More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Patl_3582 on replicon NC_008228
Organism: Pseudoalteromonas atlantica T6c



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008228  Patl_3582  heat shock protein Hsp20  100 
 
 		 166 aa  338  1e-92  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3680  heat shock protein Hsp20  47.22 
 
 		 185 aa  104  6e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.626967 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3724  heat shock protein Hsp20  47.22 
 
 		 185 aa  104  6e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4118  heat shock protein Hsp20  45.95 
 
 		 172 aa  103  1e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.513744 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3612  hypothetical protein  35.03 
 
 		 177 aa  102  2e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0538  HSP20 family protein  44.86 
 
 		 147 aa  102  3e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4859  heat shock protein Hsp20  41.82 
 
 		 204 aa  100  7e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20170  heat shock protein Hsp20  48.11 
 
 		 177 aa  100  8e-21  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.638214  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2857  heat shock protein Hsp20  40.58 
 
 		 158 aa  100  8e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.274432  normal  0.0879388 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3903  heat shock protein Hsp20  41.82 
 
 		 194 aa  100  1e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.534424 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0200  heat shock protein Hsp20  44.44 
 
 		 176 aa  100  1e-20  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.377048  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2860  heat shock protein Hsp20  44.23 
 
 		 184 aa  100  1e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.793853  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0052  heat shock protein Hsp20  44.74 
 
 		 151 aa  98.2  5e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.319643  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2986  heat shock protein Hsp20  43.4 
 
 		 147 aa  97.8  6e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00130326  normal  0.964264 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0924  heat shock protein  46.3 
 
 		 180 aa  97.8  6e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0369  HSP20 family protein  44.44 
 
 		 153 aa  97.4  8e-20  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  4.93231e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3580  molecular chaperone (small heat shock protein)  38.97 
 
 		 141 aa  95.9  2e-19  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25770  heat shock Hsp20 protein  50 
 
 		 198 aa  96.3  2e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3146  heat shock protein Hsp20  41.43 
 
 		 167 aa  95.9  2e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.754957 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0762  heat shock protein Hsp20  50 
 
 		 134 aa  95.1  4e-19  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2790  heat shock protein Hsp20  43.4 
 
 		 149 aa  94.4  7e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000163808  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4230  heat shock protein Hsp20  48.89 
 
 		 105 aa  94  8e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1917  heat shock protein Hsp20  46.94 
 
 		 156 aa  94  8e-19  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.86534  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2355  heat shock protein Hsp20  35.86 
 
 		 165 aa  94  8e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.20966  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0481  heat shock protein Hsp20  43.81 
 
 		 150 aa  94  9e-19  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.411475 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2276  heat shock protein Hsp20  47.27 
 
 		 175 aa  94  9e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5194  heat shock protein Hsp20  42.03 
 
 		 169 aa  93.6  1e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0987038  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4488  heat shock protein Hsp20  42.06 
 
 		 145 aa  93.2  1e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4507  heat shock protein Hsp20  42.06 
 
 		 145 aa  93.2  1e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2522  heat shock protein Hsp20  42.99 
 
 		 150 aa  93.6  1e-18  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1127  heat shock protein Hsp20  44.23 
 
 		 142 aa  93.6  1e-18  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4635  heat shock protein Hsp20  39.13 
 
 		 169 aa  92.8  2e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3527  putative HspC2 heat shock protein  42.73 
 
 		 173 aa  92.4  3e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0868338  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0865  heat shock protein Hsp20  46.23 
 
 		 134 aa  92  3e-18  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.303654  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4352  heat shock protein Hsp20  44.9 
 
 		 145 aa  92  3e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.735936  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1171  heat shock protein Hsp20  41.96 
 
 		 189 aa  91.7  4e-18  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.726376  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2578  putative heat shock protein  38.53 
 
 		 185 aa  91.7  4e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0580  heat shock protein Hsp20  43.12 
 
 		 145 aa  91.7  4e-18  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000199173  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2477  heat shock protein Hsp20  44.44 
 
 		 143 aa  91.7  4e-18  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0989  heat shock protein Hsp20  37.9 
 
 		 148 aa  91.3  5e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.543303  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5491  heat shock protein Hsp20  37.74 
 
 		 211 aa  91.3  5e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.710483  normal  0.352797 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3412  small HspC2 heat shock protein  41.96 
 
 		 189 aa  91.3  6e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.260583  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0629  heat shock protein Hsp20  41.96 
 
 		 189 aa  91.3  6e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.185609 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3882  heat shock protein Hsp20  40 
 
 		 158 aa  90.9  7e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.545217  normal  0.180827 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1706  heat shock protein Hsp20  42.86 
 
 		 132 aa  90.9  7e-18  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00808314  hitchhiker  0.000432661 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2024  heat shock protein Hsp20  40 
 
 		 146 aa  90.9  7e-18  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.106375 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1348  heat shock protein Hsp20  40 
 
 		 146 aa  90.9  7e-18  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.403253 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6892  heat shock protein Hsp20  37.74 
 
 		 157 aa  90.5  1e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.862152  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1366  heat shock protein Hsp20  41.82 
 
 		 176 aa  90.5  1e-17  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.74874  normal  0.190619 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4499  heat shock protein Hsp20  41.67 
 
 		 145 aa  90.5  1e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.100268 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2212  heat shock protein Hsp20  43.52 
 
