More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_3661 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008541  Arth_3661  heat shock protein Hsp20  100 
 
 
157 aa  317  3.9999999999999996e-86  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1698  heat shock protein Hsp20  70.7 
 
 
155 aa  236  6.999999999999999e-62  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.010449 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4131  heat shock protein Hsp20  49.07 
 
 
161 aa  153  7e-37  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2120  heat shock protein Hsp20  50.74 
 
 
139 aa  139  9.999999999999999e-33  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0258725  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2809  heat shock protein Hsp20  59.8 
 
 
149 aa  120  9.999999999999999e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00105088  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1796  heat shock protein Hsp20  41.45 
 
 
157 aa  116  9.999999999999999e-26  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0576694  normal  0.0264597 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2335  heat shock protein Hsp20  45.19 
 
 
142 aa  111  3e-24  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.517765  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4816  Molecular chaperone (small heat shock protein)- like protein  52.68 
 
 
143 aa  111  4.0000000000000004e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.59096  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1374  heat shock protein Hsp20  50 
 
 
143 aa  97.8  5e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.2364  normal  0.511095 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22940  molecular chaperone (small heat shock protein)  42.98 
 
 
131 aa  97.4  6e-20  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.558061  normal  0.436135 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1098  heat shock protein Hsp20  48.04 
 
 
143 aa  94  7e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.358342 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3941  heat shock protein Hsp20  48.48 
 
 
186 aa  93.6  8e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1109  heat shock protein Hsp20  48.04 
 
 
143 aa  93.6  8e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.223131  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12068  heat shock protein hspX  47.27 
 
 
144 aa  88.6  3e-17  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2857  heat shock protein Hsp20  47.37 
 
 
158 aa  84  7e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.274432  normal  0.0879388 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4230  heat shock protein Hsp20  46.88 
 
 
105 aa  84  7e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2320  heat shock protein Hsp20  37.33 
 
 
149 aa  82.8  0.000000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2678  HSP20 family protein  42.86 
 
 
151 aa  80.5  0.000000000000008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0247  heat shock protein Hsp20  44.63 
 
 
148 aa  80.1  0.00000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0267  heat shock protein Hsp20  45.63 
 
 
148 aa  79.7  0.00000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.216974 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0257  heat shock protein Hsp20  45.63 
 
 
148 aa  79.7  0.00000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.739506  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0037  heat shock protein Hsp20  34.25 
 
 
142 aa  78.6  0.00000000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1010  heat shock protein Hsp20  44.9 
 
 
153 aa  78.6  0.00000000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00224234  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2355  heat shock protein Hsp20  38.55 
 
 
165 aa  77.4  0.00000000000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.20966  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0538  HSP20 family protein  32.43 
 
 
147 aa  76.3  0.0000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2635  heat shock protein Hsp20  40.82 
 
 
195 aa  76.6  0.0000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000662159  normal  0.965311 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2860  heat shock protein Hsp20  40.2 
 
 
184 aa  76.6  0.0000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.793853  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1076  heat shock protein Hsp20  36.91 
 
 
148 aa  76.3  0.0000000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.713568  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3739  heat shock protein Hsp20  35.97 
 
 
182 aa  76.3  0.0000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0809036 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3080  heat shock protein Hsp20  33.12 
 
 
230 aa  76.3  0.0000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3074  heat shock protein Hsp20  40.28 
 
 
144 aa  75.9  0.0000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2505  heat shock protein Hsp20  35.25 
 
 
138 aa  74.3  0.0000000000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.239492  normal  0.0462479 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3435  heat shock protein Hsp20  37.61 
 
 
131 aa  74.7  0.0000000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4499  heat shock protein Hsp20  36.62 
 
 
145 aa  74.7  0.0000000000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.100268 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2986  heat shock protein Hsp20  37.59 
 
 
147 aa  74.3  0.0000000000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00130326  normal  0.964264 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6319  heat shock protein Hsp20  38.76 
 
 
149 aa  74.3  0.0000000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0296  heat shock protein Hsp20  41.51 
 
 
143 aa  73.9  0.0000000000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3577  heat shock protein Hsp20  34.19 
 
 
157 aa  73.6  0.0000000000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.202692  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0052  heat shock protein Hsp20  47.37 
 
 
151 aa  73.2  0.000000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.319643  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0833  heat shock protein Hsp20  43.14 
 
 
169 aa  73.6  0.000000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1917  heat shock protein Hsp20  38.02 
 
 
156 aa  73.2  0.000000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.86534  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0954  Hsp20/alpha crystallin family protein  38.64 
 
 
162 aa  72.8  0.000000000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.154946  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3323  heat shock protein Hsp20  38.26 
 
 
228 aa  72.4  0.000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_825  HSP20/alpha crystallin  38.64 
 
 
162 aa  72.8  0.000000000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0481  heat shock protein Hsp20  34.13 
 
 
150 aa  72.8  0.000000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.411475 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2657  heat shock protein Hsp20  34.69 
 
 
155 aa  72  0.000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.498697  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3241  heat shock protein Hsp20  36.48 
 
 
166 aa  71.6  0.000000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.406826  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1115  heat shock protein Hsp20  35.33 
 
 
162 aa  71.2  0.000000000006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0741755  normal  0.307075 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3076  heat shock protein Hsp20  36.08 
 
 
173 aa  70.9  0.000000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2578  putative heat shock protein  36.28 
 
