More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fnod_0102 on replicon NC_009718
Organism: Fervidobacterium nodosum Rt17-B1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009718  Fnod_0102  heat shock protein Hsp20  100 
 
 
142 aa  278  2e-74  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1127  heat shock protein Hsp20  55.94 
 
 
142 aa  165  2e-40  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0557  heat shock protein Hsp20  53.1 
 
 
147 aa  150  7e-36  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0117197  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0543  heat shock protein Hsp20  55.8 
 
 
147 aa  149  1e-35  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0340696  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0989  heat shock protein Hsp20  46.67 
 
 
148 aa  114  6e-25  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.543303  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0197  heat shock protein Hsp20  43.7 
 
 
147 aa  102  2e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0542117 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4342  heat shock protein Hsp20  43.7 
 
 
147 aa  102  2e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.232434  normal  0.204531 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4488  heat shock protein Hsp20  40.82 
 
 
145 aa  99.4  1e-20  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0623  heat shock protein Hsp20  40.16 
 
 
152 aa  99.8  1e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.844177  normal  0.400233 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4352  heat shock protein Hsp20  39.73 
 
 
145 aa  99  2e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.735936  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1348  heat shock protein Hsp20  36.64 
 
 
146 aa  99.4  2e-20  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.403253 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2024  heat shock protein Hsp20  36.64 
 
 
146 aa  99.4  2e-20  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.106375 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1296  heat shock protein Hsp20  37.12 
 
 
143 aa  98.2  3e-20  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2132  heat shock protein Hsp20  37.6 
 
 
164 aa  97.8  4e-20  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.585874 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4507  heat shock protein Hsp20  40.14 
 
 
145 aa  97.4  5e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0200  heat shock protein Hsp20  37.41 
 
 
176 aa  97.4  6e-20  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.377048  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1824  heat shock protein Hsp20  39.85 
 
 
146 aa  95.9  2e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0843989  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3765  heat shock protein Hsp20  36.72 
 
 
143 aa  94  7e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2532  HSP20 family protein  37.5 
 
 
144 aa  92.8  1e-18  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3076  heat shock protein Hsp20  38.46 
 
 
148 aa  93.2  1e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0052  heat shock protein Hsp20  42.59 
 
 
151 aa  92.8  2e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.319643  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2790  heat shock protein Hsp20  38.97 
 
 
149 aa  92  2e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000163808  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4766  heat shock protein Hsp20  38.62 
 
 
163 aa  92  2e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  decreased coverage  0.0000408851  hitchhiker  0.00874264 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2320  heat shock protein Hsp20  37.19 
 
 
149 aa  92.4  2e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2522  heat shock protein Hsp20  36.97 
 
 
150 aa  91.3  4e-18  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1762  heat shock protein Hsp20  38.93 
 
 
144 aa  90.9  5e-18  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0538  HSP20 family protein  35.56 
 
 
147 aa  90.9  6e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4499  heat shock protein Hsp20  34.31 
 
 
145 aa  90.5  6e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.100268 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3078  heat shock protein Hsp20  37.14 
 
 
145 aa  90.5  6e-18  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000700712  normal  0.0754711 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2022  heat shock protein Hsp20  40.65 
 
 
141 aa  90.1  8e-18  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2857  heat shock protein Hsp20  37.8 
 
 
158 aa  90.1  9e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.274432  normal  0.0879388 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2188  heat shock protein Hsp20  34.48 
 
 
156 aa  89.4  1e-17  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.345525  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2287  heat shock protein Hsp20  32.85 
 
 
189 aa  89.7  1e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3074  heat shock protein Hsp20  38.85 
 
 
144 aa  89.4  2e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2460  heat shock protein Hsp20  34.97 
 
 
186 aa  88.2  3e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.0031555  normal  0.623789 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1076  heat shock protein Hsp20  35.92 
 
 
148 aa  88.2  4e-17  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.713568  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3788  heat shock protein Hsp20  37.69 
 
 
144 aa  88.2  4e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.964317 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1917  heat shock protein Hsp20  37.69 
 
 
156 aa  88.2  4e-17  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.86534  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1366  heat shock protein Hsp20  32.45 
 
 
176 aa  87.8  5e-17  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.74874  normal  0.190619 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6439  heat shock protein Hsp20  38.52 
 
 
153 aa  87.8  5e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.024706  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3394  heat shock protein Hsp20  32.12 
 
 
189 aa  87.4  6e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0219016  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1010  heat shock protein Hsp20  34.4 
 
 
153 aa  87.4  6e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00224234  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0836  heat shock protein Hsp20  34.85 
 
 
143 aa  87.4  6e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.534587  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3234  HSP20 family protein  34.27 
 
 
231 aa  87  7e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2578  putative heat shock protein  35.82 
 
 
185 aa  87  7e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2074  heat shock protein Hsp20  33.09 
 
 
173 aa  87.4  7e-17  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.145284  normal  0.308358 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3905  heat shock protein Hsp20  36.17 
 
 
147 aa  86.3  1e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000984381  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0838  heat shock protein Hsp20  34.17 
 
 
162 aa  86.3  1e-16  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2957  HSP20 family protein  37.88 
 
 
143 aa  86.3  1e-16  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2730  heat shock protein Hsp20  34.75 
 
 
148 aa  86.3  1e-16  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0481  heat shock protein Hsp20  35.54 
 
