More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_0233 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008255  CHU_0233  small heat shock protein  100 
 
 
145 aa  295  2e-79  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.818598  normal  0.0970629 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6319  heat shock protein Hsp20  55.63 
 
 
149 aa  168  2e-41  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0836  heat shock protein Hsp20  52 
 
 
149 aa  167  6e-41  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.414458 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3751  response regulator receiver protein  49.01 
 
 
150 aa  143  1e-33  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.544355  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4413  heat shock protein Hsp20  48.67 
 
 
150 aa  136  7.999999999999999e-32  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5151  heat shock protein Hsp20  45.95 
 
 
148 aa  128  3e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0184623  normal  0.32984 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06090  small heat shock protein  43.92 
 
 
148 aa  123  7e-28  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.473161  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3917  heat shock protein Hsp20  47.01 
 
 
142 aa  114  3e-25  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1697  hypothetical protein  38.35 
 
 
145 aa  100  6e-21  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2899  heat shock protein Hsp20  41.83 
 
 
145 aa  99.4  1e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0174584 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0370  heat shock protein Hsp20  40.41 
 
 
140 aa  97.8  5e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.733353  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6221  heat shock protein Hsp20  39.44 
 
 
151 aa  90.9  5e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4132  heat shock protein Hsp20  37.12 
 
 
144 aa  82.8  0.000000000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2559  hypothetical protein  40.68 
 
 
164 aa  82.4  0.000000000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1366  heat shock protein Hsp20  33.33 
 
 
176 aa  82.4  0.000000000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.74874  normal  0.190619 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2414  hypothetical protein  40.68 
 
 
164 aa  81.3  0.000000000000004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2321  stress response protein  36.13 
 
 
513 aa  81.3  0.000000000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1029  Hsp20/alpha crystallin family protein  39.29 
 
 
146 aa  80.9  0.000000000000005  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00339514  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2326  heat shock protein Hsp20  36.69 
 
 
144 aa  80.9  0.000000000000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0663504 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0989  heat shock protein Hsp20  37.3 
 
 
148 aa  80.1  0.000000000000008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.543303  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0125  heat shock protein Hsp20  37.12 
 
 
139 aa  80.1  0.000000000000009  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.369397  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2532  HSP20 family protein  40.37 
 
 
144 aa  79.7  0.00000000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0052  heat shock protein Hsp20  37.32 
 
 
151 aa  79  0.00000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.319643  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1762  heat shock protein Hsp20  36.22 
 
 
144 aa  78.6  0.00000000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20170  heat shock protein Hsp20  33.87 
 
 
177 aa  78.6  0.00000000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.638214  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3113  heat shock protein Hsp20  33.58 
 
 
142 aa  77.4  0.00000000000006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.800815  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1434  low molecular weight heat shock protein  39.67 
 
 
160 aa  77  0.00000000000008  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1365  heat shock protein Hsp20  39.67 
 
 
160 aa  77  0.00000000000008  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.117276  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4023  heat shock protein Hsp20  33.87 
 
 
147 aa  76.3  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4061  heat shock protein Hsp20  33.87 
 
 
147 aa  76.3  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1170  heat shock protein Hsp20  40.59 
 
 
170 aa  76.3  0.0000000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3765  heat shock protein Hsp20  38.68 
 
 
143 aa  76.3  0.0000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3312  heat shock protein, putative  35.29 
 
 
129 aa  75.5  0.0000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.267805  normal  0.275059 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2477  heat shock protein Hsp20  33.33 
 
 
143 aa  75.9  0.0000000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2957  HSP20 family protein  37.01 
 
 
143 aa  75.9  0.0000000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1127  heat shock protein Hsp20  33.58 
 
 
142 aa  75.9  0.0000000000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1543  heat shock protein Hsp20  37.6 
 
 
146 aa  75.1  0.0000000000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.000494204  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3612  hypothetical protein  32.74 
 
 
177 aa  74.7  0.0000000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0460  heat shock protein Hsp20  31.01 
 
 
155 aa  74.7  0.0000000000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1165  heat shock protein Hsp20  34.13 
 
 
145 aa  74.3  0.0000000000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.245253  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0296  heat shock protein Hsp20  38.84 
 
 
156 aa  73.9  0.0000000000007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2325  stress response protein  34.48 
 
 
141 aa  73.6  0.0000000000008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.908249  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2035  stress response protein  34.48 
 
 
144 aa  73.6  0.0000000000009  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1059  stress response protein  34.48 
 
 
144 aa  73.6  0.0000000000009  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1432  HSP20/alpha crystallin family protein  32.84 
 
 
144 aa  73.6  0.0000000000009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.614633  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3093  heat shock protein  32.84 
 
 
144 aa  73.6  0.0000000000009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1345  stress response protein  34.48 
 
 
144 aa  73.6  0.0000000000009  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.260788  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3219  heat shock protein  32.84 
 
 
144 aa  73.6  0.0000000000009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2678  HSP20 family protein  37.74 
 
 
151 aa  72.8  0.000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1292  heat shock protein Hsp20  33.59 
 
 
170 aa  72.8  0.000000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0518729  normal  0.504399 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0610  heat shock protein Hsp20  36.15 
 
