More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rfer_1537 on replicon NC_007908
Organism: Rhodoferax ferrireducens T118



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007908  Rfer_1537  heat shock protein Hsp20  100 
 
 		 142 aa  283  5.999999999999999e-76  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2301  heat shock protein Hsp20  64.08 
 
 		 142 aa  187  5e-47  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.46681  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1199  heat shock protein Hsp20  64.75 
 
 		 143 aa  182  1.0000000000000001e-45  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.76992  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1869  putative small heat shock protein  51.05 
 
 		 142 aa  135  2e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.309197  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1110  heat shock protein Hsp20  50 
 
 		 145 aa  132  9.999999999999999e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.339847  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2035  stress response protein  47.22 
 
 		 144 aa  129  2.0000000000000002e-29  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1059  stress response protein  47.22 
 
 		 144 aa  129  2.0000000000000002e-29  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1345  stress response protein  47.22 
 
 		 144 aa  129  2.0000000000000002e-29  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.260788  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1432  HSP20/alpha crystallin family protein  46.53 
 
 		 144 aa  127  5.0000000000000004e-29  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.614633  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3219  heat shock protein  46.53 
 
 		 144 aa  127  5.0000000000000004e-29  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3093  heat shock protein  46.53 
 
 		 144 aa  127  5.0000000000000004e-29  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0630  heat shock protein Hsp20  53.79 
 
 		 138 aa  127  6e-29  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.140987  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2325  stress response protein  48.55 
 
 		 141 aa  126  8.000000000000001e-29  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.908249  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2321  stress response protein  47.22 
 
 		 513 aa  127  8.000000000000001e-29  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1165  heat shock protein Hsp20  51.08 
 
 		 145 aa  125  2.0000000000000002e-28  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.245253  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5914  heat shock protein Hsp20  44.44 
 
 		 144 aa  123  1e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0664313  normal  0.562292 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6187  heat shock protein Hsp20  44.44 
 
 		 144 aa  121  3e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.306682 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3113  heat shock protein Hsp20  50 
 
 		 142 aa  121  4e-27  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.800815  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1292  heat shock protein Hsp20  47.93 
 
 		 170 aa  115  3e-25  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0518729  normal  0.504399 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2459  heat shock protein Hsp20  46.97 
 
 		 142 aa  114  6e-25  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.134169  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2058  heat shock protein Hsp20  48.12 
 
 		 141 aa  112  2.0000000000000002e-24  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0200  putative small HEAT shock protein  41.78 
 
 		 140 aa  105  2e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.32202 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1149  heat shock protein Hsp20  43.36 
 
 		 140 aa  105  2e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1219  heat shock protein Hsp20  43.36 
 
 		 140 aa  105  2e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2312  heat shock protein Hsp20  48.67 
 
 		 149 aa  103  9e-22  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4514  heat shock protein Hsp20  40.56 
 
 		 140 aa  99.4  1e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.165488  normal  0.480818 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4382  heat shock protein Hsp20  40.56 
 
 		 140 aa  99.4  1e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1370  small heat shock protein  42.18 
 
 		 144 aa  97.4  6e-20  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0982961  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1167  heat shock protein Hsp20  46.76 
 
 		 149 aa  92.4  2e-18  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0383  heat shock protein Hsp20  38.19 
 
 		 158 aa  91.7  3e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0391  heat shock protein Hsp20  38.58 
 
 		 151 aa  90.5  7e-18  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0037  heat shock protein Hsp20  45 
 
 		 142 aa  89.4  2e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2043  heat shock protein  39.26 
 
 		 145 aa  87.4  6e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.467829  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2287  heat shock protein, Hsp20 family  39.26 
 
 		 145 aa  87  7e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.58706e-24 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2045  heat shock protein  39.26 
 
 		 145 aa  87  7e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00409698  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2372  heat shock protein, Hsp20 family  39.26 
 
 		 145 aa  87  7e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0601479  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2290  HSP20 family protein  39.26 
 
 		 145 aa  86.7  1e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.581771  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2106  HSP20 family protein  39.71 
 
 		 145 aa  86.3  1e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.291359  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2262  HSP20 family protein  39.71 
 
 		 145 aa  86.3  1e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.378643  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2242  heat shock protein, Hsp20 family  37.5 
 
 		 145 aa  84.3  5e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00889609  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0774  heat shock protein Hsp20  37.4 
 
 		 139 aa  82.8  0.000000000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0538  HSP20 family protein  39.42 
 
 		 147 aa  80.9  0.000000000000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0610  heat shock protein Hsp20  38.46 
 
 		 136 aa  80.5  0.000000000000008  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.335952  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1076  heat shock protein Hsp20  38.97 
 
 		 148 aa  79.7  0.00000000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.713568  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0978  molecular chaperone (small heat shock protein)  43 
 
 		 140 aa  79.3  0.00000000000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3125  heat shock protein Hsp20  47.37 
 
 		 149 aa  78.6  0.00000000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_25657  22-kDa heat-shock protein  40.91 
 
 		 138 aa  77.8  0.00000000000005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.136563  normal  0.824287 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2790  heat shock protein Hsp20  42.31 
 
 		 149 aa  77.4  0.00000000000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000163808  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0539  heat shock protein Hsp20  42.72 
 
 		 161 aa  77.4  0.00000000000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2316  heat shock protein Hsp20  35.07 
 
 		 139 aa  77  0.00000000000007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0611291  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1660  heat shock protein Hsp20  39.52 
 
 		 145 aa  77.4  0.00000000000007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.870911  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2635  heat shock protein Hsp20  35.66 
 
