More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sde_2836 on replicon NC_007912
Organism: Saccharophagus degradans 2-40



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007912  Sde_2836  heat shock protein Hsp20  100 
 
 		 197 aa  408  1e-113  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00556978  normal  0.209218 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3394  heat shock protein Hsp20  38.78 
 
 		 189 aa  154  9e-37  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0219016  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0629  heat shock protein Hsp20  37.76 
 
 		 189 aa  152  2e-36  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.185609 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3412  small HspC2 heat shock protein  38.27 
 
 		 189 aa  151  5.9999999999999996e-36  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.260583  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1171  heat shock protein Hsp20  37.76 
 
 		 189 aa  151  7e-36  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.726376  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2287  heat shock protein Hsp20  36.73 
 
 		 189 aa  147  7e-35  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2860  heat shock protein Hsp20  35.03 
 
 		 184 aa  137  1e-31  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.793853  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1366  heat shock protein Hsp20  36.92 
 
 		 176 aa  132  1.9999999999999998e-30  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.74874  normal  0.190619 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1738  small HspC2 heat shock protein  34.52 
 
 		 189 aa  119  3.9999999999999996e-26  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.267785  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2798  small HspC2 heat shock protein  34.52 
 
 		 189 aa  119  3.9999999999999996e-26  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.159343  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2355  heat shock protein Hsp20  37.2 
 
 		 165 aa  102  3e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.20966  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2212  heat shock protein Hsp20  33.67 
 
 		 171 aa  100  1e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3724  heat shock protein Hsp20  32.82 
 
 		 185 aa  100  2e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3680  heat shock protein Hsp20  32.82 
 
 		 185 aa  100  2e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.626967 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0513  heat shock protein Hsp20  38.05 
 
 		 147 aa  97.1  1e-19  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3146  heat shock protein Hsp20  29.23 
 
 		 167 aa  96.7  2e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.754957 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2462  heat shock protein Hsp20  35.03 
 
 		 168 aa  96.3  3e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0466294  normal  0.178308 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2384  heat shock protein Hsp20  32.82 
 
 		 164 aa  94.4  9e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2940  heat shock protein Hsp20  30.26 
 
 		 168 aa  92.8  3e-18  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20170  heat shock protein Hsp20  36.77 
 
 		 177 aa  92  4e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.638214  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4118  heat shock protein Hsp20  29.59 
 
 		 172 aa  92  4e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.513744 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4342  heat shock protein Hsp20  33.33 
 
 		 147 aa  92  5e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.232434  normal  0.204531 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0197  heat shock protein Hsp20  33.33 
 
 		 147 aa  90.5  1e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0542117 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3241  heat shock protein Hsp20  28.43 
 
 		 166 aa  88.2  7e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.406826  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5194  heat shock protein Hsp20  28.43 
 
 		 169 aa  87.4  1e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0987038  normal  1 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4310  heat shock protein Hsp20  30.41 
 
 		 166 aa  87.4  1e-16  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4550  heat shock protein Hsp20  30.41 
 
 		 166 aa  87.4  1e-16  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2074  heat shock protein Hsp20  32.68 
 
 		 173 aa  87.4  1e-16  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.145284  normal  0.308358 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4635  heat shock protein Hsp20  33.33 
 
 		 169 aa  87.4  1e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1115  heat shock protein Hsp20  33.97 
 
 		 162 aa  86.7  2e-16  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0741755  normal  0.307075 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2857  heat shock protein Hsp20  34.18 
 
 		 158 aa  86.3  3e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.274432  normal  0.0879388 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1917  heat shock protein Hsp20  31.82 
 
 		 156 aa  85.9  3e-16  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.86534  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0383  heat shock protein Hsp20  32.03 
 
 		 166 aa  85.9  3e-16  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.170778  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3468  heat shock protein Hsp20  32.89 
 
 		 148 aa  85.9  3e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.282569  normal  0.556723 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4859  heat shock protein Hsp20  32.03 
 
 		 204 aa  85.5  4e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0762  heat shock protein Hsp20  31.79 
 
 		 134 aa  85.9  4e-16  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4766  heat shock protein Hsp20  38.68 
 
 		 163 aa  85.9  4e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  decreased coverage  0.0000408851  hitchhiker  0.00874264 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2635  heat shock protein Hsp20  32.21 
 
 		 148 aa  84.3  9e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2796  heat shock protein  30.28 
 
 		 152 aa  84  0.000000000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.300285  normal  0.746249 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3498  heat shock protein Hsp20  28.72 
 
 		 158 aa  84.3  0.000000000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.938667  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1967  heat shock protein Hsp20  34.25 
 
 		 178 aa  84  0.000000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2250  heat shock protein Hsp20  34.25 
 
 		 178 aa  84  0.000000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0391  heat shock protein Hsp20  33.64 
 
 		 143 aa  84  0.000000000000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000478859  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2316  heat shock protein Hsp20  36.54 
 
 		 139 aa  83.6  0.000000000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0611291  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3805  heat shock protein Hsp20  28.21 
 
 		 158 aa  82.8  0.000000000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.232205  normal  0.564168 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2132  heat shock protein Hsp20  30.57 
 
 		 164 aa  82.4  0.000000000000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.585874 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2078  heat shock protein Hsp20  37.96 
 
 		 147 aa  82.4  0.000000000000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2460  heat shock protein Hsp20  31.18 
 
 		 186 aa  82.4  0.000000000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.0031555  normal  0.623789 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2118  heat shock protein Hsp20  28.72 
 
