More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene AFE_1648 on replicon NC_011761
Organism: Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011206  Lferr_1347  heat shock protein Hsp20  100 
 
 
148 aa  303  5.0000000000000004e-82  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.452932  normal  0.819182 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1648  heat shock protein, Hsp20 family  100 
 
 
148 aa  303  5.0000000000000004e-82  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.715277  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1573  heat shock protein Hsp20  38.51 
 
 
173 aa  99.4  1e-20  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  decreased coverage  0.00130938  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0982  HSP20 family protein  35.71 
 
 
176 aa  95.5  2e-19  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2321  stress response protein  40.15 
 
 
513 aa  95.9  2e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1370  small heat shock protein  36.73 
 
 
144 aa  94.7  4e-19  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0982961  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3219  heat shock protein  40.44 
 
 
144 aa  94  7e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3093  heat shock protein  40.44 
 
 
144 aa  94  7e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1432  HSP20/alpha crystallin family protein  40.44 
 
 
144 aa  94  7e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.614633  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0539  heat shock protein Hsp20  39.82 
 
 
161 aa  93.6  8e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2035  stress response protein  40.44 
 
 
144 aa  93.6  9e-19  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1059  stress response protein  40.44 
 
 
144 aa  93.6  9e-19  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1345  stress response protein  40.44 
 
 
144 aa  93.6  9e-19  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.260788  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2325  stress response protein  40.44 
 
 
141 aa  93.2  1e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.908249  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2522  heat shock protein Hsp20  34.38 
 
 
150 aa  92  2e-18  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5914  heat shock protein Hsp20  38.69 
 
 
144 aa  89.7  1e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0664313  normal  0.562292 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0369  HSP20 family protein  38.98 
 
 
153 aa  89.4  2e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  4.93231e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1869  putative small heat shock protein  39.1 
 
 
142 aa  88.6  2e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.309197  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6187  heat shock protein Hsp20  37.96 
 
 
144 aa  87.8  4e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.306682 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1429  heat shock protein Hsp20  35.88 
 
 
169 aa  87.8  5e-17  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4061  heat shock protein Hsp20  34.56 
 
 
147 aa  87.4  6e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4023  heat shock protein Hsp20  34.56 
 
 
147 aa  87.4  6e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0037  heat shock protein Hsp20  42.03 
 
 
142 aa  86.3  1e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2635  heat shock protein Hsp20  34.75 
 
 
195 aa  84  7e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000662159  normal  0.965311 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1110  heat shock protein Hsp20  36.03 
 
 
145 aa  83.6  9e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.339847  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3788  heat shock protein Hsp20  40.38 
 
 
144 aa  83.2  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.964317 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4128  heat shock protein Hsp20  35.56 
 
 
154 aa  83.2  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.226976  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0383  heat shock protein Hsp20  38.24 
 
 
158 aa  82  0.000000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1076  heat shock protein Hsp20  33.33 
 
 
148 aa  82.4  0.000000000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.713568  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0954  Hsp20/alpha crystallin family protein  30.66 
 
 
162 aa  81.6  0.000000000000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.154946  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0580  heat shock protein Hsp20  35.29 
 
 
145 aa  81.6  0.000000000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000199173  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2122  heat shock protein Hsp20  35.21 
 
 
180 aa  82  0.000000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.451471 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0481  heat shock protein Hsp20  35.88 
 
 
150 aa  82  0.000000000000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.411475 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1159  heat shock protein Hsp20  34.51 
 
 
148 aa  81.3  0.000000000000004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000413054  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0599  heat shock protein Hsp20  29.92 
 
 
176 aa  80.9  0.000000000000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.187967  normal  0.122676 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6439  heat shock protein Hsp20  36.97 
 
 
153 aa  80.5  0.000000000000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.024706  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0989  heat shock protein Hsp20  33.33 
 
 
148 aa  80.1  0.000000000000009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.543303  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3113  heat shock protein Hsp20  34.35 
 
 
142 aa  79.7  0.00000000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.800815  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0838  heat shock protein Hsp20  29.41 
 
 
162 aa  80.1  0.00000000000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_825  HSP20/alpha crystallin  29.93 
 
 
162 aa  80.1  0.00000000000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2678  HSP20 family protein  35.05 
 
 
151 aa  78.6  0.00000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4819  heat shock protein Hsp20  36.27 
 
 
218 aa  78.6  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0630  heat shock protein Hsp20  34.51 
 
 
138 aa  78.2  0.00000000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.140987  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2657  heat shock protein Hsp20  40.59 
 
 
155 aa  78.2  0.00000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.498697  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1543  heat shock protein Hsp20  38.14 
 
 
146 aa  78.2  0.00000000000004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.000494204  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1199  heat shock protein Hsp20  38.3 
 
 
143 aa  78.2  0.00000000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.76992  normal 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0143  heat shock protein Hsp20  41.9 
 
 
156 aa  77.4  0.00000000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2049  heat shock protein Hsp20  37.14 
 
 
164 aa  77.8  0.00000000000005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  hitchhiker  0.0000140473  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2898  heat shock protein Hsp20  37.93 
 
 
149 aa  77.8  0.00000000000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.828136  normal  0.116226 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1967  heat shock protein Hsp20  39.18 
 
 
178 aa  77.4  0.00000000000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2643  heat shock protein Hsp20  38.1 
 
