More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_2355 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011894  Mnod_2355  heat shock protein Hsp20  100 
 
 
165 aa  333  7.999999999999999e-91  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.20966  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2212  heat shock protein Hsp20  81.93 
 
 
171 aa  282  1.0000000000000001e-75  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3680  heat shock protein Hsp20  60.84 
 
 
185 aa  210  9e-54  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.626967 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3724  heat shock protein Hsp20  60.84 
 
 
185 aa  210  9e-54  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4118  heat shock protein Hsp20  60.74 
 
 
172 aa  203  7e-52  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.513744 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2940  heat shock protein Hsp20  56.1 
 
 
168 aa  196  2.0000000000000003e-49  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5194  heat shock protein Hsp20  58.18 
 
 
169 aa  194  5.000000000000001e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0987038  normal 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4635  heat shock protein Hsp20  56.97 
 
 
169 aa  194  5.000000000000001e-49  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3146  heat shock protein Hsp20  55.69 
 
 
167 aa  189  1e-47  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.754957 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2462  heat shock protein Hsp20  52.69 
 
 
168 aa  186  1e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0466294  normal  0.178308 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2074  heat shock protein Hsp20  51.18 
 
 
173 aa  184  5e-46  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.145284  normal  0.308358 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2118  heat shock protein Hsp20  60.95 
 
 
166 aa  184  6e-46  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2802  heat shock protein Hsp20  53.01 
 
 
167 aa  173  9.999999999999999e-43  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.20157 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3241  heat shock protein Hsp20  52.38 
 
 
166 aa  172  9.999999999999999e-43  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.406826  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4310  heat shock protein Hsp20  54.27 
 
 
166 aa  169  1e-41  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4550  heat shock protein Hsp20  54.27 
 
 
166 aa  169  1e-41  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0383  heat shock protein Hsp20  50.91 
 
 
166 aa  164  5e-40  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.170778  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1115  heat shock protein Hsp20  53.7 
 
 
162 aa  159  2e-38  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0741755  normal  0.307075 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2132  heat shock protein Hsp20  48.17 
 
 
164 aa  159  2e-38  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.585874 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2384  heat shock protein Hsp20  49.1 
 
 
164 aa  147  6e-35  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4859  heat shock protein Hsp20  49.32 
 
 
204 aa  139  9.999999999999999e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3394  heat shock protein Hsp20  44.51 
 
 
189 aa  138  3e-32  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0219016  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0629  heat shock protein Hsp20  43.29 
 
 
189 aa  138  3.9999999999999997e-32  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.185609 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1171  heat shock protein Hsp20  43.9 
 
 
189 aa  138  3.9999999999999997e-32  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.726376  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3412  small HspC2 heat shock protein  44.51 
 
 
189 aa  137  7.999999999999999e-32  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.260583  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4461  heat shock protein Hsp20  45.51 
 
 
163 aa  134  5e-31  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3903  heat shock protein Hsp20  47.4 
 
 
194 aa  133  9.999999999999999e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.534424 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2287  heat shock protein Hsp20  43.23 
 
 
189 aa  132  1.9999999999999998e-30  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1917  heat shock protein Hsp20  45.34 
 
 
156 aa  120  8e-27  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.86534  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2860  heat shock protein Hsp20  36.67 
 
 
184 aa  114  6.9999999999999995e-25  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.793853  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0389  heat shock protein Hsp20  36.53 
 
 
166 aa  108  3e-23  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.706384 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3882  heat shock protein Hsp20  42.18 
 
 
158 aa  103  9e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.545217  normal  0.180827 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3805  heat shock protein Hsp20  40.12 
 
 
158 aa  103  1e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.232205  normal  0.564168 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3498  heat shock protein Hsp20  40.12 
 
 
158 aa  102  2e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.938667  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2836  heat shock protein Hsp20  37.2 
 
 
197 aa  102  2e-21  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00556978  normal  0.209218 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4819  heat shock protein Hsp20  39.72 
 
 
146 aa  102  2e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.414421 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0200  heat shock protein Hsp20  40.13 
 
 
176 aa  101  6e-21  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.377048  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2122  heat shock protein Hsp20  34.48 
 
 
180 aa  100  7e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.451471 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0481  heat shock protein Hsp20  39.75 
 
 
150 aa  100  1e-20  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.411475 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2276  heat shock protein Hsp20  39.47 
 
 
175 aa  99.8  1e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1366  heat shock protein Hsp20  33.54 
 
 
176 aa  99.4  2e-20  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.74874  normal  0.190619 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3234  HSP20 family protein  41.1 
 
 
231 aa  99  3e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2460  heat shock protein Hsp20  40.49 
 
 
186 aa  97.8  6e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.0031555  normal  0.623789 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0296  heat shock protein Hsp20  36.17 
 
 
156 aa  97.4  8e-20  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1127  heat shock protein Hsp20  36.23 
 
 
142 aa  97.4  8e-20  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0762  heat shock protein Hsp20  39.71 
 
 
134 aa  96.7  1e-19  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0543  heat shock protein Hsp20  40.74 
 
 
147 aa  96.3  1e-19  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0340696  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6104  heat shock protein Hsp20  40.77 
 
 
158 aa  96.3  2e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0249434 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4528  heat shock protein Hsp20  42.38 
 
