More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_5291 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009921  Franean1_5291  heat shock protein Hsp20  100 
 
 
199 aa  394  1e-109  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.060881  normal  0.828695 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1179  heat shock protein Hsp20  66.45 
 
 
195 aa  202  2e-51  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.285254  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0247  heat shock protein Hsp20  53.33 
 
 
148 aa  111  6e-24  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0267  heat shock protein Hsp20  53.33 
 
 
148 aa  111  6e-24  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.216974 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0257  heat shock protein Hsp20  53.33 
 
 
148 aa  111  6e-24  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.739506  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0296  heat shock protein Hsp20  42.65 
 
 
143 aa  105  4e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3739  heat shock protein Hsp20  41.29 
 
 
182 aa  102  3e-21  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0809036 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0306  heat shock protein Hsp20  51.85 
 
 
138 aa  102  4e-21  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0420324 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10254  heat shock protein hsp (heat-stress-induced ribosome-binding protein A)  49.54 
 
 
159 aa  98.6  5e-20  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.024543 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0388  heat shock protein Hsp20  45.45 
 
 
150 aa  89.7  2e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.865112  normal  0.488414 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1010  heat shock protein Hsp20  37.09 
 
 
153 aa  84.3  0.000000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00224234  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2320  heat shock protein Hsp20  42.06 
 
 
149 aa  79.3  0.00000000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2986  heat shock protein Hsp20  33.33 
 
 
147 aa  77.8  0.00000000000009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00130326  normal  0.964264 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20170  heat shock protein Hsp20  33.55 
 
 
177 aa  77.8  0.00000000000009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.638214  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2132  heat shock protein Hsp20  35.37 
 
 
164 aa  77.8  0.0000000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.585874 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2860  heat shock protein Hsp20  33.55 
 
 
184 aa  77.4  0.0000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.793853  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25770  heat shock Hsp20 protein  33.55 
 
 
198 aa  76.6  0.0000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3905  heat shock protein Hsp20  30.32 
 
 
147 aa  76.6  0.0000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000984381  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0052  heat shock protein Hsp20  31.33 
 
 
151 aa  76.6  0.0000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.319643  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0538  HSP20 family protein  33.1 
 
 
147 aa  75.9  0.0000000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2578  putative heat shock protein  42.27 
 
 
185 aa  75.9  0.0000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3074  heat shock protein Hsp20  39.29 
 
 
144 aa  75.5  0.0000000000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2024  heat shock protein Hsp20  30.67 
 
 
146 aa  75.1  0.0000000000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.106375 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1348  heat shock protein Hsp20  30.67 
 
 
146 aa  75.1  0.0000000000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.403253 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2287  heat shock protein Hsp20  37.19 
 
 
189 aa  74.7  0.0000000000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2276  heat shock protein Hsp20  33.55 
 
 
175 aa  74.7  0.0000000000009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0675  heat shock protein Hsp20  37.74 
 
 
163 aa  74.3  0.000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.000000558694  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0989  heat shock protein Hsp20  33.11 
 
 
148 aa  73.6  0.000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.543303  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3234  HSP20 family protein  32.69 
 
 
231 aa  73.6  0.000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3394  heat shock protein Hsp20  34.51 
 
 
189 aa  73.9  0.000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0219016  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1296  heat shock protein Hsp20  32.68 
 
 
143 aa  73.2  0.000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3577  heat shock protein Hsp20  35.76 
 
 
157 aa  73.6  0.000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.202692  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4766  heat shock protein Hsp20  33.12 
 
 
163 aa  73.6  0.000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  decreased coverage  0.0000408851  hitchhiker  0.00874264 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1698  heat shock protein Hsp20  39.05 
 
 
155 aa  73.2  0.000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.010449 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2532  HSP20 family protein  40.74 
 
 
144 aa  73.2  0.000000000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2477  heat shock protein Hsp20  39.42 
 
 
143 aa  72.8  0.000000000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3612  hypothetical protein  32.69 
 
 
177 aa  72.4  0.000000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0102  heat shock protein Hsp20  34.06 
 
 
142 aa  72  0.000000000005  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0543  heat shock protein Hsp20  31.72 
 
 
147 aa  71.2  0.000000000008  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0340696  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1262  small heat shock protein  35.24 
 
 
151 aa  71.6  0.000000000008  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.753574  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1320  Hsp20/alpha crystallin family protein  35.24 
 
 
151 aa  71.6  0.000000000008  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2460  heat shock protein Hsp20  31.41 
 
 
186 aa  71.2  0.000000000009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.0031555  normal  0.623789 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2790  heat shock protein Hsp20  28.57 
 
 
149 aa  70.9  0.00000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000163808  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2635  heat shock protein Hsp20  30.43 
 
 
148 aa  70.5  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3468  heat shock protein Hsp20  30.43 
 
 
148 aa  71.2  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.282569  normal  0.556723 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0445  heat shock protein Hsp20  30.26 
 
 
150 aa  70.1  0.00000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3076  heat shock protein Hsp20  28.39 
 
 
148 aa  70.1  0.00000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3076  heat shock protein Hsp20  28.67 
 
 
173 aa  70.1  0.00000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1983  heat shock protein Hsp20  28.57 
 
 
153 aa  70.1  0.00000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00684856  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3580  molecular chaperone (small heat shock protein)  29.53 
 
