More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dde_3412 on replicon NC_007519
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007519  Dde_3412  small HspC2 heat shock protein  100 
 
 
189 aa  389  1e-107  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.260583  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0629  heat shock protein Hsp20  95.24 
 
 
189 aa  374  1e-103  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.185609 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1171  heat shock protein Hsp20  95.77 
 
 
189 aa  374  1e-103  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.726376  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3394  heat shock protein Hsp20  91.01 
 
 
189 aa  357  7e-98  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0219016  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2287  heat shock protein Hsp20  89.95 
 
 
189 aa  355  1.9999999999999998e-97  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2860  heat shock protein Hsp20  54.64 
 
 
184 aa  197  7e-50  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.793853  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1366  heat shock protein Hsp20  46.49 
 
 
176 aa  154  6e-37  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.74874  normal  0.190619 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2836  heat shock protein Hsp20  38.27 
 
 
197 aa  146  1.0000000000000001e-34  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00556978  normal  0.209218 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2355  heat shock protein Hsp20  44.51 
 
 
165 aa  137  1e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.20966  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1738  small HspC2 heat shock protein  42.39 
 
 
189 aa  135  3.0000000000000003e-31  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.267785  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2798  small HspC2 heat shock protein  42.39 
 
 
189 aa  135  3.0000000000000003e-31  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.159343  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0383  heat shock protein Hsp20  46.26 
 
 
166 aa  135  5e-31  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.170778  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2212  heat shock protein Hsp20  44.3 
 
 
171 aa  132  3e-30  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3146  heat shock protein Hsp20  40.43 
 
 
167 aa  128  5.0000000000000004e-29  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.754957 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3724  heat shock protein Hsp20  42.86 
 
 
185 aa  127  7.000000000000001e-29  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3680  heat shock protein Hsp20  42.86 
 
 
185 aa  127  7.000000000000001e-29  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.626967 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4859  heat shock protein Hsp20  48.55 
 
 
204 aa  126  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2074  heat shock protein Hsp20  42.11 
 
 
173 aa  125  4.0000000000000003e-28  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.145284  normal  0.308358 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4118  heat shock protein Hsp20  42.26 
 
 
172 aa  125  5e-28  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.513744 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3903  heat shock protein Hsp20  45.1 
 
 
194 aa  124  1e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.534424 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2462  heat shock protein Hsp20  46.85 
 
 
168 aa  119  1.9999999999999998e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0466294  normal  0.178308 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3241  heat shock protein Hsp20  45.58 
 
 
166 aa  119  3e-26  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.406826  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4310  heat shock protein Hsp20  40.76 
 
 
166 aa  115  3.9999999999999997e-25  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4550  heat shock protein Hsp20  40.76 
 
 
166 aa  115  3.9999999999999997e-25  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4635  heat shock protein Hsp20  43.24 
 
 
169 aa  115  5e-25  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2384  heat shock protein Hsp20  37.23 
 
 
164 aa  115  5e-25  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2802  heat shock protein Hsp20  43.64 
 
 
167 aa  114  7.999999999999999e-25  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.20157 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2118  heat shock protein Hsp20  36.7 
 
 
166 aa  113  2.0000000000000002e-24  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5194  heat shock protein Hsp20  43.92 
 
 
169 aa  113  2.0000000000000002e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0987038  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0200  heat shock protein Hsp20  45.52 
 
 
176 aa  111  5e-24  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.377048  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1917  heat shock protein Hsp20  38.18 
 
 
156 aa  110  9e-24  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.86534  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2132  heat shock protein Hsp20  39.76 
 
 
164 aa  110  1.0000000000000001e-23  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.585874 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1115  heat shock protein Hsp20  40.88 
 
 
162 aa  108  4.0000000000000004e-23  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0741755  normal  0.307075 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0543  heat shock protein Hsp20  42.86 
 
 
147 aa  108  5e-23  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0340696  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2940  heat shock protein Hsp20  44.03 
 
 
168 aa  108  5e-23  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0538  HSP20 family protein  36.3 
 
 
147 aa  108  6e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0557  heat shock protein Hsp20  42.03 
 
 
147 aa  108  6e-23  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0117197  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4528  heat shock protein Hsp20  42.24 
 
 
181 aa  106  2e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.550609  normal  0.0462291 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4395  heat shock protein Hsp20  42.24 
 
 
181 aa  106  2e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.481666  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2790  heat shock protein Hsp20  34.93 
 
 
149 aa  105  5e-22  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000163808  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1824  heat shock protein Hsp20  41.13 
 
 
146 aa  103  1e-21  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0843989  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2986  heat shock protein Hsp20  36.3 
 
 
147 aa  103  2e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00130326  normal  0.964264 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20170  heat shock protein Hsp20  38.82 
 
 
177 aa  102  3e-21  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.638214  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0052  heat shock protein Hsp20  42.06 
 
 
151 aa  101  6e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.319643  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3234  HSP20 family protein  39.66 
 
 
231 aa  101  7e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0481  heat shock protein Hsp20  38.69 
 
 
150 aa  100  9e-21  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.411475 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2857  heat shock protein Hsp20  42.22 
 
 
158 aa  100  9e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.274432  normal  0.0879388 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2460  heat shock protein Hsp20  40.51 
 