 
181 aa  95.9  2e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.550609  normal  0.0462291 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2657  heat shock protein Hsp20  37.78 
 
 
155 aa  95.9  2e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.498697  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0557  heat shock protein Hsp20  41.48 
 
 
147 aa  96.3  2e-19  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0117197  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4819  heat shock protein Hsp20  37.88 
 
 
218 aa  96.3  2e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4395  heat shock protein Hsp20  42.38 
 
 
181 aa  95.9  2e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.481666  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3527  putative HspC2 heat shock protein  41.83 
 
 
173 aa  95.1  3e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0868338  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2559  hypothetical protein  32.7 
 
 
164 aa  94.7  5e-19  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0143  heat shock protein Hsp20  37.68 
 
 
156 aa  94  8e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3582  heat shock protein Hsp20  35.86 
 
 
166 aa  94  8e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2414  hypothetical protein  32.7 
 
 
164 aa  94  9e-19  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2857  heat shock protein Hsp20  40.29 
 
 
158 aa  93.6  1e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.274432  normal  0.0879388 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3788  heat shock protein Hsp20  36.3 
 
 
144 aa  93.6  1e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.964317 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0538  HSP20 family protein  37.98 
 
 
147 aa  92  3e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6892  heat shock protein Hsp20  45.28 
 
 
157 aa  92  3e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.862152  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4812  heat shock protein Hsp20  38.24 
 
 
155 aa  92  3e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00238667  normal  0.807841 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4128  heat shock protein Hsp20  35.56 
 
 
154 aa  92  3e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.226976  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3468  heat shock protein Hsp20  41.48 
 
 
148 aa  91.7  4e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.282569  normal  0.556723 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2635  heat shock protein Hsp20  41.48 
 
 
148 aa  91.3  5e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2049  heat shock protein Hsp20  36.5 
 
 
164 aa  90.9  6e-18  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  hitchhiker  0.0000140473  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0197  heat shock protein Hsp20  37.32 
 
 
147 aa  90.9  7e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0542117 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0833  heat shock protein Hsp20  45.71 
 
 
169 aa  90.9  7e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4342  heat shock protein Hsp20  37.32 
 
 
147 aa  90.9  7e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.232434  normal  0.204531 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5491  heat shock protein Hsp20  44.34 
 
 
211 aa  90.9  8e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.710483  normal  0.352797 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1170  heat shock protein Hsp20  47.42 
 
 
170 aa  89.7  2e-17  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4061  heat shock protein Hsp20  32.64 
 
 
147 aa  89  3e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4023  heat shock protein Hsp20  32.64 
 
 
147 aa  89  3e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2320  heat shock protein Hsp20  40.43 
 
 
149 aa  89  3e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3076  heat shock protein Hsp20  34.06 
 
 
173 aa  88.2  4e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25770  heat shock Hsp20 protein  34.48 
 
 
198 aa  87.8  5e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1921  heat shock protein Hsp20  48.08 
 
 
167 aa  87.8  7e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.985705  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2986  heat shock protein Hsp20  36.76 
 
 
147 aa  87.4  7e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00130326  normal  0.964264 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2578  putative heat shock protein  43.12 
 
 
185 aa  87.4  8e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1348  heat shock protein Hsp20  34.72 
 
 
146 aa  87.4  8e-17  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.403253 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2024  heat shock protein Hsp20  34.72 
 
 
146 aa  87.4  8e-17  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.106375 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20170  heat shock protein Hsp20  36.18 
 
 
177 aa  87.4  9e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.638214  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0445  heat shock protein Hsp20  37.59 
 
 
150 aa  87  9e-17  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1892  HSP20 family protein  36.5 
 
 
132 aa  86.7  1e-16  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.684879  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2809  heat shock protein Hsp20  43.08 
 
 
149 aa  86.7  1e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00105088  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2505  heat shock protein Hsp20  38.85 
 
 
138 aa  87  1e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.239492  normal  0.0462479 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0924  heat shock protein  35.23 
 
 
180 aa  87  1e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0580  heat shock protein Hsp20  38.84 
 
 
145 aa  86.7  1e-16  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000199173  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1076  heat shock protein Hsp20  45.92 
 
 
148 aa  86.3  2e-16  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.713568  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0369  HSP20 family protein  40.35 
 
 
153 aa  86.3  2e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  4.93231e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0037  heat shock protein Hsp20  39.62 
 
 
142 aa  86.3  2e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3765  heat shock protein Hsp20  37.12 
 
 
143 aa  85.9  2e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1018  heat shock protein Hsp20  39.76 
 
 
177 aa  86.3  2e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.683731  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1429  heat shock protein Hsp20  36.3 
 
 
169 aa  84.7  5e-16  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1010  heat shock protein Hsp20  38.03 
 
 
153 aa  83.6  0.000000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00224234  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0989  heat shock protein Hsp20  34.07 
 
 
148 aa  83.6  0.000000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.543303  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1738  small HspC2 heat shock protein  35.33 
 
 
189 aa  82.8  0.000000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.267785  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2798  small HspC2 heat shock protein  35.33 
 
 
189 aa  82.8  0.000000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.159343  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3580  molecular chaperone (small heat shock protein)  33.83 
 
 
141 aa  82.8  0.000000000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>