More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nham_1917 on replicon NC_007964
Organism: Nitrobacter hamburgensis X14



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007964  Nham_1917  heat shock protein Hsp20  100 
 
 		 156 aa  318  3e-86  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.86534  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2857  heat shock protein Hsp20  50.65 
 
 		 158 aa  144  6e-34  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.274432  normal  0.0879388 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2860  heat shock protein Hsp20  42.76 
 
 		 184 aa  123  1e-27  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.793853  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2355  heat shock protein Hsp20  45.34 
 
 		 165 aa  120  7e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.20966  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4230  heat shock protein Hsp20  56.19 
 
 		 105 aa  118  3e-26  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0557  heat shock protein Hsp20  42.18 
 
 		 147 aa  117  3.9999999999999996e-26  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0117197  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0481  heat shock protein Hsp20  41.4 
 
 		 150 aa  117  4.9999999999999996e-26  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.411475 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2276  heat shock protein Hsp20  46.43 
 
 		 175 aa  117  7.999999999999999e-26  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0543  heat shock protein Hsp20  42.18 
 
 		 147 aa  117  9e-26  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0340696  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2212  heat shock protein Hsp20  44.17 
 
 		 171 aa  115  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3394  heat shock protein Hsp20  39.51 
 
 		 189 aa  115  1.9999999999999998e-25  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0219016  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4461  heat shock protein Hsp20  39.75 
 
 		 163 aa  115  1.9999999999999998e-25  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3805  heat shock protein Hsp20  42.24 
 
 		 158 aa  114  3.9999999999999997e-25  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.232205  normal  0.564168 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3498  heat shock protein Hsp20  41.61 
 
 		 158 aa  113  8.999999999999998e-25  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.938667  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1127  heat shock protein Hsp20  40.74 
 
 		 142 aa  113  8.999999999999998e-25  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1171  heat shock protein Hsp20  38.18 
 
 		 189 aa  112  1.0000000000000001e-24  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.726376  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0629  heat shock protein Hsp20  38.27 
 
 		 189 aa  112  2.0000000000000002e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.185609 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2986  heat shock protein Hsp20  41.79 
 
 		 147 aa  112  2.0000000000000002e-24  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00130326  normal  0.964264 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0296  heat shock protein Hsp20  40 
 
 		 156 aa  112  3e-24  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3412  small HspC2 heat shock protein  38.18 
 
 		 189 aa  110  6e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.260583  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6104  heat shock protein Hsp20  46.32 
 
 		 158 aa  109  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0249434 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1115  heat shock protein Hsp20  41.36 
 
 		 162 aa  109  1.0000000000000001e-23  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0741755  normal  0.307075 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2287  heat shock protein Hsp20  37.04 
 
 		 189 aa  109  1.0000000000000001e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2802  heat shock protein Hsp20  40.24 
 
 		 167 aa  109  1.0000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.20157 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3882  heat shock protein Hsp20  40.91 
 
 		 158 aa  108  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.545217  normal  0.180827 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0383  heat shock protein Hsp20  39.76 
 
 		 166 aa  108  3e-23  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.170778  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3680  heat shock protein Hsp20  39.05 
 
 		 185 aa  107  6e-23  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.626967 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3724  heat shock protein Hsp20  39.05 
 
 		 185 aa  107  6e-23  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3234  HSP20 family protein  40.26 
 
 		 231 aa  106  1e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2460  heat shock protein Hsp20  40.52 
 
 		 186 aa  106  1e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.0031555  normal  0.623789 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3527  putative HspC2 heat shock protein  40.46 
 
 		 173 aa  105  2e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0868338  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2074  heat shock protein Hsp20  40.3 
 
 		 173 aa  105  2e-22  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.145284  normal  0.308358 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1366  heat shock protein Hsp20  39.86 
 
 		 176 aa  105  3e-22  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.74874  normal  0.190619 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4352  heat shock protein Hsp20  43.18 
 
 		 145 aa  105  3e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.735936  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3241  heat shock protein Hsp20  39.26 
 
 		 166 aa  105  3e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.406826  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4507  heat shock protein Hsp20  43.18 
 
 		 145 aa  104  4e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0924  heat shock protein  43.51 
 
 		 180 aa  104  4e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2132  heat shock protein Hsp20  40 
 
 		 164 aa  104  5e-22  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.585874 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4118  heat shock protein Hsp20  38.32 
 
 		 172 aa  103  6e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.513744 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4488  heat shock protein Hsp20  42.42 
 
 		 145 aa  103  1e-21  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2940  heat shock protein Hsp20  38.1 
 
 		 168 aa  103  1e-21  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2462  heat shock protein Hsp20  38.89 
 
 		 168 aa  102  1e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0466294  normal  0.178308 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4635  heat shock protein Hsp20  35.5 
 
 		 169 aa  102  2e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3076  heat shock protein Hsp20  36.55 
 
 		 148 aa  102  2e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0686  heat shock protein HSP20  39.85 
 
 		 153 aa  102  2e-21  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4395  heat shock protein Hsp20  46.58 
 
 		 181 aa  102  2e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.481666  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4528  heat shock protein Hsp20  46.58 
 
 		 181 aa  102  2e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.550609  normal  0.0462291 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4859  heat shock protein Hsp20  39.71 
 
 		 204 aa  101  3e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4310  heat shock protein Hsp20  39.38 
 