 
186 aa  99.8  2e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.0031555  normal  0.623789 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3076  heat shock protein Hsp20  44.23 
 
 
148 aa  99  4e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0762  heat shock protein Hsp20  36.81 
 
 
134 aa  99  4e-20  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0197  heat shock protein Hsp20  36.24 
 
 
147 aa  97.8  7e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0542117 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3765  heat shock protein Hsp20  40.71 
 
 
143 aa  97.8  8e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1762  heat shock protein Hsp20  40.14 
 
 
144 aa  97.8  9e-20  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4342  heat shock protein Hsp20  35.57 
 
 
147 aa  96.3  2e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.232434  normal  0.204531 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1170  heat shock protein Hsp20  45.28 
 
 
170 aa  96.3  2e-19  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0833  heat shock protein Hsp20  41.27 
 
 
169 aa  96.3  2e-19  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6104  heat shock protein Hsp20  38.75 
 
 
158 aa  95.5  4e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0249434 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2276  heat shock protein Hsp20  36.93 
 
 
175 aa  95.1  5e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3527  putative HspC2 heat shock protein  38.52 
 
 
173 aa  95.1  6e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0868338  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2957  HSP20 family protein  38.67 
 
 
143 aa  94.4  9e-19  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4352  heat shock protein Hsp20  37.88 
 
 
145 aa  94  1e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.735936  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4461  heat shock protein Hsp20  36.64 
 
 
163 aa  94  1e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3905  heat shock protein Hsp20  40.38 
 
 
147 aa  93.2  2e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000984381  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0924  heat shock protein  36.75 
 
 
180 aa  93.6  2e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2316  heat shock protein Hsp20  32.59 
 
 
139 aa  92.4  3e-18  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0611291  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2522  heat shock protein Hsp20  35.94 
 
 
150 aa  92.4  3e-18  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0989  heat shock protein Hsp20  37.25 
 
 
148 aa  92.8  3e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.543303  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2078  heat shock protein Hsp20  38.66 
 
 
147 aa  92  5e-18  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2578  putative heat shock protein  29.12 
 
 
185 aa  91.7  6e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0296  heat shock protein Hsp20  36.81 
 
 
156 aa  91.7  6e-18  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3882  heat shock protein Hsp20  36.62 
 
 
158 aa  91.3  8e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.545217  normal  0.180827 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3582  heat shock protein Hsp20  41.96 
 
 
166 aa  91.3  8e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4507  heat shock protein Hsp20  36.36 
 
 
145 aa  91.3  9e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1127  heat shock protein Hsp20  35.86 
 
 
142 aa  90.5  1e-17  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2532  HSP20 family protein  35.92 
 
 
144 aa  90.9  1e-17  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2683  heat shock protein Hsp20  40.15 
 
 
145 aa  90.1  2e-17  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.338339  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2024  heat shock protein Hsp20  32.62 
 
 
146 aa  89.7  2e-17  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.106375 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4488  heat shock protein Hsp20  35.61 
 
 
145 aa  89.7  2e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1348  heat shock protein Hsp20  32.62 
 
 
146 aa  89.7  2e-17  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.403253 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2600  putative heat shock protein Hsp20  29.05 
 
 
187 aa  89.4  3e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.207676  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4766  heat shock protein Hsp20  42.31 
 
 
163 aa  89  3e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  decreased coverage  0.0000408851  hitchhiker  0.00874264 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3080  heat shock protein Hsp20  32.88 
 
 
230 aa  89.4  3e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0865  heat shock protein Hsp20  34.04 
 
 
134 aa  89  4e-17  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.303654  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0362  heat shock protein Hsp20  35.97 
 
 
144 aa  89  4e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.025472  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1543  heat shock protein Hsp20  35.04 
 
 
146 aa  88.6  5e-17  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.000494204  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0343  heat shock protein Hsp20  35.97 
 
 
144 aa  88.6  5e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.90555e-28 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6390  heat shock protein Hsp20  33.33 
 
 
187 aa  88.6  5e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.065602 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2477  heat shock protein Hsp20  36 
 
 
143 aa  88.2  6e-17  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4061  heat shock protein Hsp20  35.38 
 
 
147 aa  88.2  6e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4023  heat shock protein Hsp20  35.38 
 
 
147 aa  88.2  6e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3498  heat shock protein Hsp20  35.21 
 
 
158 aa  88.2  7e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.938667  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2459  heat shock protein Hsp20  37.9 
 
 
142 aa  88.2  7e-17  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.134169  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3805  heat shock protein Hsp20  35.21 
 
 
158 aa  87.8  8e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.232205  normal  0.564168 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2320  heat shock protein Hsp20  33.77 
 
 
149 aa  87.8  8e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6093  heat shock protein Hsp20  32.54 
 
 
187 aa  87.4  1e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0369  HSP20 family protein  34.15 
 
 
153 aa  87.4  1e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  4.93231e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4230  heat shock protein Hsp20  41.84 
 
 
105 aa  86.7  2e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1262  small heat shock protein  35.77 
 
 
151 aa  86.7  2e-16  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.753574  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4819  heat shock protein Hsp20  31.33 
 
 
146 aa  86.3  2e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.414421 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3113  heat shock protein Hsp20  37.1 
 
 
142 aa  87  2e-16  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.800815  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>