More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_2120 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008541  Arth_2120  heat shock protein Hsp20  100 
 
 
139 aa  283  5.999999999999999e-76  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0258725  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3661  heat shock protein Hsp20  51.08 
 
 
157 aa  144  4.0000000000000006e-34  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1698  heat shock protein Hsp20  47.44 
 
 
155 aa  139  9.999999999999999e-33  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.010449 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1796  heat shock protein Hsp20  50.5 
 
 
157 aa  108  2.0000000000000002e-23  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0576694  normal  0.0264597 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2809  heat shock protein Hsp20  46.49 
 
 
149 aa  106  1e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00105088  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22940  molecular chaperone (small heat shock protein)  45.3 
 
 
131 aa  105  3e-22  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.558061  normal  0.436135 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2335  heat shock protein Hsp20  45.05 
 
 
142 aa  98.2  3e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.517765  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4131  heat shock protein Hsp20  40.71 
 
 
161 aa  97.8  4e-20  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1374  heat shock protein Hsp20  52.53 
 
 
143 aa  97.4  5e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.2364  normal  0.511095 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1098  heat shock protein Hsp20  52.53 
 
 
143 aa  97.4  5e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.358342 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1109  heat shock protein Hsp20  52.53 
 
 
143 aa  97.4  6e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.223131  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12068  heat shock protein hspX  53.06 
 
 
144 aa  91.7  3e-18  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4816  Molecular chaperone (small heat shock protein)- like protein  48.35 
 
 
143 aa  91.3  4e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.59096  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3941  heat shock protein Hsp20  46.39 
 
 
186 aa  84.7  4e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2796  heat shock protein  47.12 
 
 
152 aa  82.8  0.000000000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.300285  normal  0.746249 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2320  heat shock protein Hsp20  41.32 
 
 
149 aa  82.4  0.000000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4230  heat shock protein Hsp20  47.67 
 
 
105 aa  81.3  0.000000000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2857  heat shock protein Hsp20  49.4 
 
 
158 aa  80.9  0.000000000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.274432  normal  0.0879388 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1010  heat shock protein Hsp20  45.1 
 
 
153 aa  76.3  0.0000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00224234  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0838  heat shock protein Hsp20  33.58 
 
 
162 aa  75.9  0.0000000000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0538  HSP20 family protein  38.61 
 
 
147 aa  75.1  0.0000000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0481  heat shock protein Hsp20  41.84 
 
 
150 aa  75.1  0.0000000000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.411475 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3063  heat shock protein Hsp20  40.86 
 
 
158 aa  75.1  0.0000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.89361 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2836  heat shock protein Hsp20  45.35 
 
 
197 aa  74.7  0.0000000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00556978  normal  0.209218 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4023  heat shock protein Hsp20  31.11 
 
 
147 aa  74.3  0.0000000000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4061  heat shock protein Hsp20  31.11 
 
 
147 aa  74.3  0.0000000000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2790  heat shock protein Hsp20  39.18 
 
 
149 aa  74.3  0.0000000000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000163808  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0954  Hsp20/alpha crystallin family protein  32 
 
 
162 aa  73.9  0.0000000000007  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.154946  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2522  heat shock protein Hsp20  39.58 
 
 
150 aa  73.9  0.0000000000007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0735  heat shock protein Hsp20  33.33 
 
 
145 aa  73.9  0.0000000000007  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  unclonable  0.0000000000000037192  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0296  heat shock protein Hsp20  42.86 
 
 
143 aa  73.6  0.0000000000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4819  heat shock protein Hsp20  41.18 
 
 
146 aa  73.2  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.414421 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2578  putative heat shock protein  34.75 
 
 
185 aa  73.2  0.000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3739  heat shock protein Hsp20  41.82 
 
 
182 aa  72.4  0.000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0809036 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3435  heat shock protein Hsp20  46.84 
 
 
131 aa  72  0.000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02640  low molecular weight heat shock protein  40 
 
 
158 aa  72.8  0.000000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3061  heat shock protein Hsp20  39.78 
 
 
158 aa  72.4  0.000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.301699 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2986  heat shock protein Hsp20  39.18 
 
 
147 aa  71.6  0.000000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00130326  normal  0.964264 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_825  HSP20/alpha crystallin  31.82 
 
 
162 aa  72  0.000000000003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3064  heat shock protein Hsp20  39.78 
 
 
166 aa  72  0.000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.898255 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2132  heat shock protein Hsp20  48.28 
 
 
164 aa  71.6  0.000000000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.585874 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0445  heat shock protein Hsp20  36.17 
 
 
150 aa  71.6  0.000000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0369  HSP20 family protein  39.25 
 
 
153 aa  71.2  0.000000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  4.93231e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2635  heat shock protein Hsp20  37.38 
 
 
195 aa  71.2  0.000000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000662159  normal  0.965311 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0037  heat shock protein Hsp20  40.43 
 
 
142 aa  71.6  0.000000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1348  heat shock protein Hsp20  34.19 
 
 
146 aa  71.2  0.000000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.403253 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2024  heat shock protein Hsp20  34.19 
 
 
146 aa  71.2  0.000000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.106375 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4342  heat shock protein Hsp20  28.99 
 
 
147 aa  71.2  0.000000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.232434  normal  0.204531 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2505  heat shock protein Hsp20  36.26 
 
 
138 aa  71.2  0.000000000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.239492  normal  0.0462479 
 
