More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TK90_1366 on replicon NC_013889
Organism: Thioalkalivibrio sp. K90mix



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013889  TK90_1366  heat shock protein Hsp20  100 
 
 
176 aa  351  2e-96  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.74874  normal  0.190619 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2860  heat shock protein Hsp20  49.11 
 
 
184 aa  170  1e-41  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.793853  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3412  small HspC2 heat shock protein  46.49 
 
 
189 aa  154  5.0000000000000005e-37  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.260583  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1171  heat shock protein Hsp20  45.95 
 
 
189 aa  154  5.0000000000000005e-37  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.726376  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0629  heat shock protein Hsp20  45.95 
 
 
189 aa  153  1e-36  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.185609 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3394  heat shock protein Hsp20  45.95 
 
 
189 aa  151  4e-36  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0219016  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2287  heat shock protein Hsp20  46.49 
 
 
189 aa  151  4e-36  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2836  heat shock protein Hsp20  36.92 
 
 
197 aa  129  2.0000000000000002e-29  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00556978  normal  0.209218 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1738  small HspC2 heat shock protein  40.32 
 
 
189 aa  119  1.9999999999999998e-26  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.267785  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2798  small HspC2 heat shock protein  40.32 
 
 
189 aa  119  1.9999999999999998e-26  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.159343  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4859  heat shock protein Hsp20  39.46 
 
 
204 aa  109  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2132  heat shock protein Hsp20  38.55 
 
 
164 aa  108  6e-23  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.585874 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0989  heat shock protein Hsp20  40.71 
 
 
148 aa  107  1e-22  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.543303  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3724  heat shock protein Hsp20  38.29 
 
 
185 aa  107  1e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3680  heat shock protein Hsp20  38.29 
 
 
185 aa  107  1e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.626967 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1917  heat shock protein Hsp20  39.86 
 
 
156 aa  105  4e-22  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.86534  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3903  heat shock protein Hsp20  36.05 
 
 
194 aa  105  5e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.534424 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6892  heat shock protein Hsp20  40.58 
 
 
157 aa  103  9e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.862152  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0200  heat shock protein Hsp20  38.41 
 
 
176 aa  103  1e-21  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.377048  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0383  heat shock protein Hsp20  34.76 
 
 
166 aa  103  1e-21  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.170778  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2074  heat shock protein Hsp20  38.64 
 
 
173 aa  103  1e-21  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.145284  normal  0.308358 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4118  heat shock protein Hsp20  39.26 
 
 
172 aa  103  2e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.513744 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0481  heat shock protein Hsp20  37.58 
 
 
150 aa  101  6e-21  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.411475 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5491  heat shock protein Hsp20  40.58 
 
 
211 aa  100  1e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.710483  normal  0.352797 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2355  heat shock protein Hsp20  33.54 
 
 
165 aa  99.4  2e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.20966  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0296  heat shock protein Hsp20  39.06 
 
 
156 aa  98.6  4e-20  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2940  heat shock protein Hsp20  34.08 
 
 
168 aa  97.4  8e-20  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2281  heat shock protein Hsp20  40 
 
 
173 aa  97.4  9e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.78764  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2212  heat shock protein Hsp20  35.21 
 
 
171 aa  97.4  9e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2414  hypothetical protein  33.55 
 
 
164 aa  97.1  1e-19  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2559  hypothetical protein  33.55 
 
 
164 aa  96.3  2e-19  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2578  putative heat shock protein  37.93 
 
 
185 aa  95.1  4e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0369  HSP20 family protein  44.95 
 
 
153 aa  94  1e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  4.93231e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2384  heat shock protein Hsp20  35.56 
 
 
164 aa  93.6  1e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1115  heat shock protein Hsp20  36.16 
 
 
162 aa  92.8  2e-18  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0741755  normal  0.307075 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3765  heat shock protein Hsp20  38.76 
 
 
143 aa  92.8  2e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3146  heat shock protein Hsp20  35.59 
 
 
167 aa  92.4  3e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.754957 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1262  small heat shock protein  35.46 
 
 
151 aa  92  4e-18  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.753574  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1320  Hsp20/alpha crystallin family protein  35.46 
 
 
151 aa  92  4e-18  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0389  heat shock protein Hsp20  30.68 
 
 
166 aa  91.3  6e-18  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.706384 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2522  heat shock protein Hsp20  40.57 
 
 
150 aa  91.3  6e-18  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3468  heat shock protein Hsp20  31.39 
 
 
148 aa  91.3  7e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.282569  normal  0.556723 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2460  heat shock protein Hsp20  34.03 
 
 
186 aa  91.3  7e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.0031555  normal  0.623789 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1762  heat shock protein Hsp20  38.58 
 
 
144 aa  91.3  7e-18  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0543  heat shock protein Hsp20  33.11 
 
 
147 aa  91.3  7e-18  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0340696  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2188  heat shock protein Hsp20  39.58 
 
 
156 aa  91.3  7e-18  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.345525  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2635  heat shock protein Hsp20  31.39 
 
 
148 aa  90.9  9e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2796  heat shock protein  38.4 
 
 
152 aa  90.5  1e-17  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.300285  normal  0.746249 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2118  heat shock protein Hsp20  34.66 
 
