More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_1796 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013235  Namu_1796  heat shock protein Hsp20  100 
 
 
157 aa  322  1e-87  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0576694  normal  0.0264597 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3661  heat shock protein Hsp20  41.45 
 
 
157 aa  112  2.0000000000000002e-24  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2120  heat shock protein Hsp20  50.55 
 
 
139 aa  104  5e-22  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0258725  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1698  heat shock protein Hsp20  44.04 
 
 
155 aa  103  8e-22  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.010449 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2335  heat shock protein Hsp20  40.54 
 
 
142 aa  100  7e-21  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.517765  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2809  heat shock protein Hsp20  41.96 
 
 
149 aa  91.7  3e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00105088  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22940  molecular chaperone (small heat shock protein)  46 
 
 
131 aa  89  3e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.558061  normal  0.436135 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4131  heat shock protein Hsp20  41.44 
 
 
161 aa  87.4  6e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2320  heat shock protein Hsp20  38.57 
 
 
149 aa  86.3  1e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4816  Molecular chaperone (small heat shock protein)- like protein  38.57 
 
 
143 aa  86.7  1e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.59096  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3941  heat shock protein Hsp20  44.86 
 
 
186 aa  85.5  2e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12068  heat shock protein hspX  41.54 
 
 
144 aa  84.3  6e-16  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1010  heat shock protein Hsp20  38.03 
 
 
153 aa  83.6  9e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00224234  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1374  heat shock protein Hsp20  38.33 
 
 
143 aa  82.8  0.000000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.2364  normal  0.511095 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1109  heat shock protein Hsp20  39.8 
 
 
143 aa  76.6  0.0000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.223131  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1098  heat shock protein Hsp20  39.8 
 
 
143 aa  77  0.0000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.358342 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3074  heat shock protein Hsp20  37.5 
 
 
144 aa  76.6  0.0000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2857  heat shock protein Hsp20  31.82 
 
 
158 aa  76.6  0.0000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.274432  normal  0.0879388 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0267  heat shock protein Hsp20  37.5 
 
 
148 aa  75.1  0.0000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.216974 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02640  low molecular weight heat shock protein  44.44 
 
 
158 aa  75.5  0.0000000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0257  heat shock protein Hsp20  37.5 
 
 
148 aa  75.1  0.0000000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.739506  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0247  heat shock protein Hsp20  35.82 
 
 
148 aa  75.1  0.0000000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2635  heat shock protein Hsp20  32.14 
 
 
195 aa  72.8  0.000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000662159  normal  0.965311 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1127  heat shock protein Hsp20  33.06 
 
 
142 aa  72.4  0.000000000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3394  heat shock protein Hsp20  30.22 
 
 
189 aa  71.6  0.000000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0219016  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3435  heat shock protein Hsp20  38.38 
 
 
131 aa  70.5  0.000000000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2678  HSP20 family protein  35.25 
 
 
151 aa  70.1  0.00000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0143  heat shock protein Hsp20  35.29 
 
 
156 aa  69.7  0.00000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4352  heat shock protein Hsp20  35.71 
 
 
145 aa  70.1  0.00000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.735936  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0481  heat shock protein Hsp20  31.97 
 
 
150 aa  68.9  0.00000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.411475 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0543  heat shock protein Hsp20  33.33 
 
 
147 aa  69.7  0.00000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0340696  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2522  heat shock protein Hsp20  31.13 
 
 
150 aa  68.9  0.00000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4507  heat shock protein Hsp20  35.71 
 
 
145 aa  68.6  0.00000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4499  heat shock protein Hsp20  36.73 
 
 
145 aa  68.9  0.00000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.100268 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2132  heat shock protein Hsp20  33.08 
 
 
164 aa  68.9  0.00000000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.585874 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3412  small HspC2 heat shock protein  31.21 
 
 
189 aa  68.6  0.00000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.260583  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0629  heat shock protein Hsp20  35.25 
 
 
189 aa  68.6  0.00000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.185609 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0838  heat shock protein Hsp20  34.69 
 
 
162 aa  67.8  0.00000000006  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0557  heat shock protein Hsp20  32.52 
 
 
147 aa  67.8  0.00000000006  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0117197  n/a   
 
 
-
 
NC_011771  BCAH820_C0008  Hsp  28.24 
 
 
146 aa  67.4  0.00000000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3080  heat shock protein Hsp20  36.96 
 
 
230 aa  67.4  0.00000000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1171  heat shock protein Hsp20  33.61 
 
 
189 aa  67.4  0.00000000008  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.726376  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2860  heat shock protein Hsp20  31.76 
 
 
184 aa  67  0.00000000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.793853  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4488  heat shock protein Hsp20  34.69 
 
 
145 aa  67  0.0000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2635  heat shock protein Hsp20  33.33 
 
 
148 aa  67  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2957  HSP20 family protein  38.1 
 
 
143 aa  66.6  0.0000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3739  heat shock protein Hsp20  35.58 
 
 
182 aa  66.6  0.0000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0809036 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3468  heat shock protein Hsp20  33.33 
 
 
148 aa  67  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.282569  normal  0.556723 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4819  heat shock protein Hsp20  40.51 
 
 
146 aa  67  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.414421 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1348  heat shock protein Hsp20  31.62 
 
 
146 aa  66.6  0.0000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.403253 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2024  heat shock protein Hsp20  31.62 
 