 		 166 aa  82  0.000000000000005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0622  HSP20 family protein  31.58 
 
 		 132 aa  82  0.000000000000006  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3234  HSP20 family protein  31.38 
 
 		 231 aa  81.3  0.000000000000009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0538  HSP20 family protein  27.33 
 
 		 147 aa  80.5  0.00000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2022  heat shock protein Hsp20  33.06 
 
 		 141 aa  81.3  0.00000000000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0343  heat shock protein Hsp20  37.14 
 
 		 144 aa  80.9  0.00000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.90555e-28 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3882  heat shock protein Hsp20  29.53 
 
 		 158 aa  80.9  0.00000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.545217  normal  0.180827 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0610  heat shock protein Hsp20  35.78 
 
 		 136 aa  80.5  0.00000000000001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.335952  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0125  heat shock protein Hsp20  35.2 
 
 		 139 aa  80.9  0.00000000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.369397  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_825  HSP20/alpha crystallin  38.32 
 
 		 162 aa  80.5  0.00000000000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1348  heat shock protein Hsp20  37.25 
 
 		 146 aa  80.5  0.00000000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.403253 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1365  heat shock protein Hsp20  32.74 
 
 		 160 aa  80.1  0.00000000000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.117276  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0362  heat shock protein Hsp20  36.19 
 
 		 144 aa  79.7  0.00000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.025472  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0838  heat shock protein Hsp20  37.38 
 
 		 162 aa  80.1  0.00000000000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2024  heat shock protein Hsp20  37.25 
 
 		 146 aa  80.5  0.00000000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.106375 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1434  low molecular weight heat shock protein  32.74 
 
 		 160 aa  80.1  0.00000000000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2578  putative heat shock protein  25.76 
 
 		 185 aa  79.3  0.00000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011771  BCAH820_C0008  Hsp  32.68 
 
 		 146 aa  79  0.00000000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0540  heat shock protein Hsp20  40 
 
 		 147 aa  79.3  0.00000000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0320  heat shock protein Hsp20  38.74 
 
 		 150 aa  79  0.00000000000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4819  heat shock protein Hsp20  29.63 
 
 		 146 aa  79  0.00000000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.414421 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0445  heat shock protein Hsp20  27.74 
 
 		 150 aa  79  0.00000000000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0954  Hsp20/alpha crystallin family protein  38.3 
 
 		 162 aa  78.6  0.00000000000005  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.154946  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02640  low molecular weight heat shock protein  31.75 
 
 		 158 aa  78.6  0.00000000000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3582  heat shock protein Hsp20  35.04 
 
 		 166 aa  78.6  0.00000000000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2276  heat shock protein Hsp20  36.3 
 
 		 175 aa  79  0.00000000000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3765  heat shock protein Hsp20  30.46 
 
 		 143 aa  78.6  0.00000000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2802  heat shock protein Hsp20  30.38 
 
 		 167 aa  78.6  0.00000000000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.20157 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0296  heat shock protein Hsp20  31.54 
 
 		 156 aa  78.2  0.00000000000007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0200  heat shock protein Hsp20  28.31 
 
 		 176 aa  78.2  0.00000000000007  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.377048  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2414  hypothetical protein  32.9 
 
 		 164 aa  77.8  0.00000000000008  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0052  heat shock protein Hsp20  33.64 
 
 		 151 aa  77.8  0.00000000000008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.319643  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2320  heat shock protein Hsp20  28.78 
 
 		 149 aa  78.2  0.00000000000008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0369  HSP20 family protein  36.11 
 
 		 153 aa  77.8  0.00000000000009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  4.93231e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2559  hypothetical protein  38.68 
 
 		 164 aa  77.4  0.0000000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3527  putative HspC2 heat shock protein  35.04 
 
 		 173 aa  77.4  0.0000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0868338  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2657  heat shock protein Hsp20  28.39 
 
 		 155 aa  77.4  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.498697  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6093  heat shock protein Hsp20  27.37 
 
 		 187 aa  77.4  0.0000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6390  heat shock protein Hsp20  27.37 
 
 		 187 aa  77.8  0.0000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.065602 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4230  heat shock protein Hsp20  39.13 
 
 		 105 aa  76.6  0.0000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1262  small heat shock protein  29.58 
 
 		 151 aa  76.6  0.0000000000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.753574  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1762  heat shock protein Hsp20  37.86 
 
 		 144 aa  76.6  0.0000000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0924  heat shock protein  32.45 
 
 		 180 aa  76.6  0.0000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6892  heat shock protein Hsp20  32.41 
 
 		 157 aa  77  0.0000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.862152  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1320  Hsp20/alpha crystallin family protein  29.58 
 
 		 151 aa  76.6  0.0000000000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4528  heat shock protein Hsp20  33.33 
 
 		 181 aa  76.3  0.0000000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.550609  normal  0.0462291 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4395  heat shock protein Hsp20  33.33 
 
 		 181 aa  76.3  0.0000000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.481666  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3917  heat shock protein Hsp20  33.33 
 
 		 142 aa  76.3  0.0000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2532  HSP20 family protein  38.95 
 
 		 144 aa  76.3  0.0000000000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14610  heat shock protein Hsp20  34.91 
 
 		 143 aa  76.3  0.0000000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000610495  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3903  heat shock protein Hsp20  30.71 
 
 		 194 aa  75.9  0.0000000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.534424 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2600  putative heat shock protein Hsp20  32.29 
 
 		 187 aa  75.9  0.0000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.207676  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>