More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_A2578 on replicon NC_007951
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007951  Bxe_A2578  putative heat shock protein  100 
 
 
185 aa  376  1e-104  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2600  putative heat shock protein Hsp20  61.7 
 
 
187 aa  236  9e-62  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.207676  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6093  heat shock protein Hsp20  60.96 
 
 
187 aa  231  5e-60  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6390  heat shock protein Hsp20  59.68 
 
 
187 aa  231  6e-60  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.065602 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5491  heat shock protein Hsp20  42.86 
 
 
211 aa  166  2e-40  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.710483  normal  0.352797 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6892  heat shock protein Hsp20  54.68 
 
 
157 aa  162  3e-39  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.862152  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3882  heat shock protein Hsp20  42.86 
 
 
158 aa  106  2e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.545217  normal  0.180827 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2074  heat shock protein Hsp20  43.07 
 
 
173 aa  100  1e-20  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.145284  normal  0.308358 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6104  heat shock protein Hsp20  42.86 
 
 
158 aa  99.8  2e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0249434 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4461  heat shock protein Hsp20  39.83 
 
 
163 aa  99.4  2e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3905  heat shock protein Hsp20  42.11 
 
 
147 aa  99.8  2e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000984381  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0557  heat shock protein Hsp20  36.3 
 
 
147 aa  98.6  4e-20  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0117197  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25770  heat shock Hsp20 protein  36.26 
 
 
198 aa  98.2  6e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0686  heat shock protein HSP20  37.78 
 
 
153 aa  97.1  1e-19  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3805  heat shock protein Hsp20  42.06 
 
 
158 aa  97.1  1e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.232205  normal  0.564168 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3498  heat shock protein Hsp20  40.8 
 
 
158 aa  97.1  1e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.938667  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20170  heat shock protein Hsp20  37.78 
 
 
177 aa  97.4  1e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.638214  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0481  heat shock protein Hsp20  39.1 
 
 
150 aa  97.4  1e-19  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.411475 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2678  HSP20 family protein  36.73 
 
 
151 aa  96.3  2e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0543  heat shock protein Hsp20  35.62 
 
 
147 aa  96.3  2e-19  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0340696  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0389  heat shock protein Hsp20  39.32 
 
 
166 aa  96.3  3e-19  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.706384 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1366  heat shock protein Hsp20  37.93 
 
 
176 aa  95.1  5e-19  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.74874  normal  0.190619 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2986  heat shock protein Hsp20  41.12 
 
 
147 aa  94.7  6e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00130326  normal  0.964264 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0538  HSP20 family protein  40.57 
 
 
147 aa  94  1e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1348  heat shock protein Hsp20  34 
 
 
146 aa  93.6  1e-18  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.403253 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5194  heat shock protein Hsp20  38.61 
 
 
169 aa  93.6  1e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0987038  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3394  heat shock protein Hsp20  29.67 
 
 
189 aa  94.4  1e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0219016  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2024  heat shock protein Hsp20  34 
 
 
146 aa  93.6  1e-18  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.106375 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2790  heat shock protein Hsp20  36.84 
 
 
149 aa  92.4  3e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000163808  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2287  heat shock protein Hsp20  29.67 
 
 
189 aa  92  5e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3582  heat shock protein Hsp20  38.53 
 
 
166 aa  91.7  5e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0989  heat shock protein Hsp20  36.03 
 
 
148 aa  91.7  5e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.543303  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3412  small HspC2 heat shock protein  29.12 
 
 
189 aa  91.7  6e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.260583  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1917  heat shock protein Hsp20  38.14 
 
 
156 aa  91.7  6e-18  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.86534  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2276  heat shock protein Hsp20  43.48 
 
 
175 aa  91.7  6e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3680  heat shock protein Hsp20  40.65 
 
 
185 aa  91.3  7e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.626967 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3724  heat shock protein Hsp20  40.65 
 
 
185 aa  91.3  7e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2940  heat shock protein Hsp20  35.44 
 
 
168 aa  91.3  7e-18  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2635  heat shock protein Hsp20  38.89 
 
 
195 aa  91.3  7e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000662159  normal  0.965311 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0383  heat shock protein Hsp20  48.96 
 
 
166 aa  91.3  7e-18  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.170778  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3241  heat shock protein Hsp20  36.84 
 
 
166 aa  91.3  8e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.406826  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1320  Hsp20/alpha crystallin family protein  35.66 
 
 
151 aa  90.5  1e-17  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1262  small heat shock protein  35.66 
 
 
151 aa  90.5  1e-17  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.753574  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3080  heat shock protein Hsp20  32.9 
 
 
230 aa  90.9  1e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0629  heat shock protein Hsp20  29.12 
 
 
189 aa  90.5  1e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.185609 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3146  heat shock protein Hsp20  35.58 
 
 
167 aa  90.5  1e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.754957 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3234  HSP20 family protein  42.45 
 
 
231 aa  90.1  2e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2532  HSP20 family protein  32.85 
 
 
144 aa  90.1  2e-17  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0052  heat shock protein Hsp20  36.28 
 
 
151 aa  90.1  2e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.319643  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2957  HSP20 family protein  36.03 
 