 
146 aa  66.6  0.0000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.106375 
 
 
-
 
NC_002936  DET0954  Hsp20/alpha crystallin family protein  33.67 
 
 
162 aa  66.2  0.0000000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.154946  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_825  HSP20/alpha crystallin  33.67 
 
 
162 aa  66.2  0.0000000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5914  heat shock protein Hsp20  34.29 
 
 
144 aa  65.9  0.0000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0664313  normal  0.562292 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0388  heat shock protein Hsp20  32.09 
 
 
150 aa  65.5  0.0000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.865112  normal  0.488414 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2505  heat shock protein Hsp20  38.38 
 
 
138 aa  66.2  0.0000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.239492  normal  0.0462479 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1434  low molecular weight heat shock protein  39.6 
 
 
160 aa  66.2  0.0000000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1365  heat shock protein Hsp20  39.6 
 
 
160 aa  66.2  0.0000000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.117276  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4230  heat shock protein Hsp20  36.08 
 
 
105 aa  65.9  0.0000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2477  heat shock protein Hsp20  34.91 
 
 
143 aa  65.9  0.0000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2287  heat shock protein Hsp20  32.5 
 
 
189 aa  65.9  0.0000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0369  HSP20 family protein  31.43 
 
 
153 aa  65.1  0.0000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  4.93231e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0102  heat shock protein Hsp20  29.75 
 
 
142 aa  65.1  0.0000000004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0052  heat shock protein Hsp20  37.89 
 
 
151 aa  64.7  0.0000000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.319643  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2355  heat shock protein Hsp20  30.94 
 
 
165 aa  64.3  0.0000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.20966  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3788  heat shock protein Hsp20  39.24 
 
 
144 aa  64.3  0.0000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.964317 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0580  heat shock protein Hsp20  32.33 
 
 
145 aa  64.3  0.0000000006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000199173  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1076  heat shock protein Hsp20  31.71 
 
 
148 aa  63.9  0.0000000008  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.713568  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1429  heat shock protein Hsp20  31.88 
 
 
169 aa  63.9  0.0000000008  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4118  heat shock protein Hsp20  29.58 
 
 
172 aa  63.9  0.0000000009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.513744 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0982  HSP20 family protein  38.74 
 
 
176 aa  63.5  0.000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0296  heat shock protein Hsp20  31.3 
 
 
143 aa  63.5  0.000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1573  heat shock protein Hsp20  31.06 
 
 
173 aa  63.5  0.000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  decreased coverage  0.00130938  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1366  heat shock protein Hsp20  30.58 
 
 
176 aa  63.5  0.000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.74874  normal  0.190619 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2401  heat shock protein Hsp20  39.24 
 
 
163 aa  63.2  0.000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.0000662378  hitchhiker  0.00157329 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1743  heat shock protein Hsp20  33.08 
 
 
145 aa  63.5  0.000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.49982  normal  0.0110244 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1537  heat shock protein Hsp20  35.96 
 
 
142 aa  63.5  0.000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6187  heat shock protein Hsp20  34.02 
 
 
144 aa  63.5  0.000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.306682 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2086  heat shock protein, Hsp20 family  33.08 
 
 
145 aa  63.5  0.000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4461  heat shock protein Hsp20  28.18 
 
 
163 aa  63.5  0.000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0538  HSP20 family protein  32.74 
 
 
147 aa  62.8  0.000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0200  heat shock protein Hsp20  37.74 
 
 
176 aa  62.8  0.000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.377048  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3076  heat shock protein Hsp20  35.8 
 
 
173 aa  62.4  0.000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4467  heat shock protein Hsp20  32.84 
 
 
149 aa  62.8  0.000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.156372 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0445  heat shock protein Hsp20  32.97 
 
 
150 aa  62.8  0.000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4380  heat shock protein Hsp20  32.84 
 
 
149 aa  62.8  0.000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.642417  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4761  heat shock protein Hsp20  32.84 
 
 
149 aa  62.8  0.000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.735655  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4943  heat shock protein Hsp20  37.96 
 
 
149 aa  62.4  0.000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0508199 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1805  heat shock protein Hsp20  36.11 
 
 
149 aa  62  0.000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.642811  normal  0.803886 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4023  heat shock protein Hsp20  35.37 
 
 
147 aa  62  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1110  heat shock protein Hsp20  33.67 
 
 
145 aa  62.4  0.000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.339847  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4061  heat shock protein Hsp20  35.37 
 
 
147 aa  62  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0675  heat shock protein Hsp20  33.81 
 
 
163 aa  62  0.000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.000000558694  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2049  heat shock protein Hsp20  29.58 
 
 
164 aa  61.6  0.000000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  hitchhiker  0.0000140473  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1533  heat shock protein Hsp20  33.64 
 
 
140 aa  61.6  0.000000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.207706  normal  0.208575 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0924  heat shock protein  36.19 
 
 
180 aa  61.2  0.000000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1543  heat shock protein Hsp20  27.69 
 
 
146 aa  61.2  0.000000005  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.000494204  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5291  heat shock protein Hsp20  30.61 
 
 
199 aa  60.8  0.000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.060881  normal  0.828695 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10254  heat shock protein hsp (heat-stress-induced ribosome-binding protein A)  34.48 
 
 
159 aa  60.8  0.000000006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.024543 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1320  Hsp20/alpha crystallin family protein  32.32 
 
 
151 aa  60.8  0.000000007  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>