More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcar_0369 on replicon NC_007498
Organism: Pelobacter carbinolicus DSM 2380



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007498  Pcar_0369  HSP20 family protein  100 
 
 		 153 aa  310  5.999999999999999e-84  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  4.93231e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2250  heat shock protein Hsp20  52 
 
 		 178 aa  131  3.9999999999999996e-30  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1967  heat shock protein Hsp20  51.2 
 
 		 178 aa  129  2.0000000000000002e-29  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2635  heat shock protein Hsp20  48.82 
 
 		 195 aa  118  3e-26  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000662159  normal  0.965311 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2863  heat shock protein Hsp20  48.06 
 
 		 167 aa  117  3.9999999999999996e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.203152  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2678  HSP20 family protein  43.88 
 
 		 151 aa  115  1.9999999999999998e-25  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0538  HSP20 family protein  48.57 
 
 		 147 aa  110  9e-24  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2790  heat shock protein Hsp20  48.57 
 
 		 149 aa  110  9e-24  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000163808  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3078  heat shock protein Hsp20  40.94 
 
 		 145 aa  107  6e-23  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000700712  normal  0.0754711 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2522  heat shock protein Hsp20  39.29 
 
 		 150 aa  107  6e-23  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0557  heat shock protein Hsp20  43.36 
 
 		 147 aa  104  3e-22  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0117197  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0543  heat shock protein Hsp20  43.36 
 
 		 147 aa  105  3e-22  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0340696  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1076  heat shock protein Hsp20  50.54 
 
 		 148 aa  103  8e-22  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.713568  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2986  heat shock protein Hsp20  44.76 
 
 		 147 aa  103  1e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00130326  normal  0.964264 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1348  heat shock protein Hsp20  44.66 
 
 		 146 aa  103  1e-21  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.403253 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2024  heat shock protein Hsp20  44.66 
 
 		 146 aa  103  1e-21  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.106375 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3076  heat shock protein Hsp20  44.76 
 
 		 148 aa  103  1e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0037  heat shock protein Hsp20  42.73 
 
 		 142 aa  102  2e-21  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6892  heat shock protein Hsp20  42.02 
 
 		 157 aa  102  2e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.862152  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0735  heat shock protein Hsp20  47.17 
 
 		 145 aa  101  3e-21  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  unclonable  0.0000000000000037192  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2505  heat shock protein Hsp20  44.95 
 
 		 138 aa  102  3e-21  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.239492  normal  0.0462479 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2078  heat shock protein Hsp20  40.62 
 
 		 147 aa  101  4e-21  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3905  heat shock protein Hsp20  45.71 
 
 		 147 aa  100  6e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000984381  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0762  heat shock protein Hsp20  45.83 
 
 		 134 aa  100  6e-21  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0445  heat shock protein Hsp20  42.34 
 
 		 150 aa  100  7e-21  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0540  heat shock protein Hsp20  38.28 
 
 		 147 aa  99.8  1e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_825  HSP20/alpha crystallin  45 
 
 		 162 aa  99  2e-20  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5491  heat shock protein Hsp20  45.28 
 
 		 211 aa  99.4  2e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.710483  normal  0.352797 
 
 
-
 
NC_002936  DET0954  Hsp20/alpha crystallin family protein  44 
 
 		 162 aa  98.6  3e-20  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.154946  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4461  heat shock protein Hsp20  44.12 
 
 		 163 aa  98.6  3e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3882  heat shock protein Hsp20  43.59 
 
 		 158 aa  98.2  3e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.545217  normal  0.180827 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1977  heat shock protein Hsp20  37.96 
 
 		 139 aa  98.2  3e-20  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.334288  normal  0.643075 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0865  heat shock protein Hsp20  44.63 
 
 		 134 aa  97.8  4e-20  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.303654  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1543  heat shock protein Hsp20  40.48 
 
 		 146 aa  97.8  4e-20  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.000494204  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0580  heat shock protein Hsp20  39.32 
 
 		 145 aa  97.8  5e-20  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000199173  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0982  HSP20 family protein  47.12 
 
 		 176 aa  97.4  6e-20  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3582  heat shock protein Hsp20  44.44 
 
 		 166 aa  97.4  7e-20  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0838  heat shock protein Hsp20  44 
 
 		 162 aa  96.3  1e-19  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1573  heat shock protein Hsp20  38.35 
 
 		 173 aa  96.7  1e-19  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  decreased coverage  0.00130938  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3903  heat shock protein Hsp20  43.12 
 
 		 194 aa  96.7  1e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.534424 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0200  heat shock protein Hsp20  45.28 
 
 		 176 aa  96.3  1e-19  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.377048  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14610  heat shock protein Hsp20  38.33 
 
 		 143 aa  95.5  2e-19  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000610495  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0513  heat shock protein Hsp20  42.86 
 
 		 147 aa  95.5  2e-19  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0481  heat shock protein Hsp20  44.23 
 
 		 150 aa  95.1  3e-19  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.411475 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4342  heat shock protein Hsp20  45.71 
 
 		 147 aa  95.1  3e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.232434  normal  0.204531 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0052  heat shock protein Hsp20  45.28 
 
 		 151 aa  95.5  3e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.319643  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2316  heat shock protein Hsp20  41.13 
 
 		 139 aa  94.7  4e-19  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0611291  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1366  heat shock protein Hsp20  44.95 
 
