More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic_4395 on replicon NC_010678
Organism: Ralstonia pickettii 12J



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012857  Rpic12D_4528  heat shock protein Hsp20  100 
 
 		 181 aa  373  1e-103  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.550609  normal  0.0462291 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4395  heat shock protein Hsp20  100 
 
 		 181 aa  373  1e-103  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.481666  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0924  heat shock protein  60.22 
 
 		 180 aa  196  1.0000000000000001e-49  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2460  heat shock protein Hsp20  44.32 
 
 		 186 aa  166  2e-40  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.0031555  normal  0.623789 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3234  HSP20 family protein  43.78 
 
 		 231 aa  162  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2276  heat shock protein Hsp20  54.95 
 
 		 175 aa  160  1e-38  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3527  putative HspC2 heat shock protein  53.59 
 
 		 173 aa  158  4e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0868338  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20170  heat shock protein Hsp20  43.6 
 
 		 177 aa  149  2e-35  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.638214  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25770  heat shock Hsp20 protein  43.17 
 
 		 198 aa  142  2e-33  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0200  heat shock protein Hsp20  48.1 
 
 		 176 aa  143  2e-33  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.377048  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1018  heat shock protein Hsp20  45.14 
 
 		 177 aa  129  2.0000000000000002e-29  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.683731  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2287  heat shock protein Hsp20  42.24 
 
 		 189 aa  127  1.0000000000000001e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1171  heat shock protein Hsp20  39.11 
 
 		 189 aa  123  1e-27  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.726376  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1917  heat shock protein Hsp20  46.58 
 
 		 156 aa  123  1e-27  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.86534  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3412  small HspC2 heat shock protein  42.24 
 
 		 189 aa  122  2e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.260583  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0629  heat shock protein Hsp20  38.55 
 
 		 189 aa  122  4e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.185609 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2860  heat shock protein Hsp20  42.18 
 
 		 184 aa  121  4e-27  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.793853  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0383  heat shock protein Hsp20  42 
 
 		 166 aa  120  9e-27  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.170778  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3394  heat shock protein Hsp20  37.99 
 
 		 189 aa  119  1.9999999999999998e-26  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0219016  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2118  heat shock protein Hsp20  42.61 
 
 		 166 aa  119  3e-26  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4461  heat shock protein Hsp20  51.61 
 
 		 163 aa  119  3e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3612  hypothetical protein  36.78 
 
 		 177 aa  118  3.9999999999999996e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2074  heat shock protein Hsp20  38.33 
 
 		 173 aa  117  7.999999999999999e-26  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.145284  normal  0.308358 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2212  heat shock protein Hsp20  45.7 
 
 		 171 aa  113  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2355  heat shock protein Hsp20  42.38 
 
 		 165 aa  113  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.20966  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3724  heat shock protein Hsp20  38.22 
 
 		 185 aa  109  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3680  heat shock protein Hsp20  38.22 
 
 		 185 aa  109  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.626967 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4635  heat shock protein Hsp20  43.71 
 
 		 169 aa  108  5e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4310  heat shock protein Hsp20  38.92 
 
 		 166 aa  108  5e-23  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4550  heat shock protein Hsp20  38.92 
 
 		 166 aa  108  5e-23  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2802  heat shock protein Hsp20  41.04 
 
 		 167 aa  107  1e-22  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.20157 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1115  heat shock protein Hsp20  40.67 
 
 		 162 aa  106  2e-22  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0741755  normal  0.307075 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2462  heat shock protein Hsp20  41.21 
 
 		 168 aa  105  2e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0466294  normal  0.178308 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3146  heat shock protein Hsp20  40.4 
 
 		 167 aa  105  3e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.754957 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5194  heat shock protein Hsp20  40.79 
 
 		 169 aa  104  5e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0987038  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1543  heat shock protein Hsp20  39.86 
 
 		 146 aa  104  8e-22  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.000494204  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1010  heat shock protein Hsp20  41.84 
 
 		 153 aa  104  8e-22  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00224234  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4118  heat shock protein Hsp20  39.41 
 
 		 172 aa  103  9e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.513744 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0557  heat shock protein Hsp20  40.43 
 
 		 147 aa  103  1e-21  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0117197  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0543  heat shock protein Hsp20  40.43 
 
 		 147 aa  103  1e-21  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0340696  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3241  heat shock protein Hsp20  42.28 
 
 		 166 aa  103  2e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.406826  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2320  heat shock protein Hsp20  39.04 
 
 		 149 aa  102  4e-21  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0538  HSP20 family protein  42.86 
 
 		 147 aa  101  6e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0369  HSP20 family protein  43.44 
 
 		 153 aa  100  8e-21  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  4.93231e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2522  heat shock protein Hsp20  42.31 
 
 		 150 aa  99.4  2e-20  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2940  heat shock protein Hsp20  40.79 
 
 		 168 aa  100  2e-20  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3903  heat shock protein Hsp20  38.36 
 
 		 194 aa  99.8  2e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.534424 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1127  heat shock protein Hsp20  38.26 
 
 		 142 aa  99.4  2e-20  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2790  heat shock protein Hsp20  44.76 
 
 		 149 aa  99.4  3e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000163808  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0296  heat shock protein Hsp20  42.06 
 
 		 156 aa  98.6  4e-20  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2316  heat shock protein Hsp20  42.02 
 