 
136 aa  72.8  0.000000000001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.335952  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0543  heat shock protein Hsp20  36 
 
 
147 aa  73.2  0.000000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0340696  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0184  heat shock protein Hsp20  38.38 
 
 
160 aa  72.8  0.000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.29101  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0200  heat shock protein Hsp20  32.61 
 
 
176 aa  73.2  0.000000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.377048  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3234  HSP20 family protein  37.6 
 
 
231 aa  72.4  0.000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2790  heat shock protein Hsp20  35.43 
 
 
149 aa  72.4  0.000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000163808  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0686  heat shock protein HSP20  34.33 
 
 
153 aa  72.4  0.000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1977  heat shock protein Hsp20  40.43 
 
 
139 aa  72  0.000000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.334288  normal  0.643075 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0557  heat shock protein Hsp20  36 
 
 
147 aa  72.8  0.000000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0117197  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1171  heat shock protein Hsp20  35.19 
 
 
189 aa  72  0.000000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.726376  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0481  heat shock protein Hsp20  38.54 
 
 
150 aa  71.6  0.000000000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.411475 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4819  heat shock protein Hsp20  33.1 
 
 
146 aa  72  0.000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.414421 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2860  heat shock protein Hsp20  32.35 
 
 
184 aa  72  0.000000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.793853  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1010  heat shock protein Hsp20  33.9 
 
 
153 aa  71.2  0.000000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00224234  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3788  heat shock protein Hsp20  34.04 
 
 
144 aa  71.2  0.000000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.964317 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3125  heat shock protein Hsp20  40.43 
 
 
149 aa  70.5  0.000000000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0629  heat shock protein Hsp20  34.26 
 
 
189 aa  70.9  0.000000000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.185609 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2460  heat shock protein Hsp20  37.6 
 
 
186 aa  70.9  0.000000000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.0031555  normal  0.623789 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02640  low molecular weight heat shock protein  36.36 
 
 
158 aa  70.9  0.000000000006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2459  heat shock protein Hsp20  31.39 
 
 
142 aa  70.9  0.000000000006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.134169  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0513  heat shock protein Hsp20  34.07 
 
 
147 aa  70.5  0.000000000007  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3468  heat shock protein Hsp20  32.35 
 
 
148 aa  70.5  0.000000000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.282569  normal  0.556723 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1115  heat shock protein Hsp20  33.08 
 
 
162 aa  70.1  0.000000000008  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0741755  normal  0.307075 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2188  heat shock protein Hsp20  33.33 
 
 
156 aa  70.1  0.000000000008  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.345525  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2635  heat shock protein Hsp20  36.89 
 
 
195 aa  70.1  0.000000000009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000662159  normal  0.965311 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3078  heat shock protein Hsp20  35.54 
 
 
145 aa  70.1  0.000000000009  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000700712  normal  0.0754711 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2635  heat shock protein Hsp20  32.35 
 
 
148 aa  70.1  0.000000000009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2657  heat shock protein Hsp20  34.4 
 
 
155 aa  70.1  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.498697  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2986  heat shock protein Hsp20  31.97 
 
 
147 aa  69.7  0.00000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00130326  normal  0.964264 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3412  small HspC2 heat shock protein  35.19 
 
 
189 aa  70.1  0.00000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.260583  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2287  heat shock protein Hsp20  35.19 
 
 
189 aa  70.1  0.00000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6439  heat shock protein Hsp20  34.62 
 
 
153 aa  70.1  0.00000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.024706  normal 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4635  heat shock protein Hsp20  31.62 
 
 
169 aa  69.3  0.00000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0538  HSP20 family protein  38.24 
 
 
147 aa  68.9  0.00000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0630  heat shock protein Hsp20  32.5 
 
 
138 aa  68.9  0.00000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.140987  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2022  heat shock protein Hsp20  38.32 
 
 
141 aa  69.3  0.00000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2643  heat shock protein Hsp20  31.45 
 
 
151 aa  68.9  0.00000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.840862  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0833  heat shock protein Hsp20  31.86 
 
 
169 aa  69.3  0.00000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2212  heat shock protein Hsp20  32.56 
 
 
171 aa  68.9  0.00000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0865  heat shock protein Hsp20  37.96 
 
 
134 aa  68.9  0.00000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.303654  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2408  HSP20 family protein  35.35 
 
 
160 aa  68.2  0.00000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4463  heat shock protein Hsp20  31.25 
 
 
141 aa  68.6  0.00000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1348  heat shock protein Hsp20  39.25 
 
 
146 aa  68.2  0.00000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.403253 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0762  heat shock protein Hsp20  35.59 
 
 
134 aa  68.6  0.00000000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1262  small heat shock protein  34.65 
 
 
151 aa  68.6  0.00000000003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.753574  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2024  heat shock protein Hsp20  39.25 
 
 
146 aa  68.2  0.00000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.106375 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1320  Hsp20/alpha crystallin family protein  34.65 
 
 
151 aa  68.6  0.00000000003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2320  heat shock protein Hsp20  33.33 
 
 
149 aa  68.6  0.00000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3905  heat shock protein Hsp20  32.21 
 
 
147 aa  68.6  0.00000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000984381  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2316  heat shock protein Hsp20  35.38 
 
 
139 aa  68.6  0.00000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0611291  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>