More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_6439 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013440  Hoch_6439  heat shock protein Hsp20  100 
 
 
153 aa  311  2.9999999999999996e-84  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.024706  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1762  heat shock protein Hsp20  43.36 
 
 
144 aa  103  7e-22  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4463  heat shock protein Hsp20  39.57 
 
 
141 aa  102  3e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2532  HSP20 family protein  40.65 
 
 
144 aa  100  5e-21  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0838  heat shock protein Hsp20  40.95 
 
 
162 aa  100  6e-21  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0954  Hsp20/alpha crystallin family protein  36.69 
 
 
162 aa  99  2e-20  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.154946  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_825  HSP20/alpha crystallin  35.25 
 
 
162 aa  99  2e-20  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2522  heat shock protein Hsp20  39.81 
 
 
150 aa  98.6  3e-20  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2796  heat shock protein  40.77 
 
 
152 aa  97.8  5e-20  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.300285  normal  0.746249 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2957  HSP20 family protein  40.54 
 
 
143 aa  97.1  7e-20  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3078  heat shock protein Hsp20  36.76 
 
 
145 aa  96.7  1e-19  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000700712  normal  0.0754711 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1010  heat shock protein Hsp20  42.11 
 
 
153 aa  96.3  1e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00224234  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0125  heat shock protein Hsp20  41.9 
 
 
139 aa  95.5  2e-19  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.369397  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0936  heat shock protein Hsp20  41.53 
 
 
155 aa  95.1  3e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.172536  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2188  heat shock protein Hsp20  34.59 
 
 
156 aa  94  7e-19  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.345525  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0197  heat shock protein Hsp20  39.32 
 
 
147 aa  92.8  1e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0542117 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2477  heat shock protein Hsp20  38.46 
 
 
143 aa  93.2  1e-18  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2320  heat shock protein Hsp20  42.06 
 
 
149 aa  93.6  1e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2366  heat shock protein Hsp20  41.44 
 
 
151 aa  91.7  3e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.550987  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0052  heat shock protein Hsp20  37.27 
 
 
151 aa  91.7  3e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.319643  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4342  heat shock protein Hsp20  38.46 
 
 
147 aa  92  3e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.232434  normal  0.204531 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4766  heat shock protein Hsp20  41.28 
 
 
163 aa  91.3  4e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  decreased coverage  0.0000408851  hitchhiker  0.00874264 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2022  heat shock protein Hsp20  42.06 
 
 
141 aa  90.1  9e-18  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1434  low molecular weight heat shock protein  38.1 
 
 
160 aa  89.7  1e-17  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1365  heat shock protein Hsp20  38.1 
 
 
160 aa  89.7  1e-17  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.117276  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0200  heat shock protein Hsp20  41.46 
 
 
176 aa  89.4  2e-17  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.377048  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0538  HSP20 family protein  35.51 
 
 
147 aa  87.8  4e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1029  Hsp20/alpha crystallin family protein  36.94 
 
 
146 aa  87.8  4e-17  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00339514  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0543  heat shock protein Hsp20  35.83 
 
 
147 aa  88.2  4e-17  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0340696  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0102  heat shock protein Hsp20  38.52 
 
 
142 aa  87.8  5e-17  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2024  heat shock protein Hsp20  33.09 
 
 
146 aa  87.8  5e-17  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.106375 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1348  heat shock protein Hsp20  33.09 
 
 
146 aa  87.8  5e-17  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.403253 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4507  heat shock protein Hsp20  38.33 
 
 
145 aa  87.8  5e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1296  heat shock protein Hsp20  38.21 
 
 
143 aa  87.4  6e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2730  heat shock protein Hsp20  37.74 
 
 
148 aa  87.4  6e-17  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4488  heat shock protein Hsp20  38.33 
 
 
145 aa  87.4  7e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0369  HSP20 family protein  38.71 
 
 
153 aa  87  8e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  4.93231e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0623  heat shock protein Hsp20  38.1 
 
 
152 aa  87  8e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.844177  normal  0.400233 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0557  heat shock protein Hsp20  35.83 
 
 
147 aa  87  8e-17  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0117197  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2287  heat shock protein Hsp20  37.19 
 
 
189 aa  87  9e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3394  heat shock protein Hsp20  39.81 
 
 
189 aa  86.7  1e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0219016  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3765  heat shock protein Hsp20  40.19 
 
 
143 aa  86.3  1e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0513  heat shock protein Hsp20  44.17 
 
 
147 aa  86.3  2e-16  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02640  low molecular weight heat shock protein  33.1 
 
 
158 aa  85.9  2e-16  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4352  heat shock protein Hsp20  36.67 
 
 
145 aa  85.9  2e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.735936  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0539  heat shock protein Hsp20  42.16 
 
 
161 aa  86.3  2e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0391  heat shock protein Hsp20  38.85 
 
 
143 aa  85.1  3e-16  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000478859  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0989  heat shock protein Hsp20  37.74 
 
 
148 aa  84.7  4e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.543303  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0672  heat shock protein Hsp20  37.21 
 
 
159 aa  84.7  4e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.000109595  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0774  heat shock protein Hsp20  38.46 
 
 
139 aa  84.7  4e-16  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3080  heat shock protein Hsp20  33.82 
 