 
141 aa  70.5  0.00000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2809  heat shock protein Hsp20  45.78 
 
 
149 aa  69.3  0.00000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00105088  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6093  heat shock protein Hsp20  30.87 
 
 
187 aa  69.7  0.00000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0362  heat shock protein Hsp20  28 
 
 
144 aa  69.7  0.00000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.025472  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2730  heat shock protein Hsp20  31.58 
 
 
148 aa  69.3  0.00000000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3412  small HspC2 heat shock protein  36.89 
 
 
189 aa  69.3  0.00000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.260583  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6390  heat shock protein Hsp20  30.87 
 
 
187 aa  69.3  0.00000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.065602 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0343  heat shock protein Hsp20  27.33 
 
 
144 aa  68.9  0.00000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.90555e-28 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0557  heat shock protein Hsp20  32.59 
 
 
147 aa  68.9  0.00000000005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0117197  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2957  HSP20 family protein  41.76 
 
 
143 aa  68.6  0.00000000006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0843  heat shock protein Hsp20  36.84 
 
 
144 aa  68.6  0.00000000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.505886  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4816  Molecular chaperone (small heat shock protein)- like protein  40.43 
 
 
143 aa  68.2  0.00000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.59096  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1127  heat shock protein Hsp20  35.56 
 
 
142 aa  67.8  0.00000000009  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0629  heat shock protein Hsp20  35.25 
 
 
189 aa  67.4  0.0000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.185609 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1365  heat shock protein Hsp20  35.24 
 
 
160 aa  67.8  0.0000000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.117276  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1824  heat shock protein Hsp20  37.38 
 
 
146 aa  67.4  0.0000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0843989  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1434  low molecular weight heat shock protein  35.24 
 
 
160 aa  67.8  0.0000000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02640  low molecular weight heat shock protein  38.68 
 
 
158 aa  67.8  0.0000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0774  heat shock protein Hsp20  32.05 
 
 
139 aa  67  0.0000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0481  heat shock protein Hsp20  33.06 
 
 
150 aa  66.6  0.0000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.411475 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4499  heat shock protein Hsp20  32.67 
 
 
145 aa  67  0.0000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.100268 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0296  heat shock protein Hsp20  40.21 
 
 
156 aa  67  0.0000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4157  heat shock protein Hsp20  29.75 
 
 
150 aa  66.6  0.0000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2188  heat shock protein Hsp20  35.78 
 
 
156 aa  67  0.0000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.345525  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1171  heat shock protein Hsp20  36.52 
 
 
189 aa  67  0.0000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.726376  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2600  putative heat shock protein Hsp20  31.62 
 
 
187 aa  67  0.0000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.207676  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0672  heat shock protein Hsp20  32.69 
 
 
159 aa  67  0.0000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.000109595  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1142  heat shock protein Hsp20  33.33 
 
 
146 aa  67  0.0000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3882  heat shock protein Hsp20  39.8 
 
 
158 aa  66.2  0.0000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.545217  normal  0.180827 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0838  heat shock protein Hsp20  29.66 
 
 
162 aa  66.2  0.0000000003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2074  heat shock protein Hsp20  37.93 
 
 
173 aa  66.2  0.0000000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.145284  normal  0.308358 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3661  heat shock protein Hsp20  35.38 
 
 
157 aa  66.2  0.0000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3241  heat shock protein Hsp20  34.25 
 
 
166 aa  65.9  0.0000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.406826  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2580  putative small heat shock protein, Hsp20-related  30.14 
 
 
145 aa  65.5  0.0000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0200  heat shock protein Hsp20  32.21 
 
 
176 aa  65.9  0.0000000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.377048  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3080  heat shock protein Hsp20  32.37 
 
 
230 aa  65.5  0.0000000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0686  heat shock protein HSP20  35.48 
 
 
153 aa  65.1  0.0000000006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2212  heat shock protein Hsp20  34.46 
 
 
171 aa  65.1  0.0000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4507  heat shock protein Hsp20  38.32 
 
 
145 aa  65.1  0.0000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22940  molecular chaperone (small heat shock protein)  37 
 
 
131 aa  64.7  0.0000000008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.558061  normal  0.436135 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4352  heat shock protein Hsp20  38.32 
 
 
145 aa  64.7  0.0000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.735936  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_825  HSP20/alpha crystallin  31.63 
 
 
162 aa  64.7  0.0000000008  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0735  heat shock protein Hsp20  30.2 
 
 
145 aa  64.7  0.0000000009  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  unclonable  0.0000000000000037192  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0954  Hsp20/alpha crystallin family protein  28.57 
 
 
162 aa  64.3  0.000000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.154946  n/a   
 
 
-
 
NC_011771  BCAH820_C0008  Hsp  26.95 
 
 
146 aa  63.9  0.000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0179  heat shock protein Hsp20  37.62 
 
 
149 aa  63.9  0.000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12068  heat shock protein hspX  37.89 
 
 
144 aa  64.3  0.000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2836  heat shock protein Hsp20  28.48 
 
 
197 aa  63.9  0.000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00556978  normal  0.209218 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3527  putative HspC2 heat shock protein  34.81 
 
 
173 aa  64.3  0.000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0868338  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3582  heat shock protein Hsp20  28.68 
 
 
166 aa  64.3  0.000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0623  heat shock protein Hsp20  35.26 
 
 
152 aa  64.3  0.000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.844177  normal  0.400233 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>