More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GSU0538 on replicon NC_002939
Organism: Geobacter sulfurreducens PCA



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU0538  HSP20 family protein  100 
 
 		 147 aa  302  1.0000000000000001e-81  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2986  heat shock protein Hsp20  80.14 
 
 		 147 aa  255  1e-67  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00130326  normal  0.964264 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3905  heat shock protein Hsp20  71.92 
 
 		 147 aa  232  2.0000000000000002e-60  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000984381  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2790  heat shock protein Hsp20  67.57 
 
 		 149 aa  219  8e-57  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000163808  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3076  heat shock protein Hsp20  67.35 
 
 		 148 aa  217  3.9999999999999997e-56  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0362  heat shock protein Hsp20  57.53 
 
 		 144 aa  190  5e-48  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.025472  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0343  heat shock protein Hsp20  56.16 
 
 		 144 aa  189  9e-48  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.90555e-28 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4507  heat shock protein Hsp20  48.28 
 
 		 145 aa  155  2e-37  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4488  heat shock protein Hsp20  47.59 
 
 		 145 aa  154  5.0000000000000005e-37  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4352  heat shock protein Hsp20  47.59 
 
 		 145 aa  153  7e-37  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.735936  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4499  heat shock protein Hsp20  46.85 
 
 		 145 aa  152  2e-36  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.100268 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2024  heat shock protein Hsp20  46.9 
 
 		 146 aa  143  8.000000000000001e-34  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.106375 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1348  heat shock protein Hsp20  46.9 
 
 		 146 aa  143  8.000000000000001e-34  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.403253 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4766  heat shock protein Hsp20  52.03 
 
 		 163 aa  140  6e-33  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  decreased coverage  0.0000408851  hitchhiker  0.00874264 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3078  heat shock protein Hsp20  46.9 
 
 		 145 aa  138  3e-32  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000700712  normal  0.0754711 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2957  HSP20 family protein  45.52 
 
 		 143 aa  132  1.9999999999999998e-30  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4342  heat shock protein Hsp20  38.62 
 
 		 147 aa  126  1.0000000000000001e-28  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.232434  normal  0.204531 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0197  heat shock protein Hsp20  37.93 
 
 		 147 aa  124  4.0000000000000003e-28  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0542117 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1762  heat shock protein Hsp20  43.54 
 
 		 144 aa  122  2e-27  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0052  heat shock protein Hsp20  39.46 
 
 		 151 aa  122  2e-27  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.319643  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2477  heat shock protein Hsp20  38.19 
 
 		 143 aa  118  3e-26  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0383  heat shock protein Hsp20  40.41 
 
 		 158 aa  114  3e-25  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2122  heat shock protein Hsp20  39.6 
 
 		 180 aa  114  3.9999999999999997e-25  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.451471 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0989  heat shock protein Hsp20  37.24 
 
 		 148 aa  114  3.9999999999999997e-25  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.543303  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0623  heat shock protein Hsp20  39.6 
 
 		 152 aa  114  5e-25  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.844177  normal  0.400233 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0445  heat shock protein Hsp20  39.73 
 
 		 150 aa  113  7.999999999999999e-25  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0125  heat shock protein Hsp20  39.58 
 
 		 139 aa  112  1.0000000000000001e-24  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.369397  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1365  heat shock protein Hsp20  36.73 
 
 		 160 aa  111  3e-24  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.117276  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1076  heat shock protein Hsp20  35.21 
 
 		 148 aa  111  3e-24  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.713568  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1434  low molecular weight heat shock protein  36.73 
 
 		 160 aa  111  3e-24  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2730  heat shock protein Hsp20  39.46 
 
 		 148 aa  111  4.0000000000000004e-24  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0865  heat shock protein Hsp20  46.56 
 
 		 134 aa  111  4.0000000000000004e-24  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.303654  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2022  heat shock protein Hsp20  41.61 
 
 		 141 aa  110  5e-24  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1742  heat shock protein Hsp20  46.27 
 
 		 152 aa  110  5e-24  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.314982  hitchhiker  0.000988198 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0369  HSP20 family protein  48.57 
 
 		 153 aa  110  8.000000000000001e-24  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  4.93231e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0838  heat shock protein Hsp20  44.76 
 
 		 162 aa  109  1.0000000000000001e-23  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0762  heat shock protein Hsp20  48 
 
 		 134 aa  108  2.0000000000000002e-23  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3412  small HspC2 heat shock protein  36.3 
 
 		 189 aa  108  3e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.260583  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0481  heat shock protein Hsp20  43.24 
 
 		 150 aa  108  3e-23  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.411475 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1320  Hsp20/alpha crystallin family protein  38.78 
 
 		 151 aa  108  3e-23  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2683  heat shock protein Hsp20  37.67 
 
 		 145 aa  108  3e-23  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.338339  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1262  small heat shock protein  38.78 
 
 		 151 aa  108  3e-23  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.753574  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2532  HSP20 family protein  34.93 
 
 		 144 aa  107  5e-23  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0954  Hsp20/alpha crystallin family protein  44.76 
 
 		 162 aa  107  6e-23  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.154946  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20170  heat shock protein Hsp20  52 
 
 		 177 aa  107  6e-23  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.638214  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0543  heat shock protein Hsp20  40.56 
 
 		 147 aa  107  6e-23  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0340696  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0557  heat shock protein Hsp20  40.56 
 
 		 147 aa  107  6e-23  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0117197  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2522  heat shock protein Hsp20  45.37 
 