 
143 aa  89.7  2e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4635  heat shock protein Hsp20  37.58 
 
 
169 aa  90.1  2e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2118  heat shock protein Hsp20  38.97 
 
 
166 aa  89.4  3e-17  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0369  HSP20 family protein  36.79 
 
 
153 aa  89.4  3e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  4.93231e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1171  heat shock protein Hsp20  29.73 
 
 
189 aa  89.4  3e-17  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.726376  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2460  heat shock protein Hsp20  43.75 
 
 
186 aa  89  3e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.0031555  normal  0.623789 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1018  heat shock protein Hsp20  42.98 
 
 
177 aa  89.4  3e-17  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.683731  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3323  heat shock protein Hsp20  31.58 
 
 
228 aa  88.6  4e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2860  heat shock protein Hsp20  33.64 
 
 
184 aa  89  4e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.793853  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0445  heat shock protein Hsp20  38.98 
 
 
150 aa  88.2  6e-17  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2477  heat shock protein Hsp20  38.74 
 
 
143 aa  88.2  6e-17  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2522  heat shock protein Hsp20  41.51 
 
 
150 aa  88.2  7e-17  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0580  heat shock protein Hsp20  35.34 
 
 
145 aa  87.8  8e-17  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000199173  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3076  heat shock protein Hsp20  35.96 
 
 
148 aa  87.8  8e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0037  heat shock protein Hsp20  38.26 
 
 
142 aa  87.4  9e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2355  heat shock protein Hsp20  43.12 
 
 
165 aa  87.4  1e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.20966  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1115  heat shock protein Hsp20  43.81 
 
 
162 aa  87  1e-16  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0741755  normal  0.307075 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1762  heat shock protein Hsp20  34.09 
 
 
144 aa  87.4  1e-16  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0924  heat shock protein  42.99 
 
 
180 aa  87  1e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2802  heat shock protein Hsp20  36.84 
 
 
167 aa  87  1e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.20157 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1127  heat shock protein Hsp20  34.04 
 
 
142 aa  87.4  1e-16  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3336  heat shock protein Hsp20  31.32 
 
 
191 aa  87  1e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0102  heat shock protein Hsp20  35.82 
 
 
142 aa  87  1e-16  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2559  hypothetical protein  36.43 
 
 
164 aa  86.3  2e-16  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0838  heat shock protein Hsp20  33.82 
 
 
162 aa  86.3  2e-16  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2857  heat shock protein Hsp20  38.84 
 
 
158 aa  85.9  3e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.274432  normal  0.0879388 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4118  heat shock protein Hsp20  36.94 
 
 
172 aa  85.9  3e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.513744 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2863  heat shock protein Hsp20  41.9 
 
 
167 aa  85.9  3e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.203152  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2462  heat shock protein Hsp20  39.42 
 
 
168 aa  85.9  3e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0466294  normal  0.178308 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1977  heat shock protein Hsp20  27.7 
 
 
139 aa  85.5  4e-16  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.334288  normal  0.643075 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0296  heat shock protein Hsp20  33.59 
 
 
156 aa  85.1  5e-16  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0865  heat shock protein Hsp20  39.05 
 
 
134 aa  85.1  5e-16  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.303654  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4766  heat shock protein Hsp20  38.67 
 
 
163 aa  84.7  6e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  decreased coverage  0.0000408851  hitchhiker  0.00874264 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2657  heat shock protein Hsp20  37.61 
 
 
155 aa  84.7  7e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.498697  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3527  putative HspC2 heat shock protein  39.62 
 
 
173 aa  84.3  8e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0868338  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0505  heat shock protein Hsp20  33.33 
 
 
158 aa  84.3  8e-16  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0200  heat shock protein Hsp20  37.5 
 
 
176 aa  84.3  0.000000000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.377048  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2414  hypothetical protein  37.17 
 
 
164 aa  84  0.000000000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0125  heat shock protein Hsp20  34.45 
 
 
139 aa  83.6  0.000000000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.369397  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4463  heat shock protein Hsp20  36.62 
 
 
141 aa  83.6  0.000000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3612  hypothetical protein  41.12 
 
 
177 aa  84  0.000000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0954  Hsp20/alpha crystallin family protein  33.33 
 
 
162 aa  82.8  0.000000000000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.154946  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2316  heat shock protein Hsp20  28.28 
 
 
139 aa  83.2  0.000000000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0611291  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2635  heat shock protein Hsp20  30.61 
 
 
148 aa  83.2  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0197  heat shock protein Hsp20  33.96 
 
 
147 aa  83.2  0.000000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0542117 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0833  heat shock protein Hsp20  39.29 
 
 
169 aa  82.8  0.000000000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3468  heat shock protein Hsp20  30.61 
 
 
148 aa  83.2  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.282569  normal  0.556723 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2210  heat shock protein Hsp20  29.25 
 
 
139 aa  82.8  0.000000000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0417447  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4342  heat shock protein Hsp20  33.02 
 
 
147 aa  82.8  0.000000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.232434  normal  0.204531 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4859  heat shock protein Hsp20  36 
 
 
204 aa  82.8  0.000000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0762  heat shock protein Hsp20  36.73 
 
 
134 aa  82.4  0.000000000000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>