 
173 aa  117  9.999999999999999e-26  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.145284  normal  0.308358 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3724  heat shock protein Hsp20  32.42 
 
 
185 aa  116  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3680  heat shock protein Hsp20  32.42 
 
 
185 aa  116  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.626967 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2118  heat shock protein Hsp20  35.16 
 
 
166 aa  116  1.9999999999999998e-25  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2212  heat shock protein Hsp20  37.5 
 
 
171 aa  115  3e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4310  heat shock protein Hsp20  38.5 
 
 
166 aa  114  6e-25  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4550  heat shock protein Hsp20  38.5 
 
 
166 aa  114  6e-25  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2355  heat shock protein Hsp20  36.67 
 
 
165 aa  114  8.999999999999998e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.20966  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0557  heat shock protein Hsp20  43.28 
 
 
147 aa  112  2.0000000000000002e-24  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0117197  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0543  heat shock protein Hsp20  43.28 
 
 
147 aa  113  2.0000000000000002e-24  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0340696  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5194  heat shock protein Hsp20  33.33 
 
 
169 aa  112  3e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0987038  normal 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4635  heat shock protein Hsp20  33.33 
 
 
169 aa  112  4.0000000000000004e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4859  heat shock protein Hsp20  38.85 
 
 
204 aa  110  9e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2384  heat shock protein Hsp20  34.07 
 
 
164 aa  109  2.0000000000000002e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3241  heat shock protein Hsp20  36.36 
 
 
166 aa  107  8.000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.406826  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2940  heat shock protein Hsp20  34.43 
 
 
168 aa  107  1e-22  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2281  heat shock protein Hsp20  38.19 
 
 
173 aa  105  5e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.78764  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0200  heat shock protein Hsp20  35.37 
 
 
176 aa  103  1e-21  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.377048  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2276  heat shock protein Hsp20  40.59 
 
 
175 aa  103  1e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3903  heat shock protein Hsp20  35.25 
 
 
194 aa  103  2e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.534424 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1115  heat shock protein Hsp20  34.78 
 
 
162 aa  101  5e-21  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0741755  normal  0.307075 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2857  heat shock protein Hsp20  35.42 
 
 
158 aa  101  5e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.274432  normal  0.0879388 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3582  heat shock protein Hsp20  44.23 
 
 
166 aa  100  1e-20  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4395  heat shock protein Hsp20  42.76 
 
 
181 aa  99.8  2e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.481666  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4528  heat shock protein Hsp20  42.76 
 
 
181 aa  99.8  2e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.550609  normal  0.0462291 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0538  HSP20 family protein  42.45 
 
 
147 aa  98.6  5e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0481  heat shock protein Hsp20  37.21 
 
 
150 aa  98.2  7e-20  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.411475 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3234  HSP20 family protein  36 
 
 
231 aa  97.8  9e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2460  heat shock protein Hsp20  35.57 
 
 
186 aa  97.4  9e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.0031555  normal  0.623789 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1320  Hsp20/alpha crystallin family protein  36.11 
 
 
151 aa  97.1  1e-19  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1262  small heat shock protein  36.11 
 
 
151 aa  97.1  1e-19  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.753574  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2132  heat shock protein Hsp20  33.14 
 
 
164 aa  97.1  1e-19  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.585874 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2790  heat shock protein Hsp20  36.43 
 
 
149 aa  95.9  3e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000163808  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2986  heat shock protein Hsp20  43.27 
 
 
147 aa  95.5  4e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00130326  normal  0.964264 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20170  heat shock protein Hsp20  32.76 
 
 
177 aa  94.7  6e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.638214  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2796  heat shock protein  42.86 
 
 
152 aa  94.7  6e-19  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.300285  normal  0.746249 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0762  heat shock protein Hsp20  38.24 
 
 
134 aa  94.4  9e-19  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0989  heat shock protein Hsp20  35.25 
 
 
148 aa  93.6  1e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.543303  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2802  heat shock protein Hsp20  33.74 
 
 
167 aa  93.2  2e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.20157 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3882  heat shock protein Hsp20  39.44 
 
 
158 aa  93.6  2e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.545217  normal  0.180827 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4461  heat shock protein Hsp20  30.73 
 
 
163 aa  92.8  3e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0865  heat shock protein Hsp20  40.87 
 
 
134 aa  92.4  3e-18  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.303654  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1029  Hsp20/alpha crystallin family protein  37.23 
 