 		 166 aa  101  4e-21  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4550  heat shock protein Hsp20  39.38 
 
 		 166 aa  101  4e-21  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0200  heat shock protein Hsp20  40.3 
 
 		 176 aa  100  6e-21  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.377048  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3903  heat shock protein Hsp20  41.91 
 
 		 194 aa  100  6e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.534424 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0538  HSP20 family protein  36.03 
 
 		 147 aa  100  9e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0762  heat shock protein Hsp20  41.3 
 
 		 134 aa  99.8  1e-20  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4499  heat shock protein Hsp20  39.26 
 
 		 145 aa  99.4  2e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.100268 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0580  heat shock protein Hsp20  42.74 
 
 		 145 aa  99  2e-20  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000199173  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20170  heat shock protein Hsp20  36.59 
 
 		 177 aa  99  2e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.638214  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2790  heat shock protein Hsp20  37.16 
 
 		 149 aa  98.2  4e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000163808  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5194  heat shock protein Hsp20  35.5 
 
 		 169 aa  97.8  5e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0987038  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1018  heat shock protein Hsp20  42.48 
 
 		 177 aa  97.4  6e-20  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.683731  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3612  hypothetical protein  37.18 
 
 		 177 aa  97.4  6e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0954  Hsp20/alpha crystallin family protein  38.74 
 
 		 162 aa  96.3  1e-19  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.154946  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1320  Hsp20/alpha crystallin family protein  35.29 
 
 		 151 aa  96.3  1e-19  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1262  small heat shock protein  35.29 
 
 		 151 aa  96.3  1e-19  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.753574  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0989  heat shock protein Hsp20  39.26 
 
 		 148 aa  95.9  2e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.543303  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2384  heat shock protein Hsp20  36.48 
 
 		 164 aa  95.9  2e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0052  heat shock protein Hsp20  37.93 
 
 		 151 aa  95.5  2e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.319643  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_825  HSP20/alpha crystallin  38.74 
 
 		 162 aa  95.5  3e-19  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2118  heat shock protein Hsp20  37.18 
 
 		 166 aa  94.4  5e-19  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1429  heat shock protein Hsp20  34.81 
 
 		 169 aa  94.4  6e-19  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3582  heat shock protein Hsp20  46.94 
 
 		 166 aa  94  7e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3146  heat shock protein Hsp20  33.73 
 
 		 167 aa  93.6  9e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.754957 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25770  heat shock Hsp20 protein  36.21 
 
 		 198 aa  93.2  1e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0197  heat shock protein Hsp20  38.98 
 
 		 147 aa  92.8  2e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0542117 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3905  heat shock protein Hsp20  35.42 
 
 		 147 aa  92.8  2e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000984381  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4342  heat shock protein Hsp20  38.98 
 
 		 147 aa  92.4  2e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.232434  normal  0.204531 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2414  hypothetical protein  34.25 
 
 		 164 aa  92  3e-18  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1348  heat shock protein Hsp20  37.98 
 
 		 146 aa  92  3e-18  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.403253 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2024  heat shock protein Hsp20  37.98 
 
 		 146 aa  92  3e-18  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.106375 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2578  putative heat shock protein  38.14 
 
 		 185 aa  91.7  4e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0838  heat shock protein Hsp20  37.84 
 
 		 162 aa  91.3  5e-18  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0833  heat shock protein Hsp20  40.35 
 
 		 169 aa  90.9  6e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1076  heat shock protein Hsp20  39.39 
 
 		 148 aa  90.9  7e-18  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.713568  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2366  heat shock protein Hsp20  35.25 
 
 		 151 aa  90.5  8e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.550987  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2559  hypothetical protein  34.25 
 
 		 164 aa  89.7  1e-17  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0622  HSP20 family protein  43.22 
 
 		 132 aa  89.7  1e-17  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1029  Hsp20/alpha crystallin family protein  37.31 
 
 		 146 aa  89  2e-17  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00339514  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0865  heat shock protein Hsp20  41.75 
 
 		 134 aa  89.4  2e-17  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.303654  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6892  heat shock protein Hsp20  39.66 
 
 		 157 aa  89.4  2e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.862152  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3765  heat shock protein Hsp20  34.75 
 
 		 143 aa  89  2e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4463  heat shock protein Hsp20  34.31 
 
 		 141 aa  88.6  3e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0389  heat shock protein Hsp20  34.07 
 
 		 166 aa  88.6  3e-17  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.706384 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3078  heat shock protein Hsp20  36.23 
 
 		 145 aa  88.6  3e-17  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000700712  normal  0.0754711 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0369  HSP20 family protein  40 
 
 		 153 aa  88.2  4e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  4.93231e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0102  heat shock protein Hsp20  37.69 
 
 		 142 aa  88.2  4e-17  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2320  heat shock protein Hsp20  39.5 
 
 		 149 aa  88.2  4e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1742  heat shock protein Hsp20  35.42 
 
 		 152 aa  87.8  6e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.314982  hitchhiker  0.000988198 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6093  heat shock protein Hsp20  37.61 
 
 		 187 aa  87.4  7e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1762  heat shock protein Hsp20  35.88 
 
 		 144 aa  86.3  1e-16  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6390  heat shock protein Hsp20  36.75 
 
 		 187 aa  86.3  1e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.065602 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>