 
-
 
NC_011771  BCAH820_C0008  Hsp  35.79 
 
 
146 aa  70.9  0.000000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0098  heat shock protein Hsp20  33.87 
 
 
168 aa  70.9  0.000000000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4461  heat shock protein Hsp20  37.86 
 
 
163 aa  70.5  0.000000000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3788  heat shock protein Hsp20  38.55 
 
 
144 aa  70.5  0.000000000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.964317 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3074  heat shock protein Hsp20  42.73 
 
 
144 aa  70.1  0.000000000009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4819  heat shock protein Hsp20  37.93 
 
 
218 aa  70.1  0.000000000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2678  HSP20 family protein  35.51 
 
 
151 aa  69.3  0.00000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3724  heat shock protein Hsp20  43 
 
 
185 aa  69.7  0.00000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3076  heat shock protein Hsp20  40.24 
 
 
173 aa  70.1  0.00000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0936  heat shock protein Hsp20  28.48 
 
 
155 aa  69.7  0.00000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.172536  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3468  heat shock protein Hsp20  44.05 
 
 
148 aa  69.7  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.282569  normal  0.556723 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4118  heat shock protein Hsp20  46.07 
 
 
172 aa  70.1  0.00000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.513744 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1917  heat shock protein Hsp20  42.39 
 
 
156 aa  69.3  0.00000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.86534  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3680  heat shock protein Hsp20  43 
 
 
185 aa  69.7  0.00000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.626967 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2635  heat shock protein Hsp20  44.05 
 
 
148 aa  69.7  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0267  heat shock protein Hsp20  44.23 
 
 
148 aa  69.3  0.00000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.216974 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0143  heat shock protein Hsp20  39.76 
 
 
156 aa  69.3  0.00000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16210  heat shock protein Hsp20  32.81 
 
 
163 aa  68.9  0.00000000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.221164  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0197  heat shock protein Hsp20  28.99 
 
 
147 aa  68.9  0.00000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0542117 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3577  heat shock protein Hsp20  46 
 
 
157 aa  68.9  0.00000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.202692  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0257  heat shock protein Hsp20  44.23 
 
 
148 aa  69.3  0.00000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.739506  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2957  HSP20 family protein  38.24 
 
 
143 aa  69.3  0.00000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0247  heat shock protein Hsp20  44.23 
 
 
148 aa  69.3  0.00000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2860  heat shock protein Hsp20  42.5 
 
 
184 aa  69.3  0.00000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.793853  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10254  heat shock protein hsp (heat-stress-induced ribosome-binding protein A)  40.16 
 
 
159 aa  68.2  0.00000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.024543 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3080  heat shock protein Hsp20  37.5 
 
 
230 aa  68.2  0.00000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1320  Hsp20/alpha crystallin family protein  38.24 
 
 
151 aa  68.2  0.00000000004  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1262  small heat shock protein  38.24 
 
 
151 aa  68.2  0.00000000004  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.753574  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2657  heat shock protein Hsp20  31.34 
 
 
155 aa  67.8  0.00000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.498697  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0052  heat shock protein Hsp20  41.11 
 
 
151 aa  67.8  0.00000000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.319643  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1365  heat shock protein Hsp20  33.59 
 
 
160 aa  67.8  0.00000000005  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.117276  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1434  low molecular weight heat shock protein  33.59 
 
 
160 aa  67.8  0.00000000005  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0762  heat shock protein Hsp20  36.63 
 
 
134 aa  67.8  0.00000000005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4766  heat shock protein Hsp20  40.37 
 
 
163 aa  67.8  0.00000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  decreased coverage  0.0000408851  hitchhiker  0.00874264 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1967  heat shock protein Hsp20  33.88 
 
 
178 aa  67.8  0.00000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4499  heat shock protein Hsp20  37.74 
 
 
145 aa  67.8  0.00000000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.100268 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0580  heat shock protein Hsp20  37.76 
 
 
145 aa  67.4  0.00000000006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000199173  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4467  heat shock protein Hsp20  38.38 
 
 
149 aa  67.4  0.00000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.156372 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4761  heat shock protein Hsp20  38.38 
 
 
149 aa  67.4  0.00000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.735655  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4380  heat shock protein Hsp20  38.38 
 
 
149 aa  67.4  0.00000000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.642417  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2250  heat shock protein Hsp20  33.88 
 
 
178 aa  67  0.00000000009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4943  heat shock protein Hsp20  38.78 
 
 
149 aa  66.6  0.00000000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0508199 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0540  heat shock protein Hsp20  29.77 
 
 
147 aa  66.6  0.0000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3241  heat shock protein Hsp20  42.71 
 
 
166 aa  66.6  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.406826  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3905  heat shock protein Hsp20  33.64 
 
 
147 aa  66.2  0.0000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000984381  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2049  heat shock protein Hsp20  39.53 
 
 
164 aa  66.2  0.0000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  hitchhiker  0.0000140473  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0179  heat shock protein Hsp20  35.78 
 
 
149 aa  66.2  0.0000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0184  heat shock protein Hsp20  46.51 
 
 
160 aa  65.5  0.0000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.29101  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4507  heat shock protein Hsp20  37.37 
 
 
145 aa  65.9  0.0000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2281  heat shock protein Hsp20  40 
 
 
173 aa  65.9  0.0000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.78764  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2074  heat shock protein Hsp20  42.86 
 
 
173 aa  66.2  0.0000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.145284  normal  0.308358 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>