 
166 aa  90.5  1e-17  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3241  heat shock protein Hsp20  34.62 
 
 
166 aa  90.5  1e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.406826  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0557  heat shock protein Hsp20  33.8 
 
 
147 aa  90.5  1e-17  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0117197  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4310  heat shock protein Hsp20  39.66 
 
 
166 aa  90.1  1e-17  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4550  heat shock protein Hsp20  39.66 
 
 
166 aa  90.1  1e-17  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3582  heat shock protein Hsp20  41.82 
 
 
166 aa  90.5  1e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0538  HSP20 family protein  36.43 
 
 
147 aa  89.7  2e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3234  HSP20 family protein  34.03 
 
 
231 aa  89.7  2e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0320  heat shock protein Hsp20  38.3 
 
 
150 aa  89.4  2e-17  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2678  HSP20 family protein  39.04 
 
 
151 aa  89  3e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3080  heat shock protein Hsp20  37.16 
 
 
230 aa  89.4  3e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5151  heat shock protein Hsp20  28.28 
 
 
148 aa  88.6  4e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0184623  normal  0.32984 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2477  heat shock protein Hsp20  40.71 
 
 
143 aa  88.6  4e-17  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4635  heat shock protein Hsp20  34.83 
 
 
169 aa  88.6  4e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0762  heat shock protein Hsp20  38.1 
 
 
134 aa  88.2  5e-17  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2024  heat shock protein Hsp20  36.23 
 
 
146 aa  88.6  5e-17  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.106375 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1348  heat shock protein Hsp20  36.23 
 
 
146 aa  88.6  5e-17  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.403253 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2986  heat shock protein Hsp20  37.21 
 
 
147 aa  88.2  6e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00130326  normal  0.964264 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2532  HSP20 family protein  39.37 
 
 
144 aa  87.8  7e-17  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0102  heat shock protein Hsp20  32.45 
 
 
142 aa  87.8  7e-17  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2957  HSP20 family protein  35.46 
 
 
143 aa  87.8  7e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4342  heat shock protein Hsp20  32.54 
 
 
147 aa  87.4  8e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.232434  normal  0.204531 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0838  heat shock protein Hsp20  36.04 
 
 
162 aa  87.4  9e-17  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0125  heat shock protein Hsp20  42.16 
 
 
139 aa  87.4  1e-16  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.369397  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4461  heat shock protein Hsp20  28.83 
 
 
163 aa  86.7  1e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2635  heat shock protein Hsp20  37.5 
 
 
195 aa  87.4  1e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000662159  normal  0.965311 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0833  heat shock protein Hsp20  38.89 
 
 
169 aa  86.7  1e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5194  heat shock protein Hsp20  34.27 
 
 
169 aa  87  1e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0987038  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1824  heat shock protein Hsp20  33.59 
 
 
146 aa  87.4  1e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0843989  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3527  putative HspC2 heat shock protein  33.53 
 
 
173 aa  86.7  2e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0868338  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0836  heat shock protein Hsp20  32.12 
 
 
149 aa  86.3  2e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.414458 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6319  heat shock protein Hsp20  37.38 
 
 
149 aa  86.3  2e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3905  heat shock protein Hsp20  33.33 
 
 
147 aa  86.3  2e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000984381  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25770  heat shock Hsp20 protein  36.87 
 
 
198 aa  86.3  2e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4352  heat shock protein Hsp20  35.61 
 
 
145 aa  85.9  2e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.735936  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2316  heat shock protein Hsp20  39.5 
 
 
139 aa  85.5  3e-16  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0611291  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2122  heat shock protein Hsp20  30.23 
 
 
180 aa  85.5  3e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.451471 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0391  heat shock protein Hsp20  37.96 
 
 
143 aa  85.9  3e-16  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000478859  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0954  Hsp20/alpha crystallin family protein  36.54 
 
 
162 aa  85.1  4e-16  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.154946  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0197  heat shock protein Hsp20  33.33 
 
 
147 aa  85.5  4e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0542117 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2600  putative heat shock protein Hsp20  30.05 
 
 
187 aa  85.5  4e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.207676  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3078  heat shock protein Hsp20  34.93 
 
 
145 aa  85.1  4e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000700712  normal  0.0754711 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2022  heat shock protein Hsp20  36.11 
 
 
141 aa  85.1  5e-16  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_825  HSP20/alpha crystallin  38.95 
 
 
162 aa  84.7  5e-16  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2462  heat shock protein Hsp20  33.94 
 
 
168 aa  84.7  6e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0466294  normal  0.178308 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4499  heat shock protein Hsp20  34.04 
 
 
145 aa  84.7  6e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.100268 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3917  heat shock protein Hsp20  34.91 
 
 
142 aa  84.7  7e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3580  molecular chaperone (small heat shock protein)  33.33 
 
 
141 aa  84.7  7e-16  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1127  heat shock protein Hsp20  30.66 
 
 
142 aa  84.3  8e-16  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0686  heat shock protein HSP20  35.29 
 
 
153 aa  83.6  0.000000000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0540  heat shock protein Hsp20  36.94 
 
 
147 aa  84  0.000000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0513  heat shock protein Hsp20  36.7 
 
 
147 aa  83.6  0.000000000000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>