More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_3905 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009483  Gura_3905  heat shock protein Hsp20  100 
 
 
147 aa  300  4.0000000000000003e-81  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000984381  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2986  heat shock protein Hsp20  74.83 
 
 
147 aa  240  3.9999999999999997e-63  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00130326  normal  0.964264 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0538  HSP20 family protein  71.92 
 
 
147 aa  232  2.0000000000000002e-60  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3076  heat shock protein Hsp20  72.3 
 
 
148 aa  230  6e-60  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2790  heat shock protein Hsp20  69.8 
 
 
149 aa  221  3e-57  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000163808  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0362  heat shock protein Hsp20  58.5 
 
 
144 aa  194  3e-49  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.025472  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0343  heat shock protein Hsp20  57.82 
 
 
144 aa  193  7e-49  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.90555e-28 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4352  heat shock protein Hsp20  47.22 
 
 
145 aa  142  2e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.735936  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4507  heat shock protein Hsp20  46.53 
 
 
145 aa  142  2e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4488  heat shock protein Hsp20  45.83 
 
 
145 aa  140  6e-33  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4499  heat shock protein Hsp20  45.58 
 
 
145 aa  139  9.999999999999999e-33  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.100268 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4766  heat shock protein Hsp20  53.1 
 
 
163 aa  139  9.999999999999999e-33  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  decreased coverage  0.0000408851  hitchhiker  0.00874264 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1348  heat shock protein Hsp20  45.52 
 
 
146 aa  137  6e-32  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.403253 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2024  heat shock protein Hsp20  45.52 
 
 
146 aa  137  6e-32  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.106375 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3078  heat shock protein Hsp20  44.52 
 
 
145 aa  135  3.0000000000000003e-31  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000700712  normal  0.0754711 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2957  HSP20 family protein  46.21 
 
 
143 aa  132  1.9999999999999998e-30  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4342  heat shock protein Hsp20  38.03 
 
 
147 aa  119  9.999999999999999e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.232434  normal  0.204531 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0197  heat shock protein Hsp20  37.32 
 
 
147 aa  118  3e-26  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0542117 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2477  heat shock protein Hsp20  39.58 
 
 
143 aa  116  9.999999999999999e-26  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0989  heat shock protein Hsp20  37.93 
 
 
148 aa  115  1.9999999999999998e-25  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.543303  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2366  heat shock protein Hsp20  41.72 
 
 
151 aa  114  6e-25  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.550987  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2730  heat shock protein Hsp20  40.82 
 
 
148 aa  113  1.0000000000000001e-24  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0788  heat shock protein Hsp20  41.89 
 
 
143 aa  110  6e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.351008  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1762  heat shock protein Hsp20  37.84 
 
 
144 aa  109  1.0000000000000001e-23  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0052  heat shock protein Hsp20  36.49 
 
 
151 aa  109  1.0000000000000001e-23  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.319643  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1742  heat shock protein Hsp20  43.08 
 
 
152 aa  109  1.0000000000000001e-23  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.314982  hitchhiker  0.000988198 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0125  heat shock protein Hsp20  38.19 
 
 
139 aa  109  2.0000000000000002e-23  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.369397  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0454  heat shock protein Hsp20  37.5 
 
 
144 aa  108  3e-23  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0623  heat shock protein Hsp20  36.91 
 
 
152 aa  107  7.000000000000001e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.844177  normal  0.400233 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0445  heat shock protein Hsp20  35.57 
 
 
150 aa  106  9.000000000000001e-23  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0543  heat shock protein Hsp20  43.17 
 
 
147 aa  106  1e-22  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0340696  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0557  heat shock protein Hsp20  43.17 
 
 
147 aa  105  2e-22  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0117197  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0838  heat shock protein Hsp20  35.42 
 
 
162 aa  105  2e-22  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2683  heat shock protein Hsp20  38.36 
 
 
145 aa  104  3e-22  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.338339  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0836  heat shock protein Hsp20  39.19 
 
 
143 aa  104  3e-22  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.534587  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2022  heat shock protein Hsp20  40.15 
 
 
141 aa  104  5e-22  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2532  HSP20 family protein  34.25 
 
 
144 aa  103  7e-22  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1434  low molecular weight heat shock protein  33.33 
 
 
160 aa  103  7e-22  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1365  heat shock protein Hsp20  33.33 
 
 
160 aa  103  7e-22  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.117276  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20170  heat shock protein Hsp20  43.44 
 
 
177 aa  103  9e-22  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.638214  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2188  heat shock protein Hsp20  33.99 
 
 
156 aa  101  3e-21  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.345525  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1320  Hsp20/alpha crystallin family protein  36.49 
 
 
151 aa  101  4e-21  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1262  small heat shock protein  36.49 
 
 
151 aa  101  4e-21  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.753574  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0383  heat shock protein Hsp20  36.3 
 
 
158 aa  100  5e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_825  HSP20/alpha crystallin  35.42 
 
 
162 aa  100  5e-21  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0369  HSP20 family protein  45.71 
 
 
153 aa  100  6e-21  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  4.93231e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0954  Hsp20/alpha crystallin family protein  41.9 
 
 
162 aa  100  7e-21  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.154946  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1743  heat shock protein Hsp20  36.3 
 
