More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sala_2074 on replicon NC_008048
Organism: Sphingopyxis alaskensis RB2256



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008048  Sala_2074  heat shock protein Hsp20  100 
 
 
173 aa  347  3e-95  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.145284  normal  0.308358 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4118  heat shock protein Hsp20  60.92 
 
 
172 aa  195  3e-49  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.513744 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2212  heat shock protein Hsp20  52.05 
 
 
171 aa  189  1e-47  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2355  heat shock protein Hsp20  51.18 
 
 
165 aa  184  5e-46  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.20966  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3146  heat shock protein Hsp20  56 
 
 
167 aa  183  8e-46  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.754957 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4635  heat shock protein Hsp20  56.4 
 
 
169 aa  179  2e-44  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3680  heat shock protein Hsp20  54.65 
 
 
185 aa  178  2.9999999999999997e-44  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.626967 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3724  heat shock protein Hsp20  54.65 
 
 
185 aa  178  2.9999999999999997e-44  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2940  heat shock protein Hsp20  51.46 
 
 
168 aa  177  4.999999999999999e-44  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5194  heat shock protein Hsp20  52.33 
 
 
169 aa  174  5e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0987038  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2118  heat shock protein Hsp20  53.71 
 
 
166 aa  172  1.9999999999999998e-42  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0383  heat shock protein Hsp20  52.05 
 
 
166 aa  169  1e-41  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.170778  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2462  heat shock protein Hsp20  48.85 
 
 
168 aa  168  3e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0466294  normal  0.178308 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4310  heat shock protein Hsp20  52.91 
 
 
166 aa  163  1.0000000000000001e-39  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4550  heat shock protein Hsp20  52.91 
 
 
166 aa  163  1.0000000000000001e-39  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3241  heat shock protein Hsp20  46.2 
 
 
166 aa  159  3e-38  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.406826  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2802  heat shock protein Hsp20  45.93 
 
 
167 aa  156  1e-37  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.20157 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2132  heat shock protein Hsp20  47.13 
 
 
164 aa  153  9e-37  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.585874 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1115  heat shock protein Hsp20  44.44 
 
 
162 aa  144  4.0000000000000006e-34  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0741755  normal  0.307075 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2384  heat shock protein Hsp20  43.68 
 
 
164 aa  136  2e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3394  heat shock protein Hsp20  42.11 
 
 
189 aa  129  2.0000000000000002e-29  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0219016  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1171  heat shock protein Hsp20  42.01 
 
 
189 aa  126  1.0000000000000001e-28  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.726376  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3903  heat shock protein Hsp20  44.1 
 
 
194 aa  126  1.0000000000000001e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.534424 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0629  heat shock protein Hsp20  41.52 
 
 
189 aa  126  2.0000000000000002e-28  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.185609 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2287  heat shock protein Hsp20  44.03 
 
 
189 aa  126  2.0000000000000002e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4859  heat shock protein Hsp20  46.71 
 
 
204 aa  125  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3412  small HspC2 heat shock protein  42.11 
 
 
189 aa  125  3e-28  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.260583  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4461  heat shock protein Hsp20  35.8 
 
 
163 aa  120  9.999999999999999e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2860  heat shock protein Hsp20  36.22 
 
 
184 aa  117  9.999999999999999e-26  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.793853  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2276  heat shock protein Hsp20  40 
 
 
175 aa  110  1.0000000000000001e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0557  heat shock protein Hsp20  40.71 
 
 
147 aa  108  4.0000000000000004e-23  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0117197  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0543  heat shock protein Hsp20  40 
 
 
147 aa  107  6e-23  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0340696  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1917  heat shock protein Hsp20  40.3 
 
 
156 aa  105  2e-22  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.86534  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0389  heat shock protein Hsp20  34.1 
 
 
166 aa  105  3e-22  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.706384 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1127  heat shock protein Hsp20  38.85 
 
 
142 aa  105  3e-22  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1366  heat shock protein Hsp20  38.64 
 
 
176 aa  103  1e-21  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.74874  normal  0.190619 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4528  heat shock protein Hsp20  38.33 
 
 
181 aa  102  2e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.550609  normal  0.0462291 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0445  heat shock protein Hsp20  42.28 
 
 
150 aa  102  2e-21  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4395  heat shock protein Hsp20  38.33 
 
 
181 aa  102  2e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.481666  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3527  putative HspC2 heat shock protein  38.46 
 
 
173 aa  101  4e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0868338  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2578  putative heat shock protein  43.07 
 
 
185 aa  100  9e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0200  heat shock protein Hsp20  43.67 
 
 
176 aa  99.8  2e-20  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.377048  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1738  small HspC2 heat shock protein  34.78 
 
 
189 aa  98.6  4e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.267785  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2798  small HspC2 heat shock protein  34.78 
 
 
189 aa  98.6  4e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.159343  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3234  HSP20 family protein  35.84 
 
 
231 aa  95.1  4e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0481  heat shock protein Hsp20  36.42 
 
 
150 aa  95.1  4e-19  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.411475 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2414  hypothetical protein  33.55 
 
 
164 aa  94.7  6e-19  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0924  heat shock protein  36.31 
 
 
180 aa  94.7  6e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2460  heat shock protein Hsp20  37.5 
 
 
186 aa  94.4  8e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.0031555  normal  0.623789 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2559  hypothetical protein  33.55 
 
