More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_1824 on replicon NC_013501
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013501  Rmar_1824  heat shock protein Hsp20  100 
 
 		 146 aa  304  2.0000000000000002e-82  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0843989  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0989  heat shock protein Hsp20  49.66 
 
 		 148 aa  143  7.0000000000000006e-34  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.543303  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1296  heat shock protein Hsp20  45.86 
 
 		 143 aa  113  7.999999999999999e-25  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3765  heat shock protein Hsp20  46.15 
 
 		 143 aa  113  8.999999999999998e-25  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0543  heat shock protein Hsp20  44.88 
 
 		 147 aa  110  8.000000000000001e-24  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0340696  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0557  heat shock protein Hsp20  42.54 
 
 		 147 aa  108  3e-23  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0117197  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2532  HSP20 family protein  41.3 
 
 		 144 aa  106  1e-22  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1171  heat shock protein Hsp20  41.84 
 
 		 189 aa  105  2e-22  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.726376  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1348  heat shock protein Hsp20  39.04 
 
 		 146 aa  105  2e-22  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.403253 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2024  heat shock protein Hsp20  39.04 
 
 		 146 aa  105  2e-22  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.106375 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0629  heat shock protein Hsp20  41.13 
 
 		 189 aa  104  3e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.185609 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0623  heat shock protein Hsp20  44.95 
 
 		 152 aa  104  4e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.844177  normal  0.400233 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3412  small HspC2 heat shock protein  41.13 
 
 		 189 aa  103  6e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.260583  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2957  HSP20 family protein  41.1 
 
 		 143 aa  103  7e-22  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3394  heat shock protein Hsp20  41.13 
 
 		 189 aa  102  1e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0219016  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2986  heat shock protein Hsp20  35.66 
 
 		 147 aa  100  4e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00130326  normal  0.964264 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2287  heat shock protein Hsp20  39.72 
 
 		 189 aa  100  5e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2790  heat shock protein Hsp20  37.14 
 
 		 149 aa  100  8e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000163808  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0197  heat shock protein Hsp20  40.46 
 
 		 147 aa  99.8  1e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0542117 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2132  heat shock protein Hsp20  41.8 
 
 		 164 aa  98.6  2e-20  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.585874 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2730  heat shock protein Hsp20  37.41 
 
 		 148 aa  98.2  3e-20  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4342  heat shock protein Hsp20  40.46 
 
 		 147 aa  98.2  4e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.232434  normal  0.204531 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0538  HSP20 family protein  33.57 
 
 		 147 aa  97.1  7e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3078  heat shock protein Hsp20  39.73 
 
 		 145 aa  97.1  7e-20  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000700712  normal  0.0754711 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0200  heat shock protein Hsp20  39.85 
 
 		 176 aa  96.3  1e-19  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.377048  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2683  heat shock protein Hsp20  39.85 
 
 		 145 aa  96.3  1e-19  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.338339  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0102  heat shock protein Hsp20  39.85 
 
 		 142 aa  95.9  2e-19  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1262  small heat shock protein  36.73 
 
 		 151 aa  95.9  2e-19  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.753574  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3076  heat shock protein Hsp20  37.41 
 
 		 148 aa  95.5  2e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4507  heat shock protein Hsp20  38.67 
 
 		 145 aa  95.9  2e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1320  Hsp20/alpha crystallin family protein  36.73 
 
 		 151 aa  95.9  2e-19  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0052  heat shock protein Hsp20  40 
 
 		 151 aa  95.1  3e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.319643  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1127  heat shock protein Hsp20  43.18 
 
 		 142 aa  95.1  3e-19  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4488  heat shock protein Hsp20  38 
 
 		 145 aa  94.4  5e-19  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4499  heat shock protein Hsp20  38.57 
 
 		 145 aa  94  6e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.100268 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0125  heat shock protein Hsp20  37.06 
 
 		 139 aa  94  6e-19  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.369397  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3905  heat shock protein Hsp20  33.57 
 
 		 147 aa  93.6  7e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000984381  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2188  heat shock protein Hsp20  35.29 
 
 		 156 aa  93.6  8e-19  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.345525  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0774  heat shock protein Hsp20  40 
 
 		 139 aa  93.6  8e-19  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0762  heat shock protein Hsp20  37.4 
 
 		 134 aa  93.2  1e-18  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2477  heat shock protein Hsp20  38.19 
 
 		 143 aa  93.2  1e-18  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1977  heat shock protein Hsp20  39.84 
 
 		 139 aa  92.8  1e-18  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.334288  normal  0.643075 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1762  heat shock protein Hsp20  37.5 
 
 		 144 aa  92.8  2e-18  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0788  heat shock protein Hsp20  34.06 
 
 		 143 aa  92.4  2e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.351008  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4352  heat shock protein Hsp20  38.1 
 
 		 145 aa  92.4  2e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.735936  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0609  heat shock protein Hsp20  37.4 
 
 		 156 aa  91.7  3e-18  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.346897  normal  0.0142886 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3386  heat shock protein Hsp20  37.23 
 
 		 147 aa  91.7  3e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1474  heat shock protein Hsp20  37.59 
 
 		 151 aa  91.3  4e-18  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.242626  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3074  heat shock protein Hsp20  41.84 
 
 		 144 aa  90.1  8e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0836  heat shock protein Hsp20  33.33 
 
 		 143 aa  90.1  9e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.534587  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2022  heat shock protein Hsp20  38.36 
 
