More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_1528 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007333  Tfu_1528  heat shock protein Hsp20  100 
 
 		 153 aa  311  1.9999999999999998e-84  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.00309172  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3386  heat shock protein Hsp20  41.83 
 
 		 147 aa  127  6e-29  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1474  heat shock protein Hsp20  43.14 
 
 		 151 aa  122  2e-27  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.242626  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1214  molecular chaperone (small heat shock protein)  44.16 
 
 		 260 aa  122  3e-27  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.318766  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1920  heat shock protein Hsp20  42.31 
 
 		 162 aa  112  1.0000000000000001e-24  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.143113  normal  0.422548 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4198  heat shock protein Hsp20  38.85 
 
 		 152 aa  110  6e-24  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4342  heat shock protein Hsp20  35.51 
 
 		 147 aa  101  4e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.232434  normal  0.204531 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0197  heat shock protein Hsp20  34.78 
 
 		 147 aa  99.8  1e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0542117 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2174  heat shock protein Hsp20  33.76 
 
 		 169 aa  96.7  1e-19  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.150669  normal  0.4191 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2643  heat shock protein Hsp20  35.71 
 
 		 151 aa  95.1  3e-19  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.840862  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0052  heat shock protein Hsp20  33.79 
 
 		 151 aa  92.4  2e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.319643  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1568  heat shock protein Hsp20  34.81 
 
 		 251 aa  91.7  3e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.458268 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0538  HSP20 family protein  34.72 
 
 		 147 aa  89.4  2e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0936  heat shock protein Hsp20  35.97 
 
 		 155 aa  89  2e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.172536  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0989  heat shock protein Hsp20  33.1 
 
 		 148 aa  89.4  2e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.543303  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2366  heat shock protein Hsp20  38.97 
 
 		 151 aa  89.4  2e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.550987  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3765  heat shock protein Hsp20  35.25 
 
 		 143 aa  85.5  2e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2986  heat shock protein Hsp20  32.39 
 
 		 147 aa  84.7  4e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00130326  normal  0.964264 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2035  stress response protein  42.57 
 
 		 144 aa  83.2  0.000000000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2325  stress response protein  42.57 
 
 		 141 aa  83.2  0.000000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.908249  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3093  heat shock protein  42.57 
 
 		 144 aa  83.2  0.000000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1432  HSP20/alpha crystallin family protein  42.57 
 
 		 144 aa  83.2  0.000000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.614633  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3219  heat shock protein  42.57 
 
 		 144 aa  83.2  0.000000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1345  stress response protein  42.57 
 
 		 144 aa  83.2  0.000000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.260788  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0383  heat shock protein Hsp20  32.37 
 
 		 158 aa  82.8  0.000000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1059  stress response protein  42.57 
 
 		 144 aa  83.2  0.000000000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14610  heat shock protein Hsp20  36.03 
 
 		 143 aa  82.8  0.000000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000610495  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1824  heat shock protein Hsp20  32.31 
 
 		 146 aa  82.4  0.000000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0843989  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2321  stress response protein  40.2 
 
 		 513 aa  80.9  0.000000000000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1348  heat shock protein Hsp20  32.86 
 
 		 146 aa  80.9  0.000000000000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.403253 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2024  heat shock protein Hsp20  32.86 
 
 		 146 aa  80.9  0.000000000000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.106375 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0481  heat shock protein Hsp20  43.4 
 
 		 150 aa  80.5  0.000000000000007  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.411475 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1983  heat shock protein Hsp20  35.66 
 
 		 153 aa  80.5  0.000000000000007  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00684856  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0200  heat shock protein Hsp20  34.69 
 
 		 176 aa  80.5  0.000000000000008  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.377048  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4499  heat shock protein Hsp20  33.1 
 
 		 145 aa  80.5  0.000000000000008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.100268 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1076  heat shock protein Hsp20  34.27 
 
 		 148 aa  80.5  0.000000000000008  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.713568  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3905  heat shock protein Hsp20  31.47 
 
 		 147 aa  79.3  0.00000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000984381  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3113  heat shock protein Hsp20  39.09 
 
 		 142 aa  79.3  0.00000000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.800815  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5914  heat shock protein Hsp20  43.48 
 
 		 144 aa  79.3  0.00000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0664313  normal  0.562292 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6187  heat shock protein Hsp20  43.48 
 
 		 144 aa  79  0.00000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.306682 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1296  heat shock protein Hsp20  34.31 
 
 		 143 aa  78.6  0.00000000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2287  heat shock protein Hsp20  33.96 
 
 		 189 aa  78.2  0.00000000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1929  heat shock protein Hsp20  32.17 
 
 		 149 aa  78.2  0.00000000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.638493  normal  0.0128011 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2188  heat shock protein Hsp20  33.33 
 
 		 156 aa  77.4  0.00000000000007  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.345525  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1366  heat shock protein Hsp20  37.23 
 
 		 176 aa  77  0.00000000000008  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.74874  normal  0.190619 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0463  heat shock protein Hsp20  32.19 
 
 		 166 aa  77  0.00000000000009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4352  heat shock protein Hsp20  34.03 
 
 		 145 aa  77  0.00000000000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.735936  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4766  heat shock protein Hsp20  33.33 
 
 		 163 aa  77  0.00000000000009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  decreased coverage  0.0000408851  hitchhiker  0.00874264 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2532  HSP20 family protein  30.83 
 
 		 144 aa  76.6  0.0000000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0838  heat shock protein Hsp20  35.24 
 