 		 176 aa  94  7e-19  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.74874  normal  0.190619 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4859  heat shock protein Hsp20  41.28 
 
 		 204 aa  93.6  8e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2022  heat shock protein Hsp20  39.47 
 
 		 141 aa  92.8  1e-18  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2074  heat shock protein Hsp20  44.55 
 
 		 173 aa  93.2  1e-18  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.145284  normal  0.308358 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0197  heat shock protein Hsp20  44.76 
 
 		 147 aa  92.4  2e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0542117 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0623  heat shock protein Hsp20  45.28 
 
 		 152 aa  92  2e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.844177  normal  0.400233 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1429  heat shock protein Hsp20  41.07 
 
 		 169 aa  92.8  2e-18  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4352  heat shock protein Hsp20  40.57 
 
 		 145 aa  91.7  3e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.735936  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2210  heat shock protein Hsp20  40.37 
 
 		 139 aa  91.3  4e-18  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0417447  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3080  heat shock protein Hsp20  43.4 
 
 		 230 aa  91.3  4e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1892  HSP20 family protein  40.83 
 
 		 132 aa  91.3  4e-18  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.684879  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1762  heat shock protein Hsp20  42.06 
 
 		 144 aa  91.3  4e-18  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0989  heat shock protein Hsp20  41.9 
 
 		 148 aa  91.3  4e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.543303  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0610  heat shock protein Hsp20  40.71 
 
 		 136 aa  91.3  5e-18  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.335952  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1660  heat shock protein Hsp20  38.78 
 
 		 145 aa  90.9  5e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.870911  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0343  heat shock protein Hsp20  43.01 
 
 		 144 aa  90.5  8e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.90555e-28 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4507  heat shock protein Hsp20  40.95 
 
 		 145 aa  90.5  8e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2957  HSP20 family protein  44.86 
 
 		 143 aa  90.1  9e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4488  heat shock protein Hsp20  40.57 
 
 		 145 aa  90.1  1e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0362  heat shock protein Hsp20  41.94 
 
 		 144 aa  89.7  1e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.025472  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2559  hypothetical protein  40.37 
 
 		 164 aa  89.7  1e-17  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2414  hypothetical protein  40.37 
 
 		 164 aa  89.7  1e-17  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0296  heat shock protein Hsp20  36.8 
 
 		 156 aa  89.4  2e-17  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4118  heat shock protein Hsp20  37.98 
 
 		 172 aa  89  2e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.513744 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4395  heat shock protein Hsp20  43.09 
 
 		 181 aa  89.4  2e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.481666  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0125  heat shock protein Hsp20  45.54 
 
 		 139 aa  89  2e-17  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.369397  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1159  heat shock protein Hsp20  43.4 
 
 		 148 aa  89.4  2e-17  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000413054  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1648  heat shock protein, Hsp20 family  38.98 
 
 		 148 aa  89.4  2e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.715277  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1333  heat shock protein Hsp20  40.71 
 
 		 142 aa  89  2e-17  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2578  putative heat shock protein  36.79 
 
 		 185 aa  89.4  2e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4528  heat shock protein Hsp20  43.09 
 
 		 181 aa  89.4  2e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.550609  normal  0.0462291 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2898  heat shock protein Hsp20  43.69 
 
 		 149 aa  89  2e-17  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.828136  normal  0.116226 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1347  heat shock protein Hsp20  38.98 
 
 		 148 aa  89.4  2e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.452932  normal  0.819182 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2320  heat shock protein Hsp20  41.88 
 
 		 149 aa  89  2e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2287  heat shock protein Hsp20  37.01 
 
 		 189 aa  89.4  2e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3336  heat shock protein Hsp20  39.82 
 
 		 191 aa  88.6  3e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6104  heat shock protein Hsp20  39.32 
 
 		 158 aa  88.6  3e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0249434 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0629  heat shock protein Hsp20  36.43 
 
 		 189 aa  88.2  4e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.185609 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1917  heat shock protein Hsp20  40 
 
 		 156 aa  88.2  4e-17  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.86534  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3680  heat shock protein Hsp20  40.71 
 
 		 185 aa  87.8  5e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.626967 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3076  heat shock protein Hsp20  36.22 
 
 		 173 aa  87.8  5e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3724  heat shock protein Hsp20  40.71 
 
 		 185 aa  87.8  5e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2477  heat shock protein Hsp20  46.23 
 
 		 143 aa  87.8  5e-17  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1010  heat shock protein Hsp20  43.93 
 
 		 153 aa  87.8  5e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00224234  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3498  heat shock protein Hsp20  38.14 
 
 		 158 aa  87.8  5e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.938667  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1983  heat shock protein Hsp20  42.86 
 
 		 153 aa  87.4  6e-17  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00684856  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2276  heat shock protein Hsp20  42.02 
 
 		 175 aa  87.4  6e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0383  heat shock protein Hsp20  39.68 
 
 		 158 aa  87.8  6e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3805  heat shock protein Hsp20  38.14 
 
 		 158 aa  87.4  7e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.232205  normal  0.564168 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4463  heat shock protein Hsp20  40.71 
 
 		 141 aa  87.4  7e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3412  small HspC2 heat shock protein  34.15 
 
 		 189 aa  87.4  7e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.260583  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0622  HSP20 family protein  42.5 
 
 		 132 aa  87  8e-17  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2159  heat shock protein Hsp20  41.94 
 
 		 139 aa  87  8e-17  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0146906  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>