 		 141 aa  89.7  1e-17  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2522  heat shock protein Hsp20  38.18 
 
 		 150 aa  89.7  1e-17  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2857  heat shock protein Hsp20  36.03 
 
 		 158 aa  89.4  1e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.274432  normal  0.0879388 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2210  heat shock protein Hsp20  37.5 
 
 		 139 aa  88.6  3e-17  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0417447  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1434  low molecular weight heat shock protein  34.25 
 
 		 160 aa  87.8  4e-17  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1365  heat shock protein Hsp20  34.25 
 
 		 160 aa  87.8  4e-17  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.117276  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1366  heat shock protein Hsp20  33.59 
 
 		 176 aa  87.4  6e-17  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.74874  normal  0.190619 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1929  heat shock protein Hsp20  39.5 
 
 		 149 aa  86.3  1e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.638493  normal  0.0128011 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4669  heat shock protein Hsp20  31.75 
 
 		 147 aa  86.3  1e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2320  heat shock protein Hsp20  37.59 
 
 		 149 aa  86.7  1e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0865  heat shock protein Hsp20  33.82 
 
 		 134 aa  85.9  2e-16  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.303654  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02640  low molecular weight heat shock protein  33.56 
 
 		 158 aa  85.9  2e-16  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0454  heat shock protein Hsp20  35.21 
 
 		 144 aa  85.9  2e-16  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4310  heat shock protein Hsp20  38.17 
 
 		 166 aa  85.5  2e-16  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4550  heat shock protein Hsp20  38.17 
 
 		 166 aa  85.5  2e-16  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4761  heat shock protein Hsp20  37.62 
 
 		 149 aa  85.1  3e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.735655  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1214  molecular chaperone (small heat shock protein)  33.33 
 
 		 260 aa  85.1  3e-16  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.318766  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4467  heat shock protein Hsp20  37.62 
 
 		 149 aa  85.1  3e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.156372 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0463  heat shock protein Hsp20  37.96 
 
 		 166 aa  85.1  3e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4380  heat shock protein Hsp20  37.62 
 
 		 149 aa  85.1  3e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.642417  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4943  heat shock protein Hsp20  38.61 
 
 		 149 aa  84.3  5e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0508199 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0540  heat shock protein Hsp20  35.25 
 
 		 147 aa  84  6e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0505  heat shock protein Hsp20  33.8 
 
 		 158 aa  83.6  7e-16  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2366  heat shock protein Hsp20  32.37 
 
 		 151 aa  84  7e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.550987  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0891  heat shock protein Hsp20  37.8 
 
 		 137 aa  83.6  9e-16  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.805469  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1743  heat shock protein Hsp20  37.59 
 
 		 145 aa  82.8  0.000000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.49982  normal  0.0110244 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3146  heat shock protein Hsp20  35.66 
 
 		 167 aa  82.8  0.000000000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.754957 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0610  heat shock protein Hsp20  40 
 
 		 136 aa  82.8  0.000000000000001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.335952  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2086  heat shock protein, Hsp20 family  37.59 
 
 		 145 aa  82.8  0.000000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0838  heat shock protein Hsp20  34.29 
 
 		 162 aa  82.8  0.000000000000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4635  heat shock protein Hsp20  36.11 
 
 		 169 aa  82.8  0.000000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1528  heat shock protein Hsp20  32.31 
 
 		 153 aa  82.4  0.000000000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.00309172  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1076  heat shock protein Hsp20  35.77 
 
 		 148 aa  82.4  0.000000000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.713568  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1805  heat shock protein Hsp20  36.63 
 
 		 149 aa  82.4  0.000000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.642811  normal  0.803886 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0358  Hsp20-like molecular chaperone  41.75 
 
 		 134 aa  82  0.000000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4119  heat shock protein Hsp20  37.82 
 
 		 149 aa  82.8  0.000000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00303961 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0320  heat shock protein Hsp20  34.93 
 
 		 150 aa  82.4  0.000000000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2316  heat shock protein Hsp20  37.61 
 
 		 139 aa  82.8  0.000000000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0611291  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4463  heat shock protein Hsp20  35.21 
 
 		 141 aa  82  0.000000000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0179  heat shock protein Hsp20  33.07 
 
 		 149 aa  81.6  0.000000000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1917  heat shock protein Hsp20  35.97 
 
 		 156 aa  81.6  0.000000000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.86534  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2074  heat shock protein Hsp20  39.69 
 
 		 173 aa  81.6  0.000000000000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.145284  normal  0.308358 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0343  heat shock protein Hsp20  34.59 
 
 		 144 aa  81.6  0.000000000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.90555e-28 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2276  heat shock protein Hsp20  36.36 
 
 		 175 aa  82  0.000000000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2860  heat shock protein Hsp20  31.65 
 
 		 184 aa  81.6  0.000000000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.793853  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0362  heat shock protein Hsp20  34.59 
 
 		 144 aa  81.6  0.000000000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.025472  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3724  heat shock protein Hsp20  34.59 
 
 		 185 aa  81.3  0.000000000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0383  heat shock protein Hsp20  34.09 
 
 		 166 aa  81.3  0.000000000000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.170778  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2643  heat shock protein Hsp20  33.58 
 
 		 151 aa  81.3  0.000000000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.840862  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3680  heat shock protein Hsp20  34.59 
 
 		 185 aa  81.3  0.000000000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.626967 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>