 
151 aa  77.4  0.00000000000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.840862  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1167  heat shock protein Hsp20  36.91 
 
 
149 aa  77.4  0.00000000000006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0735  heat shock protein Hsp20  38.46 
 
 
145 aa  77.4  0.00000000000006  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  unclonable  0.0000000000000037192  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3076  heat shock protein Hsp20  33.62 
 
 
173 aa  77  0.00000000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1929  heat shock protein Hsp20  32.21 
 
 
149 aa  77  0.00000000000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.638493  normal  0.0128011 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0460  heat shock protein Hsp20  34.13 
 
 
155 aa  77  0.00000000000008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0200  heat shock protein Hsp20  32.82 
 
 
176 aa  76.6  0.00000000000009  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.377048  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4819  heat shock protein Hsp20  30.07 
 
 
146 aa  76.6  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.414421 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0936  heat shock protein Hsp20  38.83 
 
 
155 aa  76.3  0.0000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.172536  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0445  heat shock protein Hsp20  32.61 
 
 
150 aa  76.6  0.0000000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2250  heat shock protein Hsp20  38.14 
 
 
178 aa  76.6  0.0000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2301  heat shock protein Hsp20  38.66 
 
 
142 aa  76.6  0.0000000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.46681  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3192  HSP20 family protein  36.36 
 
 
149 aa  75.5  0.0000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2078  heat shock protein Hsp20  28.68 
 
 
147 aa  75.9  0.0000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0543  heat shock protein Hsp20  34.07 
 
 
147 aa  75.5  0.0000000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0340696  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2986  heat shock protein Hsp20  29.77 
 
 
147 aa  75.9  0.0000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00130326  normal  0.964264 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16210  heat shock protein Hsp20  35.09 
 
 
163 aa  75.5  0.0000000000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.221164  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1292  heat shock protein Hsp20  33.59 
 
 
170 aa  75.5  0.0000000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0518729  normal  0.504399 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0463  heat shock protein Hsp20  31.21 
 
 
166 aa  75.5  0.0000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4342  heat shock protein Hsp20  36.19 
 
 
147 aa  75.5  0.0000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.232434  normal  0.204531 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0538  HSP20 family protein  29.77 
 
 
147 aa  75.1  0.0000000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3765  heat shock protein Hsp20  34.31 
 
 
143 aa  74.3  0.0000000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3527  putative HspC2 heat shock protein  33.61 
 
 
173 aa  73.9  0.0000000000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0868338  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4766  heat shock protein Hsp20  37.25 
 
 
163 aa  73.9  0.0000000000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  decreased coverage  0.0000408851  hitchhiker  0.00874264 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2459  heat shock protein Hsp20  32.06 
 
 
142 aa  73.2  0.000000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.134169  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2312  heat shock protein Hsp20  38 
 
 
149 aa  73.2  0.000000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0197  heat shock protein Hsp20  35.24 
 
 
147 aa  73.2  0.000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0542117 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2366  heat shock protein Hsp20  32.87 
 
 
151 aa  73.6  0.000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.550987  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3074  heat shock protein Hsp20  38.3 
 
 
144 aa  73.2  0.000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3061  heat shock protein Hsp20  35.29 
 
 
158 aa  73.2  0.000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.301699 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3063  heat shock protein Hsp20  34.31 
 
 
158 aa  73.2  0.000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.89361 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3064  heat shock protein Hsp20  35.29 
 
 
166 aa  73.2  0.000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.898255 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1631  heat shock protein Hsp20  40 
 
 
145 aa  72.8  0.000000000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1320  Hsp20/alpha crystallin family protein  37.25 
 
 
151 aa  72.8  0.000000000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1528  heat shock protein Hsp20  36 
 
 
153 aa  72.4  0.000000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.00309172  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4119  heat shock protein Hsp20  30.87 
 
 
149 aa  72.4  0.000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00303961 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2790  heat shock protein Hsp20  33.59 
 
 
149 aa  72  0.000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000163808  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1262  small heat shock protein  37.25 
 
 
151 aa  72.8  0.000000000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.753574  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0557  heat shock protein Hsp20  33.33 
 
 
147 aa  72.8  0.000000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0117197  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1559  heat shock protein Hsp20  36.56 
 
 
133 aa  72.8  0.000000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0277974  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6892  heat shock protein Hsp20  37.4 
 
 
157 aa  72.4  0.000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.862152  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4812  heat shock protein Hsp20  33.67 
 
 
155 aa  71.6  0.000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00238667  normal  0.807841 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1018  heat shock protein Hsp20  38.61 
 
 
177 aa  72  0.000000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.683731  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0125  heat shock protein Hsp20  35.78 
 
 
139 aa  71.6  0.000000000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.369397  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0690  heat shock protein Hsp20  36.67 
 
 
147 aa  72  0.000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000202005  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3612  hypothetical protein  28.76 
 
 
177 aa  71.6  0.000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0357  Hsp20-like molecular chaperone  43.18 
 
 
148 aa  71.6  0.000000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1537  heat shock protein Hsp20  33.09 
 
 
142 aa  71.2  0.000000000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1758  heat shock protein Hsp20  36.89 
 
 
223 aa  71.2  0.000000000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5151  heat shock protein Hsp20  33.63 
 
 
148 aa  71.6  0.000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0184623  normal  0.32984 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>