More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PP_3312 on replicon NC_002947
Organism: Pseudomonas putida KT2440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_3312  heat shock protein, putative  100 
 
 		 129 aa  259  1e-68  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.267805  normal  0.275059 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1732  HSP20 family protein  56.88 
 
 		 167 aa  135  2e-31  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.371108  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2731  heat shock protein Hsp20  48.21 
 
 		 166 aa  103  1e-21  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1170  heat shock protein Hsp20  46.67 
 
 		 170 aa  101  3e-21  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0833  heat shock protein Hsp20  40 
 
 		 169 aa  99.4  2e-20  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1921  heat shock protein Hsp20  41.82 
 
 		 167 aa  95.1  3e-19  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.985705  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3080  heat shock protein Hsp20  50.48 
 
 		 230 aa  94.4  4e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1445  putative heat shock protein  35.2 
 
 		 167 aa  84.7  4e-16  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.000891901  normal  0.866362 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0481  heat shock protein Hsp20  43 
 
 		 150 aa  84.7  4e-16  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.411475 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2898  heat shock protein Hsp20  38.94 
 
 		 149 aa  84.3  5e-16  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.828136  normal  0.116226 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0200  heat shock protein Hsp20  39.32 
 
 		 176 aa  83.6  8e-16  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.377048  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0369  HSP20 family protein  39.22 
 
 		 153 aa  82.4  0.000000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  4.93231e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1127  heat shock protein Hsp20  34.51 
 
 		 142 aa  82  0.000000000000003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2790  heat shock protein Hsp20  36.27 
 
 		 149 aa  81.3  0.000000000000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000163808  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2022  heat shock protein Hsp20  33.88 
 
 		 141 aa  79.3  0.00000000000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6892  heat shock protein Hsp20  44.23 
 
 		 157 aa  80.1  0.00000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.862152  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4352  heat shock protein Hsp20  37.86 
 
 		 145 aa  80.1  0.00000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.735936  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0539  heat shock protein Hsp20  38.83 
 
 		 161 aa  79  0.00000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2477  heat shock protein Hsp20  40.18 
 
 		 143 aa  79  0.00000000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4507  heat shock protein Hsp20  37.86 
 
 		 145 aa  79.3  0.00000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5491  heat shock protein Hsp20  44.23 
 
 		 211 aa  78.6  0.00000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.710483  normal  0.352797 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3882  heat shock protein Hsp20  36.89 
 
 		 158 aa  78.6  0.00000000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.545217  normal  0.180827 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4488  heat shock protein Hsp20  36.89 
 
 		 145 aa  78.2  0.00000000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3498  heat shock protein Hsp20  36.89 
 
 		 158 aa  77.4  0.00000000000007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.938667  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0037  heat shock protein Hsp20  36.89 
 
 		 142 aa  77  0.00000000000008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3905  heat shock protein Hsp20  33 
 
 		 147 aa  77  0.00000000000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000984381  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4499  heat shock protein Hsp20  34.95 
 
 		 145 aa  77  0.00000000000009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.100268 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1929  heat shock protein Hsp20  39.6 
 
 		 149 aa  76.6  0.00000000000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.638493  normal  0.0128011 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0580  heat shock protein Hsp20  36.27 
 
 		 145 aa  77  0.00000000000009  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000199173  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4859  heat shock protein Hsp20  41.9 
 
 		 204 aa  76.6  0.0000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0538  HSP20 family protein  34 
 
 		 147 aa  75.9  0.0000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2986  heat shock protein Hsp20  33 
 
 		 147 aa  75.5  0.0000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00130326  normal  0.964264 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2063  heat shock protein Hsp20  38.61 
 
 		 155 aa  75.9  0.0000000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.21571  normal  0.594869 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2863  heat shock protein Hsp20  37.86 
 
 		 167 aa  75.5  0.0000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.203152  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4461  heat shock protein Hsp20  36.36 
 
 		 163 aa  75.5  0.0000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1967  heat shock protein Hsp20  39 
 
 		 178 aa  75.5  0.0000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3805  heat shock protein Hsp20  35.92 
 
 		 158 aa  75.9  0.0000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.232205  normal  0.564168 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1742  heat shock protein Hsp20  37.4 
 
 		 152 aa  75.5  0.0000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.314982  hitchhiker  0.000988198 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1348  heat shock protein Hsp20  35.64 
 
 		 146 aa  75.5  0.0000000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.403253 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2024  heat shock protein Hsp20  35.64 
 
 		 146 aa  75.5  0.0000000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.106375 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0362  heat shock protein Hsp20  36.67 
 
 		 144 aa  75.1  0.0000000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.025472  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0102  heat shock protein Hsp20  38.89 
 
 		 142 aa  75.5  0.0000000000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0543  heat shock protein Hsp20  40 
 
 		 147 aa  75.1  0.0000000000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0340696  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0296  heat shock protein Hsp20  35.85 
 
 		 156 aa  75.1  0.0000000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2957  HSP20 family protein  37.39 
 
 		 143 aa  74.7  0.0000000000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4766  heat shock protein Hsp20  38.83 
 
 		 163 aa  74.7  0.0000000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  decreased coverage  0.0000408851  hitchhiker  0.00874264 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0125  heat shock protein Hsp20  32.54 
 
 		 139 aa  74.7  0.0000000000004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.369397  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2860  heat shock protein Hsp20  32.74 
 
 		 184 aa  74.7  0.0000000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.793853  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4119  heat shock protein Hsp20  39.6 
 