 
145 aa  100  9e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.49982  normal  0.0110244 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2086  heat shock protein, Hsp20 family  36.3 
 
 
145 aa  100  9e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2578  putative heat shock protein  42.11 
 
 
185 aa  99.8  1e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0481  heat shock protein Hsp20  40.95 
 
 
150 aa  98.2  3e-20  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.411475 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3788  heat shock protein Hsp20  35.62 
 
 
144 aa  98.2  4e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.964317 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1076  heat shock protein Hsp20  30.28 
 
 
148 aa  97.1  7e-20  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.713568  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3074  heat shock protein Hsp20  36.62 
 
 
144 aa  97.1  8e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0037  heat shock protein Hsp20  31.33 
 
 
142 aa  96.7  9e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2287  heat shock protein Hsp20  41.35 
 
 
189 aa  95.9  1e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02640  low molecular weight heat shock protein  34.01 
 
 
158 aa  96.7  1e-19  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3234  HSP20 family protein  46.88 
 
 
231 aa  95.9  2e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2522  heat shock protein Hsp20  39.81 
 
 
150 aa  95.5  2e-19  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0513  heat shock protein Hsp20  40.74 
 
 
147 aa  95.5  2e-19  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0540  heat shock protein Hsp20  31.29 
 
 
147 aa  95.9  2e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7806  putative small heat-shock protein molecular chaperone  34.81 
 
 
146 aa  94.7  4e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  hitchhiker  0.00540773  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0200  heat shock protein Hsp20  39.82 
 
 
176 aa  94.7  4e-19  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.377048  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2276  heat shock protein Hsp20  39.35 
 
 
175 aa  94.7  4e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0924  heat shock protein  39.74 
 
 
180 aa  94.4  5e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1127  heat shock protein Hsp20  44.14 
 
 
142 aa  94.4  5e-19  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3394  heat shock protein Hsp20  41.35 
 
 
189 aa  94  6e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0219016  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0774  heat shock protein Hsp20  47.87 
 
 
139 aa  94  6e-19  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2320  heat shock protein Hsp20  33.1 
 
 
149 aa  94  6e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1171  heat shock protein Hsp20  33.56 
 
 
189 aa  94  7e-19  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.726376  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1824  heat shock protein Hsp20  33.57 
 
 
146 aa  93.6  7e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0843989  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0629  heat shock protein Hsp20  33.56 
 
 
189 aa  93.6  8e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.185609 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2460  heat shock protein Hsp20  45.83 
 
 
186 aa  93.6  8e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.0031555  normal  0.623789 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3765  heat shock protein Hsp20  36.55 
 
 
143 aa  93.6  9e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4461  heat shock protein Hsp20  34.56 
 
 
163 aa  93.6  9e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0505  heat shock protein Hsp20  30.99 
 
 
158 aa  93.6  9e-19  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3612  hypothetical protein  34.42 
 
 
177 aa  92.8  1e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3412  small HspC2 heat shock protein  40.38 
 
 
189 aa  93.2  1e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.260583  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1917  heat shock protein Hsp20  35.42 
 
 
156 aa  92.8  1e-18  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.86534  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0320  heat shock protein Hsp20  34 
 
 
150 aa  92.8  1e-18  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0610  heat shock protein Hsp20  34.03 
 
 
136 aa  92.4  2e-18  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.335952  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0143  heat shock protein Hsp20  33.79 
 
 
156 aa  92.4  2e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2316  heat shock protein Hsp20  47.12 
 
 
139 aa  92.4  2e-18  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0611291  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2857  heat shock protein Hsp20  35.61 
 
 
158 aa  92  2e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.274432  normal  0.0879388 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1983  heat shock protein Hsp20  35.62 
 
 
153 aa  92.4  2e-18  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00684856  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2635  heat shock protein Hsp20  31.97 
 
 
148 aa  91.7  3e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2122  heat shock protein Hsp20  31.08 
 
 
180 aa  91.7  3e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.451471 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3468  heat shock protein Hsp20  31.97 
 
 
148 aa  91.7  3e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.282569  normal  0.556723 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1159  heat shock protein Hsp20  35.92 
 
 
148 aa  91.3  4e-18  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000413054  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4463  heat shock protein Hsp20  36.72 
 
 
141 aa  91.3  4e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0391  heat shock protein Hsp20  34.01 
 
 
143 aa  91.3  4e-18  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000478859  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3724  heat shock protein Hsp20  34.01 
 
 
185 aa  90.9  5e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0891  heat shock protein Hsp20  36.99 
 
 
137 aa  90.9  5e-18  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.805469  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3680  heat shock protein Hsp20  34.01 
 
 
185 aa  90.9  5e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.626967 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3577  heat shock protein Hsp20  32.41 
 
 
157 aa  90.5  6e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.202692  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1296  heat shock protein Hsp20  33.58 
 
 
143 aa  90.5  6e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2078  heat shock protein Hsp20  29.25 
 
 
147 aa  90.5  7e-18  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0188  heat shock protein Hsp20  33.1 
 
 
150 aa  90.5  7e-18  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0865  heat shock protein Hsp20  40.17 
 
 
134 aa  89.7  1e-17  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.303654  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0762  heat shock protein Hsp20  46.32 
 
 
134 aa  89.4  1e-17  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>