 
146 aa  92  4e-18  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00339514  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1434  low molecular weight heat shock protein  32.39 
 
 
160 aa  92  4e-18  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1365  heat shock protein Hsp20  32.39 
 
 
160 aa  92  4e-18  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.117276  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25770  heat shock Hsp20 protein  34.76 
 
 
198 aa  91.7  5e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2320  heat shock protein Hsp20  35.46 
 
 
149 aa  91.3  7e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3076  heat shock protein Hsp20  39.25 
 
 
148 aa  91.3  8e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3805  heat shock protein Hsp20  43.81 
 
 
158 aa  90.9  9e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.232205  normal  0.564168 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3080  heat shock protein Hsp20  36.36 
 
 
230 aa  90.9  9e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2414  hypothetical protein  33.56 
 
 
164 aa  90.5  1e-17  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1892  HSP20 family protein  35.04 
 
 
132 aa  90.5  1e-17  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.684879  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2559  hypothetical protein  33.56 
 
 
164 aa  90.1  2e-17  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3527  putative HspC2 heat shock protein  37.78 
 
 
173 aa  89.7  2e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0868338  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3498  heat shock protein Hsp20  42.86 
 
 
158 aa  89.7  2e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.938667  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0125  heat shock protein Hsp20  38.06 
 
 
139 aa  89.7  2e-17  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.369397  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0838  heat shock protein Hsp20  37.19 
 
 
162 aa  89.4  3e-17  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2578  putative heat shock protein  33.64 
 
 
185 aa  89  3e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4488  heat shock protein Hsp20  34.46 
 
 
145 aa  89.4  3e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4507  heat shock protein Hsp20  34.46 
 
 
145 aa  88.6  4e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2731  heat shock protein Hsp20  30.92 
 
 
166 aa  88.6  4e-17  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2022  heat shock protein Hsp20  33.64 
 
 
141 aa  88.6  4e-17  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0833  heat shock protein Hsp20  32.89 
 
 
169 aa  88.6  4e-17  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0052  heat shock protein Hsp20  32.64 
 
 
151 aa  89  4e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.319643  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0924  heat shock protein  37.5 
 
 
180 aa  88.6  5e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1127  heat shock protein Hsp20  35.56 
 
 
142 aa  88.2  6e-17  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1010  heat shock protein Hsp20  36.17 
 
 
153 aa  87.8  7e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00224234  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4352  heat shock protein Hsp20  33.78 
 
 
145 aa  87.8  9e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.735936  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6104  heat shock protein Hsp20  34.18 
 
 
158 aa  87.8  9e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0249434 
 
 
-
 
NC_002936  DET0954  Hsp20/alpha crystallin family protein  38.89 
 
 
162 aa  87  1e-16  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.154946  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0389  heat shock protein Hsp20  30.6 
 
 
166 aa  87.4  1e-16  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.706384 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_825  HSP20/alpha crystallin  38.89 
 
 
162 aa  87  1e-16  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2086  heat shock protein, Hsp20 family  39.69 
 
 
145 aa  86.3  2e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3905  heat shock protein Hsp20  36.79 
 
 
147 aa  87  2e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000984381  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2532  HSP20 family protein  34.17 
 
 
144 aa  86.3  2e-16  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1543  heat shock protein Hsp20  32.85 
 
 
146 aa  86.3  2e-16  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.000494204  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0580  heat shock protein Hsp20  39.62 
 
 
145 aa  86.3  2e-16  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000199173  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4499  heat shock protein Hsp20  34.25 
 
 
145 aa  86.7  2e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.100268 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2505  heat shock protein Hsp20  42.72 
 
 
138 aa  86.7  2e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.239492  normal  0.0462479 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1743  heat shock protein Hsp20  39.69 
 
 
145 aa  86.3  2e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.49982  normal  0.0110244 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4342  heat shock protein Hsp20  37.74 
 
 
147 aa  85.5  4e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.232434  normal  0.204531 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0197  heat shock protein Hsp20  37.74 
 
 
147 aa  85.5  4e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0542117 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0296  heat shock protein Hsp20  32.21 
 
 
156 aa  85.5  4e-16  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4230  heat shock protein Hsp20  37.14 
 
 
105 aa  85.5  4e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1742  heat shock protein Hsp20  31.13 
 
 
152 aa  85.5  4e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.314982  hitchhiker  0.000988198 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>