 
185 aa  71.2  0.000000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14610  heat shock protein Hsp20  34.23 
 
 
143 aa  71.2  0.000000000006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000610495  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0388  heat shock protein Hsp20  37.5 
 
 
150 aa  70.9  0.000000000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.865112  normal  0.488414 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3146  heat shock protein Hsp20  32.1 
 
 
167 aa  70.5  0.000000000008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.754957 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0143  heat shock protein Hsp20  33.8 
 
 
156 aa  70.5  0.000000000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4463  heat shock protein Hsp20  36.17 
 
 
141 aa  70.5  0.000000000008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4819  heat shock protein Hsp20  40 
 
 
146 aa  70.5  0.000000000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.414421 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16210  heat shock protein Hsp20  29.66 
 
 
163 aa  70.1  0.00000000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.221164  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4507  heat shock protein Hsp20  37.39 
 
 
145 aa  69.7  0.00000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2635  heat shock protein Hsp20  34.15 
 
 
148 aa  69.7  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6892  heat shock protein Hsp20  31.79 
 
 
157 aa  70.1  0.00000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.862152  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3468  heat shock protein Hsp20  34.15 
 
 
148 aa  70.1  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.282569  normal  0.556723 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1370  small heat shock protein  34.81 
 
 
144 aa  68.9  0.00000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0982961  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0445  heat shock protein Hsp20  37.23 
 
 
150 aa  68.9  0.00000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0197  heat shock protein Hsp20  28.19 
 
 
147 aa  69.7  0.00000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0542117 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2460  heat shock protein Hsp20  43 
 
 
186 aa  69.3  0.00000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.0031555  normal  0.623789 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0383  heat shock protein Hsp20  34.5 
 
 
166 aa  68.9  0.00000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.170778  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2276  heat shock protein Hsp20  50 
 
 
175 aa  69.3  0.00000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0580  heat shock protein Hsp20  36.43 
 
 
145 aa  69.3  0.00000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000199173  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5291  heat shock protein Hsp20  34.21 
 
 
199 aa  69.3  0.00000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.060881  normal  0.828695 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0838  heat shock protein Hsp20  30.97 
 
 
162 aa  69.3  0.00000000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3234  HSP20 family protein  43 
 
 
231 aa  68.6  0.00000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0543  heat shock protein Hsp20  35.16 
 
 
147 aa  68.6  0.00000000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0340696  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3680  heat shock protein Hsp20  40.78 
 
 
185 aa  68.6  0.00000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.626967 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4352  heat shock protein Hsp20  35.51 
 
 
145 aa  68.6  0.00000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.735936  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0383  heat shock protein Hsp20  32.7 
 
 
158 aa  68.6  0.00000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3724  heat shock protein Hsp20  40.78 
 
 
185 aa  68.6  0.00000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4342  heat shock protein Hsp20  28.19 
 
 
147 aa  68.6  0.00000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.232434  normal  0.204531 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4488  heat shock protein Hsp20  36.52 
 
 
145 aa  68.6  0.00000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0672  heat shock protein Hsp20  41.12 
 
 
159 aa  68.9  0.00000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.000109595  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1127  heat shock protein Hsp20  35.51 
 
 
142 aa  68.6  0.00000000004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2132  heat shock protein Hsp20  34.01 
 
 
164 aa  68.2  0.00000000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.585874 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1543  heat shock protein Hsp20  33.58 
 
 
146 aa  68.2  0.00000000005  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.000494204  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0557  heat shock protein Hsp20  33.83 
 
 
147 aa  67.8  0.00000000006  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0117197  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0735  heat shock protein Hsp20  33.09 
 
 
145 aa  67.8  0.00000000006  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  unclonable  0.0000000000000037192  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2790  heat shock protein Hsp20  33.33 
 
 
149 aa  67.8  0.00000000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000163808  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2522  heat shock protein Hsp20  34.69 
 
 
150 aa  67.8  0.00000000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1445  putative heat shock protein  41.18 
 
 
167 aa  67.4  0.00000000007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.000891901  normal  0.866362 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0369  HSP20 family protein  42.53 
 
 
153 aa  67.4  0.00000000007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  4.93231e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0184  heat shock protein Hsp20  47.67 
 
 
160 aa  67.4  0.00000000008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.29101  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4118  heat shock protein Hsp20  36.84 
 
 
172 aa  67.4  0.00000000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.513744 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3063  heat shock protein Hsp20  34.34 
 
 
158 aa  67.4  0.00000000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.89361 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4635  heat shock protein Hsp20  40.86 
 
 
169 aa  67  0.0000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4461  heat shock protein Hsp20  29.7 
 
 
163 aa  66.6  0.0000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4819  heat shock protein Hsp20  36.05 
 
 
218 aa  66.6  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2122  heat shock protein Hsp20  37.35 
 
 
180 aa  66.6  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.451471 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2074  heat shock protein Hsp20  33.33 
 
 
173 aa  66.2  0.0000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.145284  normal  0.308358 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2212  heat shock protein Hsp20  37.93 
 
 
171 aa  67  0.0000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0675  heat shock protein Hsp20  37.25 
 
 
163 aa  66.2  0.0000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.000000558694  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1348  heat shock protein Hsp20  30.71 
 
 
146 aa  66.6  0.0000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.403253 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2024  heat shock protein Hsp20  30.71 
 
 
146 aa  66.6  0.0000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.106375 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>