More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dshi_2796 on replicon NC_009952
Organism: Dinoroseobacter shibae DFL 12



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009952  Dshi_2796  heat shock protein  100 
 
 		 152 aa  306  5e-83  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.300285  normal  0.746249 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6439  heat shock protein Hsp20  40.77 
 
 		 153 aa  97.8  5e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.024706  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0838  heat shock protein Hsp20  41.38 
 
 		 162 aa  97.4  7e-20  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0954  Hsp20/alpha crystallin family protein  38.93 
 
 		 162 aa  95.5  2e-19  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.154946  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_825  HSP20/alpha crystallin  42.24 
 
 		 162 aa  95.9  2e-19  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0052  heat shock protein Hsp20  46 
 
 		 151 aa  95.1  3e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.319643  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2281  heat shock protein Hsp20  43.24 
 
 		 173 aa  95.1  3e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.78764  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2320  heat shock protein Hsp20  44.63 
 
 		 149 aa  95.5  3e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2860  heat shock protein Hsp20  42.86 
 
 		 184 aa  94.7  4e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.793853  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2522  heat shock protein Hsp20  42.19 
 
 		 150 aa  94  7e-19  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1010  heat shock protein Hsp20  43.59 
 
 		 153 aa  91.3  5e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00224234  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1366  heat shock protein Hsp20  38.4 
 
 		 176 aa  90.5  8e-18  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.74874  normal  0.190619 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20170  heat shock protein Hsp20  44.04 
 
 		 177 aa  90.1  9e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.638214  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0543  heat shock protein Hsp20  40.18 
 
 		 147 aa  89.7  1e-17  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0340696  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0557  heat shock protein Hsp20  40.18 
 
 		 147 aa  89.4  2e-17  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0117197  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2287  heat shock protein Hsp20  34.64 
 
 		 189 aa  88.2  3e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3582  heat shock protein Hsp20  42.24 
 
 		 166 aa  88.2  3e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3903  heat shock protein Hsp20  42.2 
 
 		 194 aa  87  7e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.534424 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1171  heat shock protein Hsp20  32.05 
 
 		 189 aa  86.7  1e-16  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.726376  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0989  heat shock protein Hsp20  40.91 
 
 		 148 aa  85.9  2e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.543303  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3394  heat shock protein Hsp20  32.03 
 
 		 189 aa  85.5  2e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0219016  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3527  putative HspC2 heat shock protein  37.14 
 
 		 173 aa  85.1  3e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0868338  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3412  small HspC2 heat shock protein  32.03 
 
 		 189 aa  85.1  3e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.260583  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0629  heat shock protein Hsp20  31.37 
 
 		 189 aa  85.1  3e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.185609 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0389  heat shock protein Hsp20  41.41 
 
 		 166 aa  84.7  4e-16  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.706384 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0200  heat shock protein Hsp20  39.09 
 
 		 176 aa  84.3  5e-16  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.377048  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2836  heat shock protein Hsp20  30.28 
 
 		 197 aa  84  6e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00556978  normal  0.209218 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25770  heat shock Hsp20 protein  38.82 
 
 		 198 aa  83.6  8e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1296  heat shock protein Hsp20  41.44 
 
 		 143 aa  83.2  0.000000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4461  heat shock protein Hsp20  39.6 
 
 		 163 aa  83.6  0.000000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4859  heat shock protein Hsp20  37.17 
 
 		 204 aa  83.6  0.000000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0423  heat shock protein Hsp20  39.2 
 
 		 152 aa  82.8  0.000000000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.943695  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0762  heat shock protein Hsp20  36.72 
 
 		 134 aa  82.8  0.000000000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0623  heat shock protein Hsp20  41.07 
 
 		 152 aa  82.8  0.000000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.844177  normal  0.400233 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1076  heat shock protein Hsp20  39.02 
 
 		 148 aa  82  0.000000000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.713568  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0102  heat shock protein Hsp20  38.1 
 
 		 142 aa  81.6  0.000000000000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1917  heat shock protein Hsp20  40.21 
 
 		 156 aa  81.6  0.000000000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.86534  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2188  heat shock protein Hsp20  34.78 
 
 		 156 aa  82  0.000000000000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.345525  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0865  heat shock protein Hsp20  41.28 
 
 		 134 aa  81.6  0.000000000000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.303654  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0481  heat shock protein Hsp20  39.17 
 
 		 150 aa  80.9  0.000000000000005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.411475 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4352  heat shock protein Hsp20  40.57 
 
 		 145 aa  80.9  0.000000000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.735936  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2790  heat shock protein Hsp20  41.94 
 
 		 149 aa  80.1  0.000000000000009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000163808  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4488  heat shock protein Hsp20  39.62 
 
 		 145 aa  79.7  0.00000000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2120  heat shock protein Hsp20  46.08 
 
 		 139 aa  80.1  0.00000000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0258725  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1115  heat shock protein Hsp20  42.06 
 
 		 162 aa  79  0.00000000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0741755  normal  0.307075 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4507  heat shock protein Hsp20  39.62 
 
 		 145 aa  79.3  0.00000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4463  heat shock protein Hsp20  35.94 
 
 		 141 aa  78.2  0.00000000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3580  molecular chaperone (small heat shock protein)  28.57 
 
 		 141 aa  78.2  0.00000000000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2384  heat shock protein Hsp20  40 
 
 		 164 aa  77.8  0.00000000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2857  heat shock protein Hsp20  39.68 
 