 		 162 aa  76.3  0.0000000000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0623  heat shock protein Hsp20  30.34 
 
 		 152 aa  76.6  0.0000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.844177  normal  0.400233 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2790  heat shock protein Hsp20  30.56 
 
 		 149 aa  76.3  0.0000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000163808  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2022  heat shock protein Hsp20  34.51 
 
 		 141 aa  75.9  0.0000000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1171  heat shock protein Hsp20  31.87 
 
 		 189 aa  75.9  0.0000000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.726376  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0629  heat shock protein Hsp20  32.08 
 
 		 189 aa  75.1  0.0000000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.185609 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6439  heat shock protein Hsp20  33.07 
 
 		 153 aa  75.5  0.0000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.024706  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2957  HSP20 family protein  32.82 
 
 		 143 aa  75.1  0.0000000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0540  heat shock protein Hsp20  33.33 
 
 		 147 aa  74.7  0.0000000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3394  heat shock protein Hsp20  32.7 
 
 		 189 aa  74.7  0.0000000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0219016  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0362  heat shock protein Hsp20  32.33 
 
 		 144 aa  74.7  0.0000000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.025472  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0343  heat shock protein Hsp20  32.33 
 
 		 144 aa  74.7  0.0000000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.90555e-28 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4119  heat shock protein Hsp20  32.17 
 
 		 149 aa  74.7  0.0000000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00303961 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0539  heat shock protein Hsp20  33.57 
 
 		 161 aa  74.7  0.0000000000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0505  heat shock protein Hsp20  31.39 
 
 		 158 aa  74.3  0.0000000000006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1029  Hsp20/alpha crystallin family protein  32.12 
 
 		 146 aa  73.9  0.0000000000007  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00339514  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1732  HSP20 family protein  37.5 
 
 		 167 aa  73.9  0.0000000000007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.371108  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1343  HSP20 family protein  33.33 
 
 		 135 aa  73.9  0.0000000000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1869  putative small heat shock protein  36.96 
 
 		 142 aa  73.9  0.0000000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.309197  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2938  heat shock protein Hsp20  33.09 
 
 		 145 aa  73.9  0.0000000000007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000000491843  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0383  heat shock protein Hsp20  36.03 
 
 		 166 aa  73.9  0.0000000000007  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.170778  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4507  heat shock protein Hsp20  32.64 
 
 		 145 aa  73.9  0.0000000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1292  heat shock protein Hsp20  38.18 
 
 		 170 aa  73.2  0.000000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0518729  normal  0.504399 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3882  heat shock protein Hsp20  36.75 
 
 		 158 aa  73.6  0.000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.545217  normal  0.180827 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0037  heat shock protein Hsp20  35.43 
 
 		 142 aa  72.8  0.000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4488  heat shock protein Hsp20  32.64 
 
 		 145 aa  73.6  0.000000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2459  heat shock protein Hsp20  37.27 
 
 		 142 aa  73.2  0.000000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.134169  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3312  heat shock protein, putative  36.07 
 
 		 129 aa  72.8  0.000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.267805  normal  0.275059 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0543  heat shock protein Hsp20  35 
 
 		 147 aa  72.8  0.000000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0340696  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3498  heat shock protein Hsp20  37.84 
 
 		 158 aa  72.4  0.000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.938667  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0580  heat shock protein Hsp20  35 
 
 		 145 aa  72  0.000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000199173  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1648  heat shock protein, Hsp20 family  36 
 
 		 148 aa  72.4  0.000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.715277  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1347  heat shock protein Hsp20  36 
 
 		 148 aa  72.4  0.000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.452932  normal  0.819182 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3412  small HspC2 heat shock protein  31.45 
 
 		 189 aa  72.8  0.000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.260583  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0423  heat shock protein Hsp20  33.81 
 
 		 152 aa  72.4  0.000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.943695  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4128  heat shock protein Hsp20  29.77 
 
 		 154 aa  72.4  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.226976  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1159  heat shock protein Hsp20  31.03 
 
 		 148 aa  72.8  0.000000000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000413054  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0289  heat shock protein Hsp20  32.86 
 
 		 148 aa  72.4  0.000000000002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0247001  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2860  heat shock protein Hsp20  30.25 
 
 		 184 aa  72.8  0.000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.793853  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1738  small HspC2 heat shock protein  31.72 
 
 		 189 aa  72  0.000000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.267785  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3080  heat shock protein Hsp20  33.06 
 
 		 230 aa  71.6  0.000000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2798  small HspC2 heat shock protein  31.72 
 
 		 189 aa  72  0.000000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.159343  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4819  heat shock protein Hsp20  34.33 
 
 		 146 aa  72  0.000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.414421 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3805  heat shock protein Hsp20  37.84 
 
 		 158 aa  72  0.000000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.232205  normal  0.564168 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1742  heat shock protein Hsp20  32.58 
 
 		 152 aa  72  0.000000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.314982  hitchhiker  0.000988198 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3076  heat shock protein Hsp20  27.59 
 
 		 148 aa  71.6  0.000000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0454  heat shock protein Hsp20  31.62 
 
 		 144 aa  71.6  0.000000000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2683  heat shock protein Hsp20  26.09 
 
 		 145 aa  71.2  0.000000000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.338339  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0557  heat shock protein Hsp20  31.47 
 
 		 147 aa  71.6  0.000000000004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0117197  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0102  heat shock protein Hsp20  32.03 
 
 		 142 aa  71.2  0.000000000005  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2078  heat shock protein Hsp20  29.8 
 
 		 147 aa  70.9  0.000000000006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>