More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ajs_3113 on replicon NC_008782
Organism: Acidovorax sp. JS42



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008782  Ajs_3113  heat shock protein Hsp20  100 
 
 
142 aa  290  6e-78  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.800815  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2459  heat shock protein Hsp20  94.37 
 
 
142 aa  277  3e-74  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.134169  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1292  heat shock protein Hsp20  79.58 
 
 
170 aa  243  6e-64  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0518729  normal  0.504399 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0630  heat shock protein Hsp20  51.08 
 
 
138 aa  135  2e-31  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.140987  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1165  heat shock protein Hsp20  49.66 
 
 
145 aa  133  7.000000000000001e-31  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.245253  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1869  putative small heat shock protein  51.09 
 
 
142 aa  132  9.999999999999999e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.309197  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2312  heat shock protein Hsp20  59.09 
 
 
149 aa  130  7.999999999999999e-30  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6187  heat shock protein Hsp20  50.78 
 
 
144 aa  124  3e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.306682 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1110  heat shock protein Hsp20  48.51 
 
 
145 aa  123  8.000000000000001e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.339847  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5914  heat shock protein Hsp20  49.22 
 
 
144 aa  121  3e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0664313  normal  0.562292 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1537  heat shock protein Hsp20  50 
 
 
142 aa  121  4e-27  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2321  stress response protein  55.66 
 
 
513 aa  119  9.999999999999999e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2035  stress response protein  50 
 
 
144 aa  118  1.9999999999999998e-26  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1432  HSP20/alpha crystallin family protein  50 
 
 
144 aa  119  1.9999999999999998e-26  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.614633  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2325  stress response protein  50 
 
 
141 aa  118  1.9999999999999998e-26  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.908249  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3093  heat shock protein  50 
 
 
144 aa  119  1.9999999999999998e-26  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1199  heat shock protein Hsp20  51.67 
 
 
143 aa  119  1.9999999999999998e-26  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.76992  normal 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1059  stress response protein  50 
 
 
144 aa  118  1.9999999999999998e-26  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1345  stress response protein  50 
 
 
144 aa  118  1.9999999999999998e-26  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.260788  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3219  heat shock protein  50 
 
 
144 aa  119  1.9999999999999998e-26  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2301  heat shock protein Hsp20  54.55 
 
 
142 aa  118  3e-26  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.46681  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0200  putative small HEAT shock protein  43.28 
 
 
140 aa  110  5e-24  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.32202 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1149  heat shock protein Hsp20  49.51 
 
 
140 aa  110  6e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1219  heat shock protein Hsp20  49.51 
 
 
140 aa  110  6e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1167  heat shock protein Hsp20  48.09 
 
 
149 aa  107  5e-23  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4382  heat shock protein Hsp20  49.51 
 
 
140 aa  107  7.000000000000001e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4514  heat shock protein Hsp20  49.51 
 
 
140 aa  107  7.000000000000001e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.165488  normal  0.480818 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2058  heat shock protein Hsp20  42.55 
 
 
141 aa  107  7.000000000000001e-23  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1370  small heat shock protein  39.42 
 
 
144 aa  92  2e-18  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0982961  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0538  HSP20 family protein  40.78 
 
 
147 aa  91.7  3e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0037  heat shock protein Hsp20  37.88 
 
 
142 aa  91.7  3e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1396  molecular chaperone-like protein  44.76 
 
 
152 aa  90.9  6e-18  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.610569 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0539  heat shock protein Hsp20  41.51 
 
 
161 aa  90.5  7e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0383  heat shock protein Hsp20  40.95 
 
 
158 aa  89.4  1e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0774  heat shock protein Hsp20  41.8 
 
 
139 aa  89.7  1e-17  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2986  heat shock protein Hsp20  38.83 
 
 
147 aa  89.4  2e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00130326  normal  0.964264 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1543  heat shock protein Hsp20  40.16 
 
 
146 aa  89  2e-17  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.000494204  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0629  heat shock protein Hsp20  35.66 
 
 
189 aa  88.2  3e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.185609 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3394  heat shock protein Hsp20  38.4 
 
 
189 aa  87.8  4e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0219016  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1171  heat shock protein Hsp20  36.8 
 
 
189 aa  87.4  6e-17  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.726376  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2287  heat shock protein Hsp20  37.6 
 
 
189 aa  87  8e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3412  small HspC2 heat shock protein  37.1 
 
 
189 aa  87  9e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.260583  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2316  heat shock protein Hsp20  39.52 
 
 
139 aa  85.9  2e-16  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0611291  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3125  heat shock protein Hsp20  44.33 
 
 
149 aa  85.5  2e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20170  heat shock protein Hsp20  38.53 
 
 
177 aa  85.1  3e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.638214  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1977  heat shock protein Hsp20  35.77 
 
 
139 aa  84.7  4e-16  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.334288  normal  0.643075 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1262  small heat shock protein  33.81 
 
 
151 aa  84.3  5e-16  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.753574  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1320  Hsp20/alpha crystallin family protein  33.81 
 
 
151 aa  84.3  5e-16  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0622  HSP20 family protein  36.09 
 
 
132 aa  82  0.000000000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4859  heat shock protein Hsp20  38.06 
 
 
204 aa  82.4  0.000000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6390  heat shock protein Hsp20  36.55 
 
 
187 aa  82.4  0.000000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.065602 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0989  heat shock protein Hsp20  37.12 
 