 		 149 aa  74.3  0.0000000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00303961 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3412  small HspC2 heat shock protein  35.94 
 
 		 189 aa  73.9  0.0000000000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.260583  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1917  heat shock protein Hsp20  36.04 
 
 		 156 aa  73.9  0.0000000000007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.86534  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0343  heat shock protein Hsp20  35.56 
 
 		 144 aa  73.9  0.0000000000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.90555e-28 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3076  heat shock protein Hsp20  34.31 
 
 		 148 aa  73.6  0.0000000000009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0954  Hsp20/alpha crystallin family protein  29.51 
 
 		 162 aa  72.8  0.000000000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.154946  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0557  heat shock protein Hsp20  38 
 
 		 147 aa  73.2  0.000000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0117197  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1573  heat shock protein Hsp20  38 
 
 		 173 aa  72.8  0.000000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  decreased coverage  0.00130938  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0383  heat shock protein Hsp20  35.92 
 
 		 158 aa  73.2  0.000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2635  heat shock protein Hsp20  36.27 
 
 		 195 aa  72.8  0.000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000662159  normal  0.965311 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2250  heat shock protein Hsp20  39 
 
 		 178 aa  72.8  0.000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0629  heat shock protein Hsp20  33.59 
 
 		 189 aa  72.4  0.000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.185609 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1528  heat shock protein Hsp20  36.07 
 
 		 153 aa  72.8  0.000000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.00309172  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3903  heat shock protein Hsp20  40 
 
 		 194 aa  72.4  0.000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.534424 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20170  heat shock protein Hsp20  37.17 
 
 		 177 aa  72.4  0.000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.638214  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1171  heat shock protein Hsp20  35.2 
 
 		 189 aa  72.8  0.000000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.726376  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0233  small heat shock protein  35.71 
 
 		 145 aa  72.4  0.000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.818598  normal  0.0970629 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0445  heat shock protein Hsp20  40.18 
 
 		 150 aa  72  0.000000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1366  heat shock protein Hsp20  34.82 
 
 		 176 aa  72  0.000000000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.74874  normal  0.190619 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_825  HSP20/alpha crystallin  29.81 
 
 		 162 aa  72  0.000000000003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0460  heat shock protein Hsp20  35.4 
 
 		 155 aa  71.6  0.000000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3376  heat shock protein Hsp20  37.29 
 
 		 130 aa  71.2  0.000000000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2460  heat shock protein Hsp20  37.76 
 
 		 186 aa  71.2  0.000000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.0031555  normal  0.623789 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0389  heat shock protein Hsp20  32.08 
 
 		 166 aa  71.6  0.000000000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.706384 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0836  heat shock protein Hsp20  36.63 
 
 		 149 aa  71.2  0.000000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.414458 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6104  heat shock protein Hsp20  38.1 
 
 		 158 aa  71.2  0.000000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0249434 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2408  HSP20 family protein  33.33 
 
 		 160 aa  71.2  0.000000000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2188  heat shock protein Hsp20  33.64 
 
 		 156 aa  71.2  0.000000000005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.345525  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3113  heat shock protein Hsp20  35.64 
 
 		 142 aa  70.9  0.000000000006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.800815  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2678  HSP20 family protein  38.24 
 
 		 151 aa  70.5  0.000000000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2522  heat shock protein Hsp20  34.31 
 
 		 150 aa  70.5  0.000000000007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0357  Hsp20-like molecular chaperone  37.14 
 
 		 148 aa  70.5  0.000000000007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0926  heat shock protein Hsp20  38 
 
 		 152 aa  70.5  0.000000000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2287  heat shock protein Hsp20  34.4 
 
 		 189 aa  70.5  0.000000000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6319  heat shock protein Hsp20  32.23 
 
 		 149 aa  70.5  0.000000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10254  heat shock protein hsp (heat-stress-induced ribosome-binding protein A)  39.47 
 
 		 159 aa  70.5  0.000000000008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.024543 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0838  heat shock protein Hsp20  29.81 
 
 		 162 aa  70.5  0.000000000008  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3234  HSP20 family protein  36.73 
 
 		 231 aa  69.7  0.00000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2532  HSP20 family protein  35.09 
 
 		 144 aa  69.7  0.00000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0686  heat shock protein HSP20  35.24 
 
 		 153 aa  69.7  0.00000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1159  heat shock protein Hsp20  34.65 
 
 		 148 aa  70.1  0.00000000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000413054  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1762  heat shock protein Hsp20  32.43 
 
 		 144 aa  69.7  0.00000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2505  heat shock protein Hsp20  34.65 
 
 		 138 aa  70.1  0.00000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.239492  normal  0.0462479 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2578  putative heat shock protein  33.33 
 
 		 185 aa  69.3  0.00000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0982  HSP20 family protein  31 
 
 		 176 aa  68.9  0.00000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0989  heat shock protein Hsp20  33.66 
 
 		 148 aa  69.3  0.00000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.543303  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4342  heat shock protein Hsp20  36.36 
 
 		 147 aa  69.3  0.00000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.232434  normal  0.204531 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2899  heat shock protein Hsp20  35.24 
 
 		 145 aa  68.9  0.00000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0174584 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3612  hypothetical protein  34.88 
 
 		 177 aa  68.6  0.00000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0296  heat shock protein Hsp20  34.19 
 
 		 143 aa  68.6  0.00000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2366  heat shock protein Hsp20  36.89 
 
 		 151 aa  68.2  0.00000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.550987  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0160  heat shock protein Hsp20  36.89 
 
 		 147 aa  67.8  0.00000000004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.248861  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>