More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ping_1533 on replicon NC_008709
Organism: Psychromonas ingrahamii 37



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008709  Ping_1533  heat shock protein Hsp20  100 
 
 
140 aa  281  3.0000000000000004e-75  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.207706  normal  0.208575 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1806  heat shock protein Hsp20  84.06 
 
 
139 aa  242  9.999999999999999e-64  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.332989  normal  0.066583 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1543  heat shock protein Hsp20  44.66 
 
 
146 aa  81.3  0.000000000000004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.000494204  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2938  heat shock protein Hsp20  48.35 
 
 
145 aa  77.4  0.00000000000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000000491843  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2321  stress response protein  40.57 
 
 
513 aa  77  0.00000000000008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0588  heat shock protein, molecular chaperone  41.35 
 
 
141 aa  76.3  0.0000000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.648467  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0580  heat shock protein Hsp20  37.96 
 
 
145 aa  75.9  0.0000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000199173  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1509  heat shock protein Hsp20  37.12 
 
 
148 aa  75.1  0.0000000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000196437  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6390  heat shock protein Hsp20  30.15 
 
 
187 aa  73.9  0.0000000000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.065602 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6093  heat shock protein Hsp20  30.15 
 
 
187 aa  73.9  0.0000000000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3582  heat shock protein Hsp20  35.71 
 
 
166 aa  73.9  0.0000000000008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1695  heat shock protein Hsp20  40.38 
 
 
151 aa  72  0.000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0622  HSP20 family protein  34.38 
 
 
132 aa  71.6  0.000000000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3076  heat shock protein Hsp20  36.63 
 
 
148 aa  71.6  0.000000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1573  heat shock protein Hsp20  31.69 
 
 
173 aa  71.2  0.000000000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  decreased coverage  0.00130938  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1110  heat shock protein Hsp20  32.19 
 
 
145 aa  71.2  0.000000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.339847  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0859  heat shock protein Hsp20  35.09 
 
 
153 aa  70.9  0.000000000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1869  putative small heat shock protein  40.59 
 
 
142 aa  70.9  0.000000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.309197  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1892  HSP20 family protein  34.21 
 
 
132 aa  70.5  0.000000000008  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.684879  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1059  stress response protein  38.1 
 
 
144 aa  69.7  0.00000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2035  stress response protein  38.1 
 
 
144 aa  69.7  0.00000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2325  stress response protein  38.1 
 
 
141 aa  69.7  0.00000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.908249  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3219  heat shock protein  38.1 
 
 
144 aa  69.7  0.00000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1432  HSP20/alpha crystallin family protein  38.1 
 
 
144 aa  69.7  0.00000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.614633  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1345  stress response protein  38.1 
 
 
144 aa  69.7  0.00000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.260788  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3093  heat shock protein  38.1 
 
 
144 aa  69.7  0.00000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3074  heat shock protein Hsp20  33.04 
 
 
144 aa  69.7  0.00000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0391  heat shock protein Hsp20  42.55 
 
 
151 aa  69.7  0.00000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4342  heat shock protein Hsp20  35.58 
 
 
147 aa  68.9  0.00000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.232434  normal  0.204531 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2683  heat shock protein Hsp20  36.22 
 
 
145 aa  68.9  0.00000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.338339  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0774  heat shock protein Hsp20  34.29 
 
 
139 aa  68.9  0.00000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0037  heat shock protein Hsp20  35.4 
 
 
142 aa  69.3  0.00000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0197  heat shock protein Hsp20  34.62 
 
 
147 aa  69.3  0.00000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0542117 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0538  HSP20 family protein  35.92 
 
 
147 aa  68.2  0.00000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1429  heat shock protein Hsp20  27.89 
 
 
169 aa  68.6  0.00000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2522  heat shock protein Hsp20  30.19 
 
 
150 aa  68.6  0.00000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2790  heat shock protein Hsp20  37.86 
 
 
149 aa  68.6  0.00000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000163808  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1738  small HspC2 heat shock protein  34.23 
 
 
189 aa  67.8  0.00000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.267785  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2798  small HspC2 heat shock protein  34.23 
 
 
189 aa  67.8  0.00000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.159343  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0936  heat shock protein Hsp20  37.25 
 
 
155 aa  68.2  0.00000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.172536  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1292  heat shock protein Hsp20  32.19 
 
 
170 aa  68.2  0.00000000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0518729  normal  0.504399 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0762  heat shock protein Hsp20  33.61 
 
 
134 aa  68.2  0.00000000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3125  heat shock protein Hsp20  37.19 
 
 
149 aa  67.8  0.00000000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3498  heat shock protein Hsp20  30.6 
 
 
158 aa  67.8  0.00000000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.938667  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3882  heat shock protein Hsp20  31.5 
 
 
158 aa  67.4  0.00000000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.545217  normal  0.180827 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5914  heat shock protein Hsp20  34.69 
 
 
144 aa  67.4  0.00000000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0664313  normal  0.562292 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3805  heat shock protein Hsp20  30.6 
 
 
158 aa  67.4  0.00000000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.232205  normal  0.564168 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0989  heat shock protein Hsp20  33.96 
 
 
148 aa  67.4  0.00000000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.543303  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2600  putative heat shock protein Hsp20  29.58 
 
 
187 aa  67.4  0.00000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.207676  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19940  molecular chaperone (small heat shock protein)  39.78 
 