 		 158 aa  77.4  0.00000000000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.274432  normal  0.0879388 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0622  HSP20 family protein  38.18 
 
 		 132 aa  77  0.00000000000007  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0538  HSP20 family protein  40 
 
 		 147 aa  77  0.00000000000009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1537  heat shock protein Hsp20  37.21 
 
 		 142 aa  77  0.00000000000009  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1762  heat shock protein Hsp20  39 
 
 		 144 aa  76.6  0.0000000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0924  heat shock protein  38.6 
 
 		 180 aa  76.3  0.0000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2132  heat shock protein Hsp20  42.39 
 
 		 164 aa  75.9  0.0000000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.585874 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2276  heat shock protein Hsp20  41.23 
 
 		 175 aa  75.9  0.0000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2678  HSP20 family protein  30.3 
 
 		 151 aa  75.1  0.0000000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1374  heat shock protein Hsp20  38.93 
 
 		 143 aa  75.1  0.0000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.2364  normal  0.511095 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0184  heat shock protein Hsp20  46.67 
 
 		 160 aa  75.1  0.0000000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.29101  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2460  heat shock protein Hsp20  39.22 
 
 		 186 aa  75.5  0.0000000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.0031555  normal  0.623789 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1109  heat shock protein Hsp20  37.12 
 
 		 143 aa  75.1  0.0000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.223131  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3234  HSP20 family protein  39.22 
 
 		 231 aa  74.7  0.0000000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3765  heat shock protein Hsp20  32.23 
 
 		 143 aa  74.7  0.0000000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4230  heat shock protein Hsp20  43.62 
 
 		 105 aa  74.7  0.0000000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4118  heat shock protein Hsp20  40.37 
 
 		 172 aa  74.3  0.0000000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.513744 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0383  heat shock protein Hsp20  37.88 
 
 		 166 aa  74.3  0.0000000000005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.170778  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0580  heat shock protein Hsp20  33.96 
 
 		 145 aa  74.7  0.0000000000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000199173  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5194  heat shock protein Hsp20  40.17 
 
 		 169 aa  73.9  0.0000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0987038  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0833  heat shock protein Hsp20  38.32 
 
 		 169 aa  73.9  0.0000000000007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0675  heat shock protein Hsp20  40.16 
 
 		 163 aa  73.9  0.0000000000007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.000000558694  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2532  HSP20 family protein  37.37 
 
 		 144 aa  73.9  0.0000000000008  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1018  heat shock protein Hsp20  38.79 
 
 		 177 aa  73.9  0.0000000000008  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.683731  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0369  HSP20 family protein  37.04 
 
 		 153 aa  73.6  0.0000000000008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  4.93231e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2986  heat shock protein Hsp20  33.64 
 
 		 147 aa  73.9  0.0000000000008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00130326  normal  0.964264 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1127  heat shock protein Hsp20  33.06 
 
 		 142 aa  73.9  0.0000000000008  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3680  heat shock protein Hsp20  38.74 
 
 		 185 aa  73.6  0.0000000000008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.626967 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3724  heat shock protein Hsp20  38.74 
 
 		 185 aa  73.6  0.0000000000008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3788  heat shock protein Hsp20  37.74 
 
 		 144 aa  73.6  0.0000000000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.964317 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3113  heat shock protein Hsp20  39.56 
 
 		 142 aa  72.8  0.000000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.800815  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1743  heat shock protein Hsp20  36.96 
 
 		 145 aa  73.2  0.000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.49982  normal  0.0110244 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4499  heat shock protein Hsp20  34.86 
 
 		 145 aa  73.6  0.000000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.100268 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1098  heat shock protein Hsp20  44.09 
 
 		 143 aa  73.2  0.000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.358342 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3386  heat shock protein Hsp20  34.72 
 
 		 147 aa  73.2  0.000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2086  heat shock protein, Hsp20 family  36.96 
 
 		 145 aa  73.2  0.000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1370  small heat shock protein  36.97 
 
 		 144 aa  72.4  0.000000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0982961  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2477  heat shock protein Hsp20  35.71 
 
 		 143 aa  72.4  0.000000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2459  heat shock protein Hsp20  39.56 
 
 		 142 aa  72  0.000000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.134169  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2731  heat shock protein Hsp20  37.11 
 
 		 166 aa  72.4  0.000000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2074  heat shock protein Hsp20  36.22 
 
 		 173 aa  72.4  0.000000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.145284  normal  0.308358 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2335  heat shock protein Hsp20  38.21 
 
 		 142 aa  72  0.000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.517765  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0320  heat shock protein Hsp20  43.3 
 
 		 150 aa  72.8  0.000000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2408  HSP20 family protein  44.19 
 
 		 160 aa  71.6  0.000000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1029  Hsp20/alpha crystallin family protein  32.81 
 
 		 146 aa  71.6  0.000000000003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00339514  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2118  heat shock protein Hsp20  37.4 
 
 		 166 aa  71.6  0.000000000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2957  HSP20 family protein  36.04 
 
 		 143 aa  71.6  0.000000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7808  Hsp20 family heat-shock protein  44.09 
 
 		 95 aa  72  0.000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  hitchhiker  0.00255696  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6093  heat shock protein Hsp20  35.88 
 
 		 187 aa  71.2  0.000000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0267  heat shock protein Hsp20  37.69 
 
 		 148 aa  71.6  0.000000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.216974 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4635  heat shock protein Hsp20  39.13 
 
 		 169 aa  71.6  0.000000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>