 		 195 aa  77  0.00000000000009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000662159  normal  0.965311 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2796  heat shock protein  37.21 
 
 		 152 aa  77  0.00000000000009  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.300285  normal  0.746249 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09080  molecular chaperone (small heat shock protein)  33.85 
 
 		 145 aa  76.6  0.0000000000001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.675828  normal  0.433955 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1543  heat shock protein Hsp20  40.57 
 
 		 146 aa  76.3  0.0000000000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.000494204  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2086  heat shock protein, Hsp20 family  40.18 
 
 		 145 aa  75.5  0.0000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1743  heat shock protein Hsp20  40.18 
 
 		 145 aa  75.5  0.0000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.49982  normal  0.0110244 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19940  molecular chaperone (small heat shock protein)  34.92 
 
 		 149 aa  75.9  0.0000000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.618399  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1368  heat shock molecular chaperone  34.48 
 
 		 167 aa  75.5  0.0000000000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1977  heat shock protein Hsp20  37.4 
 
 		 139 aa  75.9  0.0000000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.334288  normal  0.643075 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1010  heat shock protein Hsp20  36.69 
 
 		 153 aa  75.5  0.0000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00224234  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3336  heat shock protein Hsp20  36.43 
 
 		 191 aa  75.5  0.0000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0481  heat shock protein Hsp20  37.12 
 
 		 150 aa  75.1  0.0000000000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.411475 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0936  heat shock protein Hsp20  31.79 
 
 		 155 aa  74.7  0.0000000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.172536  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2210  heat shock protein Hsp20  35.92 
 
 		 139 aa  73.9  0.0000000000007  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0417447  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0250  HSP20 family protein  35.16 
 
 		 139 aa  73.6  0.0000000000008  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.962825  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2986  heat shock protein Hsp20  36.54 
 
 		 147 aa  73.6  0.0000000000009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00130326  normal  0.964264 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0052  heat shock protein Hsp20  33.33 
 
 		 151 aa  73.2  0.000000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.319643  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6439  heat shock protein Hsp20  36.89 
 
 		 153 aa  73.2  0.000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.024706  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2320  heat shock protein Hsp20  35.97 
 
 		 149 aa  73.2  0.000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0463  heat shock protein Hsp20  41.9 
 
 		 166 aa  73.2  0.000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0289  heat shock protein Hsp20  35.85 
 
 		 148 aa  73.2  0.000000000001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0247001  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1348  heat shock protein Hsp20  36.23 
 
 		 146 aa  72.8  0.000000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.403253 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2024  heat shock protein Hsp20  36.23 
 
 		 146 aa  72.8  0.000000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.106375 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2022  heat shock protein Hsp20  43.27 
 
 		 141 aa  72.8  0.000000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0989  heat shock protein Hsp20  36.54 
 
 		 148 aa  72  0.000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.543303  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20170  heat shock protein Hsp20  41.49 
 
 		 177 aa  72.8  0.000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.638214  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0588  heat shock protein, molecular chaperone  43.52 
 
 		 141 aa  72  0.000000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.648467  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1127  heat shock protein Hsp20  33.33 
 
 		 142 aa  71.6  0.000000000003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1029  Hsp20/alpha crystallin family protein  31.33 
 
 		 146 aa  72  0.000000000003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00339514  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1648  heat shock protein, Hsp20 family  33.09 
 
 		 148 aa  71.2  0.000000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.715277  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1347  heat shock protein Hsp20  33.09 
 
 		 148 aa  71.2  0.000000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.452932  normal  0.819182 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1983  heat shock protein Hsp20  38.46 
 
 		 153 aa  71.2  0.000000000005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00684856  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0838  heat shock protein Hsp20  31.21 
 
 		 162 aa  70.9  0.000000000005  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06090  small heat shock protein  35.92 
 
 		 148 aa  70.9  0.000000000005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.473161  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0762  heat shock protein Hsp20  39.6 
 
 		 134 aa  70.9  0.000000000006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1429  heat shock protein Hsp20  32.82 
 
 		 169 aa  70.9  0.000000000006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1115  heat shock protein Hsp20  36.84 
 
 		 162 aa  70.5  0.000000000007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0741755  normal  0.307075 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1296  heat shock protein Hsp20  34.29 
 
 		 143 aa  70.5  0.000000000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0102  heat shock protein Hsp20  33.59 
 
 		 142 aa  70.5  0.000000000007  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1706  heat shock protein Hsp20  37.25 
 
 		 132 aa  69.7  0.00000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00808314  hitchhiker  0.000432661 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3080  heat shock protein Hsp20  36.79 
 
 		 230 aa  70.1  0.00000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2159  heat shock protein Hsp20  37.04 
 
 		 139 aa  69.7  0.00000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0146906  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1396  molecular chaperone-like protein  44.09 
 
 		 152 aa  70.1  0.00000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.610569 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1892  HSP20 family protein  35.64 
 
 		 132 aa  68.9  0.00000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.684879  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3905  heat shock protein Hsp20  36.54 
 
 		 147 aa  68.9  0.00000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000984381  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1731  HSP20 family protein  38.83 
 
 		 126 aa  68.6  0.00000000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.13098  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1018  heat shock protein Hsp20  36.73 
 
 		 177 aa  68.6  0.00000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.683731  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0298  heat shock protein Hsp20  34.26 
 
 		 166 aa  68.2  0.00000000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.295208 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3078  heat shock protein Hsp20  31.43 
 
 		 145 aa  67.8  0.00000000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000700712  normal  0.0754711 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>