 		 150 aa  106  1e-22  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0454  heat shock protein Hsp20  39.73 
 
 		 144 aa  105  1e-22  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0629  heat shock protein Hsp20  36.3 
 
 		 189 aa  105  1e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.185609 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_825  HSP20/alpha crystallin  43.52 
 
 		 162 aa  105  1e-22  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1171  heat shock protein Hsp20  36.3 
 
 		 189 aa  106  1e-22  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.726376  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1977  heat shock protein Hsp20  45.87 
 
 		 139 aa  105  1e-22  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.334288  normal  0.643075 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3788  heat shock protein Hsp20  38.26 
 
 		 144 aa  105  2e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.964317 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2287  heat shock protein Hsp20  36.3 
 
 		 189 aa  105  2e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0200  heat shock protein Hsp20  49.51 
 
 		 176 aa  105  2e-22  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.377048  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2366  heat shock protein Hsp20  39.47 
 
 		 151 aa  105  2e-22  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.550987  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4859  heat shock protein Hsp20  39.33 
 
 		 204 aa  105  3e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1892  HSP20 family protein  43.88 
 
 		 132 aa  105  3e-22  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.684879  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2188  heat shock protein Hsp20  34.42 
 
 		 156 aa  105  3e-22  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.345525  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1743  heat shock protein Hsp20  37.67 
 
 		 145 aa  104  4e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.49982  normal  0.0110244 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2086  heat shock protein, Hsp20 family  37.67 
 
 		 145 aa  104  4e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0540  heat shock protein Hsp20  34.01 
 
 		 147 aa  103  5e-22  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4061  heat shock protein Hsp20  34.25 
 
 		 147 aa  102  2e-21  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4023  heat shock protein Hsp20  34.25 
 
 		 147 aa  102  2e-21  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1983  heat shock protein Hsp20  40.97 
 
 		 153 aa  102  2e-21  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00684856  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0505  heat shock protein Hsp20  35.21 
 
 		 158 aa  102  2e-21  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2320  heat shock protein Hsp20  35.17 
 
 		 149 aa  102  2e-21  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3582  heat shock protein Hsp20  44.86 
 
 		 166 aa  102  2e-21  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3080  heat shock protein Hsp20  34.67 
 
 		 230 aa  101  3e-21  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0391  heat shock protein Hsp20  37.67 
 
 		 143 aa  101  3e-21  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000478859  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0788  heat shock protein Hsp20  36.73 
 
 		 143 aa  101  3e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.351008  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1159  heat shock protein Hsp20  38.3 
 
 		 148 aa  101  3e-21  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000413054  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3680  heat shock protein Hsp20  40 
 
 		 185 aa  102  3e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.626967 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1929  heat shock protein Hsp20  35.57 
 
 		 149 aa  101  3e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.638493  normal  0.0128011 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3724  heat shock protein Hsp20  40 
 
 		 185 aa  102  3e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4461  heat shock protein Hsp20  37.78 
 
 		 163 aa  101  3e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0463  heat shock protein Hsp20  40.54 
 
 		 166 aa  101  3e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1127  heat shock protein Hsp20  45.95 
 
 		 142 aa  101  4e-21  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0622  HSP20 family protein  46.4 
 
 		 132 aa  101  4e-21  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3394  heat shock protein Hsp20  35.62 
 
 		 189 aa  101  4e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0219016  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2635  heat shock protein Hsp20  38.19 
 
 		 195 aa  100  5e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000662159  normal  0.965311 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1917  heat shock protein Hsp20  36.03 
 
 		 156 aa  100  7e-21  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.86534  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0037  heat shock protein Hsp20  34.25 
 
 		 142 aa  100  8e-21  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2316  heat shock protein Hsp20  48.54 
 
 		 139 aa  100  8e-21  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0611291  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4819  heat shock protein Hsp20  37.5 
 
 		 146 aa  100  8e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.414421 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2678  HSP20 family protein  37.33 
 
 		 151 aa  100  9e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0836  heat shock protein Hsp20  42.34 
 
 		 143 aa  100  9e-21  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.534587  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3903  heat shock protein Hsp20  39.57 
 
 		 194 aa  100  9e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.534424 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3468  heat shock protein Hsp20  37.16 
 
 		 148 aa  99.4  1e-20  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.282569  normal  0.556723 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02640  low molecular weight heat shock protein  36.05 
 
 		 158 aa  99.8  1e-20  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3612  hypothetical protein  38.93 
 
 		 177 aa  99.8  1e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0403  heat shock protein Hsp20  37.5 
 
 		 138 aa  98.6  2e-20  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2635  heat shock protein Hsp20  37.16 
 
 		 148 aa  99.4  2e-20  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0580  heat shock protein Hsp20  45.28 
 
 		 145 aa  99  2e-20  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000199173  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1706  heat shock protein Hsp20  42.98 
 
 		 132 aa  98.2  3e-20  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00808314  hitchhiker  0.000432661 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2860  heat shock protein Hsp20  42.45 
 
 		 184 aa  98.6  3e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.793853  normal  1 
 
 
-
 
NC_011771  BCAH820_C0008  Hsp  34.93 
 
 		 146 aa  97.8  4e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4119  heat shock protein Hsp20  34.46 
 
 		 149 aa  97.4  5e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00303961 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1010  heat shock protein Hsp20  33.78 
 
 		 153 aa  97.8  5e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00224234  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>