 
148 aa  81.6  0.000000000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.543303  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1115  heat shock protein Hsp20  40.98 
 
 
162 aa  80.9  0.000000000000005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0741755  normal  0.307075 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6093  heat shock protein Hsp20  35.86 
 
 
187 aa  80.9  0.000000000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1929  heat shock protein Hsp20  38.74 
 
 
149 aa  80.9  0.000000000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.638493  normal  0.0128011 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2522  heat shock protein Hsp20  32.59 
 
 
150 aa  80.9  0.000000000000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6439  heat shock protein Hsp20  38.24 
 
 
153 aa  80.5  0.000000000000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.024706  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2938  heat shock protein Hsp20  34.56 
 
 
145 aa  80.1  0.000000000000009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000000491843  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3582  heat shock protein Hsp20  34.68 
 
 
166 aa  80.1  0.000000000000009  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3905  heat shock protein Hsp20  39.81 
 
 
147 aa  79.7  0.00000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000984381  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1347  heat shock protein Hsp20  34.35 
 
 
148 aa  79.7  0.00000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.452932  normal  0.819182 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1528  heat shock protein Hsp20  39.09 
 
 
153 aa  79.3  0.00000000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.00309172  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2401  heat shock protein Hsp20  43.48 
 
 
163 aa  79.3  0.00000000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.0000662378  hitchhiker  0.00157329 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4119  heat shock protein Hsp20  37.61 
 
 
149 aa  79.7  0.00000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00303961 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5194  heat shock protein Hsp20  38.76 
 
 
169 aa  79.7  0.00000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0987038  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3076  heat shock protein Hsp20  37.17 
 
 
148 aa  79.7  0.00000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1648  heat shock protein, Hsp20 family  34.35 
 
 
148 aa  79.7  0.00000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.715277  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0610  heat shock protein Hsp20  29.77 
 
 
136 aa  79.3  0.00000000000002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.335952  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6319  heat shock protein Hsp20  35.94 
 
 
149 aa  79.3  0.00000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0289  heat shock protein Hsp20  34.97 
 
 
148 aa  79  0.00000000000002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0247001  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0580  heat shock protein Hsp20  32.09 
 
 
145 aa  79  0.00000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000199173  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1307  heat shock protein Hsp20  35.38 
 
 
143 aa  78.6  0.00000000000003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2210  heat shock protein Hsp20  34.33 
 
 
139 aa  78.6  0.00000000000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0417447  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2384  heat shock protein Hsp20  40.8 
 
 
164 aa  78.6  0.00000000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3724  heat shock protein Hsp20  34.07 
 
 
185 aa  78.6  0.00000000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3680  heat shock protein Hsp20  34.07 
 
 
185 aa  78.6  0.00000000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.626967 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0762  heat shock protein Hsp20  34.81 
 
 
134 aa  78.2  0.00000000000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3903  heat shock protein Hsp20  41.35 
 
 
194 aa  78.2  0.00000000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.534424 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2600  putative heat shock protein Hsp20  35.92 
 
 
187 aa  77.8  0.00000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.207676  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1892  HSP20 family protein  32.09 
 
 
132 aa  77.8  0.00000000000005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.684879  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2132  heat shock protein Hsp20  36.64 
 
 
164 aa  77.8  0.00000000000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.585874 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0865  heat shock protein Hsp20  41.51 
 
 
134 aa  77.8  0.00000000000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.303654  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0463  heat shock protein Hsp20  38.52 
 
 
166 aa  77.4  0.00000000000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06090  small heat shock protein  33.59 
 
 
148 aa  77.4  0.00000000000006  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.473161  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1348  heat shock protein Hsp20  38.71 
 
 
146 aa  77.4  0.00000000000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.403253 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2024  heat shock protein Hsp20  38.71 
 
 
146 aa  77.4  0.00000000000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.106375 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2790  heat shock protein Hsp20  34.51 
 
 
149 aa  77.4  0.00000000000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000163808  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0481  heat shock protein Hsp20  32.82 
 
 
150 aa  76.3  0.0000000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.411475 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0052  heat shock protein Hsp20  37.63 
 
 
151 aa  76.6  0.0000000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.319643  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1706  heat shock protein Hsp20  32.82 
 
 
132 aa  76.3  0.0000000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00808314  hitchhiker  0.000432661 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1429  heat shock protein Hsp20  32.33 
 
 
169 aa  76.6  0.0000000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4342  heat shock protein Hsp20  35.83 
 
 
147 aa  76.3  0.0000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.232434  normal  0.204531 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19940  molecular chaperone (small heat shock protein)  33.58 
 
 
149 aa  76.3  0.0000000000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.618399  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2355  heat shock protein Hsp20  36.3 
 
 
165 aa  75.9  0.0000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.20966  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2159  heat shock protein Hsp20  37.9 
 
 
139 aa  76.3  0.0000000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0146906  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3146  heat shock protein Hsp20  34.88 
 
 
167 aa  75.5  0.0000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.754957 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3435  heat shock protein Hsp20  38.46 
 
 
131 aa  75.5  0.0000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0197  heat shock protein Hsp20  35.83 
 
 
147 aa  75.5  0.0000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0542117 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1170  heat shock protein Hsp20  39.29 
 
 
170 aa  74.7  0.0000000000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2957  HSP20 family protein  36.89 
 
 
143 aa  74.7  0.0000000000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>