 
230 aa  84.3  5e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3905  heat shock protein Hsp20  35.24 
 
 
147 aa  84.3  5e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000984381  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1977  heat shock protein Hsp20  34.81 
 
 
139 aa  84  7e-16  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.334288  normal  0.643075 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4499  heat shock protein Hsp20  34.17 
 
 
145 aa  84  8e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.100268 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2790  heat shock protein Hsp20  35.85 
 
 
149 aa  83.6  8e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000163808  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2986  heat shock protein Hsp20  31.78 
 
 
147 aa  83.6  8e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00130326  normal  0.964264 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1127  heat shock protein Hsp20  36.84 
 
 
142 aa  84  8e-16  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4650  heat shock protein Hsp20  36.61 
 
 
145 aa  83.6  9e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.73287  normal  0.761162 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1320  Hsp20/alpha crystallin family protein  32.81 
 
 
151 aa  83.6  0.000000000000001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0423  heat shock protein Hsp20  39.45 
 
 
152 aa  82.8  0.000000000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.943695  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1262  small heat shock protein  32.81 
 
 
151 aa  83.6  0.000000000000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.753574  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0624  HSP20 family protein  38.94 
 
 
145 aa  82  0.000000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1472  HSP20 family protein  38.94 
 
 
145 aa  82  0.000000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.287102  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3047  HSP20 family protein  38.94 
 
 
145 aa  82  0.000000000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1572  HSP20 family protein  38.94 
 
 
215 aa  82.4  0.000000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.537516  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1441  HSP20 family protein  38.94 
 
 
145 aa  82  0.000000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20170  heat shock protein Hsp20  37.5 
 
 
177 aa  82.8  0.000000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.638214  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0383  heat shock protein Hsp20  33.64 
 
 
158 aa  82.4  0.000000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1247  HSP20 family protein  38.94 
 
 
145 aa  82  0.000000000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0530  HSP20 family protein  38.94 
 
 
145 aa  82  0.000000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3386  heat shock protein Hsp20  37.61 
 
 
147 aa  82  0.000000000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1235  heat shock protein Hsp20  36.84 
 
 
146 aa  81.6  0.000000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.346981  normal  0.252455 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1171  heat shock protein Hsp20  35.54 
 
 
189 aa  81.6  0.000000000000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.726376  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0782  heat shock protein Hsp20  36.84 
 
 
146 aa  81.6  0.000000000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1263  heat shock protein Hsp20  36.84 
 
 
146 aa  81.6  0.000000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.095432  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0629  heat shock protein Hsp20  34.71 
 
 
189 aa  81.3  0.000000000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.185609 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0391  heat shock protein Hsp20  34.81 
 
 
141 aa  81.3  0.000000000000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.854862  normal  0.714918 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5151  heat shock protein Hsp20  40.18 
 
 
148 aa  81.3  0.000000000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0184623  normal  0.32984 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0514  heat shock protein Hsp20  41.41 
 
 
141 aa  80.9  0.000000000000006  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0610  heat shock protein Hsp20  34.38 
 
 
136 aa  80.5  0.000000000000007  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.335952  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1573  heat shock protein Hsp20  38.46 
 
 
173 aa  80.5  0.000000000000007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  decreased coverage  0.00130938  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2578  putative heat shock protein  30.67 
 
 
185 aa  80.5  0.000000000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3113  heat shock protein Hsp20  38.24 
 
 
142 aa  80.5  0.000000000000007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.800815  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1347  heat shock protein Hsp20  36.97 
 
 
148 aa  80.5  0.000000000000008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.452932  normal  0.819182 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2809  HSP20 family protein  37.72 
 
 
146 aa  80.5  0.000000000000008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.0002171  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1648  heat shock protein, Hsp20 family  36.97 
 
 
148 aa  80.5  0.000000000000008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.715277  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0836  heat shock protein Hsp20  34.91 
 
 
143 aa  80.5  0.000000000000008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.534587  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_10507  heat shock protein Hsp20/Hsp26, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G10270)  33.82 
 
 
181 aa  79.7  0.00000000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.0988742 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0630  heat shock protein Hsp20  39.82 
 
 
138 aa  79.7  0.00000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.140987  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2055  heat shock protein Hsp20  36.84 
 
 
146 aa  80.1  0.00000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3412  small HspC2 heat shock protein  34.71 
 
 
189 aa  79.7  0.00000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.260583  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0924  heat shock protein  33.85 
 
 
180 aa  79.7  0.00000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2683  heat shock protein Hsp20  37.93 
 
 
145 aa  80.1  0.00000000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.338339  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25770  heat shock Hsp20 protein  33.58 
 
 
198 aa  79.7  0.00000000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1370  small heat shock protein  38.46 
 
 
144 aa  79  0.00000000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0982961  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4406  heat shock protein Hsp20  35.96 
 
 
146 aa  79  0.00000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3076  heat shock protein Hsp20  34.29 
 
 
148 aa  79.3  0.00000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2316  heat shock protein Hsp20  38.17 
 
 
139 aa  79.3  0.00000000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0611291  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2210  heat shock protein Hsp20  33.1 
 
 
139 aa  79.3  0.00000000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0417447  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2643  heat shock protein Hsp20  37.5 
 
 
151 aa  79.3  0.00000000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.840862  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>