 
150 aa  85.9  2e-16  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.411475 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2986  heat shock protein Hsp20  34.35 
 
 
147 aa  85.9  2e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00130326  normal  0.964264 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0788  heat shock protein Hsp20  33.33 
 
 
143 aa  85.9  2e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.351008  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2281  heat shock protein Hsp20  35.88 
 
 
173 aa  85.5  2e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.78764  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3903  heat shock protein Hsp20  31.25 
 
 
194 aa  85.1  3e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.534424 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3680  heat shock protein Hsp20  33.83 
 
 
185 aa  85.5  3e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.626967 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2086  heat shock protein, Hsp20 family  38.89 
 
 
145 aa  85.1  3e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3527  putative HspC2 heat shock protein  38.26 
 
 
173 aa  84.7  3e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0868338  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5194  heat shock protein Hsp20  33.78 
 
 
169 aa  85.1  3e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0987038  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1743  heat shock protein Hsp20  38.89 
 
 
145 aa  85.1  3e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.49982  normal  0.0110244 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3724  heat shock protein Hsp20  33.83 
 
 
185 aa  85.5  3e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2316  heat shock protein Hsp20  40.54 
 
 
139 aa  84.7  4e-16  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0611291  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0891  heat shock protein Hsp20  33.86 
 
 
137 aa  84.7  4e-16  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.805469  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4061  heat shock protein Hsp20  36.29 
 
 
147 aa  84.7  4e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1171  heat shock protein Hsp20  31.88 
 
 
189 aa  84.7  4e-16  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.726376  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4023  heat shock protein Hsp20  36.29 
 
 
147 aa  84.7  4e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0391  heat shock protein Hsp20  37.96 
 
 
143 aa  84.3  5e-16  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000478859  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0125  heat shock protein Hsp20  36.15 
 
 
139 aa  84  6e-16  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.369397  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0735  heat shock protein Hsp20  41.67 
 
 
145 aa  84  7e-16  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  unclonable  0.0000000000000037192  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0629  heat shock protein Hsp20  31.16 
 
 
189 aa  84  7e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.185609 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1115  heat shock protein Hsp20  33.82 
 
 
162 aa  84  7e-16  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0741755  normal  0.307075 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1159  heat shock protein Hsp20  40.77 
 
 
148 aa  84  7e-16  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000413054  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0954  Hsp20/alpha crystallin family protein  32.06 
 
 
162 aa  83.6  8e-16  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.154946  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0774  heat shock protein Hsp20  42.86 
 
 
139 aa  83.6  9e-16  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1929  heat shock protein Hsp20  37.78 
 
 
149 aa  82.8  0.000000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.638493  normal  0.0128011 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0762  heat shock protein Hsp20  34.85 
 
 
134 aa  82.8  0.000000000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0369  HSP20 family protein  43.3 
 
 
153 aa  83.6  0.000000000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  4.93231e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_825  HSP20/alpha crystallin  33.61 
 
 
162 aa  83.2  0.000000000000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6093  heat shock protein Hsp20  36.09 
 
 
187 aa  83.2  0.000000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1977  heat shock protein Hsp20  34.15 
 
 
139 aa  82.8  0.000000000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.334288  normal  0.643075 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4819  heat shock protein Hsp20  34.85 
 
 
146 aa  83.2  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.414421 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0865  heat shock protein Hsp20  33.33 
 
 
134 aa  82  0.000000000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.303654  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1434  low molecular weight heat shock protein  33.59 
 
 
160 aa  82  0.000000000000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1365  heat shock protein Hsp20  33.59 
 
 
160 aa  82  0.000000000000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.117276  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0513  heat shock protein Hsp20  38.05 
 
 
147 aa  82.4  0.000000000000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0675  heat shock protein Hsp20  34.27 
 
 
163 aa  82.8  0.000000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.000000558694  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6390  heat shock protein Hsp20  35.34 
 
 
187 aa  82  0.000000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.065602 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1474  heat shock protein Hsp20  37.88 
 
 
151 aa  82  0.000000000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.242626  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2796  heat shock protein  38.1 
 
 
152 aa  81.6  0.000000000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.300285  normal  0.746249 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0539  heat shock protein Hsp20  38.41 
 
 
161 aa  81.6  0.000000000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3412  small HspC2 heat shock protein  31.88 
 
 
189 aa  81.6  0.000000000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.260583  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4310  heat shock protein Hsp20  35 
 
 
166 aa  82  0.000000000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4550  heat shock protein Hsp20  35 
 
 
166 aa  82  0.000000000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20170  heat shock protein Hsp20  32.87 
 
 
177 aa  81.6  0.000000000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.638214  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2899  heat shock protein Hsp20  40 
 
 
145 aa  81.6  0.000000000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0174584 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4859  heat shock protein Hsp20  30.56 
 
 
204 aa  81.6  0.000000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3080  heat shock protein Hsp20  36.79 
 
 
230 aa  82  0.000000000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1742  heat shock protein Hsp20  34.43 
 
 
152 aa  81.6  0.000000000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.314982  hitchhiker  0.000988198 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6892  heat shock protein Hsp20  37.78 
 
 
157 aa  81.6  0.000000000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.862152  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2122  heat shock protein Hsp20  32.59 
 
 
180 aa  81.3  0.000000000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.451471 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>