More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_6104 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010511  M446_6104  heat shock protein Hsp20  100 
 
 
158 aa  311  1.9999999999999998e-84  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0249434 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3498  heat shock protein Hsp20  58.6 
 
 
158 aa  180  7e-45  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.938667  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3805  heat shock protein Hsp20  58.6 
 
 
158 aa  180  8.000000000000001e-45  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.232205  normal  0.564168 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3882  heat shock protein Hsp20  55.77 
 
 
158 aa  167  5e-41  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.545217  normal  0.180827 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1917  heat shock protein Hsp20  46.32 
 
 
156 aa  109  1.0000000000000001e-23  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.86534  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2578  putative heat shock protein  42.86 
 
 
185 aa  99.8  1e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6892  heat shock protein Hsp20  53.7 
 
 
157 aa  98.2  4e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.862152  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2857  heat shock protein Hsp20  40.15 
 
 
158 aa  96.7  1e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.274432  normal  0.0879388 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3394  heat shock protein Hsp20  38.12 
 
 
189 aa  96.3  1e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0219016  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2355  heat shock protein Hsp20  40.77 
 
 
165 aa  96.3  2e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.20966  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1171  heat shock protein Hsp20  38.12 
 
 
189 aa  96.3  2e-19  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.726376  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3412  small HspC2 heat shock protein  38.75 
 
 
189 aa  95.5  3e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.260583  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5491  heat shock protein Hsp20  50.47 
 
 
211 aa  94.7  4e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.710483  normal  0.352797 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4461  heat shock protein Hsp20  37.5 
 
 
163 aa  95.1  4e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0200  heat shock protein Hsp20  41.38 
 
 
176 aa  94.7  4e-19  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.377048  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2287  heat shock protein Hsp20  38.12 
 
 
189 aa  94.7  5e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0629  heat shock protein Hsp20  38.12 
 
 
189 aa  94.7  5e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.185609 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0580  heat shock protein Hsp20  38.68 
 
 
145 aa  92  3e-18  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000199173  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5194  heat shock protein Hsp20  36.18 
 
 
169 aa  92  3e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0987038  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1018  heat shock protein Hsp20  43.52 
 
 
177 aa  89.7  1e-17  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.683731  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3612  hypothetical protein  38.69 
 
 
177 aa  90.1  1e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20170  heat shock protein Hsp20  43.12 
 
 
177 aa  89.4  2e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.638214  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0369  HSP20 family protein  39.32 
 
 
153 aa  88.6  3e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  4.93231e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3724  heat shock protein Hsp20  34.32 
 
 
185 aa  88.6  3e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3680  heat shock protein Hsp20  34.32 
 
 
185 aa  88.6  3e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.626967 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4230  heat shock protein Hsp20  42.45 
 
 
105 aa  88.2  4e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3234  HSP20 family protein  38.6 
 
 
231 aa  87.4  6e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2860  heat shock protein Hsp20  34.18 
 
 
184 aa  87.8  6e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.793853  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6390  heat shock protein Hsp20  42.86 
 
 
187 aa  87.4  6e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.065602 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2460  heat shock protein Hsp20  38.6 
 
 
186 aa  87.4  7e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.0031555  normal  0.623789 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0557  heat shock protein Hsp20  36.24 
 
 
147 aa  87  9e-17  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0117197  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0543  heat shock protein Hsp20  40 
 
 
147 aa  87  9e-17  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0340696  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3527  putative HspC2 heat shock protein  39.04 
 
 
173 aa  86.3  1e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0868338  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6093  heat shock protein Hsp20  41.9 
 
 
187 aa  86.7  1e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4859  heat shock protein Hsp20  39.16 
 
 
204 aa  86.3  2e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3903  heat shock protein Hsp20  39.16 
 
 
194 aa  85.9  2e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.534424 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2940  heat shock protein Hsp20  36.43 
 
 
168 aa  86.3  2e-16  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0445  heat shock protein Hsp20  34.44 
 
 
150 aa  86.3  2e-16  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0383  heat shock protein Hsp20  38.26 
 
 
166 aa  85.9  2e-16  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.170778  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3080  heat shock protein Hsp20  42.86 
 
 
230 aa  85.5  3e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2074  heat shock protein Hsp20  38 
 
 
173 aa  85.1  4e-16  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.145284  normal  0.308358 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2505  heat shock protein Hsp20  43.4 
 
 
138 aa  84.3  5e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.239492  normal  0.0462479 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2212  heat shock protein Hsp20  38.35 
 
 
171 aa  84.7  5e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0838  heat shock protein Hsp20  34.86 
 
 
162 aa  84.3  6e-16  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2276  heat shock protein Hsp20  34.46 
 
 
175 aa  84.3  6e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2600  putative heat shock protein Hsp20  42.86 
 
 
187 aa  84  9e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.207676  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2790  heat shock protein Hsp20  35.85 
 
 
149 aa  83.2  0.000000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000163808  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0538  HSP20 family protein  32.62 
 
 
147 aa  82.8  0.000000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1732  HSP20 family protein  42.72 
 
 
167 aa  81.3  0.000000000000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.371108  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1115  heat shock protein Hsp20  39.29 
 
 
162 aa  81.6  0.000000000000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0741755  normal  0.307075 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3146  heat shock protein Hsp20  35.97 
 