 
149 aa  67  0.00000000007  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.618399  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06090  small heat shock protein  34.4 
 
 
148 aa  67  0.00000000008  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.473161  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2986  heat shock protein Hsp20  34.65 
 
 
147 aa  67  0.00000000009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00130326  normal  0.964264 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2578  putative heat shock protein  27.41 
 
 
185 aa  67  0.00000000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0543  heat shock protein Hsp20  30.97 
 
 
147 aa  67  0.00000000009  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0340696  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2957  HSP20 family protein  37.23 
 
 
143 aa  66.2  0.0000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1199  heat shock protein Hsp20  32.79 
 
 
143 aa  66.2  0.0000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.76992  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1983  heat shock protein Hsp20  36.89 
 
 
153 aa  66.6  0.0000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00684856  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1824  heat shock protein Hsp20  34.38 
 
 
146 aa  66.6  0.0000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0843989  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0865  heat shock protein Hsp20  33.33 
 
 
134 aa  65.5  0.0000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.303654  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4352  heat shock protein Hsp20  34.82 
 
 
145 aa  65.9  0.0000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.735936  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0557  heat shock protein Hsp20  30.97 
 
 
147 aa  65.9  0.0000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0117197  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1743  heat shock protein Hsp20  40.62 
 
 
145 aa  65.9  0.0000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.49982  normal  0.0110244 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2086  heat shock protein, Hsp20 family  40.62 
 
 
145 aa  65.9  0.0000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5194  heat shock protein Hsp20  36.19 
 
 
169 aa  65.5  0.0000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0987038  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1698  heat shock protein Hsp20  36.52 
 
 
155 aa  65.5  0.0000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.010449 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1368  heat shock molecular chaperone  34.96 
 
 
167 aa  65.1  0.0000000003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4819  heat shock protein Hsp20  27.2 
 
 
146 aa  65.1  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.414421 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0540  heat shock protein Hsp20  31.43 
 
 
147 aa  64.7  0.0000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4507  heat shock protein Hsp20  35.29 
 
 
145 aa  64.7  0.0000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3146  heat shock protein Hsp20  36.28 
 
 
167 aa  64.7  0.0000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.754957 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3774  heat shock protein Hsp20  34 
 
 
132 aa  64.7  0.0000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14610  heat shock protein Hsp20  31.43 
 
 
143 aa  64.3  0.0000000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000610495  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2351  heat shock protein Hsp20  34.19 
 
 
158 aa  64.3  0.0000000005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3666  heat shock protein Hsp20  34 
 
 
132 aa  64.7  0.0000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0021013  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1365  heat shock protein Hsp20  33.33 
 
 
160 aa  64.3  0.0000000005  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.117276  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1434  low molecular weight heat shock protein  33.33 
 
 
160 aa  64.3  0.0000000005  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4499  heat shock protein Hsp20  32.43 
 
 
145 aa  64.3  0.0000000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.100268 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3905  heat shock protein Hsp20  31.25 
 
 
147 aa  64.3  0.0000000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000984381  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2132  heat shock protein Hsp20  30.97 
 
 
164 aa  63.9  0.0000000006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.585874 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1537  heat shock protein Hsp20  38.68 
 
 
142 aa  64.3  0.0000000006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6187  heat shock protein Hsp20  34.59 
 
 
144 aa  63.9  0.0000000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.306682 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1806  small heat shock protein  34.78 
 
 
152 aa  63.9  0.0000000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2287  heat shock protein Hsp20  35.42 
 
 
189 aa  63.9  0.0000000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4488  heat shock protein Hsp20  34.31 
 
 
145 aa  63.5  0.0000000008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0982  HSP20 family protein  32.14 
 
 
176 aa  63.5  0.0000000009  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0200  putative small HEAT shock protein  36.79 
 
 
140 aa  63.5  0.0000000009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.32202 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1018  heat shock protein Hsp20  37.04 
 
 
177 aa  63.5  0.0000000009  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.683731  normal 
 
 
-
 
NC_011771  BCAH820_C0008  Hsp  33.68 
 
 
146 aa  63.5  0.0000000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6319  heat shock protein Hsp20  34.75 
 
 
149 aa  63.5  0.0000000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3063  heat shock protein Hsp20  31.86 
 
 
158 aa  63.5  0.0000000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.89361 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4514  heat shock protein Hsp20  38.04 
 
 
140 aa  63.2  0.000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.165488  normal  0.480818 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2730  heat shock protein Hsp20  38.78 
 
 
148 aa  63.2  0.000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02640  low molecular weight heat shock protein  30.33 
 
 
158 aa  63.2  0.000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2401  heat shock protein Hsp20  33.33 
 
 
163 aa  63.5  0.000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.0000662378  hitchhiker  0.00157329 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2384  heat shock protein Hsp20  30.3 
 
 
164 aa  62.8  0.000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2049  heat shock protein Hsp20  30.84 
 
 
164 aa  63.2  0.000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  hitchhiker  0.0000140473  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0052  heat shock protein Hsp20  36.08 
 
 
151 aa  62.8  0.000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.319643  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1347  heat shock protein Hsp20  35.58 
 
 
148 aa  63.2  0.000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.452932  normal  0.819182 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2860  heat shock protein Hsp20  31.31 
 
 
184 aa  63.2  0.000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.793853  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1348  heat shock protein Hsp20  38.04 
 
 
146 aa  62.8  0.000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.403253 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>