 		 139 aa  97.8  8e-20  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0611291  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2132  heat shock protein Hsp20  37.33 
 
 		 164 aa  97.1  1e-19  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.585874 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2414  hypothetical protein  35.57 
 
 		 164 aa  96.3  2e-19  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2559  hypothetical protein  35.57 
 
 		 164 aa  95.5  3e-19  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3582  heat shock protein Hsp20  38.73 
 
 		 166 aa  95.9  3e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0762  heat shock protein Hsp20  48.45 
 
 		 134 aa  95.9  3e-19  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1977  heat shock protein Hsp20  41.18 
 
 		 139 aa  95.5  4e-19  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.334288  normal  0.643075 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2635  heat shock protein Hsp20  30.64 
 
 		 195 aa  95.1  4e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000662159  normal  0.965311 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4859  heat shock protein Hsp20  38.99 
 
 		 204 aa  95.5  4e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2857  heat shock protein Hsp20  36.17 
 
 		 158 aa  95.1  5e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.274432  normal  0.0879388 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2986  heat shock protein Hsp20  39.05 
 
 		 147 aa  94.7  6e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00130326  normal  0.964264 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3076  heat shock protein Hsp20  41.9 
 
 		 148 aa  94.7  6e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4507  heat shock protein Hsp20  38.31 
 
 		 145 aa  94.7  7e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4352  heat shock protein Hsp20  37.66 
 
 		 145 aa  94.4  7e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.735936  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0838  heat shock protein Hsp20  34.31 
 
 		 162 aa  94.4  8e-19  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3882  heat shock protein Hsp20  42.99 
 
 		 158 aa  94.4  9e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.545217  normal  0.180827 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2957  HSP20 family protein  36.71 
 
 		 143 aa  94  1e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0954  Hsp20/alpha crystallin family protein  33.33 
 
 		 162 aa  93.6  1e-18  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.154946  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1029  Hsp20/alpha crystallin family protein  38.17 
 
 		 146 aa  94  1e-18  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00339514  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2384  heat shock protein Hsp20  38.51 
 
 		 164 aa  94  1e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0989  heat shock protein Hsp20  36.24 
 
 		 148 aa  93.6  1e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.543303  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0389  heat shock protein Hsp20  40.78 
 
 		 166 aa  93.6  1e-18  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.706384 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1348  heat shock protein Hsp20  36.77 
 
 		 146 aa  94  1e-18  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.403253 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2024  heat shock protein Hsp20  36.77 
 
 		 146 aa  94  1e-18  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.106375 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2678  HSP20 family protein  41.67 
 
 		 151 aa  92.8  2e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0052  heat shock protein Hsp20  34.42 
 
 		 151 aa  93.2  2e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.319643  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0865  heat shock protein Hsp20  42.61 
 
 		 134 aa  93.2  2e-18  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.303654  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2836  heat shock protein Hsp20  33.33 
 
 		 197 aa  93.2  2e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00556978  normal  0.209218 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_825  HSP20/alpha crystallin  33.33 
 
 		 162 aa  92.8  2e-18  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2578  putative heat shock protein  40 
 
 		 185 aa  92.8  2e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1076  heat shock protein Hsp20  35 
 
 		 148 aa  92.8  2e-18  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.713568  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4488  heat shock protein Hsp20  37.66 
 
 		 145 aa  93.2  2e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3805  heat shock protein Hsp20  42.59 
 
 		 158 aa  93.2  2e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.232205  normal  0.564168 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6104  heat shock protein Hsp20  39.81 
 
 		 158 aa  92.4  3e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0249434 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6219  heat shock protein Hsp20  65.38 
 
 		 93 aa  92.4  3e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.425296  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0197  heat shock protein Hsp20  41.12 
 
 		 147 aa  92  4e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0542117 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0481  heat shock protein Hsp20  40.78 
 
 		 150 aa  92  4e-18  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.411475 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3498  heat shock protein Hsp20  41.67 
 
 		 158 aa  92  4e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.938667  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2022  heat shock protein Hsp20  35.26 
 
 		 141 aa  91.3  6e-18  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3905  heat shock protein Hsp20  37.69 
 
 		 147 aa  90.9  8e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000984381  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0599  heat shock protein Hsp20  30.86 
 
 		 176 aa  91.3  8e-18  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.187967  normal  0.122676 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1921  heat shock protein Hsp20  34.55 
 
 		 167 aa  91.3  8e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.985705  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0445  heat shock protein Hsp20  32.69 
 
 		 150 aa  90.5  1e-17  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4499  heat shock protein Hsp20  34.39 
 
 		 145 aa  90.1  1e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.100268 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0833  heat shock protein Hsp20  35.26 
 
 		 169 aa  90.5  1e-17  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4342  heat shock protein Hsp20  40.19 
 
 		 147 aa  90.5  1e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.232434  normal  0.204531 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2898  heat shock protein Hsp20  36.6 
 
 		 149 aa  89.7  2e-17  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.828136  normal  0.116226 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1366  heat shock protein Hsp20  35.82 
 
 		 176 aa  89.7  2e-17  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.74874  normal  0.190619 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0391  heat shock protein Hsp20  34.64 
 
 		 143 aa  89.7  2e-17  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000478859  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0362  heat shock protein Hsp20  44.09 
 
 		 144 aa  89.4  2e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.025472  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>