 
164 aa  93.6  1e-18  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0369  HSP20 family protein  44.55 
 
 
153 aa  93.2  2e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  4.93231e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0296  heat shock protein Hsp20  32.86 
 
 
156 aa  93.2  2e-18  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2522  heat shock protein Hsp20  35.88 
 
 
150 aa  93.2  2e-18  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2857  heat shock protein Hsp20  41.86 
 
 
158 aa  91.7  4e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.274432  normal  0.0879388 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1018  heat shock protein Hsp20  35 
 
 
177 aa  91.3  5e-18  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.683731  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0538  HSP20 family protein  38.93 
 
 
147 aa  91.3  6e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3882  heat shock protein Hsp20  41.18 
 
 
158 aa  90.9  9e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.545217  normal  0.180827 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2986  heat shock protein Hsp20  42.42 
 
 
147 aa  90.5  9e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00130326  normal  0.964264 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0580  heat shock protein Hsp20  32.88 
 
 
145 aa  90.1  1e-17  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000199173  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20170  heat shock protein Hsp20  35.9 
 
 
177 aa  89.7  2e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.638214  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3582  heat shock protein Hsp20  35.92 
 
 
166 aa  89.4  2e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2122  heat shock protein Hsp20  30.61 
 
 
180 aa  89.7  2e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.451471 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4819  heat shock protein Hsp20  35.97 
 
 
218 aa  89  3e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2505  heat shock protein Hsp20  39.39 
 
 
138 aa  88.6  4e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.239492  normal  0.0462479 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2790  heat shock protein Hsp20  35.88 
 
 
149 aa  88.2  5e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000163808  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0989  heat shock protein Hsp20  35.29 
 
 
148 aa  88.2  5e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.543303  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4819  heat shock protein Hsp20  33.09 
 
 
146 aa  87.8  6e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.414421 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2049  heat shock protein Hsp20  35.07 
 
 
164 aa  87.4  9e-17  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  hitchhiker  0.0000140473  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2657  heat shock protein Hsp20  37.23 
 
 
155 aa  87.4  9e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.498697  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0102  heat shock protein Hsp20  33.09 
 
 
142 aa  87.4  1e-16  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0143  heat shock protein Hsp20  33.82 
 
 
156 aa  87  1e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0686  heat shock protein HSP20  34.09 
 
 
153 aa  87  1e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2836  heat shock protein Hsp20  32.68 
 
 
197 aa  87.4  1e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00556978  normal  0.209218 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1348  heat shock protein Hsp20  34.78 
 
 
146 aa  86.7  1e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.403253 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2024  heat shock protein Hsp20  34.78 
 
 
146 aa  86.7  1e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.106375 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3905  heat shock protein Hsp20  38.64 
 
 
147 aa  85.9  2e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000984381  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0762  heat shock protein Hsp20  37.12 
 
 
134 aa  86.3  2e-16  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0833  heat shock protein Hsp20  42.72 
 
 
169 aa  85.9  2e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2477  heat shock protein Hsp20  40.94 
 
 
143 aa  85.5  3e-16  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6104  heat shock protein Hsp20  38 
 
 
158 aa  85.1  5e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0249434 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0838  heat shock protein Hsp20  38.14 
 
 
162 aa  84.7  6e-16  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6390  heat shock protein Hsp20  37.7 
 
 
187 aa  84.3  7e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.065602 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2957  HSP20 family protein  38.1 
 
 
143 aa  84  9e-16  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6093  heat shock protein Hsp20  36.89 
 
 
187 aa  83.6  0.000000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3580  molecular chaperone (small heat shock protein)  33.08 
 
 
141 aa  83.6  0.000000000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2320  heat shock protein Hsp20  37.06 
 
 
149 aa  83.6  0.000000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3076  heat shock protein Hsp20  32.14 
 
 
173 aa  82.8  0.000000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3468  heat shock protein Hsp20  33.33 
 
 
148 aa  82.8  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.282569  normal  0.556723 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6892  heat shock protein Hsp20  35.42 
 
 
157 aa  82.8  0.000000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.862152  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1742  heat shock protein Hsp20  40.48 
 
 
152 aa  82.8  0.000000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.314982  hitchhiker  0.000988198 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5491  heat shock protein Hsp20  36.36 
 
 
211 aa  82.4  0.000000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.710483  normal  0.352797 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2635  heat shock protein Hsp20  33.33 
 
 
148 aa  82.4  0.000000000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1170  heat shock protein Hsp20  42.11 
 
 
170 aa  82.4  0.000000000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3765  heat shock protein Hsp20  37.78 
 
 
143 aa  82.4  0.000000000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7808  Hsp20 family heat-shock protein  48.91 
 
 
95 aa  82.4  0.000000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  hitchhiker  0.00255696  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0197  heat shock protein Hsp20  34.29 
 
 
147 aa  82.4  0.000000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0542117 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3076  heat shock protein Hsp20  35.88 
 
 
148 aa  82  0.000000000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1262  small heat shock protein  30.88 
 
 
151 aa  81.6  0.000000000000004  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.753574  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1320  Hsp20/alpha crystallin family protein  30.88 
 
 
151 aa  81.6  0.000000000000004  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25770  heat shock Hsp20 protein  37.5 
 
 
198 aa  82  0.000000000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>