 
167 aa  81.3  0.000000000000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.754957 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2132  heat shock protein Hsp20  39.85 
 
 
164 aa  81.3  0.000000000000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.585874 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4118  heat shock protein Hsp20  38.52 
 
 
172 aa  80.9  0.000000000000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.513744 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3582  heat shock protein Hsp20  37.74 
 
 
166 aa  80.9  0.000000000000007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0296  heat shock protein Hsp20  34.27 
 
 
156 aa  80.5  0.000000000000008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0989  heat shock protein Hsp20  34.75 
 
 
148 aa  79.7  0.00000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.543303  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3076  heat shock protein Hsp20  33.96 
 
 
148 aa  79.7  0.00000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1235  heat shock protein Hsp20  35.66 
 
 
146 aa  80.1  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.346981  normal  0.252455 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3241  heat shock protein Hsp20  31.33 
 
 
166 aa  79.7  0.00000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.406826  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1263  heat shock protein Hsp20  35.66 
 
 
146 aa  80.1  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.095432  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0782  heat shock protein Hsp20  35.66 
 
 
146 aa  80.1  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4635  heat shock protein Hsp20  35 
 
 
169 aa  80.1  0.00000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0184  heat shock protein Hsp20  43.27 
 
 
160 aa  79.3  0.00000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.29101  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0389  heat shock protein Hsp20  37.14 
 
 
166 aa  79.7  0.00000000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.706384 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0924  heat shock protein  36.91 
 
 
180 aa  78.6  0.00000000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2462  heat shock protein Hsp20  30.36 
 
 
168 aa  79  0.00000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0466294  normal  0.178308 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0102  heat shock protein Hsp20  36.07 
 
 
142 aa  78.6  0.00000000000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2408  HSP20 family protein  36.96 
 
 
160 aa  78.2  0.00000000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_10507  heat shock protein Hsp20/Hsp26, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G10270)  37.61 
 
 
181 aa  78.2  0.00000000000005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.0988742 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2635  heat shock protein Hsp20  36.19 
 
 
195 aa  77.8  0.00000000000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000662159  normal  0.965311 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2986  heat shock protein Hsp20  33.02 
 
 
147 aa  77.8  0.00000000000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00130326  normal  0.964264 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1706  heat shock protein Hsp20  35.11 
 
 
132 aa  77.8  0.00000000000005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00808314  hitchhiker  0.000432661 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0762  heat shock protein Hsp20  36 
 
 
134 aa  77.8  0.00000000000005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6252  heat shock protein Hsp20  35.04 
 
 
147 aa  77.8  0.00000000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0400474  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1983  heat shock protein Hsp20  40 
 
 
153 aa  77.8  0.00000000000006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00684856  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4395  heat shock protein Hsp20  39.81 
 
 
181 aa  77.4  0.00000000000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.481666  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4528  heat shock protein Hsp20  39.81 
 
 
181 aa  77.4  0.00000000000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.550609  normal  0.0462291 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1296  heat shock protein Hsp20  35.11 
 
 
143 aa  77.4  0.00000000000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0833  heat shock protein Hsp20  40.78 
 
 
169 aa  77.4  0.00000000000007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2024  heat shock protein Hsp20  29.79 
 
 
146 aa  77.4  0.00000000000008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.106375 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1348  heat shock protein Hsp20  29.79 
 
 
146 aa  77.4  0.00000000000008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.403253 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1333  heat shock protein Hsp20  33.1 
 
 
142 aa  77.4  0.00000000000008  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1921  heat shock protein Hsp20  42.7 
 
 
167 aa  76.6  0.0000000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.985705  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0481  heat shock protein Hsp20  34.68 
 
 
150 aa  76.6  0.0000000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.411475 
 
 
-
 
NC_002936  DET0954  Hsp20/alpha crystallin family protein  33.94 
 
 
162 aa  76.3  0.0000000000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.154946  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3905  heat shock protein Hsp20  33.96 
 
 
147 aa  75.9  0.0000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000984381  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2802  heat shock protein Hsp20  32.68 
 
 
167 aa  75.9  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.20157 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4310  heat shock protein Hsp20  39.52 
 
 
166 aa  76.3  0.0000000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4550  heat shock protein Hsp20  39.52 
 
 
166 aa  76.3  0.0000000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0926  heat shock protein Hsp20  32.48 
 
 
152 aa  76.3  0.0000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2678  HSP20 family protein  38.54 
 
 
151 aa  75.5  0.0000000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25770  heat shock Hsp20 protein  40.37 
 
 
198 aa  75.5  0.0000000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0343  HSP20 family protein  36.76 
 
 
146 aa  75.1  0.0000000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.439722  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3428  HSP20 family protein  36.76 
 
 
146 aa  75.1  0.0000000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000574786  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2615  HSP20 family protein  36.76 
 
 
146 aa  75.1  0.0000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.696707  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1127  heat shock protein Hsp20  33.08 
 
 
142 aa  75.5  0.0000000000003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1204  HSP20 family protein  36.76 
 
 
146 aa  75.1  0.0000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3389  HSP20 family protein  36.76 
 
 
146 aa  75.1  0.0000000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.134829  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3424  HSP20 family protein  36.76 
 
 
146 aa  75.1  0.0000000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_825  HSP20/alpha crystallin  34.41 
 
 
162 aa  75.1  0.0000000000003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>