 		 171 aa  90.5  1e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0296  heat shock protein Hsp20  33.82 
 
 		 156 aa  89.4  2e-17  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4310  heat shock protein Hsp20  44.12 
 
 		 166 aa  89.7  2e-17  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4550  heat shock protein Hsp20  44.12 
 
 		 166 aa  89.7  2e-17  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2287  heat shock protein Hsp20  37.59 
 
 		 189 aa  89.7  2e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2074  heat shock protein Hsp20  35.92 
 
 		 173 aa  89.4  2e-17  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.145284  normal  0.308358 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0622  HSP20 family protein  44.34 
 
 		 132 aa  89  3e-17  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2132  heat shock protein Hsp20  35.07 
 
 		 164 aa  88.6  3e-17  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.585874 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2460  heat shock protein Hsp20  44.34 
 
 		 186 aa  89  3e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.0031555  normal  0.623789 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3234  HSP20 family protein  44.34 
 
 		 231 aa  88.6  4e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2796  heat shock protein  42.24 
 
 		 152 aa  88.2  4e-17  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.300285  normal  0.746249 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2940  heat shock protein Hsp20  37.41 
 
 		 168 aa  88.2  5e-17  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1892  HSP20 family protein  43.4 
 
 		 132 aa  87.8  5e-17  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.684879  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1018  heat shock protein Hsp20  38.93 
 
 		 177 aa  88.2  5e-17  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.683731  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2118  heat shock protein Hsp20  41.28 
 
 		 166 aa  87.8  6e-17  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3905  heat shock protein Hsp20  40.57 
 
 		 147 aa  87  9e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000984381  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0184  heat shock protein Hsp20  41.12 
 
 		 160 aa  86.7  1e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.29101  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3076  heat shock protein Hsp20  40.57 
 
 		 148 aa  86.7  1e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2863  heat shock protein Hsp20  34.78 
 
 		 167 aa  87  1e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.203152  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2281  heat shock protein Hsp20  31.65 
 
 		 173 aa  85.5  3e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.78764  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1296  heat shock protein Hsp20  34.96 
 
 		 143 aa  85.5  3e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2321  stress response protein  29.55 
 
 		 513 aa  85.5  3e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2462  heat shock protein Hsp20  36.81 
 
 		 168 aa  85.9  3e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0466294  normal  0.178308 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0383  heat shock protein Hsp20  37.96 
 
 		 166 aa  85.9  3e-16  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.170778  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3394  heat shock protein Hsp20  40.18 
 
 		 189 aa  85.5  3e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0219016  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3805  heat shock protein Hsp20  37.74 
 
 		 158 aa  85.1  4e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.232205  normal  0.564168 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0197  heat shock protein Hsp20  40.54 
 
 		 147 aa  85.1  4e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0542117 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0686  heat shock protein HSP20  33.33 
 
 		 153 aa  84.7  5e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0833  heat shock protein Hsp20  37.98 
 
 		 169 aa  84.7  5e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3498  heat shock protein Hsp20  37.74 
 
 		 158 aa  84.3  6e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.938667  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2532  HSP20 family protein  39.81 
 
 		 144 aa  84.3  7e-16  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4342  heat shock protein Hsp20  40.54 
 
 		 147 aa  84.3  7e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.232434  normal  0.204531 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4395  heat shock protein Hsp20  38.73 
 
 		 181 aa  84  8e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.481666  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4528  heat shock protein Hsp20  38.73 
 
 		 181 aa  84  8e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.550609  normal  0.0462291 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1115  heat shock protein Hsp20  38.18 
 
 		 162 aa  83.6  0.000000000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0741755  normal  0.307075 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2600  putative heat shock protein Hsp20  32.26 
 
 		 187 aa  83.6  0.000000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.207676  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1434  low molecular weight heat shock protein  38.68 
 
 		 160 aa  82.8  0.000000000000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1365  heat shock protein Hsp20  38.68 
 
 		 160 aa  82.8  0.000000000000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.117276  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0289  heat shock protein Hsp20  46.46 
 
 		 148 aa  82.4  0.000000000000002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0247001  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2957  HSP20 family protein  37.96 
 
 		 143 aa  82  0.000000000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0037  heat shock protein Hsp20  39.62 
 
 		 142 aa  82  0.000000000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1806  heat shock protein Hsp20  37.33 
 
 		 139 aa  81.6  0.000000000000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.332989  normal  0.066583 
 
 
-
 
NC_002936  DET0954  Hsp20/alpha crystallin family protein  38.78 
 
 		 162 aa  82  0.000000000000004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.154946  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0543  heat shock protein Hsp20  37.93 
 
 		 147 aa  81.6  0.000000000000005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0340696  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0838  heat shock protein Hsp20  38.78 
 
 		 162 aa  81.3  0.000000000000005  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2414  hypothetical protein  37.27 
 
 		 164 aa  81.3  0.000000000000006  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1869  putative small heat shock protein  38.46 
 
 		 142 aa  81.3  0.000000000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.309197  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0756  heat shock protein Hsp20  44.34 
 
 		 132 aa  80.9  0.000000000000007  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.16256 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2559  hypothetical protein  37.96 
 
 		 164 aa  80.9  0.000000000000007  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6104  heat shock protein Hsp20  37.74 
 
 		 158 aa  80.9  0.000000000000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0249434 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>